More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_2717 on replicon NC_007973
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007973  Rmet_2717  glycosyl transferase, group 1  100 
 
 		 389 aa  766    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.114307  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0744  glycosyl transferase, group 1  62.4 
 
 		 383 aa  445  1.0000000000000001e-124  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2597  glycosyl transferase group 1  43.49 
 
 		 367 aa  271  1e-71  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3244  glycosyl transferase, group 1  42.66 
 
 		 367 aa  269  5.9999999999999995e-71  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.912834  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0825  glycosyl transferase group 1  40.55 
 
 		 382 aa  231  1e-59  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.761905  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1210  glycosyl transferase, group 1  43.96 
 
 		 373 aa  221  1.9999999999999999e-56  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0448845 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2727  glycosyl transferase, group 1  39.12 
 
 		 401 aa  214  2.9999999999999995e-54  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1201  WbwZ  32.51 
 
 		 369 aa  194  3e-48  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0116  glycosyl transferase, group 1  29.27 
 
 		 388 aa  167  2e-40  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0121  glycosyl transferase group 1  29.27 
 
 		 388 aa  167  2e-40  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3711  glycosyl transferase group 1  30.79 
 
 		 376 aa  153  4e-36  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.202497  normal  0.0584888 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0624  glycosyl transferase group 1  34.03 
 
 		 379 aa  148  1.0000000000000001e-34  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.225322 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3028  glycosyl transferase family protein  32.52 
 
 		 704 aa  142  7e-33  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1638  glycosyl transferase group 1  31.23 
 
 		 378 aa  142  9.999999999999999e-33  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000167998  hitchhiker  0.00440424 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3114  glycosyl transferase group 1  27.96 
 
 		 369 aa  139  7.999999999999999e-32  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000549793  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0673  glycosyl transferase group 1  32.7 
 
 		 371 aa  136  7.000000000000001e-31  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3803  glycosyl transferase group 1  30.97 
 
 		 390 aa  134  3e-30  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.395317 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4119  glycosyl transferase group 1  27.73 
 
 		 377 aa  134  3e-30  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0989352  unclonable  0.000000000308882 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1438  glycosyl transferase, group 1 family protein  25.9 
 
 		 356 aa  130  5.0000000000000004e-29  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2020  glycosyl transferase group 1  31.5 
 
 		 376 aa  129  9.000000000000001e-29  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3402  glycosyl transferase group 1  27.8 
 
 		 385 aa  127  2.0000000000000002e-28  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.838483  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2379  glycosyl transferase, group 1  29.43 
 
 		 381 aa  126  7e-28  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2202  glycosyl transferase, group 1  27.7 
 
 		 394 aa  126  8.000000000000001e-28  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2854  glycosyl transferase group 1  28.1 
 
 		 390 aa  125  9e-28  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2739  glycosyl transferase group 1  34.85 
 
 		 377 aa  121  1.9999999999999998e-26  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.363262  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1793  glycosyl transferase group 1  30.87 
 
 		 388 aa  120  3e-26  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.488843  n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3055  glycosyl transferase, group 1  30.91 
 
 		 439 aa  119  9.999999999999999e-26  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2329  glycosyl transferase, group 1  28.68 
 
 		 390 aa  118  1.9999999999999998e-25  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0123279  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3643  glycosyl transferase, group 1  36.02 
 
 		 387 aa  117  3e-25  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.590189  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1513  glycosyl transferase, group 1  30.67 
 
 		 399 aa  117  3e-25  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0232535  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2383  glycosyl transferase group 1  27.32 
 
 		 398 aa  117  5e-25  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.501705  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0668  glycosyl transferase, group 1  31.82 
 
 		 378 aa  115  8.999999999999998e-25  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000385091 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2692  glycosyl transferase, group 1  25.13 
 
 		 367 aa  115  1.0000000000000001e-24  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.00000000235502  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01302  glycosyl transferase, group 1 family protein  25.32 
 
 		 359 aa  114  4.0000000000000004e-24  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.378301  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0688  glycosyl transferase, group 1  28.97 
 
 		 348 aa  112  1.0000000000000001e-23  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0342377  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_14251  hypothetical protein  28.33 
 
 		 384 aa  111  3e-23  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.0241071  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0689  glycosyl transferase, group 1  31.18 
 
 		 398 aa  110  5e-23  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1131  glycosyl transferase group 1  30.51 
 
 		 904 aa  110  6e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.845699  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3084  glycosyl transferase group 1  29.63 
 
 		 379 aa  109  7.000000000000001e-23  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2019  glycosyl transferase, group 1  30.72 
 
 		 363 aa  108  1e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.891192  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4708  glycosyl transferase group 1  27.67 
 
 		 374 aa  107  2e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.392081  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3344  glycosyl transferase, group 1  28.79 
 
 		 384 aa  108  2e-22  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.224872  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1604  glycosyl transferase group 1  27.85 
 
 		 362 aa  107  3e-22  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000498756  normal  0.0753767 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0321  glycosyl transferase group 1  31.76 
 
 		 388 aa  107  4e-22  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0104  glycosyl transferase group 1  28.84 
 
 		 377 aa  107  5e-22  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3883  glycosyl transferase group 1  27.73 
 
 		 395 aa  106  8e-22  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5001  glycosyl transferase, group 1 family protein  26.95 
 
 		 365 aa  106  8e-22  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2867  glycosyl transferase, group 1  30.67 
 
 		 415 aa  106  8e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0291  glycosyl transferase, group 1  31.13 
 
 		 382 aa  106  9e-22  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.614818  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3843  glycosyl transferase, group 1  29.55 
 
 		 358 aa  105  1e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.753041 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4759  glycosyl transferase group 1  30.5 
 
 		 374 aa  105  1e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000028902  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0444  glycosyl transferase group 1  26.9 
 
 		 387 aa  105  1e-21  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.990869 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2206  glycosyl transferase group 1  30.32 
 
 		 371 aa  105  1e-21  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2339  glycosyl transferase, group 1  29.1 
 
 		 373 aa  105  2e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2460  glycosyl transferase group 1  28.03 
 
 		 381 aa  104  3e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2407  glycosyl transferase, group 1  27.41 
 
 		 387 aa  103  4e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.126337  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3212  glycosyl transferase group 1  28.61 
 
 		 374 aa  103  5e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.283031  normal  0.707738 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0459  glycosytransferase, putative  23.22 
 
 		 350 aa  103  5e-21  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00630871  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0495  glycosyl transferase group 1  34.19 
 
 		 387 aa  102  1e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5686  glycosyl transferase group 1  27.59 
 
 		 1080 aa  102  1e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2702  polysaccharide pyruvyl transferase  24.47 
 
 		 745 aa  102  1e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000746297  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6505  Glycosyltransferase-like protein  27.89 
 
 		 393 aa  101  2e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0204  glycosyl transferase group 1  30.72 
 
 		 377 aa  102  2e-20  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1507  glycosyl transferase group 1  35.34 
 
 		 395 aa  101  2e-20  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.255833 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4161  glycosyl transferase group 1  27.37 
 
 		 392 aa  101  2e-20  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0871  glycosyl transferase group 1  30.21 
 
 		 383 aa  101  2e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2514  sugar transferase, PEP-CTERM/EpsH1 system associated  31.49 
 
 		 411 aa  102  2e-20  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.54576  normal  0.0718636 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1498  glycosyl transferase, group 1  27.39 
 
 		 373 aa  100  3e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0838  glycosyl transferase, group 1 family protein  27.89 
 
 		 419 aa  101  3e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0407  glycosyl transferase group 1  31.44 
 
 		 750 aa  100  4e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3019  glycosyl transferase group 1  31.23 
 
 		 370 aa  100  4e-20  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4439  glycosyl transferase group 1  29.29 
 
 		 369 aa  100  5e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1276  glycosyl transferase group 1  28.52 
 
 		 378 aa  100  5e-20  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.680838  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0561  glycosyl transferase group 1  26.92 
 
 		 382 aa  100  6e-20  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1652  glycosyltransferase  21.97 
 
 		 350 aa  100  6e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1919  glycosyl transferase group 1  28.17 
 
 		 407 aa  99.8  8e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.854337 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2719  glycosyl transferase, group 1  30.5 
 
 		 387 aa  99.8  8e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0541086  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2463  glycosyl transferase, group 1  26.58 
 
 		 385 aa  99.8  8e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01306  Glycosyl transferase, group 1  27.62 
 
 		 366 aa  99.8  8e-20  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2492  glycosyl transferase, group 1  32.21 
 
 		 371 aa  99  1e-19  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.637644  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1787  glycosyl transferase group 1  26.96 
 
 		 383 aa  99  1e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2654  glycosyl transferase, group 1  33.12 
 
 		 388 aa  98.6  1e-19  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0179694  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5664  putative glycosyl transferase, group 1  29.03 
 
 		 385 aa  98.6  2e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.721613  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1470  mannosyl transferase  22.44 
 
 		 350 aa  98.6  2e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000263764  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0297  glycosyl transferase, group 1  26.54 
 
 		 371 aa  98.6  2e-19  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0504  glycosyl transferase group 1  28.8 
 
 		 391 aa  98.6  2e-19  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0826  glycosyl transferase group 1  35.4 
 
 		 350 aa  98.6  2e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1498  glycosyl transferase group 1  22.44 
 
 		 350 aa  97.8  3e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1684  glycosyltransferase  22.44 
 
 		 350 aa  97.8  3e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0477  glycosyl transferase, group 1 family protein  24.03 
 
 		 349 aa  97.8  3e-19  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.319799  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3174  glycosyl transferase, group 1 family protein  26.3 
 
 		 377 aa  97.1  5e-19  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6498  glycosyl transferase, group 1  29.3 
 
 		 412 aa  97.1  5e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2152  glycosyl transferase, group 1  26.15 
 
 		 387 aa  96.7  6e-19  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0833  glycosyl transferase group 1  26.8 
 
 		 415 aa  96.3  8e-19  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1396  glycosyl transferase group 1  29.6 
 
 		 440 aa  96.3  8e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0657789  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1045  group 1 glycosyl transferase  27.15 
 
 		 353 aa  95.9  1e-18  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  unclonable  0.00000151909  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1808  glycosyl transferase group 1  30.77 
 
 		 373 aa  95.9  1e-18  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2253  glycosyl transferase, group 1  35.87 
 
 		 413 aa  95.9  1e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.790793 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2591  glycosyl transferase, group 1  28.84 
 
 		 373 aa  95.5  1e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0676  glycosyl transferase group 1  29.32 
 
 		 374 aa  95.1  2e-18  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>