More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_3528 on replicon NC_007973
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007973  Rmet_3528  aldo/keto reductase  100 
 
 
332 aa  678    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3382  aldo/keto reductase  81.1 
 
 
340 aa  556  1e-157  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.159588  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0155  aldo-keto reductase yakc (NADP+)  69.82 
 
 
329 aa  467  9.999999999999999e-131  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000000886712  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0147  aldo-keto reductase YakC  69.51 
 
 
329 aa  464  9.999999999999999e-131  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0831  aldo/keto reductase  67.78 
 
 
330 aa  463  1e-129  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0648  aldo/keto reductase  64.94 
 
 
330 aa  458  9.999999999999999e-129  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.153576 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0614  aldo/keto reductase  66.26 
 
 
330 aa  456  1e-127  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3322  aldo/keto reductase  65.35 
 
 
330 aa  446  1.0000000000000001e-124  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4022  aldo/keto reductase  64.81 
 
 
331 aa  441  1e-123  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3444  aldo/keto reductase  65.75 
 
 
331 aa  442  1e-123  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2171  aldo/keto reductase  69.26 
 
 
324 aa  439  9.999999999999999e-123  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31770  putative oxidoreductase  61.59 
 
 
331 aa  434  1e-120  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3526  aldo/keto reductase  65.55 
 
 
328 aa  431  1e-120  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0256  aldo/keto reductase  65.43 
 
 
328 aa  429  1e-119  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.223996  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4462  aldo/keto reductase  65.41 
 
 
317 aa  431  1e-119  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0315022  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0434  aldo/keto reductase  68.28 
 
 
334 aa  424  1e-118  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.543204  normal  0.0329552 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03042  oxidoreductase  65.48 
 
 
309 aa  425  1e-118  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2519  aldo/keto reductase  62.31 
 
 
331 aa  426  1e-118  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.542493  normal  0.338127 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2331  aldo/keto reductase  65.44 
 
 
329 aa  426  1e-118  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.196419  normal  0.2019 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0096  aldo/keto reductase  61.38 
 
 
335 aa  421  1e-117  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.69349  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2791  oxidoreductase, aldo/keto reductase family  62.01 
 
 
331 aa  417  1e-116  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.314524  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3036  aldo/keto reductase  64.71 
 
 
328 aa  415  9.999999999999999e-116  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0625383  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0447  aldo/keto reductase  62.54 
 
 
328 aa  415  9.999999999999999e-116  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.227175 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2886  aldo/keto reductase  64.53 
 
 
328 aa  417  9.999999999999999e-116  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.253297  normal  0.167279 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0613  aldo/keto reductase  64.94 
 
 
328 aa  407  1.0000000000000001e-112  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0221334 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1517  aldo/keto reductase  66.23 
 
 
325 aa  404  1e-111  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.616958  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3286  aldo/keto reductase  66.35 
 
 
329 aa  398  9.999999999999999e-111  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.186639  normal  0.885698 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1012  aldo/keto reductase  66.02 
 
 
324 aa  397  1e-109  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.613048 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2760  aldo/keto reductase  62.5 
 
 
327 aa  395  1e-109  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3235  aldo/keto reductase  63.78 
 
 
328 aa  392  1e-108  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3134  aldo/keto reductase  63.78 
 
 
328 aa  393  1e-108  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1958  aldo/keto reductase  61.4 
 
 
326 aa  392  1e-108  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0910  aldo/keto reductase  68.28 
 
 
324 aa  389  1e-107  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.226692  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0088  aldo/keto reductase  63.55 
 
 
491 aa  387  1e-106  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8302  aldo/keto reductase  60.56 
 
 
332 aa  384  1e-105  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.625584 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2330  aldo/keto reductase  59.82 
 
 
328 aa  378  1e-104  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5029  aldo/keto reductase  63.02 
 
 
330 aa  379  1e-104  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4538  aldo/keto reductase  58.59 
 
 
331 aa  380  1e-104  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.145809 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3524  aldo/keto reductase  62.04 
 
 
334 aa  379  1e-104  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.956167  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4273  aldo/keto reductase  58.9 
 
 
330 aa  376  1e-103  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0745  aldo/keto reductase  59.32 
 
 
449 aa  374  1e-102  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4205  aldo/keto reductase  61.47 
 
 
338 aa  373  1e-102  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3627  aldo/keto reductase  58.88 
 
 
325 aa  374  1e-102  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.303826  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2255  aldo/keto reductase  55.76 
 
 
331 aa  370  1e-101  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7603  aldo/keto reductase  59.12 
 
 
326 aa  371  1e-101  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3489  aldo/keto reductase  55.59 
 
 
331 aa  365  1e-100  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1860  aldo/keto reductase  53.89 
 
 
338 aa  362  3e-99  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.599659  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3432  aldo/keto reductase  56.4 
 
 
328 aa  362  7.0000000000000005e-99  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.237598  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1904  aldo/keto reductase  56.06 
 
 
331 aa  357  9.999999999999999e-98  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000049592 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4963  aldo/keto reductase  60.51 
 
 
328 aa  356  2.9999999999999997e-97  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0173735  normal  0.596284 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6700  aldo/keto reductase  52.71 
 
 
339 aa  355  5e-97  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0153  aldo-keto reductase  53.37 
 
 
333 aa  353  2e-96  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4829  aldo/keto reductase  56.52 
 
 
328 aa  349  4e-95  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0794  aldo/keto reductase  53.14 
 
 
326 aa  349  4e-95  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.632761  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14360  predicted oxidoreductase, aryl-alcohol dehydrogenase like protein  58.49 
 
 
325 aa  348  7e-95  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2325  aldo/keto reductase  49.25 
 
 
336 aa  347  2e-94  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6983  aldo/keto reductase  54.71 
 
 
325 aa  345  5e-94  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0500537  normal  0.645262 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0577  aldo/keto reductase  54.88 
 
 
330 aa  337  1.9999999999999998e-91  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.667641  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0544  aldo/keto reductase  56.1 
 
 
330 aa  336  2.9999999999999997e-91  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.256151  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2904  aldo/keto reductase  51.84 
 
 
331 aa  336  2.9999999999999997e-91  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.96128e-16 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0728  aldo/keto reductase  51.5 
 
 
333 aa  336  3.9999999999999995e-91  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.597042 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3366  aldo/keto reductase  56.88 
 
 
320 aa  334  1e-90  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0958  aldo/keto reductase  53.17 
 
 
331 aa  333  2e-90  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.420577  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1352  aldo/keto reductase  53.11 
 
 
320 aa  333  2e-90  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.299072  normal  0.0362221 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3336  aldo/keto reductase  51.06 
 
 
331 aa  333  3e-90  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1378  aldo/keto reductase  51.53 
 
 
331 aa  332  4e-90  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0679596  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1059  aldo/keto reductase  54.01 
 
 
327 aa  331  1e-89  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1149  aldo/keto reductase  52.53 
 
 
360 aa  327  2.0000000000000001e-88  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.946345  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3931  aldo/keto reductase  58.8 
 
 
330 aa  326  3e-88  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1734  aldo/keto reductase  53.56 
 
 
328 aa  325  4.0000000000000003e-88  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0633258  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0475  aldo/keto reductase  51.41 
 
 
331 aa  325  5e-88  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6144  aldo/keto reductase  49.85 
 
 
331 aa  325  8.000000000000001e-88  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0217  oxidoreductase transmembrane protein  53.05 
 
 
342 aa  324  2e-87  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4569  aldo/keto reductase  54.6 
 
 
326 aa  324  2e-87  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.473943  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3685  aldo/keto reductase  52.76 
 
 
331 aa  323  3e-87  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.181793 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6616  aldo/keto reductase  50.91 
 
 
328 aa  323  3e-87  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4719  aldo/keto reductase family oxidoreductase  52.42 
 
 
327 aa  321  9.999999999999999e-87  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32500  Aldo/keto reductase protein  51.67 
 
 
329 aa  321  9.999999999999999e-87  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2445  aldo/keto reductase  51.7 
 
 
327 aa  320  1.9999999999999998e-86  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.587238  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5308  aldo/keto reductase  57.72 
 
 
327 aa  320  1.9999999999999998e-86  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0402  aldo/keto reductase  49.1 
 
 
335 aa  319  3.9999999999999996e-86  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0608954  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1098  putative oxidoreductase, aryl-alcohol dehydrogenase-like  52.32 
 
 
334 aa  319  5e-86  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1767  aldo/keto reductase  49.54 
 
 
329 aa  319  5e-86  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.883175  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2512  aldo/keto reductase  51.37 
 
 
328 aa  319  5e-86  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.319114 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38040  Aldo/keto reductase  49.85 
 
 
329 aa  318  5e-86  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2444  aldo/keto reductase  51.38 
 
 
331 aa  318  7e-86  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.959905  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0110  aldo/keto reductase  49.25 
 
 
334 aa  318  9e-86  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.17835  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0404  aldo/keto reductase  55.73 
 
 
328 aa  317  1e-85  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.284735  normal  0.539127 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1198  aldo/keto reductase  50.31 
 
 
327 aa  317  2e-85  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3214  aldo/keto reductase  51.21 
 
 
331 aa  317  2e-85  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3903  aldo/keto reductase  52.34 
 
 
327 aa  317  2e-85  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.392961  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1459  aldo/keto reductase  51.83 
 
 
320 aa  317  2e-85  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.829072 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2855  aldo/keto reductase  51.67 
 
 
327 aa  315  5e-85  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.113356  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4374  aldo/keto reductase  51.05 
 
 
334 aa  315  7e-85  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.25984  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2317  aldo/keto reductase  52.17 
 
 
341 aa  314  9.999999999999999e-85  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3076  aldo/keto reductase  49.54 
 
 
329 aa  313  1.9999999999999998e-84  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.545769  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1236  aldo/keto reductase  54.29 
 
 
338 aa  313  1.9999999999999998e-84  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.334986  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2999  aldo/keto reductase family oxidoreductase  49.54 
 
 
329 aa  313  1.9999999999999998e-84  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1902  aldo/keto reductase family oxidoreductase  49.54 
 
 
329 aa  313  1.9999999999999998e-84  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00458886 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0669  aldo/keto reductase  53.01 
 
 
333 aa  313  3.9999999999999997e-84  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.303974 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>