245 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_3525 on replicon NC_007973
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007973  Rmet_3525  heavy metal transport/detoxification protein  100 
 
 		 133 aa  278  2e-74  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3377  heavy metal transport/detoxification protein  84.85 
 
 		 66 aa  115  1.9999999999999998e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3349  hypothetical protein  56.06 
 
 		 66 aa  79  0.00000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.820428  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3536  hypothetical protein  49.18 
 
 		 66 aa  74.7  0.0000000000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.153014  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3218  Heavy metal transport/detoxification protein  55.93 
 
 		 70 aa  67.4  0.00000000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3544  Heavy metal transport/detoxification protein  55.93 
 
 		 70 aa  67  0.00000000009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.480212 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3162  heavy metal binding protein  50.77 
 
 		 79 aa  66.6  0.0000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.487659 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2309  heavy metal transport/detoxification protein  40.98 
 
 		 67 aa  65.5  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.369838  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3894  heavy metal transport/detoxification protein  48.48 
 
 		 73 aa  65.5  0.0000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.739174  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3241  heavy metal transport/detoxification protein  45 
 
 		 64 aa  64.7  0.0000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1968  heavy metal transport/detoxification protein  49.18 
 
 		 69 aa  64.3  0.0000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.563068  normal  1 
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9865  hypothetical protein  40.32 
 
 		 67 aa  63.9  0.0000000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0030  Heavy metal transport/detoxification protein  52.46 
 
 		 64 aa  63.5  0.0000000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0937  heavy metal transport/detoxification protein  50 
 
 		 63 aa  63.5  0.0000000008  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.543805 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1081  heavy metal transport/detoxification protein  50 
 
 		 63 aa  63.5  0.0000000008  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0663  heavy metal transport/detoxification protein  50 
 
 		 65 aa  63.2  0.000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1406  heavy metal transport/detoxification protein  40.62 
 
 		 64 aa  63.2  0.000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4089  heavy metal transport/detoxification protein  43.33 
 
 		 62 aa  62.4  0.000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.787932 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2375  heavy metal transport/detoxification protein  47.46 
 
 		 66 aa  61.2  0.000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18800  hypothetical protein  40.98 
 
 		 64 aa  60.8  0.000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.071417 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2989  heavy metal transport/detoxification protein  47.46 
 
 		 66 aa  61.2  0.000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1386  Heavy metal transport/detoxification protein  49.18 
 
 		 79 aa  60.8  0.000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.152732  hitchhiker  0.000957123 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3036  heavy metal transport/detoxification protein  47.46 
 
 		 66 aa  60.5  0.000000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10070  heavy metal transport/detoxification protein  47.69 
 
 		 65 aa  60.5  0.000000008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.173108  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2983  heavy metal transport/detoxification protein  45.76 
 
 		 66 aa  60.5  0.000000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6338  heavy metal transport/detoxification protein  47.46 
 
 		 66 aa  60.1  0.000000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4871  heavy metal transport/detoxification protein  42.37 
 
 		 65 aa  59.7  0.00000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.800618 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6074  Heavy metal transport/detoxification protein  47.46 
 
 		 65 aa  58.9  0.00000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0961744  normal  0.102 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1834  heavy metal transport/detoxification protein  46.38 
 
 		 69 aa  58.9  0.00000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3009  heavy metal transport/detoxification protein  45.76 
 
 		 66 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3947  heavy metal transport/detoxification protein  46.15 
 
 		 67 aa  58.9  0.00000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2899  heavy metal transport/detoxification protein  47.46 
 
 		 66 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4021  heavy metal transport/detoxification protein  46.15 
 
 		 67 aa  58.9  0.00000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.18432  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3961  heavy metal transport/detoxification protein  46.15 
 
 		 67 aa  58.9  0.00000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0422606 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0018  heavy metal transport/detoxification protein  47.54 
 
 		 65 aa  58.5  0.00000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.971 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_5025  heavy metal transport/detoxification protein  43.33 
 
 		 73 aa  58.2  0.00000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.726542  normal  0.727014 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2298  heavy metal binding protein  44.07 
 
 		 65 aa  57.8  0.00000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.775162  normal  0.287119 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1641  chaperonin  44.29 
 
 		 86 aa  57.8  0.00000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0737624 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4415  heavy metal transport/detoxification protein  45 
 
 		 64 aa  57.8  0.00000005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0035  heavy metal transport/detoxification protein  49.15 
 
 		 64 aa  57.8  0.00000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0033  heavy metal transport/detoxification protein  47.54 
 
 		 65 aa  57.4  0.00000007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0588  heavy metal transport/detoxification protein  43.55 
 
 		 65 aa  56.6  0.0000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1134  Heavy metal transport/detoxification protein  33.33 
 
 		 64 aa  56.6  0.0000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1951  transglutaminase-like  41.94 
 
 		 81 aa  56.2  0.0000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.441972  normal  0.32765 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3691  heavy metal translocating P-type ATPase  38.24 
 
 		 793 aa  56.6  0.0000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1021  heavy metal transport/detoxification protein  49.15 
 
 		 65 aa  56.2  0.0000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1627  hypothetical protein  40.98 
 
 		 69 aa  56.2  0.0000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7843  heavy metal translocating P-type ATPase  36.14 
 
 		 835 aa  56.6  0.0000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1772  Heavy metal transport/detoxification protein  39.06 
 
 		 64 aa  55.8  0.0000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.350999  normal  0.505439 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7878  Heavy metal transport/detoxification protein  40.98 
 
 		 69 aa  55.8  0.0000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.988763  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0633  heavy metal transport/detoxification protein  41.94 
 
 		 65 aa  55.5  0.0000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000319984 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1787  hypothetical protein  39.34 
 
 		 78 aa  56.2  0.0000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.523797  normal  0.0975189 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4050  heavy metal transport/detoxification protein  38.33 
 
 		 64 aa  56.2  0.0000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0036  Heavy metal transport/detoxification protein  45.9 
 
 		 65 aa  55.5  0.0000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.749635  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1368  heavy metal transport/detoxification protein  46.88 
 
 		 85 aa  55.1  0.0000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0738  copper ion binding protein  40 
 
 		 70 aa  55.5  0.0000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0741164  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0282  heavy metal-binding domain-containing protein  36.26 
 
 		 155 aa  55.1  0.0000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3258  Heavy metal transport/detoxification protein  44.12 
 
 		 160 aa  54.7  0.0000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0627  heavy metal transport/detoxification protein  41.94 
 
 		 65 aa  54.7  0.0000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00214961  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2465  heavy metal transport/detoxification protein  44.78 
 
 		 68 aa  54.7  0.0000005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.677036  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0204  heavy metal transport/detoxification protein  42.11 
 
 		 68 aa  53.5  0.000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0143  Heavy metal transport/detoxification protein  44.83 
 
 		 65 aa  53.1  0.000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.816482  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2419  copper ion-binding  40 
 
 		 71 aa  53.1  0.000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000928484  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2321  hypothetical protein  38.46 
 
 		 75 aa  53.5  0.000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3228  heavy metal transport/detoxification protein  38.1 
 
 		 71 aa  53.1  0.000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1570  hypothetical protein  45.16 
 
 		 65 aa  52.8  0.000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0557  heavy metal transport/detoxification protein  44.44 
 
 		 56 aa  52.4  0.000002  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1697  copper ion binding protein  40 
 
 		 67 aa  52.4  0.000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.53924  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3497  heavy metal transport/detoxification protein  38.33 
 
 		 75 aa  52.4  0.000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.427952 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2531  heavy metal transport/detoxification protein  43.48 
 
 		 70 aa  52.8  0.000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18070  putative periplasmic metal-binding protein  45.16 
 
 		 65 aa  52.4  0.000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1690  copper ion binding protein  40 
 
 		 68 aa  52.8  0.000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1770  heavy metal translocating P-type ATPase  33.33 
 
 		 833 aa  50.8  0.000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.466884 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2449  Heavy metal transport/detoxification protein  40.62 
 
 		 64 aa  50.8  0.000005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.228051  normal  0.0680079 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3893  heavy metal translocating P-type ATPase  39.34 
 
 		 855 aa  51.2  0.000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0676601  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3240  heavy metal translocating P-type ATPase  33.78 
 
 		 852 aa  50.8  0.000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.68227  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2413  heavy metal translocating P-type ATPase  37.14 
 
 		 840 aa  50.4  0.000009  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.66549  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2225  heavy metal transport/detoxification protein  39.34 
 
 		 66 aa  50.1  0.000009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.708694  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04940  copper chaperone  40 
 
 		 109 aa  50.1  0.00001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1138  heavy metal translocating P-type ATPase  37.31 
 
 		 841 aa  49.7  0.00001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.736549  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1372  heavy metal translocating P-type ATPase  32.31 
 
 		 833 aa  49.7  0.00001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.279788  normal  1 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2844  Heavy metal transport/detoxification protein  44.26 
 
 		 68 aa  50.1  0.00001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0823  heavy metal transport/detoxification protein  40.32 
 
 		 83 aa  50.1  0.00001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5393  heavy metal transport/detoxification protein  36.51 
 
 		 66 aa  48.9  0.00002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00736887 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1715  copper ion binding protein  41.67 
 
 		 77 aa  48.9  0.00002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0879446  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0113  Heavy metal transport/detoxification protein  42.42 
 
 		 70 aa  49.3  0.00002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.612125  normal  0.480924 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0504  putative cheavy metal binding protein  40.68 
 
 		 111 aa  48.9  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4576  heavy metal transport/detoxification protein  43.55 
 
 		 65 aa  49.3  0.00002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.016584  normal  0.0171789 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3747  heavy metal transport/detoxification protein  38.1 
 
 		 69 aa  49.3  0.00002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.37932  n/a   
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4520  heavy metal transport/detoxification protein  38.57 
 
 		 97 aa  49.3  0.00002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.212796  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3036  heavy metal-binding domain-containing protein  40.68 
 
 		 111 aa  48.9  0.00002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.71925  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2056  heavy metal-binding domain-containing protein  40.68 
 
 		 111 aa  48.9  0.00002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1106  heavy metal transport/detoxification protein  43.55 
 
 		 70 aa  49.7  0.00002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0639818  normal  0.0373114 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0309  heavy metal-binding domain-containing protein  40.68 
 
 		 111 aa  48.9  0.00002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0322  heavy metal-binding domain-containing protein  40.68 
 
 		 111 aa  48.9  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2228  heavy metal-binding domain-containing protein  40.68 
 
 		 111 aa  48.9  0.00002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.872872  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0029  heavy metal transport/detoxification protein  36.51 
 
 		 66 aa  48.9  0.00002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.787657  decreased coverage  0.0000308968 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0711  Heavy metal transport/detoxification protein  34.18 
 
 		 80 aa  48.9  0.00002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.190647  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4897  heavy metal translocating P-type ATPase  33.8 
 
 		 827 aa  49.3  0.00002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.248025  normal  0.348601 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0643  hypothetical protein  42.37 
 
 		 67 aa  48.5  0.00003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>