More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_3832 on replicon NC_007974
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007974  Rmet_3832  extra-cytoplasmic solute receptor  100 
 
 		 322 aa  649    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0585  hypothetical protein  65.46 
 
 		 341 aa  394  1e-108  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.156752  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2820  hypothetical protein  64.36 
 
 		 359 aa  387  1e-106  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.407557  normal  0.294179 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2025  hypothetical protein  61.72 
 
 		 324 aa  384  1e-105  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.744071  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1508  hypothetical protein  54.37 
 
 		 322 aa  351  8e-96  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0869  hypothetical protein  52.35 
 
 		 339 aa  313  1.9999999999999998e-84  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3937  hypothetical protein  51.8 
 
 		 328 aa  313  2.9999999999999996e-84  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.178831  normal  0.0313351 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2357  hypothetical protein  50 
 
 		 333 aa  310  2e-83  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.827571  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2869  hypothetical protein  49.66 
 
 		 330 aa  307  2.0000000000000002e-82  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3546  hypothetical protein  49.17 
 
 		 330 aa  306  3e-82  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0909589  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2870  hypothetical protein  49.37 
 
 		 333 aa  306  3e-82  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2991  hypothetical protein  51.31 
 
 		 333 aa  303  2.0000000000000002e-81  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.36978  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1653  hypothetical protein  50 
 
 		 333 aa  301  9e-81  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.386513  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5589  hypothetical protein  49.06 
 
 		 335 aa  299  3e-80  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4389  hypothetical protein  49.67 
 
 		 321 aa  296  3e-79  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.907682 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3983  extra-cytoplasmic solute receptor  48.76 
 
 		 328 aa  296  3e-79  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0104878 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3664  hypothetical protein  49.67 
 
 		 324 aa  293  4e-78  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3966  hypothetical protein  44.97 
 
 		 356 aa  292  7e-78  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0682449  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1908  hypothetical protein  46.89 
 
 		 336 aa  291  1e-77  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.781517  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0801  hypothetical protein  50.67 
 
 		 323 aa  288  6e-77  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.618864  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5438  hypothetical protein  47.38 
 
 		 326 aa  286  2.9999999999999996e-76  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3324  hypothetical protein  45.54 
 
 		 328 aa  285  8e-76  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  decreased coverage  0.0025587  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3974  hypothetical protein  45.54 
 
 		 328 aa  285  8e-76  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.406148 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0363  hypothetical protein  46.03 
 
 		 322 aa  284  1.0000000000000001e-75  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.732087 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3145  hypothetical protein  47.52 
 
 		 333 aa  283  4.0000000000000003e-75  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.261814  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4004  hypothetical protein  45.64 
 
 		 339 aa  282  5.000000000000001e-75  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.506172  normal  0.0371737 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5565  hypothetical protein  48.16 
 
 		 335 aa  281  2e-74  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.517724  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2095  hypothetical protein  46.51 
 
 		 324 aa  280  2e-74  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4323  hypothetical protein  43.79 
 
 		 344 aa  280  2e-74  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.957408  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3250  hypothetical protein  46.98 
 
 		 330 aa  280  3e-74  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.268792 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3671  extra-cytoplasmic solute receptor  49.53 
 
 		 334 aa  280  3e-74  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5894  extra-cytoplasmic solute receptor  47.83 
 
 		 358 aa  279  4e-74  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0453  hypothetical protein  45.02 
 
 		 345 aa  278  6e-74  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.533416  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0462  hypothetical protein  45.02 
 
 		 345 aa  278  7e-74  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.170176 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4624  hypothetical protein  46.13 
 
 		 327 aa  278  8e-74  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5370  extra-cytoplasmic solute receptor  46.54 
 
 		 322 aa  278  1e-73  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.114035  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4401  hypothetical protein  45.79 
 
 		 321 aa  276  2e-73  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0268815  normal  0.198915 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3884  hypothetical protein  45.25 
 
 		 328 aa  277  2e-73  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6217  hypothetical protein  45.21 
 
 		 322 aa  277  2e-73  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0641942  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4609  extra-cytoplasmic solute receptor  44.16 
 
 		 328 aa  276  3e-73  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.636278 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7860  hypothetical protein  42.46 
 
 		 324 aa  276  3e-73  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.266797 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0779  hypothetical protein  46.6 
 
 		 360 aa  276  4e-73  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1708  hypothetical protein  43.23 
 
 		 322 aa  274  1.0000000000000001e-72  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.0000467968  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4972  hypothetical protein  46.49 
 
 		 328 aa  274  1.0000000000000001e-72  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.345918  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1635  hypothetical protein  44.34 
 
 		 333 aa  275  1.0000000000000001e-72  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.345549  normal  0.902401 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3163  hypothetical protein  45.61 
 
 		 334 aa  273  2.0000000000000002e-72  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000218374 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1912  hypothetical protein  45.78 
 
 		 335 aa  272  4.0000000000000004e-72  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4047  extra-cytoplasmic solute receptor  42.63 
 
 		 329 aa  273  4.0000000000000004e-72  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0364236  normal  0.64466 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5382  extra-cytoplasmic solute receptor  43.12 
 
 		 331 aa  272  6e-72  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.203559  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4385  hypothetical protein  42.72 
 
 		 323 aa  271  9e-72  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.944912  normal  0.325254 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0823  hypothetical protein  40.92 
 
 		 325 aa  271  9e-72  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0213458 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4081  hypothetical protein  46.31 
 
 		 335 aa  270  2.9999999999999997e-71  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0596  hypothetical protein  45.72 
 
 		 336 aa  270  2.9999999999999997e-71  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.642014  normal  1 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5112  hypothetical protein  44.19 
 
 		 325 aa  270  2.9999999999999997e-71  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.386337  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5061  extra-cytoplasmic solute receptor  43.61 
 
 		 335 aa  269  4e-71  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000369607  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3547  hypothetical protein  46.5 
 
 		 330 aa  269  5.9999999999999995e-71  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0842  hypothetical protein  44.11 
 
 		 325 aa  268  7e-71  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5584  hypothetical protein  44.3 
 
 		 337 aa  268  1e-70  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0384253  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1885  hypothetical protein  43.83 
 
 		 323 aa  268  1e-70  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.369065 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3830  hypothetical protein  42.95 
 
 		 330 aa  267  1e-70  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.956859  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0265  hypothetical protein  44.27 
 
 		 323 aa  266  2.9999999999999995e-70  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5035  hypothetical protein  45.1 
 
 		 339 aa  266  2.9999999999999995e-70  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.401942  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4280  hypothetical protein  43.17 
 
 		 333 aa  266  2.9999999999999995e-70  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.711918  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0267  hypothetical protein  45.87 
 
 		 337 aa  266  4e-70  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.717963  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5278  extra-cytoplasmic solute receptor  44.7 
 
 		 331 aa  266  4e-70  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.777708  normal  0.21823 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3985  hypothetical protein  42.28 
 
 		 349 aa  266  4e-70  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.19648  normal  0.0884631 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3178  hypothetical protein  43.26 
 
 		 328 aa  266  5e-70  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000137109 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2444  hypothetical protein  45.85 
 
 		 334 aa  266  5e-70  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4232  extra-cytoplasmic solute receptor  46.08 
 
 		 314 aa  265  5.999999999999999e-70  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.125597  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1815  hypothetical protein  42.77 
 
 		 325 aa  265  5.999999999999999e-70  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00540737  normal  0.0160042 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1906  hypothetical protein  44.1 
 
 		 325 aa  265  7e-70  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.375062  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1161  hypothetical protein  46.44 
 
 		 323 aa  265  1e-69  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.334484  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4610  hypothetical protein  41.43 
 
 		 322 aa  263  2e-69  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0432088  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2113  hypothetical protein  40.45 
 
 		 318 aa  264  2e-69  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.723108  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0231  hypothetical protein  39.06 
 
 		 329 aa  262  4.999999999999999e-69  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0719  hypothetical protein  44.55 
 
 		 326 aa  262  6e-69  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.32495 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4213  extra-cytoplasmic solute receptor  43.22 
 
 		 326 aa  262  6e-69  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0599  hypothetical protein  43.52 
 
 		 325 aa  261  8e-69  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.127348  normal  0.507852 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0909  hypothetical protein  45.39 
 
 		 329 aa  261  8.999999999999999e-69  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3512  hypothetical protein  42.95 
 
 		 334 aa  260  2e-68  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.543672  normal  0.304228 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4279  hypothetical protein  42.62 
 
 		 356 aa  260  2e-68  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.877893  normal  0.56539 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0521  hypothetical protein  47.26 
 
 		 326 aa  261  2e-68  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0895579  normal  0.13289 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2123  hypothetical protein  42.17 
 
 		 326 aa  260  2e-68  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0729826  normal  0.176092 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4876  extra-cytoplasmic solute receptor  44.82 
 
 		 328 aa  259  3e-68  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.748926  normal  0.754985 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3917  extra-cytoplasmic solute receptor  43.81 
 
 		 328 aa  259  3e-68  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.897664 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1041  hypothetical protein  44.48 
 
 		 327 aa  259  4e-68  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1121  hypothetical protein  44.48 
 
 		 325 aa  259  5.0000000000000005e-68  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.237862  normal  0.618143 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4957  hypothetical protein  44.01 
 
 		 331 aa  259  5.0000000000000005e-68  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0102082  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2776  hypothetical protein  41.25 
 
 		 332 aa  259  5.0000000000000005e-68  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.918758  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4821  hypothetical protein  42.72 
 
 		 330 aa  259  6e-68  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5108  extra-cytoplasmic solute receptor  43.24 
 
 		 326 aa  258  7e-68  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000000000351886  normal  0.964391 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3807  hypothetical protein  42.58 
 
 		 341 aa  258  8e-68  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.477496 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5284  hypothetical protein  44.79 
 
 		 330 aa  257  1e-67  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.145464  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5968  hypothetical protein  43.04 
 
 		 344 aa  258  1e-67  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4458  hypothetical protein  41.77 
 
 		 332 aa  258  1e-67  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.60746  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5146  hypothetical protein  40.62 
 
 		 327 aa  258  1e-67  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0987531  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2502  hypothetical protein  44.41 
 
 		 333 aa  258  1e-67  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0326182  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2293  hypothetical protein  43.22 
 
 		 320 aa  258  1e-67  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.000010806  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3703  hypothetical protein  42.95 
 
 		 333 aa  257  2e-67  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1233  hypothetical protein  43.14 
 
 		 326 aa  257  2e-67  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.305229  normal  0.989225 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>