More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_2902 on replicon NC_007973
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007973  Rmet_2902  ornithine carbamoyltransferase  100 
 
 		 307 aa  645    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.674769  normal  0.667761 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2763  ornithine carbamoyltransferase  91.21 
 
 		 307 aa  593  1e-169  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2424  ornithine carbamoyltransferase  86.56 
 
 		 308 aa  558  1e-158  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.586584 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2830  ornithine carbamoyltransferase  86.23 
 
 		 308 aa  558  1e-158  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.998909  normal  0.750819 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2554  ornithine carbamoyltransferase  85.57 
 
 		 308 aa  555  1e-157  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0520201  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1754  ornithine carbamoyltransferase  75.99 
 
 		 326 aa  498  1e-140  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0940132  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1469  ornithine carbamoyltransferase  75.99 
 
 		 326 aa  497  1e-140  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.808206  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0529  ornithine carbamoyltransferase  76.8 
 
 		 309 aa  499  1e-140  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0757  ornithine carbamoyltransferase  76.14 
 
 		 309 aa  493  9.999999999999999e-139  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3205  ornithine carbamoyltransferase  76.14 
 
 		 309 aa  492  9.999999999999999e-139  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.820291  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0732  ornithine carbamoyltransferase  75.49 
 
 		 309 aa  489  1e-137  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0917  ornithine carbamoyltransferase  74.84 
 
 		 309 aa  483  1e-135  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0743  ornithine carbamoyltransferase  74.84 
 
 		 309 aa  483  1e-135  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.511035 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0124  ornithine carbamoyltransferase  74.84 
 
 		 309 aa  483  1e-135  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0375  ornithine carbamoyltransferase  74.84 
 
 		 309 aa  483  1e-135  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0675  ornithine carbamoyltransferase  74.84 
 
 		 309 aa  483  1e-135  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1073  ornithine carbamoyltransferase  74.84 
 
 		 309 aa  483  1e-135  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2577  ornithine carbamoyltransferase  74.51 
 
 		 309 aa  481  1e-135  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1942  ornithine carbamoyltransferase  74.51 
 
 		 309 aa  483  1e-135  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2472  ornithine carbamoyltransferase  74.18 
 
 		 309 aa  481  1e-135  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.893068  normal  0.0170187 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2510  ornithine carbamoyltransferase  74.84 
 
 		 309 aa  483  1e-135  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2553  ornithine carbamoyltransferase  74.51 
 
 		 309 aa  483  1e-135  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0921  ornithine carbamoyltransferase  74.84 
 
 		 309 aa  483  1e-135  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5885  ornithine carbamoyltransferase  74.18 
 
 		 309 aa  480  1e-134  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.718044 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2601  ornithine carbamoyltransferase  73.86 
 
 		 560 aa  478  1e-134  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.766266  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1850  ornithine carbamoyltransferase  71.76 
 
 		 305 aa  464  9.999999999999999e-131  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.99492 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2675  ornithine carbamoyltransferase  68.98 
 
 		 308 aa  458  9.999999999999999e-129  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3012  ornithine carbamoyltransferase  69.08 
 
 		 309 aa  454  1e-127  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3573  ornithine carbamoyltransferase  70.53 
 
 		 329 aa  457  1e-127  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.510034  normal  0.18722 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1163  ornithine carbamoyltransferase  69.51 
 
 		 309 aa  457  1e-127  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.100026  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3032  ornithine carbamoyltransferase  70.1 
 
 		 306 aa  452  1.0000000000000001e-126  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.710258  normal  0.386116 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2178  ornithine carbamoyltransferase  70.26 
 
 		 310 aa  453  1.0000000000000001e-126  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.280829  normal  0.684526 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1451  ornithine carbamoyltransferase  68.2 
 
 		 311 aa  448  1e-125  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2430  ornithine carbamoyltransferase  69.41 
 
 		 305 aa  448  1e-125  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2120  ornithine carbamoyltransferase  70.1 
 
 		 302 aa  449  1e-125  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0533894  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3003  ornithine carbamoyltransferase  69.41 
 
 		 305 aa  448  1e-125  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1709  ornithine carbamoyltransferase  69.1 
 
 		 306 aa  445  1.0000000000000001e-124  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.00976675  hitchhiker  0.00312362 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3030  ornithine carbamoyltransferase  67.85 
 
 		 320 aa  443  1e-123  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.883113 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0907  ornithine carbamoyltransferase  66.56 
 
 		 320 aa  436  1e-121  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1042  ornithine carbamoyltransferase  65.78 
 
 		 329 aa  425  1e-118  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.246407  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1902  ornithine carbamoyltransferase  67.43 
 
 		 306 aa  427  1e-118  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.24838  normal  0.639585 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0726  ornithine carbamoyltransferase  57.67 
 
 		 300 aa  364  1e-100  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.853376  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0532  ornithine carbamoyltransferase  58.19 
 
 		 302 aa  366  1e-100  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0521808  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1101  ornithine carbamoyltransferase  57.24 
 
 		 303 aa  363  2e-99  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2430  ornithine carbamoyltransferase  56.67 
 
 		 304 aa  355  6.999999999999999e-97  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3389  ornithine carbamoyltransferase  56.25 
 
 		 301 aa  349  4e-95  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.345181  normal  0.187028 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0405  ornithine carbamoyltransferase  57.53 
 
 		 311 aa  348  5e-95  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.38298  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0569  ornithine carbamoyltransferase  57.53 
 
 		 311 aa  348  5e-95  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2080  ornithine carbamoyltransferase  56.9 
 
 		 298 aa  347  1e-94  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2317  ornithine carbamoyltransferase  55.33 
 
 		 304 aa  346  2e-94  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0451253  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2465  ornithine carbamoyltransferase  56.38 
 
 		 300 aa  345  4e-94  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1461  ornithine carbamoyltransferase  53.36 
 
 		 305 aa  344  8e-94  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2130  ornithine carbamoyltransferase  53.16 
 
 		 305 aa  340  2e-92  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0781  ornithine carbamoyltransferase  53.02 
 
 		 306 aa  338  7e-92  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0769217  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1609  ornithine carbamoyltransferase  54.36 
 
 		 305 aa  338  8e-92  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0957  ornithine carbamoyltransferase  52.68 
 
 		 307 aa  338  9.999999999999999e-92  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4527  ornithine carbamoyltransferase  53.87 
 
 		 307 aa  337  1.9999999999999998e-91  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.145065 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1345  ornithine carbamoyltransferase  56 
 
 		 312 aa  337  1.9999999999999998e-91  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3743  ornithine carbamoyltransferase  54.17 
 
 		 321 aa  337  1.9999999999999998e-91  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000875067 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14030  ornithine carbamoyltransferase  53.87 
 
 		 308 aa  336  2.9999999999999997e-91  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18610  ornithine carbamoyltransferase  54.36 
 
 		 305 aa  336  2.9999999999999997e-91  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0309685 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2441  ornithine carbamoyltransferase  54.49 
 
 		 303 aa  335  5.999999999999999e-91  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.617876  normal  0.127265 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4164  ornithine carbamoyltransferase  54.55 
 
 		 306 aa  335  7.999999999999999e-91  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3342  ornithine carbamoyltransferase  54.36 
 
 		 306 aa  333  2e-90  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0493063  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3901  ornithine carbamoyltransferase  53.87 
 
 		 306 aa  331  8e-90  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0945  ornithine carbamoyltransferase  57.33 
 
 		 304 aa  330  1e-89  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0836212  normal  0.0898024 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1108  ornithine carbamoyltransferase  53.87 
 
 		 306 aa  328  9e-89  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0227  ornithine carbamoyltransferase  50.99 
 
 		 305 aa  324  1e-87  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1120  ornithine carbamoyltransferase  52.53 
 
 		 306 aa  321  8e-87  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.105458  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1079  ornithine carbamoyltransferase  52.19 
 
 		 306 aa  319  3.9999999999999996e-86  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4333  ornithine carbamoyltransferase  52.19 
 
 		 306 aa  319  3.9999999999999996e-86  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3172  ornithine carbamoyltransferase  51.49 
 
 		 305 aa  317  1e-85  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0370415  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3149  ornithine carbamoyltransferase  50.17 
 
 		 303 aa  313  1.9999999999999998e-84  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3742  ornithine carbamoyltransferase  49.83 
 
 		 303 aa  312  3.9999999999999997e-84  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3637  ornithine carbamoyltransferase  49.5 
 
 		 303 aa  309  4e-83  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0152  ornithine carbamoyltransferase  48.68 
 
 		 303 aa  306  2.0000000000000002e-82  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0205  ornithine carbamoyltransferase  48.5 
 
 		 303 aa  302  5.000000000000001e-81  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000336127 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0343  ornithine carbamoyltransferase  50 
 
 		 309 aa  298  8e-80  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0386  ornithine carbamoyltransferase  47.19 
 
 		 312 aa  294  1e-78  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0276  ornithine carbamoyltransferase  47.04 
 
 		 315 aa  294  1e-78  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0062  ornithine carbamoyltransferase  46.51 
 
 		 312 aa  290  2e-77  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.366315 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1227  ornithine carbamoyltransferase  48.83 
 
 		 355 aa  290  2e-77  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.786262  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1219  ornithine carbamoyltransferase  46.89 
 
 		 309 aa  288  1e-76  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.309397  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2415  ornithine carbamoyltransferase  48 
 
 		 302 aa  286  2e-76  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1542  ornithine carbamoyltransferase  45.13 
 
 		 308 aa  286  2e-76  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2877  ornithine carbamoyltransferase  49.19 
 
 		 309 aa  286  4e-76  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2784  ornithine carbamoyltransferase  49.19 
 
 		 309 aa  286  4e-76  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0382  ornithine carbamoyltransferase  46.53 
 
 		 308 aa  285  5.999999999999999e-76  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.539911  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0896  ornithine carbamoyltransferase  48.5 
 
 		 316 aa  285  7e-76  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2685  ornithine carbamoyltransferase  46.28 
 
 		 309 aa  283  2.0000000000000002e-75  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.570167  normal  0.0624155 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2540  ornithine carbamoyltransferase  48.03 
 
 		 313 aa  283  4.0000000000000003e-75  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0151  ornithine carbamoyltransferase  45.19 
 
 		 319 aa  283  4.0000000000000003e-75  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.950528 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3276  ornithine carbamoyltransferase  48.2 
 
 		 308 aa  282  5.000000000000001e-75  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4076  ornithine carbamoyltransferase  47.19 
 
 		 330 aa  282  5.000000000000001e-75  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5258  ornithine carbamoyltransferase  47.08 
 
 		 309 aa  282  6.000000000000001e-75  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.802222  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0643  ornithine carbamoyltransferase  47.08 
 
 		 308 aa  282  6.000000000000001e-75  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.652034  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1869  ornithine carbamoyltransferase  44.63 
 
 		 307 aa  281  7.000000000000001e-75  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4443  ornithine carbamoyltransferase  47.19 
 
 		 316 aa  281  8.000000000000001e-75  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6535  ornithine carbamoyltransferase  46.89 
 
 		 314 aa  280  2e-74  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.326081  normal  0.847113 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2691  ornithine carbamoyltransferase  48.54 
 
 		 309 aa  279  3e-74  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.661116  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>