More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_2849 on replicon NC_007973
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007973  Rmet_2849  peptidase M48, Ste24p  100 
 
 		 249 aa  504  9.999999999999999e-143  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2706  peptidase M48, Ste24p  80 
 
 		 250 aa  400  1e-111  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.268844  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1960  peptidase M48, Ste24p  71.86 
 
 		 250 aa  323  1e-87  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2547  peptidase M48 Ste24p  62.7 
 
 		 251 aa  309  2e-83  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.282417  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3955  peptidase M48 Ste24p  59.76 
 
 		 250 aa  302  3.0000000000000004e-81  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3351  M48 family peptidase  57.37 
 
 		 250 aa  290  1e-77  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0845  M48 family peptidase  57.37 
 
 		 250 aa  290  2e-77  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0849  peptidase M48 Ste24p  56.97 
 
 		 250 aa  288  5.0000000000000004e-77  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.322576  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3704  peptidase M48 Ste24p  59.84 
 
 		 250 aa  285  5e-76  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2139  peptidase M48, Ste24p  60.89 
 
 		 251 aa  279  2e-74  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.821135  normal  0.237268 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3335  peptidase M48 Ste24p  63.2 
 
 		 252 aa  273  3e-72  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.490632  normal  0.0905245 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6085  peptidase M48, Ste24p  59.68 
 
 		 253 aa  271  6e-72  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.656597 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2807  peptidase M48, Ste24p  60.8 
 
 		 253 aa  271  8.000000000000001e-72  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2674  peptidase M48 Ste24p  60.48 
 
 		 253 aa  270  1e-71  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1092  peptidase M48, Ste24p  56.73 
 
 		 253 aa  270  1e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  decreased coverage  0.000219795  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1077  peptidase M48, Ste24p  57.14 
 
 		 253 aa  270  1e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.676639  normal  0.12014 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0985  peptidase M48, Ste24p  57.14 
 
 		 253 aa  270  1e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00562813  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1044  peptidase M48, Ste24p  57.14 
 
 		 253 aa  270  1e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.330667  normal  0.397377 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1012  peptidase M48, Ste24p  57.14 
 
 		 253 aa  270  1e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.453448  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3239  peptidase M48, Ste24p  55.42 
 
 		 252 aa  270  1e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3315  peptidase M48, Ste24p  55.42 
 
 		 252 aa  270  1e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02766  predicted peptidase  54.62 
 
 		 252 aa  269  2.9999999999999997e-71  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0758  peptidase M48 Ste24p  54.62 
 
 		 252 aa  269  2.9999999999999997e-71  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3078  M48B family peptidase  54.62 
 
 		 252 aa  269  2.9999999999999997e-71  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00267563 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3369  peptidase, M48B family  54.62 
 
 		 252 aa  269  2.9999999999999997e-71  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.433794  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3270  M48B family peptidase  54.62 
 
 		 252 aa  269  2.9999999999999997e-71  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4238  peptidase, M48B family  54.62 
 
 		 252 aa  269  2.9999999999999997e-71  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0775  peptidase M48 Ste24p  54.22 
 
 		 252 aa  267  1e-70  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0200008 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3094  M48B family peptidase  54.22 
 
 		 252 aa  267  1e-70  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1070  peptidase, M48B family  53.49 
 
 		 262 aa  265  5e-70  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000805539  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0353  putative lipoprotein  59.23 
 
 		 252 aa  265  7e-70  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3342  peptidase M48, Ste24p  55.06 
 
 		 252 aa  264  1e-69  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.887566  normal  0.0880517 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0546  peptidase M48 Ste24p  58.89 
 
 		 253 aa  263  1e-69  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.786234  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00913  predicted peptidase with chaperone function  54.96 
 
 		 254 aa  263  2e-69  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.297471  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00920  hypothetical protein  54.96 
 
 		 254 aa  263  2e-69  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.297268  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2687  peptidase M48 Ste24p  54.96 
 
 		 254 aa  263  2e-69  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.000000650264  normal  0.800439 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1015  M48B family peptidase  54.96 
 
 		 254 aa  263  2e-69  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000261576  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1006  M48B family peptidase  54.96 
 
 		 254 aa  263  2e-69  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000000612622  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3901  peptidase M48 Ste24p  59.04 
 
 		 250 aa  262  4.999999999999999e-69  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2734  peptidase M48 Ste24p  54.55 
 
 		 254 aa  260  1e-68  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.000000015723  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03610  putative putative Zn-dependent protease with chaperone function  59.23 
 
 		 252 aa  261  1e-68  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00852154  hitchhiker  0.000000000112328 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0474  peptidase M48, Ste24p  61.14 
 
 		 261 aa  259  3e-68  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2779  peptidase M48 Ste24p  57.71 
 
 		 253 aa  259  4e-68  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.76757  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2755  peptidase M48, Ste24p  57.71 
 
 		 253 aa  259  4e-68  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2142  peptidase M48, Ste24p  56.92 
 
 		 604 aa  258  6e-68  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2211  M48B family peptidase  56.76 
 
 		 254 aa  257  1e-67  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000159617  normal  0.373836 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2419  peptidase, M48B family  56.76 
 
 		 235 aa  257  1e-67  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000823036  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2648  peptidase M48 Ste24p  54.98 
 
 		 254 aa  240  1e-62  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.254413 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0489  peptidase M48 Ste24p  47.98 
 
 		 256 aa  196  4.0000000000000005e-49  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0533108 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1855  Zn-dependent protease with chaperone function-like  41.18 
 
 		 312 aa  175  6e-43  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0553216  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0117  peptidase M48, Ste24p  43.5 
 
 		 275 aa  172  2.9999999999999996e-42  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2098  peptidase M48 Ste24p  43.19 
 
 		 269 aa  164  1.0000000000000001e-39  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.380945  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0225  peptidase M48, Ste24p  41.7 
 
 		 290 aa  162  5.0000000000000005e-39  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.242215  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0226  peptidase M48, Ste24p  40 
 
 		 289 aa  158  7e-38  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.303922  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0856  peptidase M48 Ste24p  28.51 
 
 		 268 aa  92.4  5e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0548  peptidase M48, Ste24p  28.74 
 
 		 268 aa  89.4  5e-17  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.420219  hitchhiker  0.000000269933 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2861  peptidase M48, Ste24p  31.58 
 
 		 271 aa  87.8  1e-16  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3390  peptidase M48 Ste24p  28.23 
 
 		 268 aa  87.8  2e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.0000000240796  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2062  peptidase M48, Ste24p  27.7 
 
 		 270 aa  84.7  0.000000000000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.02015  normal  0.416312 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1809  peptidase M48 Ste24p  28.29 
 
 		 289 aa  83.6  0.000000000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000151059 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1437  M48 family peptidase  28.46 
 
 		 264 aa  82.4  0.000000000000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.142211  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0218  peptidase M48 Ste24p  28.88 
 
 		 311 aa  81.3  0.00000000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0984  peptidase M48, Ste24p  29.59 
 
 		 282 aa  80.9  0.00000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00306933  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1783  zinc metallopeptidase  26.76 
 
 		 270 aa  80.9  0.00000000000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1887  peptidase M48, Ste24p  27.8 
 
 		 274 aa  80.9  0.00000000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3407  peptidase M48, Ste24p  28.37 
 
 		 266 aa  80.1  0.00000000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.029445  hitchhiker  0.000231655 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0203  peptidase M48, Ste24p  28.45 
 
 		 291 aa  79.7  0.00000000000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.23907  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1144  lipoprotein, putative  29.59 
 
 		 272 aa  79.7  0.00000000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.599312  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3078  peptidase M48 Ste24p  30.64 
 
 		 266 aa  79.3  0.00000000000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00000470092  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0210  peptidase M48, Ste24p  31.06 
 
 		 280 aa  79  0.00000000000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0759  hypothetical protein  27.99 
 
 		 279 aa  78.2  0.0000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0032  peptidase M48, Ste24p  28.41 
 
 		 270 aa  77.4  0.0000000000002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0332  peptidase M48 Ste24p  30.67 
 
 		 305 aa  77.4  0.0000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0787  peptidase M48, Ste24p  28.09 
 
 		 272 aa  77.8  0.0000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0801  peptidase M48 Ste24p  28.09 
 
 		 272 aa  77.4  0.0000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.740627 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0972  peptidase M48, Ste24p  30 
 
 		 268 aa  77.4  0.0000000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.0000000310302  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1850  peptidase M48, Ste24p  30.12 
 
 		 278 aa  77.4  0.0000000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3404  peptidase M48 Ste24p  30.52 
 
 		 269 aa  77  0.0000000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000146898  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1238  peptidase M48, Ste24p  27.87 
 
 		 278 aa  76.6  0.0000000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0665176  normal  0.164191 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1048  peptidase M48 Ste24p  30.52 
 
 		 269 aa  76.6  0.0000000000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000265758  hitchhiker  0.000000297579 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3529  peptidase M48 Ste24p  30.52 
 
 		 269 aa  76.6  0.0000000000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000517295  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4429  peptidase M48 Ste24p  28.09 
 
 		 271 aa  75.9  0.0000000000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0992  peptidase M48, Ste24p  29.69 
 
 		 272 aa  75.5  0.0000000000007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.000000000166595  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0964  peptidase M48, Ste24p  27.97 
 
 		 269 aa  75.5  0.0000000000008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00161877  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1800  peptidase M48, Ste24p  27.8 
 
 		 263 aa  75.5  0.0000000000008  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0722089  normal  0.0408488 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3308  peptidase M48 Ste24p  28.63 
 
 		 269 aa  75.1  0.0000000000009  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000556254  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5278  putative lipoprotein  31.95 
 
 		 273 aa  75.1  0.000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0624214  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1514  hypothetical protein  29.57 
 
 		 254 aa  74.7  0.000000000001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  decreased coverage  0.0000319394  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3072  peptidase M48 Ste24p  28.63 
 
 		 271 aa  74.7  0.000000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1137  hypothetical protein  28.57 
 
 		 269 aa  73.9  0.000000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3748  regulatory protein, ArsR  31.1 
 
 		 423 aa  73.9  0.000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.857978 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1200  peptidase M48 Ste24p  31.87 
 
 		 275 aa  73.2  0.000000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.724049 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0209  peptidase M48, Ste24p  34.59 
 
 		 289 aa  73.2  0.000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0655  peptidase M48, Ste24p  25.19 
 
 		 268 aa  72.8  0.000000000004  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0730736  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2842  peptidase M48, Ste24p  26.14 
 
 		 262 aa  72.8  0.000000000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000706614  normal  0.0604809 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0962  peptidase M48, Ste24p  27.59 
 
 		 269 aa  72.8  0.000000000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00197465  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0280  peptidase M48, Ste24p  28.83 
 
 		 284 aa  72.8  0.000000000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61290  putative lipoprotein  31.36 
 
 		 273 aa  72.8  0.000000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1904  peptidase M48, Ste24p  31.13 
 
 		 493 aa  72.4  0.000000000006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.429469  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1865  peptidase M48, Ste24p  32.37 
 
 		 280 aa  72.4  0.000000000007  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.130359  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>