126 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_3395 on replicon NC_007973
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007973  Rmet_3395  hypothetical protein  100 
 
 		 432 aa  872    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3232  hypothetical protein  66.13 
 
 		 419 aa  517  1.0000000000000001e-145  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0597283  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0335  hypothetical protein  65.57 
 
 		 247 aa  339  7e-92  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  unclonable  0.000000000159017  normal  0.161063 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2085  hypothetical protein  67.21 
 
 		 249 aa  338  9.999999999999999e-92  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000000370224  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2044  hypothetical protein  66.13 
 
 		 249 aa  335  9e-91  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0376115  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1873  hypothetical protein  63.82 
 
 		 252 aa  334  2e-90  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0316  hypothetical protein  67.49 
 
 		 264 aa  330  2e-89  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2071  hypothetical protein  64.08 
 
 		 247 aa  330  4e-89  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  0.00000154426  normal  0.408823 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2419  hypothetical protein  64.34 
 
 		 247 aa  324  2e-87  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7469  protein of unknown function DUF88  61.38 
 
 		 260 aa  308  8e-83  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6293  protein of unknown function DUF88  59.2 
 
 		 262 aa  305  1.0000000000000001e-81  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0670  protein of unknown function DUF88  61.06 
 
 		 234 aa  293  6e-78  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.135963  normal  0.923562 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0650  protein of unknown function DUF88  61.06 
 
 		 234 aa  293  6e-78  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3691  hypothetical protein  58.49 
 
 		 272 aa  290  3e-77  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3535  hypothetical protein  57.94 
 
 		 264 aa  286  5e-76  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.098439  normal  0.0144387 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0520  hypothetical protein  54.84 
 
 		 262 aa  281  2e-74  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2871  hypothetical protein  59.19 
 
 		 240 aa  278  9e-74  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.234327 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_11160  conserved hypothetical protein  54.66 
 
 		 262 aa  276  4e-73  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.997063  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0806  protein of unknown function DUF88  52.63 
 
 		 246 aa  271  1e-71  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.806829  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2768  hypothetical protein  53.67 
 
 		 272 aa  271  2e-71  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1453  hypothetical protein  50.41 
 
 		 258 aa  266  4e-70  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.55452  normal  0.529403 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2410  hypothetical protein  49.8 
 
 		 259 aa  261  1e-68  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.727494  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0707  protein of unknown function DUF88  49.8 
 
 		 258 aa  259  5.0000000000000005e-68  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000235983  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1822  hypothetical protein  49.62 
 
 		 275 aa  258  2e-67  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.81231  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0095  hypothetical protein  53.36 
 
 		 273 aa  254  3e-66  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0117028  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4482  hypothetical protein  50.83 
 
 		 267 aa  248  2e-64  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4005  hypothetical protein  49.2 
 
 		 263 aa  245  9.999999999999999e-64  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.52012  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2652  protein of unknown function DUF88  47.35 
 
 		 253 aa  243  6e-63  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000246678  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3603  protein of unknown function DUF88  50.19 
 
 		 259 aa  243  7e-63  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.162611  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0118  hypothetical protein  46.07 
 
 		 286 aa  240  2.9999999999999997e-62  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.122838  n/a   
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4745  hypothetical protein  49.6 
 
 		 246 aa  239  9e-62  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03707  hypothetical protein  50.84 
 
 		 276 aa  233  4.0000000000000004e-60  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1025  hypothetical protein  45.08 
 
 		 260 aa  228  1e-58  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0102117  normal  0.260028 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0476  hypothetical protein  43.56 
 
 		 265 aa  227  3e-58  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3658  hypothetical protein  45.16 
 
 		 242 aa  226  7e-58  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.339092  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0704  hypothetical protein  44.15 
 
 		 268 aa  223  4e-57  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3564  hypothetical protein  43.77 
 
 		 268 aa  220  3e-56  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0656546 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1869  hypothetical protein  47.11 
 
 		 335 aa  218  2e-55  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.670416  normal  0.501233 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2026  hypothetical protein  46.69 
 
 		 270 aa  218  2e-55  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0659  hypothetical protein  46.69 
 
 		 262 aa  217  4e-55  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1934  protein of unknown function DUF88  41.23 
 
 		 552 aa  214  1.9999999999999998e-54  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.0000288494  normal  0.0274849 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1386  hypothetical protein  39.46 
 
 		 303 aa  211  2e-53  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.351938  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3025  protein of unknown function DUF88  42.69 
 
 		 285 aa  209  7e-53  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.775317  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3744  hypothetical protein  42.75 
 
 		 287 aa  208  2e-52  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0048  hypothetical protein  44.67 
 
 		 239 aa  204  3e-51  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.665316  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1459  hypothetical protein  44.4 
 
 		 248 aa  202  9.999999999999999e-51  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.360023  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0110  hypothetical protein  44.4 
 
 		 248 aa  202  9.999999999999999e-51  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.151004 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0057  hypothetical protein  44.35 
 
 		 246 aa  200  3e-50  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.184388 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0180  hypothetical protein  43.67 
 
 		 254 aa  200  3.9999999999999996e-50  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.124198  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5232  hypothetical protein  40.94 
 
 		 284 aa  196  9e-49  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.682006 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11150  hypothetical protein  43.78 
 
 		 314 aa  193  5e-48  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.280093 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00290  hypothetical protein  43.4 
 
 		 249 aa  193  5e-48  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0169  hypothetical protein  42.08 
 
 		 271 aa  189  7e-47  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.654892  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15160  conserved hypothetical protein TIGR00288  56.33 
 
 		 371 aa  186  9e-46  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0105  hypothetical protein  41.81 
 
 		 236 aa  181  2e-44  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05410  Protein of unknown function DUF88  37.8 
 
 		 312 aa  179  5.999999999999999e-44  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  decreased coverage  0.00000245308  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4318  hypothetical protein  52.9 
 
 		 298 aa  166  9e-40  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.577985  normal  0.180731 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2536  hypothetical protein  37.16 
 
 		 313 aa  156  8e-37  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.13473  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1180  hypothetical protein  33.62 
 
 		 259 aa  149  9e-35  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0741  protein of unknown function DUF88  35.09 
 
 		 251 aa  124  4e-27  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.614685 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0182  hypothetical protein  30 
 
 		 232 aa  121  1.9999999999999998e-26  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.518612  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0220  hypothetical protein  30 
 
 		 232 aa  121  3e-26  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0199  hypothetical protein  29.09 
 
 		 232 aa  120  3.9999999999999996e-26  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008759  Pnap_4909  hypothetical protein  30.17 
 
 		 279 aa  119  9.999999999999999e-26  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0665884  normal  0.351144 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1475  hypothetical protein  28.93 
 
 		 229 aa  117  5e-25  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1924  protein of unknown function DUF88  25.64 
 
 		 334 aa  102  1e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.000000499479  unclonable  0.0000000129019 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0714  hypothetical protein  27.97 
 
 		 498 aa  94.4  3e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1193  hypothetical protein  27.97 
 
 		 498 aa  94.4  3e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1190  protein of unknown function DUF88  28.89 
 
 		 275 aa  94.7  3e-18  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1072  hypothetical protein  28.35 
 
 		 507 aa  94  5e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1168  hypothetical protein  27.59 
 
 		 498 aa  93.2  9e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.628977  normal  0.0240517 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4302  hypothetical protein  27.48 
 
 		 496 aa  92.4  1e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.160322  normal  0.186883 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2113  hypothetical protein  28.74 
 
 		 508 aa  92.8  1e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.827349  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3120  hypothetical protein  28.46 
 
 		 264 aa  92.4  1e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.462437  normal  0.0322119 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1798  hypothetical protein  28.68 
 
 		 483 aa  89.7  8e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.237942  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0347  hypothetical protein  28.68 
 
 		 483 aa  89.7  9e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3189  hypothetical protein  27.2 
 
 		 421 aa  89.4  1e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1099  hypothetical protein  29.06 
 
 		 472 aa  89  2e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.167735  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3462  hypothetical protein  40.15 
 
 		 225 aa  88.6  2e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0939176 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1734  hypothetical protein  29.75 
 
 		 249 aa  88.6  2e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.322719 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2205  hypothetical protein  27.48 
 
 		 381 aa  88.2  3e-16  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0541  hypothetical protein  27.31 
 
 		 440 aa  88.2  3e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1883  hypothetical protein  28.96 
 
 		 477 aa  87.8  4e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.148092  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0775  hypothetical protein  28.35 
 
 		 480 aa  85.9  0.000000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.193151  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1700  protein of unknown function DUF88  26.59 
 
 		 564 aa  85.1  0.000000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0123455  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3191  protein of unknown function DUF88  26.14 
 
 		 478 aa  84.3  0.000000000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.000122431  normal  0.16823 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0356  hypothetical protein  39.81 
 
 		 160 aa  82.8  0.00000000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0198586 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1940  hypothetical protein  33.56 
 
 		 308 aa  82.4  0.00000000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1542  hypothetical protein  28.88 
 
 		 272 aa  78.2  0.0000000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2905  protein of unknown function DUF88  29.46 
 
 		 253 aa  75.9  0.000000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.489552  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2999  protein of unknown function DUF88  29.46 
 
 		 253 aa  75.9  0.000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2817  hypothetical protein  29.46 
 
 		 253 aa  75.5  0.000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.556577  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3809  protein of unknown function DUF88  33.76 
 
 		 319 aa  75.5  0.000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.154504  normal  0.410999 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0857  protein of unknown function DUF88  36.57 
 
 		 275 aa  73.9  0.000000000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0980  protein of unknown function DUF88  23.14 
 
 		 260 aa  66.6  0.0000000007  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04690  hypothetical protein  31.4 
 
 		 412 aa  63.2  0.000000008  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3452  hypothetical protein  31.96 
 
 		 282 aa  62  0.00000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0855  protein of unknown function DUF88  34.69 
 
 		 272 aa  62  0.00000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3241  hypothetical protein  27.11 
 
 		 789 aa  62  0.00000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000142022  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2090  hypothetical protein  25.53 
 
 		 268 aa  61.6  0.00000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.164001 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>