138 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_2962 on replicon NC_007973
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007973  Rmet_2962  hypothetical protein  100 
 
 		 265 aa  538  9.999999999999999e-153  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0239  hypothetical protein  75.34 
 
 		 266 aa  353  1e-96  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.220267  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0290  hypothetical protein  73.78 
 
 		 265 aa  352  2.9999999999999997e-96  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0197  hypothetical protein  60.26 
 
 		 271 aa  261  8e-69  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.680563 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0216  signal peptide protein  60.26 
 
 		 271 aa  259  2e-68  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000480093 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3379  putative transmembrane protein  58.95 
 
 		 269 aa  256  3e-67  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0341  signal peptide protein  59.73 
 
 		 268 aa  252  4.0000000000000004e-66  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3265  putative transmembrane protein  58.48 
 
 		 268 aa  251  7e-66  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3587  hypothetical protein  57.59 
 
 		 268 aa  249  3e-65  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.00011907  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1958  putative signal peptide protein  46.47 
 
 		 278 aa  206  3e-52  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1664  hypothetical protein  46.34 
 
 		 281 aa  199  5e-50  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.886499  normal  0.578123 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0239  hypothetical protein  44.66 
 
 		 256 aa  198  7e-50  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0595  putative transmembrane protein  48 
 
 		 234 aa  184  2.0000000000000003e-45  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.812754  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0052  hypothetical protein  45.73 
 
 		 257 aa  181  1e-44  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  decreased coverage  0.0060351  normal  0.567667 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1084  hypothetical protein  43.32 
 
 		 272 aa  162  8.000000000000001e-39  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0585166  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2512  hypothetical protein  42.28 
 
 		 263 aa  150  2e-35  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0104508  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0182  hypothetical protein  36.69 
 
 		 265 aa  138  1e-31  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.56754  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2358  hypothetical protein  37.17 
 
 		 259 aa  127  3e-28  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0162  hypothetical protein  39.53 
 
 		 243 aa  126  5e-28  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.844011 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0180  hypothetical protein  39.75 
 
 		 243 aa  124  2e-27  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.223462  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0232  hypothetical protein  37.45 
 
 		 241 aa  123  3e-27  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3315  hypothetical protein  35.14 
 
 		 236 aa  110  2.0000000000000002e-23  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.266873  normal  0.0899377 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0217  hypothetical protein  36.44 
 
 		 274 aa  110  3e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.207419  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5922  hypothetical protein  32.89 
 
 		 287 aa  107  2e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0546  hypothetical protein  31.52 
 
 		 279 aa  105  8e-22  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0802876  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0301  hypothetical protein  33.21 
 
 		 243 aa  104  2e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2615  hypothetical protein  32.2 
 
 		 281 aa  97.8  2e-19  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.360147  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3778  hypothetical protein  35.98 
 
 		 249 aa  96.3  5e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.919699 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2231  hypothetical protein  31.15 
 
 		 280 aa  90.5  3e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4354  hypothetical protein  36.71 
 
 		 229 aa  87  3e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3732  hypothetical protein  35.1 
 
 		 230 aa  86.3  5e-16  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.817538  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1577  hypothetical protein  27.59 
 
 		 296 aa  85.5  9e-16  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1041  hypothetical protein  30.77 
 
 		 239 aa  84.7  0.000000000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0114575  normal  0.584816 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02514  hypothetical protein  32.42 
 
 		 227 aa  83.2  0.000000000000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0933  hypothetical protein  34.74 
 
 		 244 aa  83.2  0.000000000000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.281157  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0294  hypothetical protein  31.25 
 
 		 223 aa  82.4  0.000000000000006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.385476  normal  0.206619 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0963  hypothetical protein  30.69 
 
 		 239 aa  82  0.000000000000009  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.151638  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3079  hypothetical protein  29.71 
 
 		 256 aa  82  0.000000000000009  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0478  hypothetical protein  34.59 
 
 		 229 aa  81.3  0.00000000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1847  hypothetical protein  31.43 
 
 		 251 aa  82  0.00000000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.562939  normal  0.371248 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5833  hypothetical protein  29.49 
 
 		 298 aa  80.9  0.00000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3039  hypothetical protein  33.93 
 
 		 260 aa  80.1  0.00000000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2403  hypothetical protein  40.98 
 
 		 220 aa  79.7  0.00000000000004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1482  hypothetical protein  33.47 
 
 		 232 aa  79.3  0.00000000000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3155  hypothetical protein  29.07 
 
 		 245 aa  79  0.00000000000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.751817  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3159  hypothetical protein  30.99 
 
 		 229 aa  77.4  0.0000000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0194  hypothetical protein  31.09 
 
 		 245 aa  77.4  0.0000000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.743567 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0547  hypothetical protein  32.98 
 
 		 230 aa  75.9  0.0000000000006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0429  hypothetical protein  31.12 
 
 		 230 aa  75.9  0.0000000000006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0547  hypothetical protein  31.41 
 
 		 230 aa  75.9  0.0000000000007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3483  hypothetical protein  30.89 
 
 		 230 aa  75.1  0.000000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3025  hypothetical protein  30.81 
 
 		 240 aa  74.7  0.000000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00392442  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3762  hypothetical protein  32.46 
 
 		 230 aa  73.9  0.000000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.852713 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3818  hypothetical protein  32.46 
 
 		 230 aa  73.9  0.000000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3944  hypothetical protein  32.46 
 
 		 230 aa  73.9  0.000000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.291724  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1600  hypothetical protein  39.66 
 
 		 241 aa  73.9  0.000000000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.400677  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46580  hypothetical protein  29.71 
 
 		 252 aa  73.2  0.000000000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0506  hypothetical protein  31.94 
 
 		 230 aa  72.8  0.000000000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.255853  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0599  hypothetical protein  30.37 
 
 		 230 aa  72.8  0.000000000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0546  hypothetical protein  30.89 
 
 		 230 aa  72.8  0.000000000006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3533  hypothetical protein  32.28 
 
 		 228 aa  71.2  0.00000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3326  hypothetical protein  29.84 
 
 		 230 aa  72  0.00000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1111  hypothetical protein  33.17 
 
 		 240 aa  71.6  0.00000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0309164  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3575  hypothetical protein  35 
 
 		 219 aa  71.2  0.00000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.580348  hitchhiker  0.00969465 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4680  hypothetical protein  29.76 
 
 		 221 aa  69.7  0.00000000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.467996  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0660  hypothetical protein  32.18 
 
 		 241 aa  69.3  0.00000000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1089  hypothetical protein  32.5 
 
 		 240 aa  68.2  0.0000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0210765  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1183  hypothetical protein  32.5 
 
 		 240 aa  68.2  0.0000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3206  hypothetical protein  32 
 
 		 240 aa  66.6  0.0000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2028  hypothetical protein  25.43 
 
 		 234 aa  66.6  0.0000000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1149  hypothetical protein  32 
 
 		 240 aa  66.6  0.0000000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0395177  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1194  hypothetical protein  35.83 
 
 		 234 aa  65.9  0.0000000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0143956  hitchhiker  0.0000261256 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1829  hypothetical protein  25.65 
 
 		 253 aa  65.5  0.0000000009  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1944  hypothetical protein  33.56 
 
 		 235 aa  65.5  0.0000000009  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0137324  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1336  hypothetical protein  39.45 
 
 		 234 aa  65.1  0.000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1081  hypothetical protein  32.14 
 
 		 240 aa  65.1  0.000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.000020952  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2041  hypothetical protein  26.52 
 
 		 231 aa  64.7  0.000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0564933  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2602  hypothetical protein  31.53 
 
 		 255 aa  63.9  0.000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.245239  normal  0.167948 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2652  hypothetical protein  28.64 
 
 		 242 aa  63.2  0.000000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.00000000484219  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1117  hypothetical protein  35.83 
 
 		 234 aa  63.2  0.000000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4008  hypothetical protein  34.96 
 
 		 239 aa  62.8  0.000000006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.161963  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1005  hypothetical protein  36.97 
 
 		 234 aa  62.4  0.000000007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.433057  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3502  hypothetical protein  31.38 
 
 		 280 aa  61.6  0.00000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3481  hypothetical protein  30.14 
 
 		 312 aa  61.6  0.00000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.352755  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02644  putative periplasmic protein  31.54 
 
 		 240 aa  61.6  0.00000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0717  hypothetical protein  34.65 
 
 		 267 aa  60.5  0.00000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.0000000000102421  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4252  hypothetical protein  29.27 
 
 		 248 aa  60.8  0.00000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00504  hypothetical protein  29.15 
 
 		 273 aa  60.5  0.00000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0506  hypothetical protein  36.28 
 
 		 323 aa  60.1  0.00000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3109  hypothetical protein  31.5 
 
 		 240 aa  60.1  0.00000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.052504  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0128  hypothetical protein  29.27 
 
 		 248 aa  59.7  0.00000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4213  hypothetical protein  29.27 
 
 		 245 aa  59.7  0.00000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2930  hypothetical protein  32.04 
 
 		 240 aa  58.9  0.00000008  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000617689  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3012  hypothetical protein  32.84 
 
 		 240 aa  58.9  0.00000008  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0896353  normal  1 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0140  hypothetical protein  34.59 
 
 		 329 aa  58.9  0.00000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3033  hypothetical protein  36.36 
 
 		 234 aa  58.5  0.0000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.501077  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3838  hypothetical protein  28.18 
 
 		 248 aa  58.2  0.0000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3931  hypothetical protein  28.18 
 
 		 248 aa  58.2  0.0000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1317  hypothetical protein  36.36 
 
 		 239 aa  58.5  0.0000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4694  hypothetical protein  28.18 
 
 		 245 aa  57.4  0.0000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>