More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_3560 on replicon NC_007973
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010551  BamMC406_3059  multi-sensor signal transduction histidine kinase  66.47 
 
 		 800 aa  653    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.510583  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0315  multi-sensor signal transduction histidine kinase  67.12 
 
 		 800 aa  656    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0041  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  57.64 
 
 		 803 aa  826    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0077  two component sensor histidine kinase transcription regulator protein  69.63 
 
 		 811 aa  1107    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.000219775  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3137  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  56.62 
 
 		 804 aa  820    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.428024 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0148  nitrogen regulation protein NtrY, putative  66.8 
 
 		 806 aa  657    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.155051  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3403  multi-sensor signal transduction histidine kinase  88.21 
 
 		 812 aa  1406    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0352  sensor kinase protein  66.8 
 
 		 787 aa  657    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.452742  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0157  sensor histidine kinase  66.8 
 
 		 802 aa  657    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.278492  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6472  multi-sensor signal transduction histidine kinase  56.85 
 
 		 804 aa  823    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_2075  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  45.54 
 
 		 770 aa  663    Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2281  putative nitrogen regulation protein NtrY  66.8 
 
 		 802 aa  657    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0640916  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3672  multi-sensor signal transduction histidine kinase  69.59 
 
 		 823 aa  1115    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0134  nitrogen regulation protein NtrY, putative  66.02 
 
 		 787 aa  652    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.822432  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3118  multi-sensor signal transduction histidine kinase  66.67 
 
 		 817 aa  659    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.728829  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4410  multi-sensor Signal transduction histidine kinase  57.36 
 
 		 800 aa  811    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3349  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  69.59 
 
 		 823 aa  1125    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3560  multi-sensor signal transduction histidine kinase  100 
 
 		 827 aa  1668    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2799  putative nitrogen regulation protein NtrY  66.8 
 
 		 802 aa  657    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2359  putative nitrogen regulation protein NtrY  66.8 
 
 		 802 aa  657    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.252159  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2507  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  56.62 
 
 		 804 aa  820    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.537383  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3176  multi-sensor signal transduction histidine kinase  66.47 
 
 		 804 aa  655    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3121  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  56.62 
 
 		 804 aa  820    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.655307  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0167  sensor histidine kinase  66.8 
 
 		 802 aa  657    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.211147  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3630  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  47.16 
 
 		 765 aa  626  1e-178  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.153032 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0274  multi-sensor signal transduction histidine kinase  47.51 
 
 		 781 aa  623  1e-177  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.276593  decreased coverage  0.00464659 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4001  histidine kinase  44.77 
 
 		 774 aa  598  1e-169  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000232996 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0030  multi-sensor signal transduction histidine kinase  45.41 
 
 		 718 aa  581  1e-164  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.838483 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0515  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  41.96 
 
 		 780 aa  570  1e-161  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.168108 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1773  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  53.56 
 
 		 764 aa  528  1e-148  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.866376 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3241  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  51.46 
 
 		 762 aa  487  1e-136  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.235789  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3892  multi-sensor signal transduction histidine kinase  51.46 
 
 		 762 aa  487  1e-136  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.820879 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2268  multi-sensor signal transduction histidine kinase  52.86 
 
 		 764 aa  486  1e-136  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4434  multi-sensor signal transduction histidine kinase  52.08 
 
 		 765 aa  487  1e-136  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.341187  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0593  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  51.68 
 
 		 776 aa  483  1e-135  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.729726  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3588  multi-sensor signal transduction histidine kinase  50.59 
 
 		 775 aa  461  9.999999999999999e-129  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0529984  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4526  multi-sensor signal transduction histidine kinase  46.98 
 
 		 772 aa  462  9.999999999999999e-129  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4084  histidine kinase  49.8 
 
 		 705 aa  412  1e-113  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0018  multi-sensor Signal transduction histidine kinase  47.13 
 
 		 710 aa  392  1e-107  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.2698 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0390  multi-sensor signal transduction histidine kinase  46.64 
 
 		 744 aa  382  1e-104  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0182  multi-sensor signal transduction histidine kinase  43.59 
 
 		 708 aa  376  1e-102  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000583847 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2624  multi-sensor signal transduction histidine kinase  42.55 
 
 		 729 aa  342  1e-92  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.608847  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0189  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  31.13 
 
 		 725 aa  342  2e-92  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2269  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  39.43 
 
 		 736 aa  332  2e-89  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00414095 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2847  nitrogen regulation protein NtrY, putative  39.71 
 
 		 734 aa  315  2.9999999999999996e-84  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0199  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  40.56 
 
 		 734 aa  312  1e-83  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.779269  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3018  Signal transduction histidine kinase, NtrY  41.74 
 
 		 712 aa  311  2e-83  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0023  nitrogen regulation protein NtrY, putative  40.16 
 
 		 710 aa  284  4.0000000000000003e-75  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.736908  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0024  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  40.16 
 
 		 736 aa  284  5.000000000000001e-75  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.10248 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2081  multi-sensor signal transduction histidine kinase  37.4 
 
 		 816 aa  270  1e-70  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0812  nitrogen regulation protein NtrY, putative  34.81 
 
 		 748 aa  248  3e-64  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.439119  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0744  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  35.71 
 
 		 756 aa  248  3e-64  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.857607  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0484  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.09 
 
 		 754 aa  243  1e-62  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.187529  normal  0.0210363 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0777  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  33.94 
 
 		 748 aa  240  9e-62  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3361  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  34.32 
 
 		 756 aa  238  3e-61  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0436  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.49 
 
 		 733 aa  237  6e-61  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.589571  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0900  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.11 
 
 		 756 aa  234  5e-60  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.361287  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1933  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.89 
 
 		 741 aa  234  5e-60  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.820438  normal  0.142567 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1376  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.4 
 
 		 737 aa  232  2e-59  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.00550904  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0547  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  32.55 
 
 		 731 aa  231  3e-59  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1374  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.3 
 
 		 746 aa  231  6e-59  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.131978  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1360  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.54 
 
 		 759 aa  229  1e-58  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0709  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.16 
 
 		 738 aa  228  4e-58  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.0000623284  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3000  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.27 
 
 		 733 aa  227  6e-58  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1573  histidine kinase  36.07 
 
 		 767 aa  226  1e-57  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0740881  normal  0.0763149 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2344  two component signal transduction histidine kinase  32.58 
 
 		 752 aa  226  1e-57  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000619377  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2239  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.64 
 
 		 756 aa  226  2e-57  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.292158  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1834  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  32.93 
 
 		 736 aa  223  9.999999999999999e-57  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.273222  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1489  multi-sensor signal transduction histidine kinase  36.96 
 
 		 753 aa  220  7e-56  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.726921  normal  0.706753 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0249  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.28 
 
 		 768 aa  220  7.999999999999999e-56  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.513538  normal  0.0270747 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4071  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.96 
 
 		 784 aa  219  1e-55  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.714466 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1455  multi-sensor signal transduction histidine kinase  36.23 
 
 		 753 aa  219  2e-55  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.205006  normal  0.134875 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2591  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.08 
 
 		 762 aa  219  2e-55  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.682378  normal  0.0198144 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2136  two component sensor kinase  30.15 
 
 		 759 aa  219  2e-55  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.132627  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2035  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.4 
 
 		 740 aa  219  2e-55  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2738  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  30.8 
 
 		 749 aa  218  4e-55  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.789248  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2839  nitrogen regulation protein, NtrY, Signal transduction histidine kinase  36.64 
 
 		 769 aa  216  9.999999999999999e-55  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2940  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.73 
 
 		 799 aa  216  9.999999999999999e-55  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3128  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.63 
 
 		 779 aa  215  1.9999999999999998e-54  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.865325  normal  0.321459 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6542  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  31.33 
 
 		 753 aa  215  1.9999999999999998e-54  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1091  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.71 
 
 		 757 aa  214  3.9999999999999995e-54  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.414611  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1679  multi-sensor Signal transduction histidine kinase  32.75 
 
 		 760 aa  214  5.999999999999999e-54  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.859765  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2864  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.29 
 
 		 763 aa  213  7.999999999999999e-54  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4128  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.88 
 
 		 752 aa  213  2e-53  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.43986 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2579  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.23 
 
 		 761 aa  212  2e-53  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.838184  normal  0.345494 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5940  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.97 
 
 		 779 aa  211  5e-53  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.363869 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1520  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.58 
 
 		 757 aa  209  1e-52  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.203555  normal  0.0623449 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3049  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  32.54 
 
 		 799 aa  209  1e-52  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.70723  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2822  PAS sensor protein  32.33 
 
 		 799 aa  208  3e-52  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.354635 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1838  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.56 
 
 		 764 aa  207  9e-52  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1446  nitrogen regulatory signal transduction histidine kinase NtrY  30.49 
 
 		 766 aa  206  1e-51  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.263583  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2881  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.29 
 
 		 762 aa  206  1e-51  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0943385  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1491  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.88 
 
 		 814 aa  206  2e-51  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0430544 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0530  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.78 
 
 		 755 aa  205  3e-51  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1116  nitrogen regulation protein NtrY  29.92 
 
 		 774 aa  204  4e-51  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1074  nitrogen regulation protein NtrY  29.73 
 
 		 774 aa  203  9e-51  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  decreased coverage  0.000929955  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0299  putative nitrogen regulation protein NtrY  31.98 
 
 		 714 aa  203  9.999999999999999e-51  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.333561  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1458  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.56 
 
 		 845 aa  202  1.9999999999999998e-50  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.468501 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1929  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  31.24 
 
 		 742 aa  201  5e-50  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0542  nitrogen regulation protein NtrY  31.26 
 
 		 742 aa  200  7.999999999999999e-50  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0128365  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>