More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_3178 on replicon NC_007973
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009379  Pnuc_0148  anthranilate synthase component I  68.63 
 
 
501 aa  712    Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.315921  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0644  anthranilate synthase component I  80.31 
 
 
522 aa  819    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2881  anthranilate synthase component I  86.44 
 
 
509 aa  897    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.889445 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2758  anthranilate synthase component I  85.49 
 
 
510 aa  885    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.654997  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0533  anthranilate synthase component I  80.31 
 
 
497 aa  820    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.137643  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0752  anthranilate synthase component I  71.51 
 
 
499 aa  721    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3023  anthranilate synthase component I  93.7 
 
 
505 aa  972    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0594824  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0162  anthranilate synthase component I  67.25 
 
 
501 aa  698    Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.487235  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3575  anthranilate synthase component I  80.31 
 
 
522 aa  819    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.889198  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3463  anthranilate synthase component I  70.83 
 
 
491 aa  707    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0715652 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3621  anthranilate synthase component I  78.94 
 
 
497 aa  812    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3897  anthranilate synthase component I  70.44 
 
 
495 aa  701    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.839724 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3496  anthranilate synthase component I  80.31 
 
 
497 aa  800    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.703327  hitchhiker  0.000325099 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0506  anthranilate synthase component I  79.13 
 
 
497 aa  813    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.978551 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2909  anthranilate synthase component I  80.12 
 
 
522 aa  818    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0366  anthranilate synthase component I  71.91 
 
 
519 aa  743    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2698  anthranilate synthase component I  80.71 
 
 
497 aa  830    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0356  anthranilate synthase component I  71.91 
 
 
499 aa  743    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3123  anthranilate synthase component I  85.69 
 
 
510 aa  885    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.274281  normal  0.443979 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3607  anthranilate synthase component I  70.92 
 
 
503 aa  708    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4457  anthranilate synthase component I  68 
 
 
526 aa  708    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.989225 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0461  anthranilate synthase component I  80.71 
 
 
497 aa  801    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3556  anthranilate synthase component I  80.31 
 
 
522 aa  819    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.317199  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3178  anthranilate synthase component I  100 
 
 
508 aa  1030    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2571  anthranilate synthase component I  79.33 
 
 
497 aa  815    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0573  anthranilate synthase component I  70.33 
 
 
500 aa  699    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0940  anthranilate synthase component I  80.31 
 
 
522 aa  819    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1212  anthranilate synthase component I  71.32 
 
 
517 aa  729    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.18446  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0442  anthranilate synthase component I  71.12 
 
 
499 aa  728    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.223622 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0439  anthranilate synthase component I  79.13 
 
 
497 aa  816    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.629503  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0463  anthranilate synthase component I  79.13 
 
 
497 aa  816    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.612638  normal  0.521627 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1910  anthranilate synthase component I  80.31 
 
 
522 aa  819    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3583  anthranilate synthase component I  80.31 
 
 
522 aa  819    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0534  anthranilate synthase component I  79.33 
 
 
497 aa  815    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2860  anthranilate synthase component I  79.33 
 
 
497 aa  815    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.167727  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3654  anthranilate synthase component I  70.14 
 
 
499 aa  714    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.915059 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2471  anthranilate synthase, component I  62.06 
 
 
494 aa  617  1e-175  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3481  anthranilate synthase component I  60.67 
 
 
491 aa  604  1.0000000000000001e-171  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.219559 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2228  anthranilate synthase, component I  62.97 
 
 
521 aa  603  1.0000000000000001e-171  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2369  anthranilate synthase component I  60.59 
 
 
493 aa  594  1e-168  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0926  anthranilate synthase component I  59.29 
 
 
490 aa  573  1.0000000000000001e-162  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3997  anthranilate synthase component I  57.09 
 
 
496 aa  563  1.0000000000000001e-159  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.346347  normal  0.520041 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46640  anthranilate synthase component I  56.19 
 
 
492 aa  560  1e-158  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2362  anthranilate synthase component I  57.4 
 
 
495 aa  555  1e-157  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0448  anthranilate synthase component I  55.12 
 
 
493 aa  548  1e-155  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.422801  normal  0.519955 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0417  anthranilate synthase component I  55.12 
 
 
493 aa  547  1e-154  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.446736  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4609  anthranilate synthase component I  55.58 
 
 
493 aa  547  1e-154  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0451  anthranilate synthase component I  54.71 
 
 
493 aa  545  1e-154  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.365985 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4785  anthranilate synthase component I  54.72 
 
 
493 aa  543  1e-153  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.830549  normal  0.531444 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2323  anthranilate synthase, component I  55.86 
 
 
518 aa  542  1e-153  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.933209  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3517  anthranilate synthase component I  54.58 
 
 
495 aa  542  1e-153  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.789365  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2082  anthranilate synthase component I  55.77 
 
 
491 aa  540  9.999999999999999e-153  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0568  anthranilate synthase, component I  54.1 
 
 
493 aa  540  9.999999999999999e-153  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2877  anthranilate synthase component I  55.01 
 
 
489 aa  534  1e-150  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0753  anthranilate synthase component I  55.58 
 
 
492 aa  530  1e-149  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.196571  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07940  anthranilate synthase component I  55.8 
 
 
492 aa  530  1e-149  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00127058 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2494  anthranilate synthase component I  55.56 
 
 
492 aa  528  1e-148  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.184686  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5118  anthranilate synthase component I  54.4 
 
 
492 aa  526  1e-148  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0266  anthranilate synthase component I  52.63 
 
 
501 aa  525  1e-148  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2584  anthranilate synthase component I  55.38 
 
 
495 aa  523  1e-147  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2250  anthranilate synthase component I  54.39 
 
 
502 aa  524  1e-147  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.327103  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0747  anthranilate synthase, component I  52.83 
 
 
493 aa  519  1e-146  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04195  anthranilate synthase component I  53.63 
 
 
491 aa  515  1.0000000000000001e-145  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2109  anthranilate synthase component I  52.94 
 
 
502 aa  516  1.0000000000000001e-145  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.490453  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2846  anthranilate synthase component I  55.36 
 
 
505 aa  508  9.999999999999999e-143  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0361965  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3245  anthranilate synthase component I  55.36 
 
 
505 aa  508  9.999999999999999e-143  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.459901  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3722  anthranilate synthase component I  53.44 
 
 
491 aa  503  1e-141  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.803971 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0179  anthranilate synthase component I  51.87 
 
 
501 aa  493  9.999999999999999e-139  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0157  anthranilate synthase component I  51.67 
 
 
501 aa  494  9.999999999999999e-139  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2497  anthranilate synthase, component I  51.09 
 
 
491 aa  474  1e-132  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000612726  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1122  anthranilate synthase, component I  50.29 
 
 
496 aa  459  9.999999999999999e-129  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00596141  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2383  anthranilate synthase component I  47.94 
 
 
491 aa  444  1e-123  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1731  anthranilate synthase component I  47.13 
 
 
491 aa  443  1e-123  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1804  anthranilate synthase component I  48.12 
 
 
491 aa  444  1e-123  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0147265 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2547  anthranilate synthase component I  48.22 
 
 
491 aa  439  9.999999999999999e-123  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000521944  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2413  anthranilate synthase component I  47.33 
 
 
491 aa  439  9.999999999999999e-123  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0730  anthranilate synthase, component I  46.56 
 
 
494 aa  435  1e-120  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4721  anthranilate synthase, component I  44.77 
 
 
504 aa  423  1e-117  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1582  anthranilate synthase component I  46.53 
 
 
491 aa  423  1e-117  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.0000405168  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1481  anthranilate synthase component I  44.82 
 
 
485 aa  419  1e-116  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3594  anthranilate synthase component I  42.89 
 
 
503 aa  417  9.999999999999999e-116  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1271  anthranilate synthase, component I  44.82 
 
 
485 aa  417  9.999999999999999e-116  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1246  anthranilate synthase component I  44.27 
 
 
492 aa  417  9.999999999999999e-116  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1251  anthranilate/para-aminobenzoate synthass component I  45.22 
 
 
485 aa  412  1e-114  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0875  anthranilate synthase, component I  45.28 
 
 
494 aa  411  1e-113  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000225677  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3792  anthranilate synthase, component I  44.83 
 
 
511 aa  409  1e-113  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2132  anthranilate synthase component I  48.08 
 
 
500 aa  410  1e-113  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1162  anthranilate synthase component I  47.07 
 
 
485 aa  405  1e-111  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.127235  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1143  anthranilate synthase component I  46.4 
 
 
503 aa  404  1e-111  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.0793229 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1776  anthranilate synthase  45.33 
 
 
530 aa  403  1e-111  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3579  anthranilate synthase component I  46.41 
 
 
574 aa  394  1e-108  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.736027  normal  0.0487715 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0386  anthranilate synthase component I  43.33 
 
 
507 aa  392  1e-108  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.994927  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0904  anthranilate synthase component I  43.79 
 
 
497 aa  392  1e-108  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0377  anthranilate synthase component I  43.33 
 
 
507 aa  393  1e-108  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1796  anthranilate synthase component I  44.62 
 
 
509 aa  394  1e-108  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.00033121  normal  0.176001 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4552  anthranilate synthase component I  43.64 
 
 
508 aa  394  1e-108  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1468  anthranilate synthase component I  45.09 
 
 
496 aa  392  1e-107  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.408149  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1891  anthranilate synthase component I  45.22 
 
 
504 aa  389  1e-107  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  decreased coverage  0.00894891  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4120  anthranilate synthase, component I  46.55 
 
 
489 aa  391  1e-107  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.622363  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1783  anthranilate synthase component I  45.96 
 
 
498 aa  390  1e-107  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.589436  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>