15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_2361 on replicon NC_007973
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007973  Rmet_2361  hypothetical protein  100 
 
 		 119 aa  237  5e-62  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00000000168319  unclonable  0.000000122129 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3432  hypothetical protein  70.83 
 
 		 119 aa  159  1e-38  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.275835  normal  0.581055 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4187  hypothetical protein  69.17 
 
 		 119 aa  158  2e-38  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.429609 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1390  hypothetical protein  65.55 
 
 		 120 aa  145  2.0000000000000003e-34  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1176  hypothetical protein  60.66 
 
 		 125 aa  135  2e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1248  hypothetical protein  59.02 
 
 		 125 aa  122  1e-27  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.625657  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0427  hypothetical protein  55.46 
 
 		 121 aa  118  3e-26  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2402  hypothetical protein  49.59 
 
 		 122 aa  97.4  6e-20  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2178  hypothetical protein  48.78 
 
 		 122 aa  96.3  1e-19  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.207131  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1617  hypothetical protein  57.47 
 
 		 127 aa  92.4  2e-18  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0691  hypothetical protein  53.72 
 
 		 123 aa  91.7  4e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.157339  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2867  hypothetical protein  49.15 
 
 		 119 aa  77.8  0.00000000000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.438274  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0940  hypothetical protein  39.52 
 
 		 124 aa  70.9  0.000000000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0739  hypothetical protein  56.52 
 
 		 221 aa  52.4  0.000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.355396  normal  0.7194 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0581  hypothetical protein  40.22 
 
 		 120 aa  48.5  0.00003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>