29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_2348 on replicon NC_007973
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007973  Rmet_2348  hypothetical protein  100 
 
 
132 aa  262  1e-69  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00000206285  unclonable  0.000000125887 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1403  hypothetical protein  97.73 
 
 
132 aa  256  5.0000000000000005e-68  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.16111  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1261  hypothetical protein  97.73 
 
 
132 aa  256  5.0000000000000005e-68  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1169  hypothetical protein  98.47 
 
 
136 aa  256  9e-68  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1189  hypothetical protein  96.15 
 
 
136 aa  250  4.0000000000000004e-66  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.651211  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4174  hypothetical protein  94.66 
 
 
136 aa  247  4e-65  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.00950155  normal  0.900002 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3419  hypothetical protein  90.84 
 
 
136 aa  244  3e-64  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.399009  normal  0.0716917 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0440  hypothetical protein  78.03 
 
 
132 aa  216  1e-55  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.477088  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1631  hypothetical protein  76.52 
 
 
132 aa  212  9.999999999999999e-55  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2389  hypothetical protein  66.67 
 
 
136 aa  176  1e-43  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.84186  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2191  hypothetical protein  63.85 
 
 
136 aa  174  4e-43  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0953  hypothetical protein  63.08 
 
 
136 aa  168  2e-41  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2854  hypothetical protein  60.77 
 
 
132 aa  163  6.9999999999999995e-40  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.284991  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0507  hypothetical protein  67.94 
 
 
152 aa  157  6e-38  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0678  hypothetical protein  67.77 
 
 
142 aa  153  7e-37  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.450088  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_59890  hypothetical protein  48.03 
 
 
128 aa  118  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0571428  hitchhiker  0.00000000000107847 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4510  hypothetical protein  48.03 
 
 
128 aa  117  6e-26  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3018  hypothetical protein  49.24 
 
 
137 aa  111  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1447  hypothetical protein  44.27 
 
 
130 aa  101  3e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.111651 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2943  hypothetical protein  47.24 
 
 
133 aa  100  6e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36230  hypothetical protein  45.45 
 
 
130 aa  100  7e-21  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3325  hypothetical protein  46.46 
 
 
133 aa  100  9e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0866  hypothetical protein  50 
 
 
121 aa  99.4  1e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1759  hypothetical protein  36.36 
 
 
122 aa  73.6  0.0000000000008  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0655  hypothetical protein  38.84 
 
 
124 aa  64.3  0.0000000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4174  hypothetical protein  36.89 
 
 
121 aa  63.2  0.000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4091  hypothetical protein  36.89 
 
 
121 aa  63.2  0.000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0332  hypothetical protein  36.07 
 
 
121 aa  62.4  0.000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.134237 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3710  hypothetical protein  36 
 
 
124 aa  62.4  0.000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.802299  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>