299 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_2700 on replicon NC_007973
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007973  Rmet_2700  glutathione S-transferase-like protein  100 
 
 
218 aa  449  1e-125  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.302839  normal  0.422305 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0763  glutathione S-transferase  88.53 
 
 
217 aa  395  1e-109  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6895  Glutathione S-transferase domain  72.48 
 
 
217 aa  345  4e-94  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.134635  normal  0.66105 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2940  glutathione S-transferase  72.02 
 
 
217 aa  343  8e-94  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4314  glutathione S-transferase domain-containing protein  72.09 
 
 
221 aa  334  7.999999999999999e-91  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2755  glutathione S-transferase-like protein  70.64 
 
 
218 aa  333  1e-90  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.155229 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1566  glutathione S-transferase  69.86 
 
 
219 aa  331  5e-90  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0453975  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4215  glutathione S-transferase domain-containing protein  70.51 
 
 
220 aa  326  1.0000000000000001e-88  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0158899 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1684  glutathione S-transferase-like protein  67.89 
 
 
218 aa  325  4.0000000000000003e-88  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.511087  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1900  glutathione S-transferase-like protein  68.98 
 
 
218 aa  321  5e-87  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1959  glutathione S-transferase domain-containing protein  68.81 
 
 
217 aa  321  6e-87  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.399077  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1217  glutathione S-transferase domain-containing protein  68.04 
 
 
219 aa  316  2e-85  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2364  glutathione S-transferase-like protein  68.52 
 
 
220 aa  314  7e-85  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0709999  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1840  glutathione S-transferase-like  66.06 
 
 
244 aa  314  7e-85  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.0573301 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3789  glutathione S-transferase domain-containing protein  67.28 
 
 
220 aa  313  9.999999999999999e-85  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.181151  normal  0.0204408 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3732  glutathione S-transferase domain-containing protein  66.82 
 
 
239 aa  311  3.9999999999999997e-84  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.0407787 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4632  glutathione S-transferase-like  66.82 
 
 
239 aa  311  3.9999999999999997e-84  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.517858  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6278  putative maleylacetoacetate isomerase (MAAI) (glutathione S- transferase)  71.71 
 
 
217 aa  311  5.999999999999999e-84  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3614  glutathione S-transferase domain-containing protein  67.59 
 
 
220 aa  308  2.9999999999999997e-83  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.922528  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2135  glutathione S-transferase domain-containing protein  64.95 
 
 
216 aa  286  2e-76  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0624  Glutathione S-transferase domain protein  65.6 
 
 
217 aa  284  8e-76  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0101229 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4995  glutathione S-transferase domain-containing protein  57.8 
 
 
218 aa  253  2.0000000000000002e-66  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000401874 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1488  putative glutathione-S-transferase protein  56.42 
 
 
218 aa  242  3e-63  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0682  putative glutathione-S-transferase protein  58.26 
 
 
218 aa  238  5.999999999999999e-62  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.994031 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4069  putative glutathione-S-transferase protein  57.34 
 
 
218 aa  236  2e-61  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.822879 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3775  putative glutathione-S-transferase protein  57.34 
 
 
218 aa  236  2e-61  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.102051  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4030  putative glutathione-S-transferase protein  57.34 
 
 
240 aa  235  5.0000000000000005e-61  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.388336  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0700  Glutathione S-transferase domain protein  50.7 
 
 
214 aa  199  3e-50  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0086  hypothetical protein  48.57 
 
 
229 aa  192  3e-48  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.851127  normal  0.63256 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3341  Glutathione S-transferase domain protein  49.52 
 
 
229 aa  192  3e-48  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0178  glutathione S-transferase-like protein  50.49 
 
 
229 aa  192  4e-48  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.413822 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3664  Glutathione S-transferase domain  48.57 
 
 
229 aa  191  1e-47  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2898  glutathione S-transferase domain-containing protein  47.64 
 
 
215 aa  191  1e-47  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.474988  normal  0.112272 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3193  glutathione S-transferase-like protein  46.19 
 
 
222 aa  178  5.999999999999999e-44  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6379  glutathione S-transferase-like protein  46.48 
 
 
215 aa  178  7e-44  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4787  putative glutathione S-transferase (GST)  47.09 
 
 
219 aa  178  7e-44  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3568  Glutathione S-transferase domain  43.98 
 
 
218 aa  177  1e-43  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3032  glutathione S-transferase domain-containing protein  45.54 
 
 
215 aa  177  1e-43  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.865066  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2418  glutathione S-transferase-like  45.54 
 
 
215 aa  177  1e-43  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2384  glutathione S-transferase-like protein  47.25 
 
 
218 aa  176  3e-43  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  hitchhiker  0.00711866  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3051  glutathione S-transferase domain-containing protein  45.54 
 
 
215 aa  175  4e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0255759 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3070  glutathione S-transferase-like  46.79 
 
 
218 aa  175  4e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.15979  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0933  glutathione S-transferase domain-containing protein  48.53 
 
 
210 aa  175  5e-43  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.250168 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57200  putative glutathione S-transferase  45.37 
 
 
211 aa  175  5e-43  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0200  glutathione S-transferase  44.86 
 
 
217 aa  174  9e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0221  glutathione S-transferase  49.05 
 
 
229 aa  174  9.999999999999999e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3027  glutathione S-transferase domain-containing protein  45.54 
 
 
215 aa  173  1.9999999999999998e-42  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.890622 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3077  glutathione S-transferase domain-containing protein  45.54 
 
 
215 aa  172  2.9999999999999996e-42  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4154  Glutathione S-transferase domain protein  42.59 
 
 
215 aa  172  3.9999999999999995e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.930839 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2943  glutathione S-transferase domain-containing protein  45.07 
 
 
215 aa  172  5e-42  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.561118  normal  0.706349 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4972  glutathione S-transferase domain-containing protein  44.88 
 
 
209 aa  171  6.999999999999999e-42  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3154  glutathione S-transferase domain-containing protein  47.69 
 
 
227 aa  166  2e-40  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.861762  normal  0.107503 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3316  glutathione S-transferase domain-containing protein  44.29 
 
 
218 aa  166  2e-40  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0456  glutathione S-transferase domain-containing protein  44.29 
 
 
218 aa  166  2e-40  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2106  glutathione S-transferase domain-containing protein  44.29 
 
 
218 aa  166  2e-40  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4377  glutathione S-transferase domain-containing protein  44.61 
 
 
210 aa  166  2e-40  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.707138  normal  0.0169284 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3336  glutathione S-transferase-like  47.32 
 
 
218 aa  166  2.9999999999999998e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0235  glutathione S-transferase domain-containing protein  43.81 
 
 
234 aa  165  5e-40  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0271  glutathione S-transferase domain-containing protein  44.88 
 
 
215 aa  164  8e-40  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.791762  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3362  glutathione S-transferase domain-containing protein  44.88 
 
 
215 aa  164  8e-40  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3826  Glutathione S-transferase domain  41.2 
 
 
215 aa  164  8e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2986  glutathione S-transferase domain-containing protein  44.88 
 
 
215 aa  164  8e-40  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0005  glutathione S-transferase domain-containing protein  40.19 
 
 
220 aa  164  9e-40  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4502  glutathione S-transferase domain-containing protein  43.63 
 
 
210 aa  164  9e-40  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.282964  normal  0.694536 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0259  glutathione S-transferase domain-containing protein  44.88 
 
 
215 aa  164  1.0000000000000001e-39  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.118169  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4206  glutathione S-transferase domain-containing protein  45.07 
 
 
228 aa  163  2.0000000000000002e-39  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.779157 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0005  glutathione S-transferase domain-containing protein  39.71 
 
 
220 aa  162  2.0000000000000002e-39  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.0120161 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0005  glutathione S-transferase domain-containing protein  40.19 
 
 
220 aa  162  2.0000000000000002e-39  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0005  Glutathione S-transferase domain protein  40.19 
 
 
220 aa  163  2.0000000000000002e-39  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000759122 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0613  Glutathione S-transferase domain  46.23 
 
 
222 aa  162  3e-39  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0499995 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2428  glutathione S-transferase-like  43.58 
 
 
218 aa  162  3e-39  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.470962  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3120  glutathione S-transferase domain-containing protein  42.31 
 
 
215 aa  162  3e-39  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0013  glutathione S-transferase domain-containing protein  39.91 
 
 
218 aa  162  5.0000000000000005e-39  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000975013 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3297  hypothetical protein  43.4 
 
 
234 aa  162  5.0000000000000005e-39  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.210866  normal  0.103895 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0005  glutathione S-transferase domain-containing protein  40.38 
 
 
218 aa  162  5.0000000000000005e-39  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000000152518 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0005  glutathione S-transferase domain-containing protein  40.38 
 
 
218 aa  160  1e-38  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.0533093 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0954  glutathione S-transferase domain-containing protein  42.65 
 
 
210 aa  157  9e-38  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.428451  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1470  glutathione S-transferase domain-containing protein  40.65 
 
 
229 aa  157  1e-37  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0012  glutathione S-transferase family protein  38.14 
 
 
220 aa  157  1e-37  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1706  glutathione S-transferase  43.72 
 
 
218 aa  156  2e-37  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.644809  normal  0.447888 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13360  glutathione S-transferase family protein  44.34 
 
 
214 aa  156  2e-37  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3736  glutathione S-transferase  42.99 
 
 
217 aa  156  3e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.110407  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4092  glutathione S-transferase  42.65 
 
 
208 aa  156  3e-37  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.886958 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0753  Glutathione S-transferase domain protein  39.44 
 
 
217 aa  155  6e-37  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00015348 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0523  Glutathione S-transferase domain protein  40.19 
 
 
228 aa  154  7e-37  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3467  glutathione S-transferase domain-containing protein  40.85 
 
 
231 aa  154  1e-36  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.616657  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0813  glutathione S-transferase domain-containing protein  46.73 
 
 
219 aa  154  1e-36  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0139942  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0424  glutathione S-transferase domain-containing protein  38.21 
 
 
219 aa  154  1e-36  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0507  glutathione S-transferase domain-containing protein  40.19 
 
 
228 aa  154  1e-36  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.911631  normal  0.0384549 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2405  Glutathione S-transferase domain protein  43.2 
 
 
227 aa  152  2.9999999999999998e-36  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.720241  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4340  glutathione S-transferase  42.92 
 
 
219 aa  152  4e-36  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1259  glutathione S-transferase domain-containing protein  38.32 
 
 
229 aa  150  1e-35  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4398  glutathione S-transferase family protein  40.95 
 
 
260 aa  149  2e-35  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1089  glutathione S-transferase-like  37.56 
 
 
227 aa  149  3e-35  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2921  Glutathione S-transferase domain protein  39.6 
 
 
228 aa  148  5e-35  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3912  hypothetical protein  40.09 
 
 
230 aa  148  5e-35  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.874335  normal  0.368309 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4426  glutathione S-transferase-like protein  42.16 
 
 
210 aa  148  6e-35  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1672  glutathione S-transferase domain-containing protein  37.07 
 
 
217 aa  147  1.0000000000000001e-34  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.252264 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1347  glutathione S-transferase family protein  44.61 
 
 
210 aa  146  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.114443  hitchhiker  0.00114308 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0002  glutathione S-transferase-like protein  45.45 
 
 
223 aa  146  2.0000000000000003e-34  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.0515777 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>