More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_3411 on replicon NC_007973
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007973  Rmet_3411  hypothetical protein  100 
 
 		 330 aa  656    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5153  extra-cytoplasmic solute receptor  60.24 
 
 		 329 aa  402  1e-111  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.415379 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0108  hypothetical protein  52.73 
 
 		 332 aa  371  1e-102  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.251449 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0125  hypothetical protein  54.67 
 
 		 332 aa  361  1e-98  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.232724  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0693  hypothetical protein  54.55 
 
 		 320 aa  351  1e-95  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5058  extra-cytoplasmic solute receptor  54 
 
 		 328 aa  300  3e-80  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0827045  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1325  hypothetical protein  49.83 
 
 		 330 aa  299  5e-80  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0097  hypothetical protein  47 
 
 		 316 aa  298  7e-80  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0114  hypothetical protein  46.96 
 
 		 316 aa  296  3e-79  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3546  hypothetical protein  45.97 
 
 		 330 aa  285  5.999999999999999e-76  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0909589  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0869  hypothetical protein  47.99 
 
 		 339 aa  284  1.0000000000000001e-75  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0210  hypothetical protein  45.79 
 
 		 322 aa  285  1.0000000000000001e-75  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2869  hypothetical protein  45.64 
 
 		 330 aa  283  2.0000000000000002e-75  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3937  hypothetical protein  47.16 
 
 		 328 aa  281  1e-74  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.178831  normal  0.0313351 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4804  hypothetical protein  46.1 
 
 		 350 aa  274  1.0000000000000001e-72  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.589881  normal  0.119891 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0596  hypothetical protein  42.69 
 
 		 336 aa  268  8.999999999999999e-71  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.642014  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5273  extra-cytoplasmic solute receptor  44.37 
 
 		 322 aa  264  2e-69  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.320147  normal  0.0608959 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4609  extra-cytoplasmic solute receptor  43.41 
 
 		 328 aa  263  3e-69  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.636278 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4213  extra-cytoplasmic solute receptor  43.2 
 
 		 326 aa  261  1e-68  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5146  hypothetical protein  41.64 
 
 		 327 aa  260  3e-68  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0987531  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0489  hypothetical protein  42.01 
 
 		 344 aa  258  7e-68  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1868  hypothetical protein  41.39 
 
 		 330 aa  258  1e-67  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4624  hypothetical protein  43.73 
 
 		 327 aa  258  1e-67  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0143  hypothetical protein  41.25 
 
 		 330 aa  256  5e-67  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.627963 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0161  hypothetical protein  41.25 
 
 		 330 aa  256  5e-67  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3614  hypothetical protein  42.11 
 
 		 355 aa  254  1.0000000000000001e-66  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.380289  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5565  hypothetical protein  45.92 
 
 		 335 aa  254  2.0000000000000002e-66  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.517724  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3862  hypothetical protein  44.75 
 
 		 339 aa  254  2.0000000000000002e-66  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.915599  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5112  hypothetical protein  39.6 
 
 		 325 aa  254  2.0000000000000002e-66  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.386337  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2117  hypothetical protein  42.52 
 
 		 327 aa  253  3e-66  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.299705  normal  0.290671 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4458  hypothetical protein  42.44 
 
 		 332 aa  253  4.0000000000000004e-66  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.60746  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0779  hypothetical protein  43.14 
 
 		 360 aa  253  4.0000000000000004e-66  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3178  hypothetical protein  40.72 
 
 		 328 aa  253  4.0000000000000004e-66  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000137109 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6278  hypothetical protein  43.81 
 
 		 322 aa  253  4.0000000000000004e-66  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.000130922  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2596  hypothetical protein  43.14 
 
 		 327 aa  252  6e-66  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.523201  normal  0.428813 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4947  extra-cytoplasmic solute receptor  42.63 
 
 		 327 aa  251  9.000000000000001e-66  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.395577  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1635  hypothetical protein  41.1 
 
 		 333 aa  251  1e-65  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.345549  normal  0.902401 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5035  hypothetical protein  41.19 
 
 		 339 aa  250  2e-65  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.401942  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5370  extra-cytoplasmic solute receptor  42.28 
 
 		 322 aa  250  2e-65  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.114035  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3530  hypothetical protein  42.77 
 
 		 331 aa  250  3e-65  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.175021  hitchhiker  0.00737093 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0835  hypothetical protein  40.36 
 
 		 351 aa  250  3e-65  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0180096  normal  0.0225936 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0453  hypothetical protein  41.18 
 
 		 345 aa  249  5e-65  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.533416  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4385  hypothetical protein  40 
 
 		 323 aa  249  5e-65  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.944912  normal  0.325254 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3716  hypothetical protein  41.47 
 
 		 334 aa  248  7e-65  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.128099  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0462  hypothetical protein  41.18 
 
 		 345 aa  248  7e-65  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.170176 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3721  extra-cytoplasmic solute receptor  35.76 
 
 		 345 aa  248  1e-64  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.31096 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5382  extra-cytoplasmic solute receptor  40.91 
 
 		 331 aa  246  3e-64  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.203559  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1121  hypothetical protein  42.28 
 
 		 325 aa  246  4.9999999999999997e-64  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.237862  normal  0.618143 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1041  hypothetical protein  42.28 
 
 		 327 aa  246  4.9999999999999997e-64  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4821  hypothetical protein  40.48 
 
 		 330 aa  245  6e-64  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3580  hypothetical protein  43.81 
 
 		 336 aa  245  8e-64  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.082795  normal  0.0103715 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4389  hypothetical protein  42.47 
 
 		 321 aa  245  8e-64  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.907682 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0060  hypothetical protein  40.6 
 
 		 322 aa  244  1.9999999999999999e-63  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3624  hypothetical protein  42.64 
 
 		 330 aa  243  3e-63  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.210677  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5589  hypothetical protein  42.25 
 
 		 335 aa  243  3e-63  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4876  extra-cytoplasmic solute receptor  42.14 
 
 		 328 aa  242  6e-63  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.748926  normal  0.754985 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2507  hypothetical protein  41.47 
 
 		 336 aa  242  7.999999999999999e-63  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0200  hypothetical protein  40.68 
 
 		 349 aa  241  9e-63  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2991  hypothetical protein  41.91 
 
 		 333 aa  241  1e-62  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.36978  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4274  hypothetical protein  43.1 
 
 		 318 aa  240  2e-62  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0445604  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4644  hypothetical protein  40.68 
 
 		 321 aa  240  2e-62  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.206487  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0478  hypothetical protein  41.59 
 
 		 325 aa  240  2.9999999999999997e-62  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.606939  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4853  extra-cytoplasmic solute receptor  41.61 
 
 		 314 aa  240  2.9999999999999997e-62  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0565268  normal  0.206495 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1812  hypothetical protein  41.47 
 
 		 326 aa  240  2.9999999999999997e-62  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2752  hypothetical protein  39.8 
 
 		 325 aa  240  2.9999999999999997e-62  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.299516 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4341  extra-cytoplasmic solute receptor  41.43 
 
 		 320 aa  239  2.9999999999999997e-62  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4073  extra-cytoplasmic solute receptor  40.06 
 
 		 332 aa  239  4e-62  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000509768  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2422  hypothetical protein  40.37 
 
 		 698 aa  239  4e-62  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0403526 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5278  extra-cytoplasmic solute receptor  42.18 
 
 		 331 aa  239  5.999999999999999e-62  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.777708  normal  0.21823 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3983  extra-cytoplasmic solute receptor  39.08 
 
 		 328 aa  238  6.999999999999999e-62  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0104878 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4214  hypothetical protein  41.28 
 
 		 324 aa  238  9e-62  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3894  hypothetical protein  39.51 
 
 		 321 aa  238  1e-61  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0107663  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3819  hypothetical protein  41.23 
 
 		 318 aa  238  1e-61  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.364165  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0522  hypothetical protein  42.37 
 
 		 324 aa  237  2e-61  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3884  hypothetical protein  39.08 
 
 		 328 aa  237  2e-61  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5108  extra-cytoplasmic solute receptor  39.87 
 
 		 326 aa  237  2e-61  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000000000351886  normal  0.964391 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1726  hypothetical protein  41.16 
 
 		 337 aa  237  2e-61  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.183123  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1334  hypothetical protein  40.5 
 
 		 325 aa  237  2e-61  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000781341 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1018  twin-arginine translocation pathway signal  41.28 
 
 		 328 aa  236  3e-61  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4286  extra-cytoplasmatic solute receptor  39.26 
 
 		 353 aa  236  3e-61  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.85012 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3324  hypothetical protein  38.59 
 
 		 328 aa  236  3e-61  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  decreased coverage  0.0025587  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0179  hypothetical protein  39.75 
 
 		 328 aa  236  3e-61  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.303741 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3974  hypothetical protein  38.59 
 
 		 328 aa  236  4e-61  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.406148 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3664  hypothetical protein  40.34 
 
 		 324 aa  236  4e-61  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5531  hypothetical protein  40.31 
 
 		 321 aa  236  4e-61  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0250  hypothetical protein  43.14 
 
 		 319 aa  236  4e-61  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4972  hypothetical protein  42.14 
 
 		 328 aa  236  5.0000000000000005e-61  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.345918  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4557  hypothetical protein  41.72 
 
 		 327 aa  235  8e-61  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.634039  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3145  hypothetical protein  40.26 
 
 		 333 aa  235  8e-61  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.261814  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5895  hypothetical protein  38.85 
 
 		 324 aa  235  1.0000000000000001e-60  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0219552  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1607  hypothetical protein  35.57 
 
 		 333 aa  234  1.0000000000000001e-60  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4229  twin-arginine translocation pathway signal  42.61 
 
 		 335 aa  235  1.0000000000000001e-60  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.467764  normal  0.364318 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0843  hypothetical protein  38.34 
 
 		 324 aa  234  2.0000000000000002e-60  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.593129  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0119  hypothetical protein  38.1 
 
 		 328 aa  234  2.0000000000000002e-60  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3135  hypothetical protein  41.61 
 
 		 326 aa  234  2.0000000000000002e-60  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.82433  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0801  hypothetical protein  40.87 
 
 		 323 aa  234  2.0000000000000002e-60  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.618864  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4441  hypothetical protein  39.15 
 
 		 385 aa  234  2.0000000000000002e-60  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.150685 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3671  extra-cytoplasmic solute receptor  40.73 
 
 		 334 aa  234  2.0000000000000002e-60  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0585  hypothetical protein  43.09 
 
 		 341 aa  233  3e-60  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.156752  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4289  hypothetical protein  41.47 
 
 		 322 aa  233  3e-60  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0170791  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>