More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_2481 on replicon NC_007973
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011662  Tmz1t_2545  citrate synthase I  72.77 
 
 
431 aa  658  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1134  type II citrate synthase  81.16 
 
 
432 aa  748  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.066915  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3605  type II citrate synthase  79.82 
 
 
436 aa  738  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.113528 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2450  type II citrate synthase  69.68 
 
 
434 aa  646  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.444525 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3253  type II citrate synthase  70.35 
 
 
434 aa  650  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1796  type II citrate synthase  79.13 
 
 
436 aa  736  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.216782  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2288  type II citrate synthase  79.59 
 
 
436 aa  733  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2199  type II citrate synthase  81.65 
 
 
436 aa  746  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.308068  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1425  type II citrate synthase  80.5 
 
 
436 aa  735  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0665  type II citrate synthase  83.37 
 
 
433 aa  772  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.170997  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0858  citrate synthase I  70.02 
 
 
433 aa  645  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.690144  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1822  type II citrate synthase  89.61 
 
 
433 aa  803  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0907648  normal  0.724589 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1660  type II citrate synthase  70 
 
 
429 aa  641  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1106  type II citrate synthase  69.65 
 
 
435 aa  638  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2042  type II citrate synthase  70.12 
 
 
430 aa  639  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0529149  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2890  type II citrate synthase  82.68 
 
 
433 aa  768  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2843  type II citrate synthase  69.68 
 
 
434 aa  645  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.433784  normal  0.36225 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2481  type II citrate synthase  100 
 
 
433 aa  908  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.523496  normal  0.0627534 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3037  type II citrate synthase  79.82 
 
 
436 aa  740  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.797011  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2798  type II citrate synthase  79.59 
 
 
436 aa  733  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.242965 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1626  type II citrate synthase  83.14 
 
 
433 aa  771  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00616613  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1681  citrate synthase I  68.94 
 
 
429 aa  634  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.592991 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3939  type II citrate synthase  82.91 
 
 
433 aa  767  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3316  type II citrate synthase  82.91 
 
 
433 aa  769  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.229262  normal  0.697255 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4350  type II citrate synthase  78.9 
 
 
436 aa  724  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.398062 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2165  type II citrate synthase  81.88 
 
 
437 aa  753  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.962895  normal  0.161655 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1834  type II citrate synthase  83.14 
 
 
433 aa  771  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0219356  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2329  type II citrate synthase  83.14 
 
 
433 aa  771  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2467  type II citrate synthase  83.14 
 
 
433 aa  771  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00536833  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0504  type II citrate synthase  83.14 
 
 
433 aa  771  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.405584  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4428  type II citrate synthase  82.91 
 
 
433 aa  767  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0763  type II citrate synthase  80.96 
 
 
437 aa  753  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2147  type II citrate synthase  82.91 
 
 
433 aa  767  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.787035  normal  0.703076 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2320  type II citrate synthase  96.77 
 
 
433 aa  885  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3517  type II citrate synthase  69.3 
 
 
429 aa  637  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4194  type II citrate synthase  69.77 
 
 
429 aa  638  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0867349  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4425  citrate synthase I  70.14 
 
 
436 aa  645  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.224643  normal  0.0272577 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6352  type II citrate synthase  95.59 
 
 
433 aa  869  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0645718  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2860  citrate synthase  71.4 
 
 
432 aa  649  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5205  type II citrate synthase  80.83 
 
 
433 aa  752  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.237518  normal  0.311757 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2701  type II citrate synthase  81.19 
 
 
437 aa  749  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0134767 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4366  type II citrate synthase  83.6 
 
 
433 aa  778  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2422  type II citrate synthase  76.83 
 
 
436 aa  716  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1744  type II citrate synthase  83.14 
 
 
433 aa  771  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.676143  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3832  type II citrate synthase  82.68 
 
 
433 aa  768  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.418606 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3765  type II citrate synthase  69.77 
 
 
429 aa  638  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0679988  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2813  type II citrate synthase  71.06 
 
 
434 aa  649  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.796858 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1058  type II citrate synthase  80.5 
 
 
437 aa  750  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.704464  normal  0.0578787 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0788  type II citrate synthase  83.14 
 
 
433 aa  771  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0858919  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4643  type II citrate synthase  83.37 
 
 
433 aa  772  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3589  type II citrate synthase  82.91 
 
 
433 aa  767  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0248785  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1609  type II citrate synthase  69.77 
 
 
429 aa  637  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.706948  normal  0.65049 
 
 
-
 
NC_004310  BR1148  type II citrate synthase  69.65 
 
 
430 aa  638  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6851  type II citrate synthase  82.91 
 
 
433 aa  769  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.622921 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1845  type II citrate synthase  68.84 
 
 
433 aa  639  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.273477  normal  0.198527 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1991  type II citrate synthase  89.15 
 
 
433 aa  795  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.179438  normal  0.357874 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5525  type II citrate synthase  80.7 
 
 
432 aa  745  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.615237  normal  0.487627 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2146  type II citrate synthase  89.61 
 
 
433 aa  803  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4502  type II citrate synthase  67.9 
 
 
434 aa  632  1e-180  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.705578 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1596  type II citrate synthase  68.37 
 
 
429 aa  631  1e-180  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.218131  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1646  type II citrate synthase  68.08 
 
 
429 aa  634  1e-180  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0982845  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2563  type II citrate synthase  68.37 
 
 
429 aa  630  1e-179  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.102281  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2194  citrate synthase I  68.84 
 
 
429 aa  629  1e-179  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1144  type II citrate synthase  68.14 
 
 
429 aa  630  1e-179  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.300068  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2004  type II citrate synthase  68.84 
 
 
429 aa  630  1e-179  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.719341  normal  0.158891 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1708  type II citrate synthase  68.47 
 
 
433 aa  630  1e-179  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.693797  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29820  type II citrate synthase  69.53 
 
 
427 aa  630  1e-179  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1409  citrate synthase I  69.03 
 
 
429 aa  630  1e-179  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.423182 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0061  citrate synthase  66.97 
 
 
430 aa  628  1e-179  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0890712  normal  0.301769 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1422  type II citrate synthase  68.37 
 
 
428 aa  630  1e-179  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  6.89188e-05  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1789  type II citrate synthase  67.91 
 
 
429 aa  629  1e-179  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.069091  hitchhiker  0.00547545 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3181  citrate synthase I  67.21 
 
 
438 aa  625  1e-178  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.270593  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2508  type II citrate synthase  68.24 
 
 
436 aa  624  1e-178  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.636436  normal  0.21976 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1600  citrate synthase  67.44 
 
 
433 aa  626  1e-178  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44070  type II citrate synthase  67.91 
 
 
428 aa  623  1e-177  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4680  citrate synthase I  68.5 
 
 
446 aa  621  1e-177  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0646  citrate synthase I  69.4 
 
 
430 aa  621  1e-177  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.615558 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5145  citrate synthase I  68.5 
 
 
429 aa  622  1e-177  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.236177  normal  0.0251581 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0704  citrate synthase I  67.54 
 
 
428 aa  623  1e-177  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0599  type II citrate synthase  68.19 
 
 
430 aa  622  1e-177  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.281651  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3091  citrate synthase I  67.78 
 
 
428 aa  623  1e-177  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.31999 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1524  citrate synthase I  69.16 
 
 
430 aa  622  1e-177  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.802094  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3694  type II citrate synthase  67.91 
 
 
428 aa  622  1e-177  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1994  citrate synthase  67.3 
 
 
428 aa  620  1e-176  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.189666  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5222  citrate synthase I  67.78 
 
 
429 aa  620  1e-176  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.827577  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3716  citrate synthase I  68.84 
 
 
430 aa  620  1e-176  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.364105  normal  0.0570227 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2023  citrate synthase I  68.03 
 
 
429 aa  620  1e-176  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2274  type II citrate synthase  68.6 
 
 
428 aa  614  1e-175  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  3.58341e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1926  type II citrate synthase  68.37 
 
 
428 aa  613  1e-174  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1395  citrate synthase  65.73 
 
 
434 aa  614  1e-174  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.322092  normal  0.0167868 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1132  citrate synthase  65.81 
 
 
431 aa  613  1e-174  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1678  type II citrate synthase  65.36 
 
 
431 aa  609  1e-173  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0407476  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2633  type II citrate synthase  68.37 
 
 
428 aa  608  1e-173  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000579193  normal  0.265493 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2520  type II citrate synthase  68.37 
 
 
428 aa  608  1e-173  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0560239  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0841  type II citrate synthase  64.88 
 
 
429 aa  607  1e-173  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2513  type II citrate synthase  68.37 
 
 
428 aa  608  1e-173  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  2.56312e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2257  citrate synthase I  65.58 
 
 
431 aa  608  1e-173  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.19804  normal  0.414999 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1630  type II citrate synthase  68.37 
 
 
428 aa  610  1e-173  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.01465  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1705  type II citrate synthase  68.37 
 
 
428 aa  611  1e-173  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00232802  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2111  citrate synthase  66.28 
 
 
454 aa  610  1e-173  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.000226419  normal  0.855626 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>