More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_3245 on replicon NC_007973
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007973  Rmet_3245  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  100 
 
 		 207 aa  405  1.0000000000000001e-112  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3108  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  93.72 
 
 		 207 aa  362  2e-99  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2949  hypothetical protein  79.71 
 
 		 207 aa  335  1.9999999999999998e-91  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.514078  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3226  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  77.78 
 
 		 207 aa  331  5e-90  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2879  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  77.29 
 
 		 207 aa  311  3.9999999999999997e-84  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0513768 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0401  MarC family multiple antibiotic resistance protein  66.99 
 
 		 206 aa  288  4e-77  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2711  MarC membrane protein  69.27 
 
 		 206 aa  286  1e-76  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3721  MarC membrane protein  69.27 
 
 		 206 aa  286  1e-76  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.596949  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3690  hypothetical protein  69.27 
 
 		 206 aa  286  1e-76  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.984937  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3526  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  67.96 
 
 		 206 aa  287  1e-76  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.303666  normal  0.286765 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2990  hypothetical protein  69.27 
 
 		 206 aa  286  1e-76  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.792349  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2762  MarC membrane protein  69.27 
 
 		 206 aa  286  1e-76  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3242  MarC membrane protein  69.27 
 
 		 206 aa  286  1e-76  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3663  MarC membrane protein  69.27 
 
 		 206 aa  286  1e-76  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1791  MarC membrane protein  69.27 
 
 		 206 aa  286  1e-76  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3557  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  66.02 
 
 		 206 aa  285  2.9999999999999996e-76  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.247513  hitchhiker  0.0000492857 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2679  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  67.96 
 
 		 206 aa  285  4e-76  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.356849  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0428  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  67.96 
 
 		 206 aa  285  4e-76  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0407  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  67.96 
 
 		 206 aa  284  5.999999999999999e-76  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.190902 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0346  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  67.48 
 
 		 206 aa  284  8e-76  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.383588  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0355  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  66.99 
 
 		 206 aa  283  1.0000000000000001e-75  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.458882 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0331  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  67.48 
 
 		 206 aa  282  3.0000000000000004e-75  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2756  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  65.05 
 
 		 206 aa  277  1e-73  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0187  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  53.59 
 
 		 213 aa  226  2e-58  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3804  putative transmembrane protein  54.07 
 
 		 239 aa  216  2e-55  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0273275 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0238  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  53.33 
 
 		 210 aa  213  1.9999999999999998e-54  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0319  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  54.07 
 
 		 211 aa  211  4.9999999999999996e-54  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0253  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  53.08 
 
 		 212 aa  210  1e-53  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.592133  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0258  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  53.08 
 
 		 212 aa  210  1e-53  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0133581 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0186  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  52.61 
 
 		 210 aa  206  2e-52  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.969233  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0417  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  52.76 
 
 		 202 aa  204  9e-52  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3813  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  48.29 
 
 		 206 aa  199  3e-50  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0677256  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0054  integral membrane protein, MarC family  47.78 
 
 		 216 aa  191  5e-48  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.207585  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0055  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  47.78 
 
 		 218 aa  191  6e-48  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0468967  normal  0.907646 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4933  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  50.48 
 
 		 217 aa  191  7e-48  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.19467  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0372  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  50.24 
 
 		 215 aa  187  1e-46  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1962  hypothetical protein  44.5 
 
 		 214 aa  179  2.9999999999999997e-44  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2071  hypothetical protein  44.5 
 
 		 214 aa  179  2.9999999999999997e-44  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0381177  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2164  hypothetical protein  44.5 
 
 		 214 aa  177  7e-44  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.033055  normal  0.026113 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2703  hypothetical protein  44 
 
 		 214 aa  176  2e-43  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000872945  hitchhiker  0.000692167 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1910  hypothetical protein  44.88 
 
 		 207 aa  174  9.999999999999999e-43  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000000443138  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2303  hypothetical protein  44.33 
 
 		 215 aa  172  1.9999999999999998e-42  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.45168  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2196  hypothetical protein  43 
 
 		 214 aa  172  2.9999999999999996e-42  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.522591  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1694  hypothetical protein  43.56 
 
 		 210 aa  169  2e-41  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.0657108 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01216  predicted inner membrane protein  44.33 
 
 		 215 aa  168  5e-41  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2408  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  44.33 
 
 		 215 aa  168  5e-41  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000022238  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1900  hypothetical protein  44.33 
 
 		 215 aa  168  5e-41  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.382554  normal  0.103806 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1407  hypothetical protein  44.33 
 
 		 215 aa  168  5e-41  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.090251  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1351  hypothetical protein  44.33 
 
 		 215 aa  168  5e-41  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000939425  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1390  hypothetical protein  44.33 
 
 		 215 aa  168  5e-41  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.718233  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2386  hypothetical protein  44.33 
 
 		 215 aa  168  5e-41  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.377039  hitchhiker  0.00000152892 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1726  hypothetical protein  44.33 
 
 		 215 aa  168  5e-41  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.345038  normal  0.523448 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01226  hypothetical protein  44.33 
 
 		 215 aa  168  5e-41  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1580  hypothetical protein  43.84 
 
 		 215 aa  167  1e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.439502  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1881  hypothetical protein  43.84 
 
 		 215 aa  167  1e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.66407 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1875  hypothetical protein  43.84 
 
 		 215 aa  167  1e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.67019  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1938  hypothetical protein  43.84 
 
 		 215 aa  167  1e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.476555 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1397  hypothetical protein  43.84 
 
 		 215 aa  167  1e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.126468  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1684  hypothetical protein  42.65 
 
 		 210 aa  166  2e-40  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.197685  normal  0.181239 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1789  hypothetical protein  42.65 
 
 		 210 aa  166  2e-40  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.153384  normal  0.0804929 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1759  hypothetical protein  42.65 
 
 		 210 aa  166  2.9999999999999998e-40  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0131249  normal  0.465228 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1911  hypothetical protein  42.57 
 
 		 213 aa  165  4e-40  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0139262  unclonable  0.00000197593 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002930  multiple antibiotic transporter  42.36 
 
 		 212 aa  165  4e-40  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000449619  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2137  hypothetical protein  42.65 
 
 		 210 aa  164  1.0000000000000001e-39  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2348  hypothetical protein  44.06 
 
 		 210 aa  164  1.0000000000000001e-39  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0647314  hitchhiker  0.000000838099 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1812  hypothetical protein  42.65 
 
 		 210 aa  164  1.0000000000000001e-39  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03019  hypothetical protein  42.86 
 
 		 212 aa  163  2.0000000000000002e-39  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1923  hypothetical protein  42.16 
 
 		 210 aa  162  3e-39  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2370  hypothetical protein  42.16 
 
 		 210 aa  162  3e-39  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0117247  normal  0.036415 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1949  hypothetical protein  42.16 
 
 		 210 aa  162  3e-39  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0303133  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1956  hypothetical protein  42.16 
 
 		 210 aa  162  3e-39  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.466227 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2242  hypothetical protein  41.79 
 
 		 212 aa  162  4.0000000000000004e-39  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.177472  normal  0.0116098 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2045  hypothetical protein  41.71 
 
 		 207 aa  159  3e-38  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00255531  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2154  hypothetical protein  42.44 
 
 		 210 aa  154  1e-36  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0620075  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1620  hypothetical protein  42 
 
 		 212 aa  153  2e-36  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.079521  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1233  hypothetical protein  39.7 
 
 		 208 aa  153  2e-36  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0570  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  37.25 
 
 		 217 aa  152  4e-36  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1961  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  35.38 
 
 		 213 aa  142  3e-33  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1278  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  34.15 
 
 		 212 aa  140  1.9999999999999998e-32  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0686  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  34 
 
 		 213 aa  134  8e-31  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2143  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  35.61 
 
 		 214 aa  134  8e-31  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1406  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  34 
 
 		 213 aa  134  9e-31  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0428  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  32.21 
 
 		 219 aa  134  9e-31  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.157732  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0161  hypothetical protein  34.48 
 
 		 210 aa  133  1.9999999999999998e-30  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1270  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  33.67 
 
 		 213 aa  133  1.9999999999999998e-30  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2097  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  35 
 
 		 206 aa  132  3.9999999999999996e-30  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1818  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  37 
 
 		 205 aa  132  3.9999999999999996e-30  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.397202 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1410  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  40.53 
 
 		 231 aa  131  6e-30  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0451  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  31 
 
 		 219 aa  129  3e-29  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0603  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  33.66 
 
 		 201 aa  129  3e-29  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.708242  normal  0.450021 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0635  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  33.17 
 
 		 201 aa  128  5.0000000000000004e-29  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.586575 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1199  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  36.76 
 
 		 217 aa  128  8.000000000000001e-29  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1832  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  36.22 
 
 		 211 aa  126  2.0000000000000002e-28  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.475063  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1917  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  36.6 
 
 		 211 aa  126  2.0000000000000002e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0692726  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1556  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  37.38 
 
 		 216 aa  126  3e-28  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0717  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  36.76 
 
 		 217 aa  124  1e-27  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  decreased coverage  0.000442646  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0364  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  29.8 
 
 		 231 aa  121  7e-27  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.840532  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3711  multiple antibiotic resistance protein  39.38 
 
 		 212 aa  120  9.999999999999999e-27  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.372343  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0527  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  39.59 
 
 		 212 aa  120  9.999999999999999e-27  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3347  multiple drug resistance protein MarC  34.17 
 
 		 217 aa  120  9.999999999999999e-27  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.123982 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>