More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_3532 on replicon NC_007973
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007973  Rmet_3532  AsnC family transcriptional regulator  100 
 
 		 159 aa  318  1.9999999999999998e-86  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3386  AsnC family transcriptional regulator  93.51 
 
 		 157 aa  286  7e-77  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.227667  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3354  transcription regulator protein  77.78 
 
 		 158 aa  244  3e-64  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3548  transcriptional regulator, AsnC family  77.78 
 
 		 158 aa  243  6.999999999999999e-64  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.621561 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3224  transcriptional regulator, AsnC family  76.6 
 
 		 158 aa  224  5.0000000000000005e-58  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3336  AsnC family transcriptional regulator  66.23 
 
 		 163 aa  208  3e-53  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3054  AsnC family transcriptional regulator  65.58 
 
 		 163 aa  208  3e-53  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3382  AsnC family transcriptional regulator  66.23 
 
 		 181 aa  207  7e-53  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2928  AsnC family transcriptional regulator  66.23 
 
 		 181 aa  207  7e-53  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0205  AsnC family transcriptional regulator  66.23 
 
 		 181 aa  207  7e-53  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2987  AsnC family transcriptional regulator  66.23 
 
 		 181 aa  207  7e-53  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_4074  AsnC family transcriptional regulator  66.23 
 
 		 163 aa  206  8e-53  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.609142  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_4000  AsnC family transcriptional regulator  66.23 
 
 		 163 aa  206  8e-53  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1615  AsnC family transcriptional regulator  66.23 
 
 		 163 aa  206  8e-53  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0012  AsnC family transcriptional regulator  65.58 
 
 		 168 aa  206  1e-52  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0078  AsnC family transcriptional regulator  65.58 
 
 		 161 aa  205  2e-52  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.746042  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3260  AsnC family transcriptional regulator  65.58 
 
 		 161 aa  205  2e-52  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.432237 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0079  AsnC family transcriptional regulator  65.58 
 
 		 161 aa  205  2e-52  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.123654  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3920  transcriptional regulator, AsnC family  65.58 
 
 		 163 aa  205  2e-52  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.31326  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0097  AsnC family transcriptional regulator  65.58 
 
 		 161 aa  205  2e-52  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2976  AsnC family transcriptional regulator  65.58 
 
 		 161 aa  205  2e-52  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0079  AsnC family transcriptional regulator  65.58 
 
 		 161 aa  205  2e-52  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0070  AsnC family transcriptional regulator  65.58 
 
 		 161 aa  205  2e-52  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0100  transcriptional regulator, AsnC family  48.1 
 
 		 173 aa  145  3e-34  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0006  transcriptional regulator, AsnC family  50 
 
 		 159 aa  143  1e-33  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0569  AsnC family transcriptional regulator  46.41 
 
 		 159 aa  133  9e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.933873  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1447  transcriptional regulator, AsnC family  45.7 
 
 		 161 aa  132  9.999999999999999e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.190932  normal  0.829418 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2835  AsnC family transcriptional regulator  46.67 
 
 		 172 aa  126  1.0000000000000001e-28  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.242458  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2213  regulatory proteins, AsnC/Lrp  45.7 
 
 		 153 aa  126  1.0000000000000001e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.214008  normal  0.442221 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4773  transcriptional regulator, AsnC family  44.08 
 
 		 155 aa  126  1.0000000000000001e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0213128  hitchhiker  0.0021999 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1074  AsnC family transcriptional regulator  41.29 
 
 		 157 aa  126  1.0000000000000001e-28  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.405104  hitchhiker  0.000029673 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5282  AsnC family transcriptional regulator  46.36 
 
 		 154 aa  125  2.0000000000000002e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.451768  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1172  regulatory proteins, AsnC/Lrp  38.85 
 
 		 159 aa  125  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.793215 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2309  AsnC family transcriptional regulator  45.33 
 
 		 157 aa  125  2.0000000000000002e-28  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00293447 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3252  AsnC family transcriptional regulator  45.7 
 
 		 153 aa  125  2.0000000000000002e-28  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4986  AsnC family transcriptional regulator  46.36 
 
 		 154 aa  125  2.0000000000000002e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3085  AsnC family transcriptional regulator  46.36 
 
 		 154 aa  125  2.0000000000000002e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5672  AsnC family transcriptional regulator  45.1 
 
 		 157 aa  125  3e-28  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5049  AsnC family transcriptional regulator  44.08 
 
 		 154 aa  125  3e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.778931 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1999  AsnC family transcriptional regulator  43.42 
 
 		 155 aa  124  5e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.267629  normal  0.0117406 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0505  AsnC family transcriptional regulator  43.14 
 
 		 181 aa  124  5e-28  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.287922  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5171  AsnC family transcriptional regulator  45.03 
 
 		 154 aa  123  8.000000000000001e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.201064 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4924  putative AsnC/lsr family transcriptional regulator  40 
 
 		 157 aa  123  8.000000000000001e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.459173  normal  0.0801597 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4642  AsnC family transcriptional regulator  45.03 
 
 		 154 aa  123  8.000000000000001e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3438  AsnC family transcriptional regulator  43.71 
 
 		 154 aa  123  1e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.950868 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2829  AsnC family transcriptional regulator  45.7 
 
 		 153 aa  122  2e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5150  transcriptional regulator, AsnC family  44 
 
 		 154 aa  122  2e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0368  AsnC family transcriptional regulator  45.03 
 
 		 154 aa  122  2e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.937008  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0809  AsnC family transcriptional regulator  43.71 
 
 		 174 aa  121  3e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.465063  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1570  AsnC family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 174 aa  120  6e-27  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0611  AsnC family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 174 aa  120  6e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0033  transcriptional regulator, AsnC family  42.48 
 
 		 161 aa  120  7e-27  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000210116 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58510  AsnC family transcriptional regulator  43.14 
 
 		 157 aa  119  9.999999999999999e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4500  AsnC family transcriptional regulator  40 
 
 		 157 aa  119  9.999999999999999e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.699014  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4446  AsnC family transcriptional regulator  40.13 
 
 		 155 aa  119  9.999999999999999e-27  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.386761 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5122  putative transcriptional regulator  43.14 
 
 		 157 aa  119  9.999999999999999e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2116  AsnC family transcriptional regulator  40.52 
 
 		 156 aa  120  9.999999999999999e-27  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0323344 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2031  AsnC family transcriptional regulator  43.05 
 
 		 154 aa  119  1.9999999999999998e-26  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2204  AsnC family transcriptional regulator  43.05 
 
 		 154 aa  119  1.9999999999999998e-26  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.656309  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0711  AsnC family transcriptional regulator  43.05 
 
 		 154 aa  119  1.9999999999999998e-26  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2118  AsnC family transcriptional regulator  43.05 
 
 		 154 aa  119  1.9999999999999998e-26  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1553  AsnC family transcriptional regulator  40.67 
 
 		 154 aa  117  4.9999999999999996e-26  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0410589  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2497  AsnC family transcriptional regulator  43.33 
 
 		 156 aa  117  4.9999999999999996e-26  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.38008  normal  0.590435 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1665  AsnC family transcriptional regulator  42.31 
 
 		 156 aa  117  4.9999999999999996e-26  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.7494 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0023  AsnC family transcriptional regulator  40.88 
 
 		 159 aa  117  6e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.28543  normal  0.347248 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3830  AsnC family transcriptional regulator  44 
 
 		 158 aa  117  6e-26  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.676178  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2037  AsnC family transcriptional regulator  41.94 
 
 		 158 aa  117  6e-26  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0190388 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3226  transcriptional regulator, AsnC family  41.67 
 
 		 171 aa  117  7.999999999999999e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1616  AsnC family transcriptional regulator  42 
 
 		 155 aa  117  7.999999999999999e-26  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.636289  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4765  transcriptional regulator, AsnC family  40.91 
 
 		 157 aa  117  7.999999999999999e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.261527  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5805  transcriptional regulator, AsnC family  40.26 
 
 		 172 aa  116  9.999999999999999e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0160115  n/a   
 
 
-
 
NC_007488  RSP_3973  AsnC family transcriptional regulator  44.06 
 
 		 154 aa  116  9.999999999999999e-26  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.918788  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0945  transcriptional regulator, AsnC family  39.07 
 
 		 157 aa  116  9.999999999999999e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.74107  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4756  AsnC family transcriptional regulator  43.71 
 
 		 165 aa  115  1.9999999999999998e-25  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1530  AsnC family transcriptional regulator  40.65 
 
 		 157 aa  115  1.9999999999999998e-25  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.14965  normal  0.648234 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0459  AsnC family transcriptional regulator  40.4 
 
 		 160 aa  115  1.9999999999999998e-25  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4212  AsnC family transcriptional regulator  40.26 
 
 		 157 aa  115  1.9999999999999998e-25  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.642978  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0736  AsnC family transcriptional regulator  41.03 
 
 		 171 aa  115  1.9999999999999998e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0882  transcriptional regulator, AsnC family  42.38 
 
 		 152 aa  115  1.9999999999999998e-25  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7497  AsnC family transcriptional regulator  41.4 
 
 		 169 aa  115  3e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000799666  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3070  AsnC family transcriptional regulator  43.23 
 
 		 158 aa  115  3e-25  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.142573  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1485  AsnC family transcriptional regulator  37.01 
 
 		 159 aa  115  3e-25  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.457516  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03286  transcriptional regulator AsnC family  45.1 
 
 		 189 aa  115  3e-25  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1325  AsnC family transcriptional regulator  37.01 
 
 		 160 aa  114  3.9999999999999997e-25  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0991  AsnC family transcriptional regulator  37.01 
 
 		 160 aa  114  3.9999999999999997e-25  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0576  AsnC family transcriptional regulator  37.01 
 
 		 160 aa  114  3.9999999999999997e-25  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1319  AsnC family transcriptional regulator  37.01 
 
 		 160 aa  114  3.9999999999999997e-25  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0301  AsnC family transcriptional regulator  37.01 
 
 		 160 aa  114  3.9999999999999997e-25  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0951908  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2510  AsnC family transcriptional regulator  37.01 
 
 		 160 aa  114  3.9999999999999997e-25  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.161372  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1253  AsnC family transcriptional regulator  37.01 
 
 		 160 aa  114  3.9999999999999997e-25  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1293  AsnC family transcriptional regulator  37.75 
 
 		 164 aa  114  6e-25  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5907  AsnC family transcriptional regulator  41.94 
 
 		 166 aa  114  6e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2600  AsnC family transcriptional regulator  41.94 
 
 		 166 aa  114  6e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3655  AsnC family transcriptional regulator  42.28 
 
 		 156 aa  114  6e-25  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.182716 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0509  AsnC family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 167 aa  114  6e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0842444  normal  0.148048 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0598  AsnC family transcriptional regulator  42.67 
 
 		 170 aa  114  6e-25  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2576  AsnC family transcriptional regulator  41.94 
 
 		 166 aa  114  6e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1965  AsnC family transcriptional regulator  41.94 
 
 		 166 aa  114  6e-25  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.113817  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2495  AsnC family transcriptional regulator  41.94 
 
 		 166 aa  114  6e-25  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0775617  normal  0.732108 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2624  AsnC family transcriptional regulator  41.94 
 
 		 166 aa  114  6e-25  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.30758  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>