250 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_3736 on replicon NC_007974
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007974  Rmet_3736  flagellar basal body rod modification protein  100 
 
 
222 aa  430  1e-120  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5627  flagellar basal body rod modification protein  81.55 
 
 
226 aa  333  1e-90  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4197  flagellar hook capping protein  45.63 
 
 
228 aa  182  4.0000000000000006e-45  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1555  flagellar basal body rod modification protein  46.15 
 
 
223 aa  172  3.9999999999999995e-42  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.96706  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3712  flagellar hook capping protein  46.7 
 
 
215 aa  171  7.999999999999999e-42  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.395074 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4789  flagellar hook capping protein  46.7 
 
 
215 aa  171  7.999999999999999e-42  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.739847  normal  0.428557 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0751  flagellar hook capping protein  46.15 
 
 
229 aa  165  5.9999999999999996e-40  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.873785  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1870  flagellar basal body rod modification protein  45.23 
 
 
224 aa  163  2.0000000000000002e-39  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1635  flagellar basal body rod modification protein  42.11 
 
 
221 aa  162  3e-39  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.904883  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2968  flagellar basal body rod modification protein  42.21 
 
 
225 aa  162  3e-39  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.127656  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1527  flagellar hook capping protein  43.37 
 
 
225 aa  161  7e-39  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2596  flagellar basal body rod modification protein  45.23 
 
 
224 aa  160  2e-38  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.661244  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1323  flagellar basal body rod modification protein  41.75 
 
 
222 aa  158  5e-38  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0344  basal-body rod modification protein FlgD  45.36 
 
 
221 aa  155  4e-37  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.974182  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1956  flagellar hook capping protein  35.68 
 
 
228 aa  154  7e-37  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1288  flagellar basal body rod modification protein  41.06 
 
 
232 aa  153  2e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.126128  normal  0.0193993 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1273  flagellar basal body rod modification protein  41.06 
 
 
232 aa  153  2e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.41149  normal  0.0170794 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2196  flagellar basal body rod modification protein  41.06 
 
 
232 aa  153  2e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000763375 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1244  flagellar basal body rod modification protein  41.06 
 
 
232 aa  153  2e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.450688  normal  0.238344 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2012  flagellar basal body rod modification protein  41.06 
 
 
232 aa  153  2e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2571  flagellar hook capping protein  42.86 
 
 
231 aa  152  2.9999999999999998e-36  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.67756  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2053  flagellar basal body rod modification protein  41.46 
 
 
231 aa  152  4e-36  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.251185 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2250  flagellar basal body rod modification protein  42.86 
 
 
231 aa  152  4e-36  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2423  flagellar basal body rod modification protein  40.7 
 
 
228 aa  151  8e-36  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.563147  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1198  flagellar basal body rod modification protein  42.36 
 
 
231 aa  151  8e-36  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1454  flagellar basal body rod modification protein  42.36 
 
 
231 aa  151  8e-36  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00192771 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2525  flagellar basal body rod modification protein  42.36 
 
 
231 aa  151  8e-36  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.414017  hitchhiker  0.00818545 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01071  flagellar basal body rod modification protein D  41.87 
 
 
231 aa  150  1e-35  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.600835  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01079  hypothetical protein  41.87 
 
 
231 aa  150  1e-35  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.703206  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2000  flagellar basal body rod modification protein  40.2 
 
 
225 aa  150  2e-35  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2322  flagellar basal body rod modification protein  40.2 
 
 
228 aa  149  2e-35  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1198  flagellar basal body rod modification protein  42.36 
 
 
231 aa  148  6e-35  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1976  flagellar basal body rod modification protein  37.56 
 
 
235 aa  148  7e-35  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24020  flagellar basal body rod modification protein  39.49 
 
 
222 aa  140  9.999999999999999e-33  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0142  flagellar basal body rod modification protein  43.37 
 
 
240 aa  140  9.999999999999999e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.937871 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1589  flagellar basal body rod modification protein  38.54 
 
 
236 aa  139  3e-32  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0242  flagellar basal body rod modification protein  41.2 
 
 
278 aa  137  1e-31  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2950  flagellar basal body rod modification protein  43.15 
 
 
237 aa  136  2e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.427206  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3792  flagellar basal body rod modification protein  41.33 
 
 
240 aa  136  2e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2933  flagellar basal body rod modification protein  42 
 
 
248 aa  136  2e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.766915 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3068  flagellar basal body rod modification protein  42 
 
 
248 aa  137  2e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3018  flagellar basal body rod modification protein  42 
 
 
247 aa  136  3.0000000000000003e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3915  flagellar hook capping protein  44.64 
 
 
221 aa  134  7.000000000000001e-31  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0387265 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2922  flagellar hook capping protein  31.98 
 
 
224 aa  134  8e-31  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0464  flagellar basal body rod modification protein  40.57 
 
 
280 aa  134  9.999999999999999e-31  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6369  flagellar basal body rod modification protein  41.15 
 
 
251 aa  134  9.999999999999999e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.338716  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0268  flagellar basal body rod modification protein  40.57 
 
 
280 aa  134  9.999999999999999e-31  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.501331  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0280  flagellar basal body rod modification protein  40.57 
 
 
280 aa  134  9.999999999999999e-31  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0567  flagellar hook capping protein  37.14 
 
 
236 aa  133  1.9999999999999998e-30  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3327  flagellar basal body rod modification protein  40 
 
 
277 aa  132  5e-30  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2996  flagellar basal body rod modification protein  40 
 
 
277 aa  132  5e-30  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2097  flagellar basal body rod modification protein  40 
 
 
277 aa  132  5e-30  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3352  flagellar basal body rod modification protein  40 
 
 
277 aa  132  5e-30  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2409  flagellar basal body rod modification protein  40.5 
 
 
248 aa  131  9e-30  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.858083  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3023  flagellar basal body rod modification protein  40.5 
 
 
248 aa  131  9e-30  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.112366  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3042  flagellar basal body rod modification protein  44.44 
 
 
248 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4422  flagellar hook capping protein  35 
 
 
216 aa  123  3e-27  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3831  flagellar hook capping protein  40 
 
 
221 aa  121  8e-27  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3829  flagellar hook capping protein  36.32 
 
 
216 aa  121  8e-27  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.383027 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3102  flagellar hook capping protein  36.84 
 
 
216 aa  121  9e-27  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.576147  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1466  flagellar basal body rod modification protein  33.03 
 
 
234 aa  120  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3716  flagellar hook capping protein  37.08 
 
 
223 aa  117  9.999999999999999e-26  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0417  flagellar hook assembly protein FlgD  34.74 
 
 
218 aa  116  1.9999999999999998e-25  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3730  flagellar basal body rod modification protein  31.82 
 
 
235 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.468195  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0782  flagellar hook capping protein  35.27 
 
 
230 aa  116  3e-25  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3479  flagellar basal body rod modification protein  35.08 
 
 
229 aa  115  5e-25  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.205954  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1935  basal-body rod modification protein FlgD  36.94 
 
 
229 aa  114  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3950  flagellar basal body rod modification protein  38.71 
 
 
233 aa  114  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2732  flagellar hook capping protein  35.84 
 
 
224 aa  114  1.0000000000000001e-24  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000455072 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3248  flagellar basal body rod modification protein  33.84 
 
 
253 aa  111  7.000000000000001e-24  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0631  flagellar hook capping protein  39.46 
 
 
220 aa  111  9e-24  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2848  flagellar basal body rod modification protein  31.34 
 
 
221 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.128669 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4249  flagellar basal body rod modification protein  38.82 
 
 
242 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.833484 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1323  flagellar basal body rod modification protein  33.84 
 
 
259 aa  110  2.0000000000000002e-23  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.088062 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4206  flagellar hook capping protein  35.71 
 
 
221 aa  108  7.000000000000001e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3105  flagellar hook capping protein  33.14 
 
 
218 aa  107  1e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1342  flagellar basal body rod modification protein  29.53 
 
 
270 aa  107  1e-22  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1347  flagellar basal body rod modification protein  31.61 
 
 
260 aa  107  1e-22  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.796846  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1599  flagellar basal body rod modification protein  31.61 
 
 
270 aa  107  2e-22  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2376  flagellar hook capping protein  32.67 
 
 
226 aa  107  2e-22  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004171  flagellar basal-body rod modification protein FlgD  31.71 
 
 
236 aa  106  2e-22  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2469  flagellar hook capping protein  35.84 
 
 
225 aa  106  3e-22  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.144549  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4298  flagellar basal body rod modification protein  34.87 
 
 
227 aa  106  3e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1388  flagellar hook capping protein  35.84 
 
 
225 aa  106  3e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0334116  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0928  flagellar hook capping protein  31.47 
 
 
223 aa  106  3e-22  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1219  flagellar hook capping protein  31.46 
 
 
226 aa  106  3e-22  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.248011  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0576  flagellar hook capping protein  35.11 
 
 
227 aa  106  3e-22  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2565  flagellar hook capping protein  35.84 
 
 
225 aa  105  4e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0763244  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50460  flagellar basal body rod modification protein  34.87 
 
 
237 aa  105  4e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.021036 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3085  flagellar basal body rod modification protein  31.09 
 
 
282 aa  105  7e-22  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1790  flagellar basal body rod modification protein  31.08 
 
 
235 aa  104  1e-21  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1269  flagellar hook capping protein  33.95 
 
 
226 aa  104  1e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.271153  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3071  flagellar hook capping protein  36.11 
 
 
217 aa  104  1e-21  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.113202 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2336  flagellar basal body rod modification protein  31.05 
 
 
236 aa  103  2e-21  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4389  flagellar basal body rod modification protein  35.62 
 
 
233 aa  102  4e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.459754  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1904  flagellar basal body rod modification protein  32.99 
 
 
227 aa  102  4e-21  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.141438 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1261  flagellar basal body rod modification protein  31.63 
 
 
256 aa  102  4e-21  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2960  flagellar basal body rod modification protein  31.12 
 
 
256 aa  102  6e-21  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.198197  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3098  flagellar basal body rod modification protein  31.12 
 
 
256 aa  102  6e-21  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1185  flagellar hook initiation protein FlgD  32.58 
 
 
218 aa  102  7e-21  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>