142 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_3125 on replicon NC_007973
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007973  Rmet_3125  cell division protein FtsQ  100 
 
 
300 aa  608  1e-173  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2976  cell division protein FtsQ  83.67 
 
 
294 aa  452  1.0000000000000001e-126  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.958191  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2841  putative cell division transmembrane protein  68.36 
 
 
299 aa  351  8e-96  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3086  Polypeptide-transport-associated domain protein FtsQ-type  64.5 
 
 
303 aa  348  9e-95  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2721  cell division protein FtsQ  64.5 
 
 
303 aa  347  1e-94  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2833  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  55.86 
 
 
250 aa  256  4e-67  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.000280119  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0080  cell division protein FtsQ  55.47 
 
 
250 aa  254  1.0000000000000001e-66  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0168578  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0562  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  55.47 
 
 
250 aa  254  1.0000000000000001e-66  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.000118415  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0533  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  55.47 
 
 
250 aa  254  1.0000000000000001e-66  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000284929  normal  0.537044 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3648  cell division protein FtsQ  55.47 
 
 
250 aa  253  2.0000000000000002e-66  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0726048  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0491  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  55.08 
 
 
250 aa  252  5.000000000000001e-66  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00415174  normal  0.980179 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0466  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  55.08 
 
 
250 aa  251  8.000000000000001e-66  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0206402  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3467  Polypeptide-transport-associated domain protein FtsQ-type  53.12 
 
 
250 aa  251  9.000000000000001e-66  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.0000457508  hitchhiker  0.00184571 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1121  cell division protein FtsQ  54.69 
 
 
250 aa  250  2e-65  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0489  putative cell division transmembrane protein, FtsQ  52.34 
 
 
250 aa  250  2e-65  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0227105  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3541  cell division protein FtsQ  54.69 
 
 
250 aa  249  5e-65  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3522  cell division protein FtsQ  54.69 
 
 
250 aa  249  5e-65  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3547  cell division protein FtsQ  54.69 
 
 
250 aa  249  5e-65  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2670  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  53.91 
 
 
250 aa  247  1e-64  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.597575  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2548  cell division protein FtsQ  54.3 
 
 
250 aa  246  3e-64  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0469  cell division protein FtsQ  54.3 
 
 
250 aa  246  3e-64  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1328  cell division protein FtsQ  54.3 
 
 
250 aa  246  3e-64  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.64132  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3235  cell division protein FtsQ  54.3 
 
 
250 aa  246  3e-64  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0184  Polypeptide-transport-associated domain protein FtsQ-type  43.95 
 
 
291 aa  241  1e-62  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.00000203448  normal  0.635947 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0170  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  43.6 
 
 
285 aa  236  3e-61  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.000748343  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3422  cell division protein FtsQ  39.69 
 
 
261 aa  175  8e-43  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0109041  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0922  cell division protein FtsQ  39.68 
 
 
262 aa  170  3e-41  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.130342  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3424  cell division protein FtsQ  38.2 
 
 
287 aa  169  5e-41  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.291979  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1078  cell division protein FtsQ  38.55 
 
 
267 aa  166  2.9999999999999998e-40  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0136029  normal  0.503505 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3667  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  37.05 
 
 
277 aa  166  4e-40  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.364111  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2977  cell division protein FtsQ  37.05 
 
 
277 aa  166  4e-40  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  decreased coverage  0.00192048  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3414  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  37.8 
 
 
263 aa  163  3e-39  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0285361  normal  0.709755 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2490  cell division protein FtsQ  37.2 
 
 
236 aa  161  1e-38  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1473  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  38.11 
 
 
266 aa  159  5e-38  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.132552  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0465  cell division protein FtsQ  38.55 
 
 
268 aa  159  7e-38  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.126292 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2265  cell division protein FtsQ  37.1 
 
 
243 aa  155  1e-36  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.245819  hitchhiker  0.00532421 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4573  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  37.67 
 
 
294 aa  154  2e-36  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0515888  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0824  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  38.65 
 
 
275 aa  153  2.9999999999999998e-36  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.586164 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3495  cell division protein FtsQ  37.2 
 
 
246 aa  149  8e-35  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0823778  normal  0.301759 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0123  cell division protein FtsQ  37.55 
 
 
258 aa  140  3.9999999999999997e-32  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0118462  normal  0.0546575 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0525  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  36.65 
 
 
267 aa  138  1e-31  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.981478 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1968  cell division protein  28.69 
 
 
243 aa  115  8.999999999999998e-25  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.00917782  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0228  cell division protein FtsQ  28.69 
 
 
243 aa  115  8.999999999999998e-25  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000146493  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2642  cell division protein FtsQ  29.87 
 
 
256 aa  112  9e-24  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2087  cell division protein FtsQ  34.35 
 
 
263 aa  110  3e-23  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.588433  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3516  cell division protein FtsQ  32.82 
 
 
253 aa  108  9.000000000000001e-23  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.320398  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2189  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  35.48 
 
 
271 aa  108  1e-22  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.171516  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3809  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  31.22 
 
 
262 aa  107  2e-22  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000142789  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2857  cell division protein FtsQ  31.33 
 
 
265 aa  107  3e-22  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.0000000516173  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0605  Polypeptide-transport-associated domain protein FtsQ-type  34.3 
 
 
249 aa  106  6e-22  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3568  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  35.23 
 
 
249 aa  103  3e-21  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00488652  hitchhiker  0.0000000422237 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0388  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  35.23 
 
 
249 aa  103  3e-21  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.109832  hitchhiker  0.00233636 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3741  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  35.23 
 
 
249 aa  103  3e-21  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0016419  hitchhiker  0.000000228967 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04364  cell division protein FtsQ  32.5 
 
 
273 aa  103  5e-21  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.749304  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0489  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  35.8 
 
 
249 aa  103  5e-21  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000145309  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3802  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  35.68 
 
 
256 aa  102  6e-21  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0128831  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3451  cell division protein FtsQ  32.56 
 
 
254 aa  102  6e-21  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.188936  hitchhiker  0.000214204 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4531  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  35.23 
 
 
218 aa  102  6e-21  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0127742  hitchhiker  0.000127547 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4217  cell division protein FtsQ  35.23 
 
 
262 aa  102  7e-21  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0429  cell division protein FtsQ  36.36 
 
 
249 aa  102  9e-21  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000800756  hitchhiker  0.0000000000534186 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2187  cell division protein FtsQ  29.79 
 
 
240 aa  101  1e-20  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.521359  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0404  cell division protein FtsQ  36.36 
 
 
262 aa  102  1e-20  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00313866  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0403  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  35.23 
 
 
262 aa  101  1e-20  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000561241  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3384  cell division protein FtsQ  32.42 
 
 
275 aa  101  1e-20  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000592378  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0415  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  36.36 
 
 
262 aa  102  1e-20  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.235658  hitchhiker  0.0000875019 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3515  cell division protein FtsQ  32.42 
 
 
263 aa  101  1e-20  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.228011  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004488  cell division protein FtsQ  28.1 
 
 
260 aa  100  2e-20  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00754349  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0764  cell division protein FtsQ  33.66 
 
 
283 aa  100  2e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000031953  normal  0.691336 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00904  hypothetical protein  27.69 
 
 
260 aa  99.8  4e-20  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2425  cell division protein FtsQ, putative  30.99 
 
 
273 aa  97.1  3e-19  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.228539  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4462  cell division protein FtsQ  27.31 
 
 
286 aa  96.3  5e-19  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.24194  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0412  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  31.82 
 
 
254 aa  96.3  5e-19  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.466864  hitchhiker  0.00145589 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0357  cell division protein FtsQ  30.89 
 
 
250 aa  96.3  6e-19  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00205743  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0613  cell division protein FtsQ  32.22 
 
 
284 aa  95.5  9e-19  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0180301  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0356  cell division protein FtsQ  34.08 
 
 
274 aa  95.1  1e-18  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0290766  hitchhiker  0.000649691 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3777  cell division protein FtsQ  32.78 
 
 
274 aa  95.5  1e-18  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0326352  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13280  Cell division protein FtsQ  28.83 
 
 
286 aa  94.7  2e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.021703  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1977  cell division protein FtsQ  28.43 
 
 
260 aa  92.8  6e-18  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00013353  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3589  cell division protein FtsQ  31.67 
 
 
274 aa  91.7  1e-17  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0421726  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0639  cell division protein FtsQ  30 
 
 
280 aa  89.7  5e-17  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000184858  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0527  cell division protein FtsQ  24.81 
 
 
313 aa  89.7  5e-17  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00011649  hitchhiker  0.00000227269 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0140  cell division protein FtsQ  29.44 
 
 
276 aa  89.4  7e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.467459  normal  0.392627 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2449  cell division protein FtsQ  29.83 
 
 
279 aa  89.4  7e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0699952  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4981  cell division protein FtsQ  27.35 
 
 
287 aa  89.4  7e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.157087  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0148  cell division protein FtsQ  29.44 
 
 
276 aa  88.6  1e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000728019  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0143  cell division protein FtsQ  29.44 
 
 
276 aa  88.6  1e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.216821  hitchhiker  0.00000339309 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0147  cell division protein FtsQ  29.44 
 
 
276 aa  88.6  1e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0183403  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0143  cell division protein FtsQ  29.44 
 
 
276 aa  88.6  1e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.00198063  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57300  cell division protein FtsQ  27.35 
 
 
287 aa  89  1e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2045  cell division protein  29.91 
 
 
278 aa  88.6  1e-16  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  0.0000010685  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1966  cell division protein FtsQ  31.28 
 
 
278 aa  88.2  1e-16  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.0000753144  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0202  cell division protein FtsQ  28.4 
 
 
280 aa  87.4  2e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0381  Polypeptide-transport-associated domain protein FtsQ-type  28.4 
 
 
280 aa  87.4  2e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.00296108  normal  0.100496 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2534  cell division protein FtsQ  26.58 
 
 
239 aa  85.9  7e-16  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2611  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  34.18 
 
 
226 aa  85.9  8e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.0000621629  unclonable  0.00000000000366922 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1150  cell division protein FtsQ  25.57 
 
 
245 aa  85.1  0.000000000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.460682  normal  0.89976 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0651  cell division protein FtsQ  30.56 
 
 
284 aa  84.3  0.000000000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0684604  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4405  cell division protein FtsQ, putative  27.69 
 
 
289 aa  84.3  0.000000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.292768  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4670  cell division protein FtsQ  27.92 
 
 
288 aa  84.7  0.000000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000533312  normal  0.45598 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0925  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  27.23 
 
 
288 aa  84.3  0.000000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.316066  normal  0.89864 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>