More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_2459 on replicon NC_007973
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007347  Reut_A2298  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  86.07 
 
 
401 aa  678    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2459  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  100 
 
 
402 aa  828    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00148709  normal  0.252663 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4382  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  73.79 
 
 
394 aa  615  1e-175  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.258823  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3861  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  74.05 
 
 
410 aa  598  1e-170  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2117  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  73.79 
 
 
396 aa  597  1e-169  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.175356 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4614  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  74.05 
 
 
396 aa  595  1e-169  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.162026  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6834  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  73.28 
 
 
396 aa  593  1e-168  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.373794  normal  0.455704 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3562  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  73.54 
 
 
396 aa  592  1e-168  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3356  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  73.54 
 
 
410 aa  594  1e-168  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3966  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  73.54 
 
 
396 aa  592  1e-168  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0704678  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4401  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  73.28 
 
 
396 aa  590  1e-167  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2873  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  72.77 
 
 
396 aa  586  1e-166  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.674895 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0687  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  72.77 
 
 
405 aa  583  1.0000000000000001e-165  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0160219  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0761  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  72.77 
 
 
405 aa  578  1e-164  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.203208  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2299  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  72.77 
 
 
423 aa  578  1e-164  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.21935  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2437  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  72.77 
 
 
423 aa  578  1e-164  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.391584  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1713  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  72.52 
 
 
396 aa  577  1.0000000000000001e-163  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.292156  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1657  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  72.52 
 
 
396 aa  577  1.0000000000000001e-163  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1866  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  72.52 
 
 
423 aa  577  1.0000000000000001e-163  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0537  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  72.52 
 
 
423 aa  577  1.0000000000000001e-163  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1042  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  67.77 
 
 
402 aa  555  1e-157  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal  0.37384 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0779  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  66.17 
 
 
402 aa  551  1e-156  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.000704939  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1907  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  65.65 
 
 
389 aa  536  1e-151  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1905  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  63.96 
 
 
395 aa  525  1e-148  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1691  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  65.1 
 
 
392 aa  522  1e-147  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.557417 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3055  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  65.75 
 
 
394 aa  520  1e-146  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0877  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  63.17 
 
 
393 aa  514  1e-144  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.0710283 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1608  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  59.01 
 
 
411 aa  504  1e-141  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0809  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  59.49 
 
 
397 aa  499  1e-140  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2710  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  61.32 
 
 
403 aa  490  1e-137  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.531318  normal  0.420206 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0930  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  60.35 
 
 
393 aa  486  1e-136  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1093  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  59.9 
 
 
404 aa  484  1e-135  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.560821 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2063  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  58.4 
 
 
404 aa  480  1e-134  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.154855  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3758  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  58.08 
 
 
406 aa  479  1e-134  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.00999725  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1721  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  58.4 
 
 
404 aa  480  1e-134  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.274842 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1669  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  58.52 
 
 
403 aa  475  1e-133  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.813893  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1929  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  60.35 
 
 
396 aa  471  1e-132  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34140  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  61.79 
 
 
403 aa  473  1e-132  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2488  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  60.21 
 
 
383 aa  469  1.0000000000000001e-131  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1689  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  59.24 
 
 
413 aa  465  9.999999999999999e-131  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.79324 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2682  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  55.61 
 
 
407 aa  466  9.999999999999999e-131  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1243  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  59.39 
 
 
406 aa  466  9.999999999999999e-131  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1151  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  60.1 
 
 
399 aa  461  1e-129  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1864  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  57.68 
 
 
411 aa  464  1e-129  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.800927  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2071  dihydrolipoamide dehydrogenase  58.78 
 
 
397 aa  462  1e-129  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.667467  normal  0.823205 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2026  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  60.82 
 
 
403 aa  462  1e-129  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0235918  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23930  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  61.6 
 
 
403 aa  458  9.999999999999999e-129  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2150  cystathionine gamma-synthase  61.52 
 
 
414 aa  461  9.999999999999999e-129  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.500866 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1797  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  55.5 
 
 
397 aa  457  1e-127  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.697099  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1903  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  58.04 
 
 
403 aa  452  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3810  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  57.76 
 
 
403 aa  449  1e-125  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2735  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  54.61 
 
 
404 aa  447  1.0000000000000001e-124  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.484206  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2225  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  54.36 
 
 
404 aa  446  1.0000000000000001e-124  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.833274  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4768  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  55.44 
 
 
452 aa  444  1e-123  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0722667 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1562  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  57.51 
 
 
403 aa  442  1e-123  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.272758 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1268  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  57.25 
 
 
402 aa  444  1e-123  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.373712  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2001  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  56.74 
 
 
403 aa  437  1e-121  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3760  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  56.49 
 
 
403 aa  436  1e-121  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.192892  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1535  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  56.49 
 
 
403 aa  435  1e-121  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.47488 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1730  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  55.84 
 
 
434 aa  431  1e-120  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000563319  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0219  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  53.67 
 
 
407 aa  427  1e-118  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.897628  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1551  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  55.27 
 
 
407 aa  427  1e-118  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.75247  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1511  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  56.07 
 
 
396 aa  425  1e-118  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00343011  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2049  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  53.3 
 
 
391 aa  424  1e-117  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0688  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  51.38 
 
 
411 aa  421  1e-116  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.175139 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0409  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  53.49 
 
 
396 aa  420  1e-116  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.384656  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3860  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  51.75 
 
 
402 aa  415  9.999999999999999e-116  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0516  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  51.14 
 
 
412 aa  413  1e-114  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0538  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  51.14 
 
 
412 aa  412  1e-114  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0985823  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0526  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  51.14 
 
 
412 aa  412  1e-114  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3645  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  51.5 
 
 
402 aa  413  1e-114  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3103  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  52.34 
 
 
394 aa  410  1e-113  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1016  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  52.15 
 
 
406 aa  409  1e-113  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00284664 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10395  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  51.9 
 
 
406 aa  410  1e-113  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00173886  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0792  cystathionine gamma-synthase  53.05 
 
 
424 aa  407  1.0000000000000001e-112  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.145563  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0798  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  52.79 
 
 
422 aa  405  1.0000000000000001e-112  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.40297  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0139  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  47 
 
 
397 aa  403  1e-111  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.380806 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35030  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  49.48 
 
 
417 aa  404  1e-111  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0305  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  50 
 
 
398 aa  399  9.999999999999999e-111  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.226958  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0768  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  48.56 
 
 
402 aa  401  9.999999999999999e-111  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  decreased coverage  0.00770297  hitchhiker  0.00215966 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2947  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  49.49 
 
 
419 aa  400  9.999999999999999e-111  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0513  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  50.62 
 
 
410 aa  398  9.999999999999999e-111  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.047245  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0318  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  50 
 
 
401 aa  399  9.999999999999999e-111  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1496  cystathionine gamma-lyase  47.47 
 
 
390 aa  396  1e-109  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3214  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  50 
 
 
413 aa  398  1e-109  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1942  cystathionine gamma-synthase  48.72 
 
 
396 aa  395  1e-109  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.00385575  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1198  cystathionine gamma-synthase  50.39 
 
 
414 aa  392  1e-108  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0398  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  48.96 
 
 
397 aa  394  1e-108  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0903  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  47.93 
 
 
408 aa  392  1e-108  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5251  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  50 
 
 
403 aa  394  1e-108  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.903252  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2393  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  47.69 
 
 
404 aa  392  1e-108  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.168744  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1236  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  49.25 
 
 
400 aa  389  1e-107  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.43898  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0219  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  46.25 
 
 
422 aa  389  1e-107  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2665  cystathionine gamma-synthase  48.84 
 
 
402 aa  386  1e-106  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.6869  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0471  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  50.38 
 
 
406 aa  387  1e-106  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.706891  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4904  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  48.48 
 
 
401 aa  385  1e-106  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.247924  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1038  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  49.5 
 
 
408 aa  384  1e-105  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2410  trans-sulfuration enzyme family protein  48.96 
 
 
392 aa  384  1e-105  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0536  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  48.14 
 
 
400 aa  382  1e-105  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4034  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  48.35 
 
 
404 aa  385  1e-105  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>