More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_2562 on replicon NC_007973
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007973  Rmet_2562  protein serine/threonine phosphatases  100 
 
 		 256 aa  509  1e-143  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.144925  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2423  protein phosphatase 2C-like  57.92 
 
 		 259 aa  272  4.0000000000000004e-72  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0477  protein serine/threonine phosphatases  51.57 
 
 		 256 aa  250  2e-65  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3832  protein serine/threonine phosphatase  51.57 
 
 		 256 aa  247  1e-64  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.982959 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4004  protein serine/threonine phosphatase  50 
 
 		 256 aa  246  2e-64  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.467216  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0146  putative phosphoprotein phosphatase  46.89 
 
 		 242 aa  204  1e-51  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00890  putative phosphoprotein phosphatase  46.47 
 
 		 242 aa  204  1e-51  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0335578  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2314  protein phosphatase 2C domain-containing protein  45.87 
 
 		 243 aa  197  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.109306  hitchhiker  0.0000219679 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0105  protein phosphatase 2C domain-containing protein  50.64 
 
 		 242 aa  195  6e-49  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.895672  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5417  serine/threonine phosphoprotein phosphatase  45.64 
 
 		 242 aa  184  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42890  serine/threonine phosphoprotein phosphatase Stp1  45.96 
 
 		 242 aa  183  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.566256 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3602  serine/threonine phosphoprotein phosphatase Stp1  45.53 
 
 		 242 aa  182  7e-45  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2879  protein serine/threonine phosphatase  42.06 
 
 		 262 aa  169  3e-41  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0260244 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2086  protein phosphatase 2C domain-containing protein  45.34 
 
 		 239 aa  168  6e-41  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.440717  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5576  protein serine/threonine phosphatase  45.64 
 
 		 242 aa  168  8e-41  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.9371 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3050  protein serine/threonine phosphatase  41.63 
 
 		 267 aa  162  3e-39  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2371  protein serine/threonine phosphatase  38.33 
 
 		 255 aa  163  3e-39  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1343  protein serine/threonine phosphatase  41.42 
 
 		 394 aa  156  3e-37  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00740563 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2487  protein serine/threonine phosphatase  39.83 
 
 		 241 aa  155  7e-37  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00028988  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0573  protein serine/threonine phosphatases  35.95 
 
 		 245 aa  155  7e-37  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000179403  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0912  protein serine/threonine phosphatase  41.6 
 
 		 276 aa  154  9e-37  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.615558 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0039  protein serine/threonine phosphatase  39.69 
 
 		 472 aa  152  5e-36  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.759123  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000018  serine/threonine protein phosphatase  36.22 
 
 		 264 aa  151  1e-35  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1333  protein serine/threonine phosphatase  41.42 
 
 		 270 aa  151  1e-35  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.535084  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0081  protein serine/threonine phosphatase  43.24 
 
 		 519 aa  150  1e-35  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0031  protein serine/threonine phosphatase  38.64 
 
 		 477 aa  148  9e-35  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3942  protein phosphatase 2C domain-containing protein  42.62 
 
 		 280 aa  146  3e-34  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.145265  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0909  protein serine/threonine phosphatases  38.46 
 
 		 236 aa  145  4.0000000000000006e-34  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0310722  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03320  serine/threonine protein phosphatase  39.91 
 
 		 452 aa  146  4.0000000000000006e-34  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0159722  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3041  protein serine/threonine phosphatase  40.71 
 
 		 395 aa  145  5e-34  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1534  protein serine/threonine phosphatase  34.98 
 
 		 241 aa  145  6e-34  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0029  Phosphoprotein phosphatase  40.43 
 
 		 505 aa  144  1e-33  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27050  serine/threonine protein phosphatase  40.79 
 
 		 425 aa  144  1e-33  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02467  protein phosphatase  38.53 
 
 		 234 aa  143  2e-33  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1066  protein serine/threonine phosphatase  37.92 
 
 		 249 aa  141  9.999999999999999e-33  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1992  protein phosphatase 2C family protein  34.85 
 
 		 239 aa  141  9.999999999999999e-33  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1710  protein phosphatase 2C family protein  34.85 
 
 		 239 aa  141  9.999999999999999e-33  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1589  protein phosphatase 2C domain-containing protein  39.32 
 
 		 237 aa  140  1.9999999999999998e-32  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1588  protein serine/threonine phosphatase  37.98 
 
 		 267 aa  140  1.9999999999999998e-32  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0022  protein serine/threonine phosphatases  41.84 
 
 		 421 aa  140  3e-32  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0044  protein phosphatase 2C domain-containing protein  37.55 
 
 		 482 aa  139  3e-32  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.111894  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26950  serine/threonine protein phosphatase  40 
 
 		 466 aa  139  3.9999999999999997e-32  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.978389  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0029  protein serine/threonine phosphatase  42.05 
 
 		 479 aa  139  3.9999999999999997e-32  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.893327  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1520  putative phosphoprotein phosphatase  35.62 
 
 		 241 aa  139  6e-32  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.101947 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0049  protein serine/threonine phosphatase  37.55 
 
 		 478 aa  138  7.999999999999999e-32  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.24969 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00220  serine/threonine protein phosphatase  40.83 
 
 		 507 aa  138  7.999999999999999e-32  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.682874 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0846  protein serine/threonine phosphatase  39.13 
 
 		 234 aa  138  1e-31  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0489  protein serine/threonine phosphatase  41.39 
 
 		 285 aa  137  2e-31  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.650161  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3111  protein serine/threonine phosphatase  38.56 
 
 		 319 aa  137  2e-31  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0426507 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1750  protein phosphatase 2C domain-containing protein  35.68 
 
 		 247 aa  137  2e-31  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.165871  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0090  protein serine/threonine phosphatase  38.56 
 
 		 422 aa  137  2e-31  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3622  protein serine/threonine phosphatase  41.3 
 
 		 271 aa  137  2e-31  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  decreased coverage  0.00717219  decreased coverage  0.000139718 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4532  protein serine/threonine phosphatase  40.43 
 
 		 239 aa  136  3.0000000000000003e-31  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00167554 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1956  protein serine/threonine phosphatase  38.84 
 
 		 252 aa  135  4e-31  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0014  protein serine/threonine phosphatase  40.34 
 
 		 416 aa  135  6.0000000000000005e-31  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4426  protein serine/threonine phosphatase  39.73 
 
 		 364 aa  135  7.000000000000001e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0345572  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6475  protein serine/threonine phosphatase  40 
 
 		 463 aa  135  7.000000000000001e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0121274 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0075  Protein phosphatase 2C-like  38.65 
 
 		 463 aa  135  8e-31  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0579215  normal  0.315447 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2083  Serine/threonine protein phosphatase  35.92 
 
 		 258 aa  134  9.999999999999999e-31  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0051  protein serine/threonine phosphatase  38.02 
 
 		 426 aa  134  1.9999999999999998e-30  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  hitchhiker  0.00361373  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1112  serine/threonine phosphoprotein phosphatase  34.08 
 
 		 217 aa  134  1.9999999999999998e-30  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5250  protein serine/threonine phosphatase  36.4 
 
 		 449 aa  134  1.9999999999999998e-30  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.383211 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1312  protein serine/threonine phosphatase  36.71 
 
 		 236 aa  133  3e-30  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3062  protein phosphatase 2C-like  39.3 
 
 		 474 aa  132  3.9999999999999996e-30  Thermobifida fusca YX  Bacteria  decreased coverage  0.00558874  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4432  protein serine/threonine phosphatases  39.09 
 
 		 469 aa  132  3.9999999999999996e-30  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.35733 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0952  protein phosphatase 2C-like protein  38.31 
 
 		 276 aa  132  3.9999999999999996e-30  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00400  serine/threonine protein phosphatase  37.22 
 
 		 478 aa  132  3.9999999999999996e-30  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.784973 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1711  protein phosphatase 2C domain-containing protein  35.83 
 
 		 238 aa  132  5e-30  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0849  protein serine/threonine phosphatase  37.66 
 
 		 247 aa  132  6e-30  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.102968 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1071  protein serine/threonine phosphatase  38.87 
 
 		 538 aa  132  6.999999999999999e-30  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.821303  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2307  protein serine/threonine phosphatase  35.29 
 
 		 238 aa  131  9e-30  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0816987  hitchhiker  0.000541845 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4111  protein phosphatase 2C domain-containing protein  40 
 
 		 239 aa  131  1.0000000000000001e-29  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3492  protein phosphatase 2C-like  43.46 
 
 		 248 aa  130  2.0000000000000002e-29  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.492295  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1774  serine/threonine protein phosphatase-like  39.08 
 
 		 264 aa  130  2.0000000000000002e-29  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0461354  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3297  protein serine/threonine phosphatases  34.76 
 
 		 243 aa  130  2.0000000000000002e-29  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00780778 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3382  protein serine/threonine phosphatase  36.71 
 
 		 240 aa  130  3e-29  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4033  protein serine/threonine phosphatase  38.98 
 
 		 404 aa  130  3e-29  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0996  protein phosphatase 2C-like protein  38.74 
 
 		 305 aa  130  3e-29  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4547  protein phosphatase 2C domain-containing protein  38.59 
 
 		 470 aa  129  5.0000000000000004e-29  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3136  protein phosphatase 2C domain-containing protein  43.23 
 
 		 251 aa  129  5.0000000000000004e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0526297 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0472  protein serine/threonine phosphatase  36.78 
 
 		 320 aa  129  6e-29  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3187  protein serine/threonine phosphatase  35.95 
 
 		 415 aa  129  6e-29  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000686686  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3832  protein serine/threonine phosphatase  39.2 
 
 		 256 aa  128  7.000000000000001e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.140812  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3691  serine/threonine phosphatase  39.2 
 
 		 256 aa  129  7.000000000000001e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.221121  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3345  cyclic nucleotide-binding protein  33.46 
 
 		 417 aa  128  7.000000000000001e-29  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.254717  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3749  protein serine/threonine phosphatase  39.2 
 
 		 256 aa  128  7.000000000000001e-29  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  decreased coverage  0.00230331  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0174  protein serine/threonine phosphatase  38.82 
 
 		 500 aa  128  8.000000000000001e-29  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.841118 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0099  protein serine/threonine phosphatase  35.89 
 
 		 449 aa  128  9.000000000000001e-29  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3965  protein serine/threonine phosphatase  36.75 
 
 		 244 aa  128  1.0000000000000001e-28  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09950  phosphoric monoester hydrolase  32.63 
 
 		 236 aa  127  1.0000000000000001e-28  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0770  protein serine/threonine phosphatase  42.13 
 
 		 280 aa  127  2.0000000000000002e-28  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0138  protein serine/threonine phosphatase  37.61 
 
 		 467 aa  127  2.0000000000000002e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.568402  decreased coverage  0.00197643 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2458  protein phosphatase 2C domain-containing protein  38.75 
 
 		 258 aa  127  2.0000000000000002e-28  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.469461 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0770  protein serine/threonine phosphatase  42.13 
 
 		 280 aa  127  2.0000000000000002e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0437  protein phosphatase 2C-like  37.6 
 
 		 296 aa  126  4.0000000000000003e-28  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.018902 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0030  protein serine/threonine phosphatase  37.08 
 
 		 462 aa  125  5e-28  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0808  protein phosphatase 2C domain-containing protein  38.39 
 
 		 516 aa  125  5e-28  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0034  protein phosphatase 2C  36.33 
 
 		 554 aa  125  6e-28  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1755  protein serine/threonine phosphatase  35.88 
 
 		 284 aa  125  6e-28  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.959742  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0115  Phosphoprotein phosphatase  37.55 
 
 		 441 aa  125  6e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.11266  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>