More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_2801 on replicon NC_007973
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007973  Rmet_2801  peptidase M48, Ste24p  100 
 
 		 341 aa  690    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.57827 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0642  peptidase M48, Ste24p  66.47 
 
 		 347 aa  462  1e-129  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0644  putative transmembrane protein  57.93 
 
 		 358 aa  375  1e-103  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0537  peptidase M48 Ste24p  55.14 
 
 		 364 aa  365  1e-100  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.426689  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0581  peptidase M48 Ste24p  55.33 
 
 		 361 aa  349  3e-95  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.380263 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4143  peptidase M48, Ste24p  38.08 
 
 		 347 aa  192  5e-48  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.724866  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0462  M48 family peptidase  38.73 
 
 		 357 aa  192  7e-48  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0169095  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0096  peptidase M48, Ste24p  35.9 
 
 		 348 aa  179  4.999999999999999e-44  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.220235  normal  0.168407 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1120  peptidase M48 Ste24p  32.66 
 
 		 354 aa  171  1e-41  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.597091  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2182  peptidase M48, Ste24p  33.53 
 
 		 349 aa  168  1e-40  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0326  peptidase M48 Ste24p  33.72 
 
 		 353 aa  164  3e-39  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.988889  normal  0.269331 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2660  peptidase M48 Ste24p  37.61 
 
 		 395 aa  162  7e-39  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.110854 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0514  peptidase M48 Ste24p  33.43 
 
 		 343 aa  161  1e-38  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0802067  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2155  peptidase M48, Ste24p  36.58 
 
 		 327 aa  157  2e-37  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3004  peptidase M48 Ste24p  36.39 
 
 		 374 aa  157  3e-37  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.558677  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3686  peptidase M48 Ste24p  35.52 
 
 		 383 aa  157  3e-37  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3721  peptidase M48, Ste24p  36.12 
 
 		 377 aa  155  1e-36  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0533853  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3534  peptidase M48, Ste24p  36.23 
 
 		 383 aa  155  1e-36  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0790  peptidase M48, Ste24p  34.64 
 
 		 444 aa  154  2e-36  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.534887  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1147  peptidase M48 Ste24p  32.11 
 
 		 363 aa  152  7e-36  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3622  peptidase M48 Ste24p  34.93 
 
 		 383 aa  152  1e-35  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2077  putative Zn-dependent protease  33.14 
 
 		 336 aa  148  2.0000000000000003e-34  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1893  peptidase M48, Ste24p  31.44 
 
 		 398 aa  146  4.0000000000000006e-34  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.118004 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0388  peptidase M48 Ste24p  33.02 
 
 		 349 aa  141  9.999999999999999e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0132188  normal  0.117009 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0429  peptidase M48 Ste24p  32.34 
 
 		 345 aa  137  2e-31  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0258  peptidase M48, Ste24p  34.88 
 
 		 352 aa  138  2e-31  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  decreased coverage  0.00863149  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0378  peptidase M48 Ste24p  32.34 
 
 		 345 aa  136  6.0000000000000005e-31  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1953  peptidase M48, Ste24p  30.45 
 
 		 367 aa  127  3e-28  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0119619  normal  0.0677006 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2917  peptidase M48, Ste24p  27.33 
 
 		 335 aa  125  1e-27  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.154407  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03032  peptidase  31.56 
 
 		 331 aa  123  4e-27  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0872  M48 family peptidase  28.65 
 
 		 348 aa  120  3e-26  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3535  M48 family peptidase  28.65 
 
 		 348 aa  120  3e-26  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3664  peptidase M48 Ste24p  28.65 
 
 		 348 aa  120  3e-26  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0567  peptidase M48 Ste24p  29.29 
 
 		 333 aa  119  9.999999999999999e-26  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3470  peptidase M48 Ste24p  30.59 
 
 		 343 aa  102  8e-21  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2014  peptidase M48 Ste24p  29.63 
 
 		 378 aa  98.2  2e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.700955  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2290  peptidase M48 Ste24p  33.2 
 
 		 378 aa  97.1  4e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.323007 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3237  peptidase M48 Ste24p  31.82 
 
 		 378 aa  95.5  1e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1976  peptidase M48 Ste24p  30.51 
 
 		 373 aa  92.8  7e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.88766  normal  0.175052 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5225  peptidase M48 Ste24p  26.22 
 
 		 358 aa  89  1e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.32225 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0456  peptidase M48 Ste24p  28.63 
 
 		 395 aa  88.2  2e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3691  peptidase M48, Ste24p  27.68 
 
 		 359 aa  83.2  0.000000000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3510  TPR repeat-containing Zn-dependent protease  28.05 
 
 		 370 aa  80.5  0.00000000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3399  peptidase M48 Ste24p  28.83 
 
 		 362 aa  79.3  0.00000000000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.132097 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1437  M48 family peptidase  33.77 
 
 		 264 aa  78.2  0.0000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.142211  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2092  peptidase M48 Ste24p  31.86 
 
 		 280 aa  77.4  0.0000000000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6656  putative metalloendopeptidase  28.53 
 
 		 383 aa  75.5  0.000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.342538 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1307  hypothetical protein  32.73 
 
 		 490 aa  73.6  0.000000000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.31128  normal  0.470451 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3390  peptidase M48 Ste24p  33.11 
 
 		 268 aa  73.6  0.000000000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.0000000240796  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0856  peptidase M48 Ste24p  33.77 
 
 		 268 aa  73.6  0.000000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3089  peptidase M48, Ste24p  28.51 
 
 		 483 aa  72.4  0.00000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0123  putative exported peptidase  30.13 
 
 		 479 aa  72.4  0.00000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0813  peptidase M48 Ste24p  31.29 
 
 		 365 aa  70.9  0.00000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2381  peptidase M48, Ste24p  33.52 
 
 		 307 aa  70.9  0.00000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2972  peptidase M48 Ste24p  28.08 
 
 		 447 aa  70.5  0.00000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.297503  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1904  peptidase M48, Ste24p  31.48 
 
 		 493 aa  70.5  0.00000000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.429469  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0867  peptidase M48, Ste24p  33.76 
 
 		 427 aa  70.5  0.00000000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1238  peptidase M48, Ste24p  29.14 
 
 		 278 aa  70.1  0.00000000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0665176  normal  0.164191 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7542  hypothetical protein  31.84 
 
 		 488 aa  68.6  0.0000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0404  peptidase M48 Ste24p  30.82 
 
 		 604 aa  68.9  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.527715  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0040  hypothetical protein  31.87 
 
 		 513 aa  68.9  0.0000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.257159 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0508  peptidase M48, Ste24p  24.59 
 
 		 279 aa  68.2  0.0000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0200  peptidase M48, Ste24p  31.58 
 
 		 475 aa  67  0.0000000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0178367 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2222  peptidase M48 Ste24p  35.1 
 
 		 445 aa  67  0.0000000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0985  peptidase M48, Ste24p  30.99 
 
 		 489 aa  67  0.0000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.932429  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0581  peptidase M48 Ste24p  26.8 
 
 		 424 aa  66.6  0.0000000006  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0013814  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3171  peptidase M48 Ste24p  28.57 
 
 		 445 aa  66.2  0.0000000007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0821  peptidase M48, Ste24p  34.1 
 
 		 432 aa  65.9  0.0000000009  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.371859  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2749  peptidase M48 Ste24p  35.23 
 
 		 494 aa  65.9  0.0000000009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.114888  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1042  peptidase M48 Ste24p  31.33 
 
 		 489 aa  65.5  0.000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66690  putative protease  32.91 
 
 		 479 aa  65.1  0.000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1761  peptidase, putative  28.74 
 
 		 493 aa  64.3  0.000000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0448124  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0183  peptidase M48 Ste24p  27.21 
 
 		 632 aa  64.3  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.457604 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0246  peptidase M48, Ste24p  29.19 
 
 		 442 aa  63.9  0.000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1046  peptidase M48 Ste24p  31.47 
 
 		 489 aa  63.9  0.000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.615139  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0188  peptidase M48 Ste24p  27.21 
 
 		 632 aa  64.3  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5784  putative lipoprotein  32.28 
 
 		 479 aa  63.5  0.000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0070  peptidase M48 Ste24p  24.11 
 
 		 260 aa  63.9  0.000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.885024  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1699  putative peptidase  28.74 
 
 		 475 aa  63.9  0.000000004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.00848357  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0072  peptidase M48 Ste24p  24.11 
 
 		 260 aa  63.9  0.000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1139  peptidase M48 Ste24p  29.34 
 
 		 476 aa  63.9  0.000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2828  peptidase M48 Ste24p  25.3 
 
 		 284 aa  63.5  0.000000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0448  peptidase M48 Ste24p  31.13 
 
 		 292 aa  63.5  0.000000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3262  peptidase M48, Ste24p  30.77 
 
 		 480 aa  63.5  0.000000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.742551  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1212  Zn-dependent protease, putative  30.32 
 
 		 436 aa  63.2  0.000000007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000776404  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0402  peptidase M48, Ste24p  33.12 
 
 		 529 aa  62.8  0.000000008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4669  peptidase M48, Ste24p  32.69 
 
 		 514 aa  62.8  0.000000009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0464  peptidase M48 Ste24p  31.13 
 
 		 292 aa  62.4  0.00000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.115654 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4141  peptidase M48 Ste24p  28.82 
 
 		 482 aa  62.4  0.00000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0703431  normal  0.108462 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0130  peptidase M48, Ste24p  29.33 
 
 		 528 aa  62  0.00000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3812  peptidase M48 Ste24p  28.24 
 
 		 513 aa  61.6  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.685027  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3303  peptidase M48 Ste24p  34 
 
 		 487 aa  61.2  0.00000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.433705 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3626  peptidase M48 Ste24p  34 
 
 		 500 aa  61.2  0.00000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.679206  normal  0.283809 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0488  peptidase M48 Ste24p  29.48 
 
 		 505 aa  60.5  0.00000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.54801  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4269  hypothetical protein  28.07 
 
 		 513 aa  60.5  0.00000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5407  peptidase M48 Ste24p  29.25 
 
 		 489 aa  60.5  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0209  peptidase M48, Ste24p  32.67 
 
 		 289 aa  60.5  0.00000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3748  regulatory protein, ArsR  32.48 
 
 		 423 aa  60.5  0.00000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.857978 
 
 
-
 
NC_002978  WD0652  M48 family peptidase  26.67 
 
 		 426 aa  60.1  0.00000005  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.59081  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0670  peptidase M48, Ste24p  28.25 
 
 		 288 aa  60.1  0.00000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00234542  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>