206 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_3744 on replicon NC_007974
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007974  Rmet_3744  flagellar hook-associated protein FlgL  100 
 
 
412 aa  814  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5635  flagellar hook-associated protein FlgL  66.67 
 
 
404 aa  531  1e-149  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24100  flagellar hook-associated protein FlgL  47.33 
 
 
401 aa  361  1e-98  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.184718  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4181  flagellar hook-associated protein FlgL  45.5 
 
 
403 aa  337  2e-91  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1968  flagellar hook-associated protein FlgL  43.06 
 
 
410 aa  335  9e-91  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6360  flagellar hook-associated protein FlgL  41.59 
 
 
413 aa  278  1e-73  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3336  flagellar hook-associated protein FlgL  38.74 
 
 
410 aa  271  1e-71  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0277  flagellar hook-associated protein FlgL  38.74 
 
 
410 aa  271  1e-71  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3009  flagellar hook-associated protein FlgL  40.58 
 
 
411 aa  271  1e-71  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0475  flagellar hook-associated protein FlgL  38.74 
 
 
410 aa  271  1e-71  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3005  flagellar hook-associated protein FlgL  38.74 
 
 
410 aa  271  1e-71  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.659687  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0289  flagellar hook-associated protein FlgL  38.74 
 
 
410 aa  272  1e-71  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2088  flagellar hook-associated protein FlgL  38.74 
 
 
410 aa  271  1e-71  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3343  flagellar hook-associated protein FlgL  38.74 
 
 
410 aa  271  1e-71  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.804576  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2959  flagellar hook-associated protein FlgL  40.34 
 
 
406 aa  271  2e-71  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.146319 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3033  flagellar hook-associated protein FlgL  39.86 
 
 
411 aa  266  4e-70  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0251  flagellar hook-associated protein FlgL  39.47 
 
 
410 aa  266  7e-70  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3059  flagellar hook-associated protein FlgL  39.9 
 
 
413 aa  263  3e-69  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3014  flagellar hook-associated protein FlgL  38.89 
 
 
411 aa  252  9e-66  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00481401  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2400  flagellar hook-associated protein FlgL  38.89 
 
 
411 aa  252  9e-66  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.60868  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2924  flagellar hook-associated protein FlgL  39.66 
 
 
413 aa  250  3e-65  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.777627 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0151  flagellar hook-associated protein FlgL  37.35 
 
 
407 aa  243  4e-63  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.838516 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3783  flagellar hook-associated protein FlgL  37.11 
 
 
407 aa  240  4e-62  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2368  flagellin-like  32.69 
 
 
400 aa  211  2e-53  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1227  flagellar hook-associated protein 3  33.66 
 
 
400 aa  209  8e-53  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.31859  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0903  flagellar hook-associated protein 3  33.96 
 
 
408 aa  202  1e-50  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.432658  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06164  flagellar hook-associated protein FlgL  32.06 
 
 
401 aa  196  4e-49  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.80798  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01002  flagellar hook-associated protein FlgL  32.06 
 
 
401 aa  196  4e-49  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0789594  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1896  flagellar hook-associated protein FlgL  33.09 
 
 
400 aa  193  4e-48  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.664262  normal  0.100262 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4290  flagellar hook-associated protein FlgL  29.93 
 
 
433 aa  187  3e-46  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.399131  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1627  flagellar hook-associated protein FlgL  47.54 
 
 
300 aa  184  2e-45  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.930623 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1234  flagellar hook-associated protein FlgL  30.88 
 
 
411 aa  182  1e-44  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1234  flagellar hook-associated protein FlgL  30.31 
 
 
411 aa  180  4e-44  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1252  flagellar hook-associated protein FlgL  47.89 
 
 
317 aa  177  3e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.724059  normal  0.244786 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1296  flagellar hook-associated protein FlgL  47.89 
 
 
317 aa  177  4e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  4.79805e-05 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2188  flagellar hook-associated protein FlgL  47.89 
 
 
317 aa  177  4e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  1.01663e-05 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2004  flagellar hook-associated protein FlgL  47.89 
 
 
317 aa  177  4e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0025359  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1281  flagellar hook-associated protein FlgL  47.89 
 
 
317 aa  177  4e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.482155  hitchhiker  0.000108184 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50340  flagellar hook-associated protein FlgL  29.75 
 
 
439 aa  176  7e-43  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000457191 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0510  flagellar hook-associated protein 3  30.39 
 
 
420 aa  175  1e-42  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.796621  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2009  flagellar hook-associated protein 3  48.95 
 
 
248 aa  174  2e-42  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2313  flagellar hook-associated protein FlgL  48.95 
 
 
326 aa  174  4e-42  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2415  flagellar hook-associated protein FlgL  48.95 
 
 
326 aa  174  4e-42  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.209645  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1350  flagellar hook-associated protein FlgL  29.74 
 
 
400 aa  172  1e-41  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2563  flagellar hook-associated protein 3  44.95 
 
 
317 aa  168  2e-40  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000663156  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2517  flagellar hook-associated protein FlgL  44.95 
 
 
317 aa  168  2e-40  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0270874  hitchhiker  0.000364234 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1206  flagellar hook-associated protein FlgL  44.95 
 
 
317 aa  168  2e-40  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0066805  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2242  flagellar hook-associated protein FlgL  44.95 
 
 
317 aa  168  2e-40  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0269991  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1206  flagellar hook-associated protein FlgL  44.95 
 
 
317 aa  168  2e-40  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0674951  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01079  flagellar hook-associated protein L  45.96 
 
 
317 aa  167  3e-40  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0213586  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2045  flagellar hook-associated protein FlgL  44.44 
 
 
317 aa  167  4e-40  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0140515  normal  0.0179401 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1462  flagellar hook-associated protein FlgL  44.95 
 
 
317 aa  166  5e-40  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00628542  hitchhiker  4.76574e-07 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2724  flagellar hook-associated protein 3  31.09 
 
 
405 aa  164  2e-39  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  1.13698e-06 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1607  flagellar hook-associated protein FlgL  28.16 
 
 
396 aa  165  2e-39  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.756895  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1112  flagellar hook-associated protein FlgL  28.87 
 
 
410 aa  164  2e-39  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.00867916  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1535  flagellar hook-associated protein 3  44.22 
 
 
312 aa  162  1e-38  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1355  flagellar hook-associated protein FlgL  29.33 
 
 
396 aa  161  2e-38  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3077  flagellar hook-associated protein FlgL  29.61 
 
 
396 aa  161  2e-38  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1313  flagellar hook-associated protein FlgL  28.4 
 
 
400 aa  161  2e-38  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2960  flagellar hook-associated protein 3  45.45 
 
 
319 aa  160  4e-38  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1597  flagellar hook-associated protein FlgL  44.72 
 
 
317 aa  157  5e-37  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2308  flagellar hook-associated protein FlgL  27.91 
 
 
401 aa  156  5e-37  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.24261 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0936  flagellar hook-associated protein 3  29.04 
 
 
416 aa  154  3e-36  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.415465 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02918  flagellar hook-associated protein FlgL  26.67 
 
 
404 aa  153  6e-36  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.432868  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1331  flagellar hook-associated protein FlgL  28.3 
 
 
403 aa  152  2e-35  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.143794  normal  0.0994213 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2587  flagellar hook-associated protein FlgL  28.12 
 
 
403 aa  151  3e-35  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1331  flagellar hook-associated protein FlgL  41.88 
 
 
311 aa  150  5e-35  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.522926  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3239  flagellar hook-associated protein FlgL  29.29 
 
 
403 aa  149  6e-35  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1487  flagellar hook-associated protein FlgL  27.44 
 
 
406 aa  149  8e-35  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.893149  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3090  flagellar hook-associated protein FlgL  26.9 
 
 
408 aa  147  3e-34  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2914  flagellar hook-associated protein FlgL  41.49 
 
 
302 aa  146  6e-34  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.481604  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1171  flagellar hook-associated protein FlgL  27.85 
 
 
401 aa  146  8e-34  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1269  flagellar hook-associated protein FlgL  27.38 
 
 
402 aa  145  1e-33  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1426  flagellar hook-associated protein FlgL  27.64 
 
 
403 aa  144  4e-33  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2588  flagellar hook-associated protein FlgL  42.11 
 
 
317 aa  143  7e-33  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0623  flagellar hook-associated protein 3  28.84 
 
 
399 aa  142  8e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1339  flagellar hook-associated protein FlgL  26.63 
 
 
402 aa  142  1e-32  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3090  flagellar hook-associated protein FlgL  27.4 
 
 
403 aa  142  1e-32  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1878  flagellar hook-associated protein FlgL  42.63 
 
 
318 aa  141  2e-32  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2952  flagellar hook-associated protein FlgL  27.16 
 
 
403 aa  141  3e-32  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2937  flagellar hook-associated protein FlgL  27.16 
 
 
403 aa  140  3e-32  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0559  flagellar hook-associated protein 3  27.52 
 
 
417 aa  140  4e-32  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.981861 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0759  flagellar hook-associated protein FlgL  39.13 
 
 
326 aa  139  7e-32  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.847019  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3063  flagellin-related hook-associated protein  29.12 
 
 
398 aa  137  3e-31  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.154617  normal  0.835037 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1964  flagellar hook-associated protein FlgL  38.71 
 
 
304 aa  134  3e-30  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2840  flagellar hook-associated protein FlgL  39 
 
 
562 aa  132  8e-30  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.878588  normal  0.22747 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2328  flagellar hook-associated protein FlgL  26.46 
 
 
397 aa  132  9e-30  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01298  flagellar hook-associated protein FlgL  25.96 
 
 
396 aa  128  2e-28  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1563  flagellar hook-associated protein 3  40.44 
 
 
309 aa  128  2e-28  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.334101  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004163  flagellar hook-associated protein FlgL  25.06 
 
 
397 aa  124  4e-27  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1782  flagellar hook-associated protein FlgL  24.05 
 
 
397 aa  123  6e-27  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.857694  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2203  flagellin-like protein  26.48 
 
 
532 aa  120  5e-26  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3724  flagellin-like  27.1 
 
 
410 aa  117  5e-25  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0065  flagellar hook-associated protein 3  32.97 
 
 
305 aa  114  5e-24  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4380  flagellar hook-associated protein FlgL  29.84 
 
 
521 aa  113  5e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0059  flagellar hook-associated protein 3  32.97 
 
 
305 aa  108  1e-22  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3721  flagellar hook-associated protein FlgL  35.52 
 
 
524 aa  109  1e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3838  flagellar hook-associated protein 3  25.84 
 
 
420 aa  108  2e-22  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1945  flagellar hook-associated protein FlgL  33.33 
 
 
530 aa  105  1e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0770249  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3111  flagellar hook-associated protein 3  24.77 
 
 
420 aa  104  2e-21  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>