175 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_3580 on replicon NC_007973
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007973  Rmet_3580  MOSC domain-containing protein  100 
 
 
218 aa  440  1e-123  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.482482  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3423  MOSC  59.31 
 
 
212 aa  240  9e-63  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7096  MOSC domain-containing protein  51.58 
 
 
222 aa  201  8e-51  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4375  MOSC domain-containing protein  50 
 
 
191 aa  171  9e-42  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.480561 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3716  hypothetical protein  50.53 
 
 
197 aa  166  2e-40  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1848  MOSC domain-containing protein  44.61 
 
 
203 aa  165  5e-40  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0110  MOSC domain-containing protein  46.32 
 
 
192 aa  158  5e-38  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.721008  normal  0.0279097 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3596  MOSC domain containing protein  41.57 
 
 
211 aa  123  3e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.564722  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0651  hypothetical protein  40.56 
 
 
233 aa  114  1.0000000000000001e-24  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4660  MOSC domain containing protein  42.63 
 
 
220 aa  107  1e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.287736 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3230  MOSC domain containing protein  30.46 
 
 
222 aa  107  1e-22  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4291  MOSC domain-containing protein  40.21 
 
 
235 aa  107  2e-22  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1157  hypothetical protein  42.04 
 
 
241 aa  105  6e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.192207 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1839  3-alpha:MOSC  38.61 
 
 
241 aa  105  6e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5027  MOSC domain-containing protein  36.65 
 
 
233 aa  102  3e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.351151  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2807  MOSC domain containing protein  39.56 
 
 
549 aa  102  4e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4809  MOSC domain containing protein  40.31 
 
 
227 aa  102  4e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.495896  normal  0.359001 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2108  MOSC domain-containing protein  38.27 
 
 
228 aa  102  6e-21  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1580  MOSC domain-containing protein  38.31 
 
 
235 aa  99.4  3e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000909232  normal  0.645323 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4419  MOSC domain containing protein  38.92 
 
 
229 aa  99  5e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.326918  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4456  MOSC domain-containing protein  35.47 
 
 
250 aa  99  5e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.267556  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00092  mosc domain protein  34.9 
 
 
237 aa  98.6  6e-20  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0997  MOSC domain containing protein  39.24 
 
 
234 aa  98.6  7e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.265579  normal  0.156654 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2442  MOSC domain-containing protein  35.84 
 
 
211 aa  98.2  9e-20  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  decreased coverage  0.000472936  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0313  MOSC domain containing protein  35.68 
 
 
212 aa  98.2  9e-20  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1921  MOSC domain-containing protein  36.98 
 
 
226 aa  97.8  1e-19  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.919687  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0572  MOSC domain-containing protein  39.49 
 
 
226 aa  97.8  1e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0963  MOSC domain-containing protein  29.17 
 
 
221 aa  95.9  4e-19  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2166  MOSC domain containing protein  30.77 
 
 
212 aa  95.5  6e-19  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00996581  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1093  MOSC domain containing protein  38.22 
 
 
234 aa  95.5  6e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.846076 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5316  MOSC domain containing protein  35.52 
 
 
232 aa  95.1  7e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00687382  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4906  MOSC domain-containing protein  33.55 
 
 
227 aa  94.4  1e-18  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0191  MOSC domain-containing protein  37.24 
 
 
242 aa  94  1e-18  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4406  MOSC domain-containing protein  38.24 
 
 
232 aa  94  1e-18  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.0712401 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1147  MOSC domain-containing protein  36.46 
 
 
208 aa  94  2e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0079  MOSC family protein  37.14 
 
 
235 aa  93.2  3e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0138915  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1774  MOSC domain-containing protein  32.43 
 
 
209 aa  93.2  3e-18  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.000110547  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1138  MOSC domain-containing protein  39.05 
 
 
234 aa  93.2  3e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1855  mosc domain-containing protein  35.04 
 
 
229 aa  93.2  3e-18  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3061  MOSC domain-containing protein  34.95 
 
 
243 aa  92  6e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.068485  normal  0.778276 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2475  MOSC domain containing protein  32.58 
 
 
215 aa  92  6e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1436  MOSC domain-containing protein  36.55 
 
 
226 aa  91.3  9e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.685858  normal  0.697669 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4616  MOSC domain-containing protein  37.36 
 
 
234 aa  91.3  1e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.111886  hitchhiker  0.00165938 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1986  MOSC domain-containing protein  39.26 
 
 
212 aa  91.3  1e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.963912 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2441  MOSC domain containing protein  41.08 
 
 
229 aa  91.3  1e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.12104  normal  0.12202 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2076  hypothetical protein  32.61 
 
 
228 aa  90.9  1e-17  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5247  MOSC domain-containing protein  36.93 
 
 
234 aa  90.9  1e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5612  MOSC domain-containing protein  36.93 
 
 
234 aa  90.9  1e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.882843  normal  0.283548 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2352  MOSC domain containing protein  36.9 
 
 
216 aa  90.9  1e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0210  MOSC domain containing protein  34.8 
 
 
242 aa  90.1  2e-17  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.261785  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001034  hypothetical protein  33.15 
 
 
230 aa  89.4  4e-17  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.907247  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1485  hypothetical protein  34.84 
 
 
232 aa  89.4  4e-17  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0104541  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1502  mosc domain-containing protein  29.67 
 
 
221 aa  89.4  4e-17  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0155  hypothetical protein  34.3 
 
 
205 aa  88.6  6e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5365  hypothetical protein  36.17 
 
 
224 aa  88.6  7e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.326759  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4643  MOSC domain-containing protein  35.98 
 
 
218 aa  88.6  7e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.300911  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5441  MOSC domain-containing protein  36.63 
 
 
234 aa  88.2  8e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.165299  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4123  MOSC domain-containing protein  36.05 
 
 
232 aa  88.2  9e-17  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03796  hypothetical protein  36.17 
 
 
224 aa  87.8  1e-16  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.181991  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4074  MOSC domain containing protein  36.17 
 
 
224 aa  87.8  1e-16  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2660  MOSC ferredoxin--oxidoreductase  35.14 
 
 
581 aa  87.8  1e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.841081  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03745  hypothetical protein  36.17 
 
 
224 aa  87.8  1e-16  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.200423  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4303  hypothetical protein  35.92 
 
 
224 aa  87.8  1e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.445001  hitchhiker  0.00595644 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3049  MOSC domain-containing protein  38.3 
 
 
217 aa  87.4  1e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.309272  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4390  hypothetical protein  36.17 
 
 
224 aa  87.4  1e-16  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4107  hypothetical protein  36.17 
 
 
224 aa  87.8  1e-16  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6438  MOSC domain containing protein  30.5 
 
 
586 aa  88.2  1e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4141  hypothetical protein  36.17 
 
 
224 aa  87.8  1e-16  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2753  MOSC domain containing protein  37.27 
 
 
218 aa  87.4  2e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00265011 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0846  MOSC domain-containing protein  34.05 
 
 
214 aa  86.7  2e-16  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.201546  normal  0.0737228 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4212  MOSC domain-containing protein  33.33 
 
 
218 aa  86.7  3e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3024  mosc domain-containing protein  39.29 
 
 
239 aa  86.3  3e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.076191  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2884  MOSC domain containing protein  39.18 
 
 
181 aa  85.9  4e-16  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.211052  normal  0.150346 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0802  MOSC domain-containing protein  33.33 
 
 
235 aa  85.9  4e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0280  MOSC domain-containing protein  34.27 
 
 
229 aa  85.9  4e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.077384  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3657  MOSC domain containing protein  36.71 
 
 
221 aa  85.9  4e-16  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2577  MOSC domain containing protein  37.41 
 
 
220 aa  85.9  4e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4797  MOSC domain-containing protein  36.92 
 
 
232 aa  85.5  6e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00107513 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1617  MOSC domain containing protein  34.22 
 
 
218 aa  85.5  6e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.891186  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0273  MOSC domain-containing protein  33.57 
 
 
231 aa  85.5  6e-16  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0281  MOSC domain-containing protein  33.57 
 
 
231 aa  85.5  6e-16  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4891  MOSC domain-containing protein  36.05 
 
 
234 aa  85.1  7e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.0553056 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0277  MOSC domain containing protein  33.57 
 
 
237 aa  85.1  7e-16  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5783  MOSC domain-containing protein  37.5 
 
 
215 aa  85.1  7e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0998  MOSC domain-containing protein  35.33 
 
 
229 aa  85.1  7e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.759805  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4444  hypothetical protein  36.17 
 
 
224 aa  85.1  7e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3658  MOSC domain containing protein  35.56 
 
 
217 aa  85.1  7e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.192632 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3877  MOSC  35.54 
 
 
224 aa  84.7  9e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.913671  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0548  MOSC  35.95 
 
 
230 aa  84.3  0.000000000000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1701  MOSC domain-containing protein  40 
 
 
219 aa  84.3  0.000000000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0083  MOSC domain-containing protein  37.06 
 
 
230 aa  84.3  0.000000000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0145195  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0385  MOSC domain-containing protein  34.27 
 
 
231 aa  84  0.000000000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1959  MOSC domain-containing protein  37.06 
 
 
229 aa  83.2  0.000000000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0955  MOSC domain-containing protein  37.06 
 
 
229 aa  83.2  0.000000000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0870  MOSC domain-containing protein  37.06 
 
 
229 aa  83.2  0.000000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0278  MOSC domain-containing protein  37.06 
 
 
229 aa  83.2  0.000000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0356222  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1159  MOSC domain-containing protein  37.06 
 
 
229 aa  82.8  0.000000000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0269  MOSC domain-containing protein  34.06 
 
 
231 aa  82.4  0.000000000000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.480151  hitchhiker  0.0000407513 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0270  MOSC domain-containing protein  34.06 
 
 
231 aa  82.4  0.000000000000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.112146  hitchhiker  0.00000109327 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3520  hypothetical protein  37.31 
 
 
229 aa  82.8  0.000000000000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.344482  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>