More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_2460 on replicon NC_007973
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010682  Rpic_2130  amidophosphoribosyltransferase  82.3 
 
 		 511 aa  860    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.176137  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3056  amidophosphoribosyltransferase  66.46 
 
 		 511 aa  684    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2489  amidophosphoribosyltransferase  63.02 
 
 		 502 aa  641    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1976  amidophosphoribosyltransferase  82.26 
 
 		 511 aa  865    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.399256  normal  0.224002 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1043  amidophosphoribosyltransferase  75 
 
 		 512 aa  778    Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.603388 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1656  amidophosphoribosyltransferase  77.25 
 
 		 511 aa  823    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00031  amidophosphoribosyltransferase  63.49 
 
 		 486 aa  651    Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2300  amidophosphoribosyltransferase  77.65 
 
 		 511 aa  826    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.990709  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1714  amidophosphoribosyltransferase  77.25 
 
 		 511 aa  823    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.227459  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1688  amidophosphoribosyltransferase  66.4 
 
 		 505 aa  712    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0876  amidophosphoribosyltransferase  67.55 
 
 		 505 aa  705    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.602615  normal  0.0457402 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1331  amidophosphoribosyltransferase  62.99 
 
 		 485 aa  648    Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2299  amidophosphoribosyltransferase  90.78 
 
 		 508 aa  962    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.725008  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1908  amidophosphoribosyltransferase  65.82 
 
 		 506 aa  679    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.60084 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0762  amidophosphoribosyltransferase  77.65 
 
 		 511 aa  826    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1671  amidophosphoribosyltransferase  62.81 
 
 		 503 aa  642    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.735528  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3563  amidophosphoribosyltransferase  77.25 
 
 		 510 aa  825    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2151  amidophosphoribosyltransferase  65.69 
 
 		 509 aa  698    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.318494 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2118  amidophosphoribosyltransferase  77.25 
 
 		 510 aa  824    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.775097  normal  0.196419 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0004  amidophosphoribosyltransferase  63.41 
 
 		 485 aa  656    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.970099  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4615  amidophosphoribosyltransferase  77.84 
 
 		 510 aa  827    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.257725  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2736  amidophosphoribosyltransferase  68.47 
 
 		 502 aa  702    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0536  amidophosphoribosyltransferase  77.25 
 
 		 511 aa  823    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_00031  amidophosphoribosyltransferase  64.03 
 
 		 485 aa  641    Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0004  amidophosphoribosyltransferase  63.35 
 
 		 486 aa  650    Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.259611  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1906  amidophosphoribosyltransferase  69.01 
 
 		 506 aa  716    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3371  amidophosphoribosyltransferase  67.7 
 
 		 508 aa  681    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  decreased coverage  0.00440111  normal  0.186489 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0686  amidophosphoribosyltransferase  77.84 
 
 		 511 aa  828    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.488002  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1863  amidophosphoribosyltransferase  68.32 
 
 		 501 aa  682    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.308686  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2683  amidophosphoribosyltransferase  67.49 
 
 		 501 aa  687    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1692  amidophosphoribosyltransferase  68.12 
 
 		 511 aa  702    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.387172 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1607  amidophosphoribosyltransferase  66.53 
 
 		 505 aa  699    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2874  amidophosphoribosyltransferase  79.65 
 
 		 516 aa  851    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.352356 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1798  amidophosphoribosyltransferase  62.58 
 
 		 504 aa  647    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.449367  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1267  amidophosphoribosyltransferase  63.92 
 
 		 506 aa  640    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0479924  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2460  amidophosphoribosyltransferase  100 
 
 		 510 aa  1048    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0352966  normal  0.628087 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6835  amidophosphoribosyltransferase  79.26 
 
 		 516 aa  851    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.661611  normal  0.513568 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3860  amidophosphoribosyltransferase  77.45 
 
 		 510 aa  824    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0778  amidophosphoribosyltransferase  75 
 
 		 512 aa  783    Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000128601  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4402  amidophosphoribosyltransferase  77.25 
 
 		 510 aa  825    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.333421  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4769  amidophosphoribosyltransferase  67.33 
 
 		 502 aa  698    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.573839  normal  0.111826 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1242  amidophosphoribosyltransferase  63.56 
 
 		 504 aa  643    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.520504  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1806  amidophosphoribosyltransferase  82.68 
 
 		 511 aa  864    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.704264  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3355  amidophosphoribosyltransferase  77.45 
 
 		 510 aa  824    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0220372  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1865  amidophosphoribosyltransferase  77.25 
 
 		 511 aa  823    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2438  amidophosphoribosyltransferase  77.65 
 
 		 511 aa  826    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.107689  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00031  amidophosphoribosyltransferase  63.49 
 
 		 486 aa  650    Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.486133  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3965  amidophosphoribosyltransferase  77.25 
 
 		 510 aa  825    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.146016  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00031  amidophosphoribosyltransferase  62.45 
 
 		 485 aa  642    Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.495809  hitchhiker  0.00403524 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4381  amidophosphoribosyltransferase  79.61 
 
 		 516 aa  827    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.779329  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2226  amidophosphoribosyltransferase  68.47 
 
 		 502 aa  702    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.467921  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1092  amidophosphoribosyltransferase  65.75 
 
 		 509 aa  702    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.47355 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_00031  amidophosphoribosyltransferase  61.2 
 
 		 486 aa  637    Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.242446  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3759  amidophosphoribosyltransferase  66.25 
 
 		 500 aa  656    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.041178  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00031  amidophosphoribosyltransferase  63.2 
 
 		 485 aa  649    Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.763757  normal  0.837003 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1552  amidophosphoribosyltransferase  63.84 
 
 		 507 aa  640    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.27756  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1259  amidophosphoribosyltransferase  62.14 
 
 		 503 aa  630  1e-179  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1902  amidophosphoribosyltransferase  61.54 
 
 		 501 aa  623  1e-177  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34150  amidophosphoribosyltransferase  61.43 
 
 		 501 aa  621  1e-177  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2980  amidophosphoribosyltransferase  60.54 
 
 		 504 aa  620  1e-176  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.470057  normal  0.120272 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1656  amidophosphoribosyltransferase  60.33 
 
 		 504 aa  619  1e-176  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00921285  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2302  amidophosphoribosyltransferase  59.92 
 
 		 504 aa  615  1e-175  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2072  amidophosphoribosyltransferase  61.78 
 
 		 504 aa  617  1e-175  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.729582  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2000  amidophosphoribosyltransferase  61.73 
 
 		 501 aa  612  9.999999999999999e-175  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.604146  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2832  amidophosphoribosyltransferase  59.44 
 
 		 504 aa  612  9.999999999999999e-175  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00972927 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3811  amidophosphoribosyltransferase  61.34 
 
 		 502 aa  613  9.999999999999999e-175  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1561  amidophosphoribosyltransferase  61.11 
 
 		 501 aa  613  9.999999999999999e-175  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.183865  normal  0.29049 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1668  amidophosphoribosyltransferase  61.54 
 
 		 502 aa  614  9.999999999999999e-175  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.416229  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0808  amidophosphoribosyltransferase  60.74 
 
 		 503 aa  612  9.999999999999999e-175  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2755  amidophosphoribosyltransferase  59.44 
 
 		 504 aa  612  9.999999999999999e-175  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2711  amidophosphoribosyltransferase  60.98 
 
 		 502 aa  613  9.999999999999999e-175  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.966551  normal  0.266296 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1621  amidophosphoribosyltransferase  59.92 
 
 		 504 aa  613  9.999999999999999e-175  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1609  amidophosphoribosyltransferase  57.94 
 
 		 505 aa  612  9.999999999999999e-175  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1621  amidophosphoribosyltransferase  59.44 
 
 		 504 aa  612  9.999999999999999e-175  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.387036  normal  0.862121 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1534  amidophosphoribosyltransferase  61.32 
 
 		 501 aa  613  9.999999999999999e-175  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.609043 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1483  amidophosphoribosyltransferase  59.04 
 
 		 504 aa  612  9.999999999999999e-175  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.812724 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2738  amidophosphoribosyltransferase  59.44 
 
 		 504 aa  611  9.999999999999999e-175  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3798  amidophosphoribosyltransferase  58.76 
 
 		 505 aa  609  1e-173  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3064  amidophosphoribosyltransferase  58.84 
 
 		 504 aa  610  1e-173  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2437  amidophosphoribosyltransferase  59.04 
 
 		 504 aa  610  1e-173  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2025  amidophosphoribosyltransferase  60.41 
 
 		 501 aa  608  1e-173  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1153  amidophosphoribosyltransferase  61.44 
 
 		 506 aa  610  1e-173  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0456137  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0525  amidophosphoribosyltransferase  59.92 
 
 		 504 aa  610  1e-173  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00168895  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1430  amidophosphoribosyltransferase  59.04 
 
 		 504 aa  609  1e-173  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1495  amidophosphoribosyltransferase  59.04 
 
 		 504 aa  609  1e-173  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.842806  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3761  amidophosphoribosyltransferase  61.32 
 
 		 501 aa  610  1e-173  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002879  amidophosphoribosyltransferase  57.96 
 
 		 504 aa  607  9.999999999999999e-173  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23920  amidophosphoribosyltransferase  60.2 
 
 		 501 aa  607  9.999999999999999e-173  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.444651  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2146  amidophosphoribosyltransferase  57.77 
 
 		 504 aa  607  9.999999999999999e-173  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0936  amidophosphoribosyltransferase  60 
 
 		 511 aa  604  1.0000000000000001e-171  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1282  amidophosphoribosyltransferase  59.48 
 
 		 511 aa  603  1.0000000000000001e-171  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.734228  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1103  amidophosphoribosyltransferase  59.48 
 
 		 511 aa  602  1.0000000000000001e-171  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.414294 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03095  amidophosphoribosyltransferase  59.71 
 
 		 504 aa  603  1.0000000000000001e-171  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1399  amidophosphoribosyltransferase  59.3 
 
 		 504 aa  603  1.0000000000000001e-171  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1490  amidophosphoribosyltransferase  59.3 
 
 		 504 aa  600  1e-170  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00163594  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3328  amidophosphoribosyltransferase  58.13 
 
 		 505 aa  592  1e-168  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1965  amidophosphoribosyltransferase  59.59 
 
 		 504 aa  594  1e-168  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.960535  normal  0.602914 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2048  amidophosphoribosyltransferase  59.67 
 
 		 502 aa  590  1e-167  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.854474  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1080  amidophosphoribosyltransferase  58.18 
 
 		 504 aa  586  1e-166  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0916  amidophosphoribosyltransferase  57.4 
 
 		 504 aa  585  1e-166  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.703004  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>