212 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_3400 on replicon NC_007973
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007973  Rmet_3400  major facilitator transporter  100 
 
 		 400 aa  763    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3238  major facilitator transporter  83.7 
 
 		 373 aa  533  1e-150  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0490  major facilitator superfamily MFS_1  62.23 
 
 		 383 aa  392  1e-108  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.300495 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0503  major facilitator superfamily MFS_1  60.66 
 
 		 369 aa  383  1e-105  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.114936 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0585  putative transport transmembrane protein  60.93 
 
 		 408 aa  343  2.9999999999999997e-93  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0114  major facilitator transporter  48.66 
 
 		 403 aa  309  4e-83  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4324  major facilitator transporter  49.75 
 
 		 403 aa  294  2e-78  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0396  major facilitator superfamily MFS_1  51.07 
 
 		 373 aa  280  3e-74  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0193  major facilitator transporter  49.07 
 
 		 404 aa  277  2e-73  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.553342  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0206  major facilitator transporter  49.07 
 
 		 404 aa  277  2e-73  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0187  major facilitator transporter  47.39 
 
 		 439 aa  277  2e-73  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000715717 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0050  amino acid ABC transporter, permease protein, putative  48.66 
 
 		 372 aa  273  3e-72  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3382  major facilitator transporter  48.4 
 
 		 409 aa  273  4.0000000000000004e-72  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3157  amino acid ABC transporter, permease protein, putative  46.98 
 
 		 451 aa  273  4.0000000000000004e-72  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3830  putative amino acid ABC transporter, permease protein  48.38 
 
 		 402 aa  271  2e-71  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.852722  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3911  putative amino acid ABC transporter, permease protein  48.38 
 
 		 402 aa  271  2e-71  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.531832  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2902  amino acid ABC transporter, permease protein, putative  48.11 
 
 		 402 aa  269  8e-71  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3406  putative amino acid ABC transporter, permease protein  48.11 
 
 		 402 aa  269  8e-71  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.126603  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1638  putative amino acid ABC transporter, permease protein  48.11 
 
 		 402 aa  269  8e-71  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.501244  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2963  putative amino acid ABC transporter, permease protein  48.11 
 
 		 402 aa  269  8e-71  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.798243  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0279  major facilitator transporter  48.59 
 
 		 405 aa  267  2e-70  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.928738  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0261  major facilitator transporter  48.08 
 
 		 405 aa  264  2e-69  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.989591 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0434  major facilitator transporter  42.66 
 
 		 441 aa  215  9e-55  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2244  major facilitator transporter  41.41 
 
 		 400 aa  197  4.0000000000000005e-49  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.802988 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0923  major facilitator superfamily MFS_1  35.2 
 
 		 385 aa  190  4e-47  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.174621  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2151  major facilitator superfamily MFS_1  33.42 
 
 		 388 aa  185  1.0000000000000001e-45  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000894415  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1383  major facilitator superfamily MFS_1  42.94 
 
 		 384 aa  182  1e-44  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1715  putative transporter  35.03 
 
 		 397 aa  180  2.9999999999999997e-44  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1165  major facilitator superfamily MFS_1  33.16 
 
 		 387 aa  179  1e-43  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.104586 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1860  major facilitator superfamily MFS_1  39.28 
 
 		 385 aa  176  5e-43  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4432  major facilitator transporter  38.78 
 
 		 388 aa  174  2.9999999999999996e-42  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00669065 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1121  major facilitator transporter  33.78 
 
 		 397 aa  172  9e-42  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3423  major facilitator superfamily MFS_1  33.16 
 
 		 402 aa  171  2e-41  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5723  major facilitator superfamily MFS_1  34.04 
 
 		 378 aa  171  2e-41  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.871136 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1552  major facilitator superfamily MFS_1  32.25 
 
 		 386 aa  170  4e-41  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0840  major facilitator superfamily MFS_1  33.42 
 
 		 405 aa  170  4e-41  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1180  major facilitator transporter  40.59 
 
 		 393 aa  170  5e-41  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.260259  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4331  MFS permease  34.5 
 
 		 384 aa  169  1e-40  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.611947  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2464  major facilitator superfamily MFS_1  30.59 
 
 		 387 aa  168  2e-40  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.163506  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3207  major facilitator transporter  38.22 
 
 		 401 aa  165  1.0000000000000001e-39  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3134  major facilitator transporter  36.41 
 
 		 396 aa  164  2.0000000000000002e-39  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1853  putative transporter  37.17 
 
 		 417 aa  162  8.000000000000001e-39  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.117056  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2952  major facilitator superfamily MFS_1  35.03 
 
 		 379 aa  159  1e-37  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.105005 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8644  major facilitator superfamily MFS_1  35.11 
 
 		 407 aa  157  3e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.700499 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1167  major facilitator transporter  29.95 
 
 		 405 aa  157  3e-37  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0461  major facilitator superfamily MFS_1  35.54 
 
 		 381 aa  154  2.9999999999999998e-36  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1509  major facilitator superfamily MFS_1  28.57 
 
 		 387 aa  153  5e-36  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.553774  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3589  transporter, putative  31.94 
 
 		 383 aa  152  7e-36  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3360  major facilitator transporter  31.82 
 
 		 383 aa  151  2e-35  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0738289  normal  0.406179 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3330  major facilitator transporter  35.96 
 
 		 391 aa  151  2e-35  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1792  major facilitator superfamily protein  38.52 
 
 		 403 aa  150  4e-35  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0909  major facilitator superfamily MFS_1  36.26 
 
 		 377 aa  149  7e-35  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3832  major facilitator superfamily MFS_1  36.29 
 
 		 397 aa  148  1.0000000000000001e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15630  hypothetical protein  33.05 
 
 		 432 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0399318  hitchhiker  3.8947399999999994e-20 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1877  major facilitator superfamily MFS_1  33.15 
 
 		 392 aa  147  2.0000000000000003e-34  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1109  major facilitator superfamily MFS_1  32.29 
 
 		 389 aa  146  5e-34  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0848827  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2159  major facilitator superfamily MFS_1  32.18 
 
 		 391 aa  146  6e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0853792  normal  0.5938 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4160  major facilitator superfamily MFS_1  35.58 
 
 		 396 aa  143  5e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5362  major facilitator superfamily MFS_1  31.93 
 
 		 403 aa  142  1.9999999999999998e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1100  major facilitator transporter  33.42 
 
 		 386 aa  141  1.9999999999999998e-32  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4432  major facilitator transporter  35.46 
 
 		 419 aa  140  3e-32  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3896  hypothetical protein  35.28 
 
 		 401 aa  139  1e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.446184 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1792  major facilitator superfamily MFS_1  33.33 
 
 		 386 aa  137  4e-31  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1162  major facilitator transporter  33.94 
 
 		 384 aa  137  4e-31  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.019331  normal  0.470763 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2920  major facilitator transporter  34.49 
 
 		 382 aa  137  4e-31  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.146582 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3086  major facilitator superfamily MFS_1  36.67 
 
 		 391 aa  137  5e-31  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.269541 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1499  major facilitator superfamily MFS_1  34.03 
 
 		 379 aa  136  6.0000000000000005e-31  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.276684  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3207  major facilitator superfamily MFS_1  31.17 
 
 		 389 aa  135  9.999999999999999e-31  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3084  major facilitator superfamily MFS_1  33.42 
 
 		 415 aa  134  3e-30  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.11728  normal  0.436987 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1615  hypothetical protein  35.74 
 
 		 383 aa  133  3.9999999999999996e-30  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0289  major facilitator superfamily MFS_1  30.18 
 
 		 408 aa  133  5e-30  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.580244  normal  0.107939 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18660  hypothetical protein  35.44 
 
 		 383 aa  132  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.166024 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3265  major facilitator transporter  33.42 
 
 		 384 aa  132  1.0000000000000001e-29  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.025013  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1070  putative transporter  32.89 
 
 		 378 aa  131  2.0000000000000002e-29  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.44302  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1181  transporter, putative  35.03 
 
 		 377 aa  132  2.0000000000000002e-29  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.510237  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0062  putative transporter  32.89 
 
 		 378 aa  131  2.0000000000000002e-29  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0357  putative transporter  32.89 
 
 		 378 aa  131  2.0000000000000002e-29  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.39371  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1647  major facilitator family transporter  32.89 
 
 		 378 aa  131  2.0000000000000002e-29  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1229  putative transporter  32.89 
 
 		 378 aa  131  2.0000000000000002e-29  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.277921  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0228  putative transport protein  32.89 
 
 		 378 aa  130  3e-29  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.402008  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2868  major facilitator transporter  32.68 
 
 		 399 aa  130  3e-29  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2912  major facilitator superfamily transporter  32.68 
 
 		 399 aa  130  3e-29  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.452412  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2898  major facilitator transporter  32.68 
 
 		 399 aa  130  3e-29  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.681989 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5020  major facilitator superfamily MFS_1  30.43 
 
 		 390 aa  130  4.0000000000000003e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.850855  normal  0.118195 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2285  major facilitator transporter  24.14 
 
 		 386 aa  130  4.0000000000000003e-29  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1735  major facilitator superfamily permease  32.62 
 
 		 378 aa  129  8.000000000000001e-29  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2841  major facilitator transporter  33.79 
 
 		 384 aa  128  2.0000000000000002e-28  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.968636  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2808  major facilitator superfamily MFS_1  30.91 
 
 		 398 aa  128  2.0000000000000002e-28  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.794185  normal  0.146653 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2762  major facilitator transporter  33.79 
 
 		 384 aa  128  2.0000000000000002e-28  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00913666  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1443  major facilitator transporter  33.79 
 
 		 384 aa  128  2.0000000000000002e-28  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00314587  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1047  major facilitator superfamily MFS_1  35.42 
 
 		 387 aa  127  3e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.743504  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3174  major facilitator superfamily transporter  30.93 
 
 		 396 aa  127  3e-28  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.273368  normal  0.04307 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2626  putative major facilitator superfamily (MFS) transporter  36.83 
 
 		 392 aa  127  3e-28  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.686935  hitchhiker  0.0081174 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7621  major facilitator superfamily permease  33.42 
 
 		 398 aa  127  5e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.262333 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3065  MFS family transporter  34.42 
 
 		 377 aa  123  5e-27  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0451681  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8112  major facilitator transporter  31.65 
 
 		 396 aa  123  5e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.743041 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36380  sugar phosphate permease  30.48 
 
 		 447 aa  123  7e-27  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0408  major facilitator transporter  30.15 
 
 		 443 aa  122  9.999999999999999e-27  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.964674 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2067  putative transport protein (permease)  33.04 
 
 		 379 aa  120  3e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.212256 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5894  major facilitator transporter  33.43 
 
 		 389 aa  120  4.9999999999999996e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>