More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_2582 on replicon NC_007973
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_003295  RSc2211  ATP-dependent RNA helicase protein  73.19 
 
 
495 aa  696    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2409  DEAD/DEAH box helicase domain protein  75.15 
 
 
493 aa  698    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.92601 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0899  helicase, C-terminal:DEAD/DEAH box helicase, N-terminal  88.6 
 
 
537 aa  865    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2015  DEAD/DEAH box helicase domain protein  74.75 
 
 
493 aa  713    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.73004  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2582  DEAD/DEAH box helicase-like protein  100 
 
 
556 aa  1130    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2339  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  64.6 
 
 
520 aa  601  1.0000000000000001e-171  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0312074 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1704  DEAD/DEAH box helicase-like  64.6 
 
 
520 aa  601  1.0000000000000001e-171  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2316  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  64.6 
 
 
520 aa  601  1.0000000000000001e-171  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0961  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  64.4 
 
 
509 aa  595  1e-169  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0175474  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2355  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  65.53 
 
 
497 aa  595  1e-169  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.651471  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2235  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  65.23 
 
 
511 aa  597  1e-169  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5658  DEAD/DEAH box helicase-like  62.9 
 
 
527 aa  593  1e-168  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0981  ATP-dependent RNA helicase RhlE  63.36 
 
 
571 aa  589  1e-167  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1250  DEAD/DEAH box helicase domain protein  65.78 
 
 
489 aa  588  1e-167  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2082  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  66.6 
 
 
482 aa  586  1e-166  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.162291 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3295  putative ATP-dependent RNA helicase 2  64.89 
 
 
491 aa  586  1e-166  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1917  ATP-dependent RNA helicase RhlE  65.65 
 
 
482 aa  584  1.0000000000000001e-165  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0135106  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1352  putative ATP-dependent RNA helicase 2  63.94 
 
 
559 aa  583  1.0000000000000001e-165  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.051549  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1193  DEAD/DEAH box helicase  65.65 
 
 
481 aa  584  1.0000000000000001e-165  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.444937  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0828  ATP-dependent RNA helicase RhlE  65.65 
 
 
482 aa  584  1.0000000000000001e-165  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00138839  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0323  DEAD/DEAH box helicase  65.65 
 
 
482 aa  584  1.0000000000000001e-165  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0723689  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1040  DEAD/DEAH box helicase  65.65 
 
 
482 aa  584  1.0000000000000001e-165  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.33431  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1201  DEAD/DEAH box helicase  65.65 
 
 
482 aa  584  1.0000000000000001e-165  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0820684  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1252  DEAD/DEAH box helicase domain protein  58.78 
 
 
479 aa  548  1e-154  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.225431  normal  0.30978 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0604  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  57.12 
 
 
473 aa  545  1e-153  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1339  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  56.62 
 
 
486 aa  522  1e-147  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0203924  hitchhiker  0.000949009 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1257  DEAD/DEAH box helicase-like protein  58.3 
 
 
460 aa  518  1e-146  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.41988 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1148  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  56.97 
 
 
489 aa  517  1.0000000000000001e-145  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1053  DEAD/DEAH box helicase domain protein  57.38 
 
 
484 aa  512  1e-144  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0617  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  56.05 
 
 
479 aa  514  1e-144  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.028654 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1132  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  57.17 
 
 
484 aa  510  1e-143  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.716722 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0631  putative ATP-dependent RNA helicase 2  54.33 
 
 
494 aa  505  9.999999999999999e-143  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.640854  normal  0.233669 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1516  DEAD/DEAH box helicase-like  55.67 
 
 
492 aa  504  1e-141  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2155  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  56.67 
 
 
504 aa  502  1e-141  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.659506  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3878  DEAD/DEAH box helicase domain protein  57.76 
 
 
486 aa  501  1e-140  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3310  helicase, C-terminal:DEAD/DEAH box helicase, N-terminal  53.12 
 
 
507 aa  493  9.999999999999999e-139  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.0221884 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3028  DEAD/DEAH box helicase-like  55.13 
 
 
506 aa  495  9.999999999999999e-139  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.287974  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3202  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  56.21 
 
 
487 aa  491  1e-137  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.409913 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1646  DEAD/DEAH box helicase domain protein  54.19 
 
 
545 aa  473  1e-132  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2657  DEAD/DEAH box helicase-like  52.45 
 
 
510 aa  466  9.999999999999999e-131  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1101  DEAD/DEAH box helicase  56.43 
 
 
460 aa  464  1e-129  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.173172  normal  0.740894 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2460  putative ATP-dependent RNA helicase rhlE  57.03 
 
 
485 aa  428  1e-118  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.115512  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0248  ATP-dependent RNA helicase RhlE  57.03 
 
 
485 aa  428  1e-118  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0914  ATP-dependent RNA helicase  57.03 
 
 
485 aa  428  1e-118  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.348859  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5998  DEAD/DEAH box helicase  57.29 
 
 
484 aa  427  1e-118  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.123523 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2699  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  57.29 
 
 
486 aa  427  1e-118  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.411563  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3259  ATP-dependent RNA helicase, DEAD box family protein  57.55 
 
 
429 aa  426  1e-118  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  unclonable  0.00000130647  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0607  ATP-dependent RNA helicase RhlE  57.03 
 
 
482 aa  425  1e-118  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0748  putative ATP-dependent RNA helicase rhlE  57.03 
 
 
485 aa  428  1e-118  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.162375  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0426  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  57.03 
 
 
522 aa  426  1e-118  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.234124  normal  0.583297 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0627  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  57.29 
 
 
480 aa  426  1e-118  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2059  DEAD/DEAH box helicase-like  57.29 
 
 
486 aa  426  1e-118  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.311638  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0735  putative ATP-dependent RNA helicase rhlE  57.03 
 
 
485 aa  427  1e-118  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2670  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  57.29 
 
 
486 aa  426  1e-118  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0817  DEAD/DEAH box helicase-like protein  56.88 
 
 
452 aa  422  1e-117  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.187281  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2379  ATP-dependent RNA helicase RhlE  56.59 
 
 
488 aa  422  1e-117  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1288  ATP-dependent RNA helicase RhlE  55.87 
 
 
462 aa  424  1e-117  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2723  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  57.03 
 
 
480 aa  425  1e-117  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0181544  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2595  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  57.03 
 
 
479 aa  425  1e-117  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.381467  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0779  DEAD/DEAH box helicase-like  56.19 
 
 
445 aa  419  1e-116  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2698  putative ATP-dependent RNA helicase rhlE  57.64 
 
 
473 aa  421  1e-116  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0539  ATP-dependent RNA helicase protein  55.04 
 
 
540 aa  416  9.999999999999999e-116  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.00876522  normal  0.882809 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0703  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  54.55 
 
 
494 aa  416  9.999999999999999e-116  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3851  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  51.17 
 
 
513 aa  418  9.999999999999999e-116  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00282331 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0517  helicase, C-terminal:Type III restriction enzyme, res subunit:DEAD/DEAH box helicase, N-terminal  55.38 
 
 
506 aa  416  9.999999999999999e-116  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0847838  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0025  DEAD/DEAH box helicase-like  53.39 
 
 
398 aa  416  9.999999999999999e-116  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1528  ATP-dependent RNA helicase RhlE  56.25 
 
 
477 aa  417  9.999999999999999e-116  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.515167  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2935  ATP-dependent RNA helicase RhlE  56.25 
 
 
476 aa  417  9.999999999999999e-116  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0648  putative ATP-dependent RNA helicase 1  55.73 
 
 
543 aa  417  9.999999999999999e-116  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.498001 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3311  DEAD/DEAH box helicase domain protein  55.47 
 
 
515 aa  418  9.999999999999999e-116  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.23551  normal  0.773236 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1342  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  51.17 
 
 
426 aa  418  9.999999999999999e-116  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00764  RNA helicase  55.21 
 
 
454 aa  412  1e-114  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.697529  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2845  DEAD/DEAH box helicase domain protein  55.21 
 
 
454 aa  412  1e-114  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0947  ATP-dependent RNA helicase RhlE  55.21 
 
 
453 aa  414  1e-114  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.283527  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2648  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  55.11 
 
 
479 aa  414  1e-114  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0820  ATP-dependent RNA helicase RhlE  55.21 
 
 
454 aa  412  1e-114  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0883  ATP-dependent RNA helicase RhlE  55.21 
 
 
453 aa  414  1e-114  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.809863  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1433  ATP-dependent RNA helicase RhlE  55.73 
 
 
418 aa  415  1e-114  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.858886  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3825  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  55.21 
 
 
443 aa  414  1e-114  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0862  ATP-dependent RNA helicase RhlE  55.21 
 
 
454 aa  412  1e-114  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1150  DEAD/DEAH box helicase domain protein  55.73 
 
 
418 aa  415  1e-114  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1952  DEAD/DEAH box helicase-like  53.5 
 
 
426 aa  413  1e-114  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.62212 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2846  ATP-dependent RNA helicase RhlE  55.21 
 
 
454 aa  412  1e-114  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0376153 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2088  putative ATP-dependent RNA helicase 1  54.43 
 
 
453 aa  412  1e-114  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.936977 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0456  DEAD/DEAH box helicase-like protein  55.41 
 
 
540 aa  414  1e-114  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0420  DEAD/DEAH box helicase domain protein  54.52 
 
 
560 aa  412  1e-114  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.437867  hitchhiker  0.000179935 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0915  ATP-dependent RNA helicase RhlE  55.21 
 
 
453 aa  414  1e-114  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0968  ATP-dependent RNA helicase RhlE  55.21 
 
 
453 aa  413  1e-114  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0855  ATP-dependent RNA helicase RhlE  55.21 
 
 
453 aa  414  1e-114  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00781  hypothetical protein  55.21 
 
 
454 aa  412  1e-114  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.74748  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0945  ATP-dependent RNA helicase RhlE  55.21 
 
 
455 aa  412  1e-114  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0434  DEAD/DEAH box helicase domain protein  54.52 
 
 
565 aa  414  1e-114  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.326828  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2419  DEAD/DEAH box helicase domain protein  56.25 
 
 
452 aa  414  1e-114  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.131978  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3682  DEAD/DEAH box helicase domain protein  52.82 
 
 
601 aa  409  1e-113  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0604  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  55.81 
 
 
491 aa  411  1e-113  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.631555 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1733  DEAD/DEAH box helicase  55.53 
 
 
477 aa  409  1e-113  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.210981  normal  0.24417 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3520  DEAD/DEAH box helicase-like  53.08 
 
 
579 aa  409  1e-113  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.119632 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1331  ATP-dependent RNA helicase RhlE  55.47 
 
 
456 aa  412  1e-113  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0786  putative ATP-dependent RNA helicase rhlE  53.14 
 
 
411 aa  409  1e-113  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.456558  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2555  ATP-dependent RNA helicase RhlE  54.95 
 
 
454 aa  410  1e-113  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>