34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_2357 on replicon NC_007973
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007973  Rmet_2357  hypothetical protein  100 
 
 		 316 aa  657    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000499719  unclonable  0.000000165257 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1252  hypothetical protein  96.17 
 
 		 315 aa  629  1e-179  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.613488  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1180  hypothetical protein  90.1 
 
 		 315 aa  597  1e-170  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1394  hypothetical protein  90.71 
 
 		 315 aa  597  1e-170  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.924671  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4183  hypothetical protein  89.74 
 
 		 315 aa  592  1e-168  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.18849  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3428  hypothetical protein  89.14 
 
 		 315 aa  593  1e-168  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.881387 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0687  protein of unknown function DUF1527  85.02 
 
 		 316 aa  558  1e-158  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.340734  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0944  protein of unknown function DUF1527  85.28 
 
 		 314 aa  544  1e-154  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2398  hypothetical protein  84.62 
 
 		 314 aa  540  1e-153  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2182  hypothetical protein  84.95 
 
 		 314 aa  543  1e-153  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1621  protein of unknown function DUF1527  77.6 
 
 		 311 aa  524  1e-148  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0431  protein of unknown function DUF1527  76.87 
 
 		 308 aa  516  1.0000000000000001e-145  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.617131  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2863  protein of unknown function DUF1527  77.45 
 
 		 312 aa  512  1e-144  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0490  hypothetical protein  75.49 
 
 		 309 aa  499  1e-140  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0849  hypothetical protein  68.83 
 
 		 312 aa  455  1e-127  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36350  hypothetical protein  69.28 
 
 		 310 aa  451  1.0000000000000001e-126  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1429  hypothetical protein  68.39 
 
 		 312 aa  441  1e-123  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4520  hypothetical protein  67.5 
 
 		 312 aa  416  9.999999999999999e-116  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.380222  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_59990  hypothetical protein  67.5 
 
 		 312 aa  417  9.999999999999999e-116  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.858519  hitchhiker  0.00000000908984 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3026  hypothetical protein  56.39 
 
 		 318 aa  367  1e-100  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2953  hypothetical protein  53.27 
 
 		 343 aa  345  7e-94  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3331  hypothetical protein  53.27 
 
 		 325 aa  342  2.9999999999999997e-93  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0679  protein of unknown function DUF1527  48.12 
 
 		 322 aa  314  1.9999999999999998e-84  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1775  hypothetical protein  47.35 
 
 		 308 aa  309  4e-83  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4164  hypothetical protein  48.01 
 
 		 335 aa  299  3e-80  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0349  hypothetical protein  48.01 
 
 		 335 aa  296  3e-79  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4074  hypothetical protein  46.63 
 
 		 335 aa  293  4e-78  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3701  hypothetical protein  47.42 
 
 		 317 aa  292  5e-78  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.749557  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0651  hypothetical protein  43.25 
 
 		 340 aa  257  1e-67  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_3924  hypothetical protein  33.55 
 
 		 384 aa  179  4.999999999999999e-44  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2753  hypothetical protein  33.52 
 
 		 431 aa  96.3  7e-19  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.408249  normal  0.787486 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1021  hypothetical protein  26.28 
 
 		 324 aa  85.9  9e-16  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1059  hypothetical protein  26.28 
 
 		 324 aa  85.9  9e-16  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2393  hypothetical protein  26.95 
 
 		 353 aa  85.1  0.000000000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>