56 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_3421 on replicon NC_007973
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007973  Rmet_3421  putative signal peptide protein  100 
 
 		 152 aa  308  2e-83  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3253  putative signal peptide protein  78.95 
 
 		 152 aa  217  5e-56  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3455  hypothetical protein  70.78 
 
 		 151 aa  198  1.9999999999999998e-50  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3127  hypothetical protein  70.39 
 
 		 151 aa  196  7e-50  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3257  putative signal peptide protein  68.42 
 
 		 152 aa  186  7e-47  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3773  hypothetical protein  51.35 
 
 		 143 aa  142  1e-33  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2282  hypothetical protein  57.52 
 
 		 113 aa  132  9.999999999999999e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1593  hypothetical protein  56.64 
 
 		 113 aa  131  3e-30  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0563903  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1669  hypothetical protein  55.75 
 
 		 113 aa  129  1.0000000000000001e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0808  hypothetical protein  40.52 
 
 		 145 aa  123  1e-27  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.893436  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1837  hypothetical protein  53.04 
 
 		 150 aa  120  9e-27  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.412927 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1031  hypothetical protein  42.86 
 
 		 145 aa  113  6.9999999999999995e-25  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.454179 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2431  putative signal peptide protein  42.61 
 
 		 137 aa  109  2.0000000000000002e-23  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0564  hypothetical protein  37.9 
 
 		 147 aa  76.3  0.0000000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2602  hypothetical protein  40.38 
 
 		 115 aa  68.9  0.00000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00587907  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1472  hypothetical protein  34.85 
 
 		 151 aa  68.6  0.00000000003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  decreased coverage  0.00198336  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1398  domain of unknown function DUF1791  35.48 
 
 		 150 aa  68.2  0.00000000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4145  protein of unknown function DUF1791  39.34 
 
 		 153 aa  66.2  0.0000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0120  protein of unknown function DUF1791  34.42 
 
 		 154 aa  66.2  0.0000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0768427 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0692  Domain of unknown function DUF1791  32.91 
 
 		 147 aa  65.1  0.0000000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0872755 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0691  Domain of unknown function DUF1791  36.29 
 
 		 146 aa  63.5  0.0000000009  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0623346 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0130  hypothetical protein  37 
 
 		 111 aa  62.8  0.000000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.314669  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1221  hypothetical protein  34.65 
 
 		 127 aa  62  0.000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0468  hypothetical protein  38 
 
 		 111 aa  61.6  0.000000004  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.0179279  hitchhiker  0.0000000186223 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0805  hypothetical protein  29.56 
 
 		 150 aa  59.3  0.00000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0536  hypothetical protein  33.6 
 
 		 123 aa  59.3  0.00000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2158  hypothetical protein  30.37 
 
 		 163 aa  57  0.00000008  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1583  hypothetical protein  33.91 
 
 		 119 aa  57  0.00000009  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0253638  normal  0.163534 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0015  hypothetical protein  33.33 
 
 		 112 aa  56.6  0.0000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  unclonable  0.000000000351673  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0093  hypothetical protein  33.33 
 
 		 116 aa  56.6  0.0000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1803  hypothetical protein  32.79 
 
 		 116 aa  55.5  0.0000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.268314 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0468  hypothetical protein  34.29 
 
 		 112 aa  55.5  0.0000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0466  hypothetical protein  34.65 
 
 		 115 aa  55.1  0.0000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0779  hypothetical protein  32.17 
 
 		 115 aa  52.4  0.000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.790907  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1233  hypothetical protein  30 
 
 		 116 aa  52.4  0.000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.83649  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3197  hypothetical protein  34.45 
 
 		 114 aa  51.6  0.000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.218996 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2301  Domain of unknown function DUF1791  37.4 
 
 		 162 aa  51.2  0.000005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.583301  normal  0.0480111 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0065  hypothetical protein  35.29 
 
 		 112 aa  51.2  0.000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1626  hypothetical protein  28.7 
 
 		 110 aa  50.8  0.000006  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1822  Domain of unknown function DUF1791  36.51 
 
 		 112 aa  50.8  0.000007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.699958  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3212  hypothetical protein  29.46 
 
 		 176 aa  50.8  0.000007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0267  hypothetical protein  35.37 
 
 		 144 aa  50.1  0.00001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.0000206306  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3680  hypothetical protein  32.23 
 
 		 140 aa  47.8  0.00005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.803572  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0896  hypothetical protein  27.88 
 
 		 163 aa  47.4  0.00007  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3025  hypothetical protein  32.5 
 
 		 162 aa  47.4  0.00008  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4871  hypothetical protein  33.33 
 
 		 151 aa  46.6  0.0001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0095  Domain of unknown function DUF1791  26.58 
 
 		 176 aa  45.1  0.0003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.921438  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2157  hypothetical protein  33.33 
 
 		 152 aa  45.1  0.0004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1135  hypothetical protein  28.95 
 
 		 110 aa  44.3  0.0006  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.401796 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3670  hypothetical protein  34.43 
 
 		 153 aa  43.9  0.0007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2493  hypothetical protein  28.46 
 
 		 174 aa  43.1  0.001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.256462  normal  0.792033 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0139  hypothetical protein  28.03 
 
 		 151 aa  42.7  0.002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.433672  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0173  hypothetical protein  29.09 
 
 		 159 aa  42.7  0.002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.129014  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4264  hypothetical protein  28.38 
 
 		 150 aa  42  0.003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.901179  normal  0.594903 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1053  hypothetical protein  29.57 
 
 		 180 aa  42.4  0.003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.32942  normal  0.267344 
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6946  Domain of unknown function DUF1791  27.52 
 
 		 151 aa  40.4  0.008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>