More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_3476 on replicon NC_007973
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007973  Rmet_3476  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  100 
 
 		 437 aa  862    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3325  sensor histidine kinase  82.52 
 
 		 358 aa  452  1.0000000000000001e-126  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.205515  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4348  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  50.68 
 
 		 330 aa  276  7e-73  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4198  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  48 
 
 		 349 aa  261  2e-68  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2031  sensor histidine kinase  48.07 
 
 		 344 aa  259  7e-68  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.872643 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2222  sensor histidine kinase  42.86 
 
 		 344 aa  248  2e-64  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.464629  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4427  histidine kinase  46.62 
 
 		 458 aa  226  7e-58  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3645  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  45.71 
 
 		 443 aa  219  7.999999999999999e-56  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2702  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  43.91 
 
 		 443 aa  211  2e-53  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.118263 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1244  histidine kinase  42.11 
 
 		 438 aa  208  1e-52  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0432448  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2085  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  41.64 
 
 		 434 aa  207  4e-52  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5703  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  41.64 
 
 		 435 aa  207  4e-52  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.123247  normal  0.334136 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4613  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  46.1 
 
 		 440 aa  206  7e-52  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5019  histidine kinase  39.83 
 
 		 440 aa  205  1e-51  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.554141  normal  0.501174 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3113  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  39.83 
 
 		 440 aa  205  1e-51  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5254  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  39.83 
 
 		 440 aa  205  1e-51  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1586  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  39.22 
 
 		 494 aa  204  2e-51  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.864341 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1972  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  41.16 
 
 		 451 aa  204  3e-51  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0298113 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5141  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  45.72 
 
 		 440 aa  204  4e-51  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0160949  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2590  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  42.24 
 
 		 472 aa  203  4e-51  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.911629  normal  1 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4124  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  40.85 
 
 		 485 aa  201  1.9999999999999998e-50  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0399  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  44.98 
 
 		 440 aa  200  5e-50  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.836623 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2106  sensor protein  39.42 
 
 		 425 aa  199  6e-50  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0080  sensor histidine kinase  39.42 
 
 		 425 aa  199  7e-50  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.0579685  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2402  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  43.56 
 
 		 428 aa  199  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3293  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  43.18 
 
 		 428 aa  198  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.931435 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3381  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  39.5 
 
 		 473 aa  197  2.0000000000000003e-49  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2346  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  39.85 
 
 		 717 aa  198  2.0000000000000003e-49  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.596828  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1083  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  39.56 
 
 		 453 aa  197  4.0000000000000005e-49  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.205423  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3460  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  44.07 
 
 		 442 aa  196  9e-49  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.025343  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2093  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  44.44 
 
 		 463 aa  196  9e-49  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.186061  normal  0.978183 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2007  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  43.18 
 
 		 428 aa  195  1e-48  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.242422  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1279  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  39.26 
 
 		 464 aa  194  2e-48  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4605  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  44.53 
 
 		 441 aa  194  3e-48  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1908  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  42.8 
 
 		 428 aa  194  3e-48  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.414185  normal  0.194942 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2910  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  37.87 
 
 		 488 aa  194  3e-48  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.988017  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04422  two-component system sensor protein  38.33 
 
 		 499 aa  193  4e-48  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3910  sensor histidine kinase  40.15 
 
 		 435 aa  192  1e-47  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1149  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  44.06 
 
 		 454 aa  190  5e-47  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3404  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  43.48 
 
 		 444 aa  189  5.999999999999999e-47  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6322  histidine kinase  42.8 
 
 		 276 aa  189  7e-47  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2271  histidine kinase  39.93 
 
 		 479 aa  189  9e-47  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4602  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase A, N-terminal  45.26 
 
 		 396 aa  188  1e-46  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1067  histidine kinase  39.38 
 
 		 444 aa  186  5e-46  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5287  histidine kinase  40.58 
 
 		 425 aa  186  6e-46  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.531754 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1373  histidine kinase  40.14 
 
 		 454 aa  185  1.0000000000000001e-45  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.182248  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6217  putative two component sensor histidine kinase  41.11 
 
 		 467 aa  183  5.0000000000000004e-45  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7107  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  41.98 
 
 		 469 aa  183  5.0000000000000004e-45  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.338438  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0851  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  40.5 
 
 		 453 aa  183  5.0000000000000004e-45  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1632  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.25 
 
 		 535 aa  182  7e-45  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0270  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  42.18 
 
 		 455 aa  182  1e-44  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00239183 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4090  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  40.21 
 
 		 444 aa  182  1e-44  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.280279  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3908  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  40.65 
 
 		 441 aa  181  2e-44  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.441725  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1960  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  41.91 
 
 		 442 aa  181  2.9999999999999997e-44  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.463219  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2274  histidine kinase  36.22 
 
 		 440 aa  181  2.9999999999999997e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0463006  normal  0.363393 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0816  histidine kinase  39.92 
 
 		 443 aa  181  2.9999999999999997e-44  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.643594  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1189  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  40.35 
 
 		 451 aa  180  4e-44  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.288659  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0286  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  42.55 
 
 		 455 aa  179  7e-44  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.502891  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1300  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  39.48 
 
 		 469 aa  179  8e-44  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0433366  normal  0.502899 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2050  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.24 
 
 		 439 aa  179  8e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.125558  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2146  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.46 
 
 		 476 aa  179  1e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2417  signal transduction histidine kinase  40.65 
 
 		 480 aa  179  1e-43  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0296  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  42.65 
 
 		 455 aa  179  1e-43  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2388  sensor histidine kinase  35.27 
 
 		 469 aa  177  2e-43  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.18608  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4077  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  41.76 
 
 		 443 aa  178  2e-43  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.269613 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0517  ATPase domain-containing protein  40 
 
 		 432 aa  178  2e-43  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.907108  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0993  two-component sensor  44.49 
 
 		 434 aa  178  2e-43  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4653  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  40.43 
 
 		 446 aa  177  3e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.724731 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2472  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  40.89 
 
 		 469 aa  177  4e-43  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.22285  normal  1 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3773  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.46 
 
 		 488 aa  176  5e-43  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.996229 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2156  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.55 
 
 		 473 aa  176  5e-43  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.165906  normal  0.149594 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_4049  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.46 
 
 		 488 aa  176  5e-43  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2738  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  38.71 
 
 		 425 aa  174  1.9999999999999998e-42  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0327693 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2424  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.95 
 
 		 493 aa  174  3.9999999999999995e-42  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.444371 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2178  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.89 
 
 		 454 aa  173  5.999999999999999e-42  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3287  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  43.63 
 
 		 479 aa  172  7.999999999999999e-42  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.133  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2373  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  38.16 
 
 		 456 aa  171  3e-41  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.351814  normal  0.619069 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0473  osmolarity sensor protein EnvZ, putative  35.94 
 
 		 474 aa  166  5.9999999999999996e-40  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.185005  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3232  histidine kinase  41.11 
 
 		 270 aa  166  5.9999999999999996e-40  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2285  sensor histidine kinase  31.03 
 
 		 480 aa  164  2.0000000000000002e-39  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0585987  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6198  putative two component sensor histidine kinase  37.81 
 
 		 458 aa  164  3e-39  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1149  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.35 
 
 		 479 aa  163  5.0000000000000005e-39  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  decreased coverage  0.000106108  normal  0.933142 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1937  putative two-component sensor  38.67 
 
 		 482 aa  162  2e-38  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2498  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  40.68 
 
 		 453 aa  162  2e-38  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4372  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  35.77 
 
 		 475 aa  160  4e-38  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4348  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.27 
 
 		 488 aa  160  5e-38  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00134459  hitchhiker  0.00520721 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1012  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.19 
 
 		 484 aa  159  1e-37  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1013  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.66 
 
 		 484 aa  158  2e-37  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.317801  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3438  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.49 
 
 		 419 aa  158  2e-37  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22960  putative two-component sensor  38.28 
 
 		 473 aa  158  2e-37  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.758955  normal  0.36049 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6493  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  40.38 
 
 		 375 aa  158  2e-37  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1112  sensor histidine kinase  35 
 
 		 483 aa  157  3e-37  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.60391 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1814  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.93 
 
 		 493 aa  157  3e-37  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.181871  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1291  sensor histidine kinase  35 
 
 		 468 aa  157  4e-37  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3619  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  41.26 
 
 		 432 aa  157  5.0000000000000005e-37  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4211  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.43 
 
 		 484 aa  156  5.0000000000000005e-37  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.733608  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5740  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  40 
 
 		 376 aa  156  5.0000000000000005e-37  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1051  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.27 
 
 		 484 aa  157  5.0000000000000005e-37  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.237327  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1833  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  39.1 
 
 		 435 aa  156  9e-37  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.276388  normal  0.18394 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0765  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  34.66 
 
 		 438 aa  155  1e-36  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.776621  normal  0.225366 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>