35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_2352 on replicon NC_007973
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007973  Rmet_2352  hypothetical protein  100 
 
 		 146 aa  301  3.0000000000000004e-81  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000000432269  unclonable  0.00000015715 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1165  putative secreted protein  88.36 
 
 		 146 aa  241  1.9999999999999999e-63  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.42219  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1399  putative secreted protein  87.67 
 
 		 146 aa  241  3e-63  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.518521  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1257  putative secreted protein  100 
 
 		 149 aa  234  2e-61  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.525148  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1185  hypothetical protein  90.41 
 
 		 146 aa  226  1e-58  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.657598  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1627  putative secreted protein  74.66 
 
 		 145 aa  223  7e-58  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4178  putative signal peptide  89.68 
 
 		 149 aa  222  2e-57  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0535453  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3423  putative signal peptide  89.68 
 
 		 149 aa  220  4.9999999999999996e-57  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.410037 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0436  putative secreted protein  71.23 
 
 		 145 aa  218  3e-56  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.739123  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2858  hypothetical protein  78.74 
 
 		 144 aa  209  9e-54  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.972087  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2393  hypothetical protein  82.03 
 
 		 144 aa  206  1e-52  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0949  hypothetical protein  80.47 
 
 		 144 aa  202  1e-51  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.960717  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2187  hypothetical protein  81.25 
 
 		 144 aa  202  2e-51  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0503  hypothetical protein  70 
 
 		 154 aa  193  6e-49  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.179782  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0682  hypothetical protein  73.76 
 
 		 144 aa  186  1e-46  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.166566  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36270  hypothetical protein  63.83 
 
 		 148 aa  185  2e-46  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.15047  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1443  hypothetical protein  64.29 
 
 		 151 aa  183  8e-46  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.116738 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0860  hypothetical protein  61.49 
 
 		 151 aa  181  4.0000000000000006e-45  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_59930  hypothetical protein  59.31 
 
 		 147 aa  178  2e-44  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.0000257746  hitchhiker  0.00000000000507389 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4514  signal recognition particle GTPase  59.31 
 
 		 147 aa  176  9e-44  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4170  putative lipoprotein  51.72 
 
 		 141 aa  157  4e-38  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4087  putative lipoprotein  51.72 
 
 		 141 aa  156  7e-38  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3022  hypothetical protein  58.91 
 
 		 125 aa  156  9e-38  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.529171  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2947  hypothetical protein  60 
 
 		 139 aa  155  2e-37  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0336  putative lipoprotein  53.79 
 
 		 141 aa  154  3e-37  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.490993 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3329  hypothetical protein  59.23 
 
 		 139 aa  152  1e-36  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.136345  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0661  hypothetical protein  42.47 
 
 		 136 aa  117  4.9999999999999996e-26  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1763  hypothetical protein  42.65 
 
 		 134 aa  115  1.9999999999999998e-25  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3706  putative lipoprotein  43.7 
 
 		 133 aa  111  4.0000000000000004e-24  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0647  hypothetical protein  39.52 
 
 		 133 aa  95.1  3e-19  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.893708  n/a   
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_3927  putative secreted protein  38.4 
 
 		 126 aa  90.1  9e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2756  hypothetical protein  40.13 
 
 		 161 aa  90.1  9e-18  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.449847  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2391  hypothetical protein  33.33 
 
 		 129 aa  62  0.000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1023  hypothetical protein  34.57 
 
 		 115 aa  51.6  0.000004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1061  hypothetical protein  34.57 
 
 		 115 aa  51.6  0.000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>