More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_3546 on replicon NC_007973
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007973  Rmet_3546  major facilitator transporter  100 
 
 		 398 aa  777    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3805  major facilitator transporter  74.81 
 
 		 408 aa  484  1e-135  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38000  MFS permease  63.8 
 
 		 401 aa  438  9.999999999999999e-123  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1223  major facilitator transporter  54.47 
 
 		 393 aa  416  9.999999999999999e-116  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3062  transporter  60.21 
 
 		 389 aa  414  1e-114  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0534836  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3302  transporter  60.21 
 
 		 389 aa  414  1e-114  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2509  major facilitator superfamily MFS_1  59.24 
 
 		 402 aa  414  1e-114  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2763  major facilitator superfamily MFS_1  58.91 
 
 		 402 aa  391  1e-107  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.689815  normal  0.779689 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2790  MFS permease  57.61 
 
 		 406 aa  386  1e-106  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.68726  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3754  major facilitator transporter  56.73 
 
 		 407 aa  380  1e-104  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.503769  normal  0.0279175 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7383  major facilitator superfamily (MSF) transporter  58.18 
 
 		 396 aa  374  1e-102  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1033  major facilitator superfamily transporter  58.44 
 
 		 413 aa  354  1e-96  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.854206  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5605  major facilitator transporter  51.33 
 
 		 405 aa  344  1e-93  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.919705 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5822  major facilitator transporter  51.33 
 
 		 405 aa  344  1e-93  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7020  major facilitator transporter  51.47 
 
 		 405 aa  343  2.9999999999999997e-93  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.303658  normal  0.0738208 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1474  major facilitator transporter  51.21 
 
 		 405 aa  342  8e-93  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  decreased coverage  0.00116593  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6354  major facilitator transporter  51.21 
 
 		 405 aa  342  8e-93  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.623556  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4954  major facilitator transporter  49.86 
 
 		 405 aa  331  1e-89  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.960972  normal  0.410728 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5762  major facilitator transporter  49.87 
 
 		 404 aa  327  3e-88  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2393  major facilitator superfamily drug efflux transporter  49.6 
 
 		 404 aa  327  3e-88  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.988182  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1589  major facilitator transporter  50.94 
 
 		 395 aa  325  6e-88  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.24766  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3304  major facilitator family transporter  50.14 
 
 		 398 aa  321  9.999999999999999e-87  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3138  major facilitator transporter  50.42 
 
 		 398 aa  316  4e-85  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.82105 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1438  major facilitator superfamily MFS_1  49.21 
 
 		 447 aa  311  1e-83  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0684  major facilitator family transporter  47.62 
 
 		 400 aa  306  3e-82  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.837842  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1982  major facilitator family transporter  47.62 
 
 		 400 aa  306  5.0000000000000004e-82  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.21038  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0591  major facilitator family transporter  47.62 
 
 		 400 aa  306  5.0000000000000004e-82  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5502  major facilitator superfamily MFS_1  51.18 
 
 		 388 aa  303  5.000000000000001e-81  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0812471  normal  0.0619637 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3344  bicyclomycin resistance protein  39.25 
 
 		 392 aa  276  5e-73  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0949  transporter  39.68 
 
 		 406 aa  275  7e-73  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.800881  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1014  transporter  39.68 
 
 		 406 aa  275  7e-73  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.32709  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1182  putative transporter  39.68 
 
 		 403 aa  274  2.0000000000000002e-72  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000458101  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2355  major facilitator transporter  50.4 
 
 		 399 aa  273  3e-72  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.235883  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03770  major facilitator family (MFS) transporter  48.21 
 
 		 401 aa  270  2.9999999999999997e-71  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0912  major facilitator transporter  47.86 
 
 		 405 aa  270  4e-71  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.973164  normal  0.300944 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2208  major facilitator transporter  49.36 
 
 		 399 aa  263  4e-69  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3566  major facilitator family transporter  49.1 
 
 		 399 aa  262  8.999999999999999e-69  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0643  major facilitator transporter  41.34 
 
 		 385 aa  260  2e-68  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0160  major facilitator transporter  41.34 
 
 		 399 aa  260  3e-68  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0610  major facilitator transporter  41.34 
 
 		 399 aa  258  9e-68  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0971506  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5649  major facilitator transporter  47.71 
 
 		 400 aa  258  2e-67  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0871  major facilitator transporter  41.98 
 
 		 416 aa  257  3e-67  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3729  major facilitator transporter  41.34 
 
 		 399 aa  252  1e-65  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.487409  normal  0.452524 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0630  major facilitator transporter  51.41 
 
 		 409 aa  251  2e-65  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0823424  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2479  major facilitator transporter  50.66 
 
 		 402 aa  249  4e-65  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.469359 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2449  major facilitator transporter  48.19 
 
 		 399 aa  249  5e-65  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2743  major facilitator transporter  41.34 
 
 		 399 aa  246  6e-64  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0608632  normal  0.943249 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2654  major facilitator superfamily MFS_1  42.66 
 
 		 399 aa  239  6.999999999999999e-62  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.400382  normal  0.458588 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3334  major facilitator transporter  41.24 
 
 		 399 aa  239  9e-62  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3197  major facilitator transporter  41.24 
 
 		 399 aa  239  9e-62  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3455  major facilitator transporter  41.24 
 
 		 399 aa  239  9e-62  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1242  major facilitator transporter  42.13 
 
 		 433 aa  238  2e-61  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1462  major facilitator transporter  42.33 
 
 		 400 aa  236  5.0000000000000005e-61  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.22661 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1506  major facilitator transporter  40.77 
 
 		 404 aa  235  1.0000000000000001e-60  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2190  major facilitator transporter  35.77 
 
 		 394 aa  228  1e-58  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.637684  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1704  major facilitator transporter  41.22 
 
 		 426 aa  228  2e-58  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.136946  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2415  major facilitator transporter  42.25 
 
 		 415 aa  226  4e-58  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0245324  normal  0.166892 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0970  major facilitator transporter  39.31 
 
 		 395 aa  225  1e-57  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.586357 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3161  major facilitator transporter  41.41 
 
 		 394 aa  224  1e-57  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2079  major facilitator transporter  44.23 
 
 		 399 aa  224  2e-57  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.154057  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3120  major facilitator family transporter  41.9 
 
 		 422 aa  224  3e-57  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00127728  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5771  major facilitator superfamily MFS_1  49.3 
 
 		 413 aa  222  7e-57  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.926843 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3303  major facilitator superfamily MFS_1  43.09 
 
 		 419 aa  221  9.999999999999999e-57  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.00459923  normal  0.0115406 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02536  predicted transporter  40 
 
 		 394 aa  220  3.9999999999999997e-56  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1026  major facilitator transporter  40 
 
 		 394 aa  220  3.9999999999999997e-56  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.164339 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2817  major facilitator family transporter  40 
 
 		 394 aa  220  3.9999999999999997e-56  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3925  major facilitator family transporter  40 
 
 		 394 aa  219  5e-56  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.51646 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3326  major facilitator superfamily MFS_1  40.5 
 
 		 406 aa  219  7.999999999999999e-56  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2964  major facilitator family transporter  39.72 
 
 		 394 aa  219  8.999999999999998e-56  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2956  major facilitator superfamily MFS_1  42.66 
 
 		 419 aa  219  8.999999999999998e-56  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.127266  hitchhiker  0.000719262 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2274  major facilitator superfamily transporter  39.79 
 
 		 411 aa  216  5.9999999999999996e-55  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.670451  hitchhiker  0.000000383306 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3482  major facilitator superfamily MFS_1  41.23 
 
 		 406 aa  216  5.9999999999999996e-55  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3162  major facilitator superfamily MFS_1  39.94 
 
 		 397 aa  215  9.999999999999999e-55  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6119  major facilitator superfamily MFS_1  34.71 
 
 		 413 aa  214  1.9999999999999998e-54  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3408  major facilitator transporter  42.11 
 
 		 431 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.0000015695  normal  0.276957 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0257  major facilitator superfamily MFS_1  43.38 
 
 		 403 aa  214  2.9999999999999995e-54  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.209561  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0548  major facilitator transporter  38.36 
 
 		 401 aa  213  3.9999999999999995e-54  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0024  major facilitator transporter  40.71 
 
 		 383 aa  213  3.9999999999999995e-54  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0151304 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0212  major facilitator transporter  43.82 
 
 		 427 aa  213  3.9999999999999995e-54  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.000448649  unclonable  0.0000000000115228 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1197  major facilitator family transporter  40.29 
 
 		 399 aa  212  7e-54  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0289  major facilitator transporter  44.99 
 
 		 427 aa  212  7.999999999999999e-54  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000369004  unclonable  0.0000000000514998 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3539  major facilitator superfamily MFS_1  38.9 
 
 		 415 aa  212  1e-53  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2797  major facilitator transporter  44.72 
 
 		 427 aa  211  1e-53  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.0004999  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0309  major facilitator transporter  44.72 
 
 		 427 aa  211  1e-53  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.0000378785  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1860  major facilitator transporter  35.64 
 
 		 403 aa  211  2e-53  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.00000002484  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2803  major facilitator family transporter  40 
 
 		 394 aa  210  3e-53  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.188499  normal  0.0180883 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0538  major facilitator transporter  38.68 
 
 		 401 aa  211  3e-53  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.925567 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7086  major facilitator transporter  39.19 
 
 		 390 aa  210  4e-53  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0503  major facilitator family transporter  39.21 
 
 		 401 aa  209  5e-53  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.766631  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0862  major facilitator superfamily MFS_1  39.06 
 
 		 399 aa  209  9e-53  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1473  major facilitator transporter  38.44 
 
 		 389 aa  209  9e-53  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3465  MFS transporter  40.59 
 
 		 405 aa  207  2e-52  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2929  major facilitator family transporter  40.56 
 
 		 394 aa  207  2e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3012  major facilitator family transporter  40.56 
 
 		 394 aa  207  2e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00472083 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2995  major facilitator family transporter  40.56 
 
 		 394 aa  207  2e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00244716 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3428  major facilitator family transporter  40.59 
 
 		 399 aa  207  2e-52  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3118  major facilitator family protein  40.56 
 
 		 394 aa  207  2e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.126701 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0894  major facilitator superfamily MFS_1  41.01 
 
 		 399 aa  207  2e-52  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0703604  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3082  major facilitator family transporter  42.82 
 
 		 398 aa  207  3e-52  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1404  major facilitator family transporter  42.54 
 
 		 398 aa  207  3e-52  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>