36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_2337 on replicon NC_007973
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007973  Rmet_2337  hypothetical protein  100 
 
 		 249 aa  503  1e-141  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  unclonable  0.00000000000677124  unclonable  0.000000210338 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3415  hypothetical protein  95.18 
 
 		 249 aa  465  9.999999999999999e-131  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.194582  normal  0.0633742 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1407  hypothetical protein  94.38 
 
 		 249 aa  459  9.999999999999999e-129  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0472461  normal  0.945554 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1194  hypothetical protein  96.39 
 
 		 249 aa  455  1e-127  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0187174  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1273  hypothetical protein  97.59 
 
 		 249 aa  454  1e-127  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1174  hypothetical protein  94.47 
 
 		 253 aa  446  1.0000000000000001e-124  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4170  hypothetical protein  90.12 
 
 		 253 aa  424  1e-118  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.05325  normal  0.977781 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1637  hypothetical protein  78.31 
 
 		 249 aa  392  1e-108  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0447  hypothetical protein  77.91 
 
 		 249 aa  381  1e-105  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2846  hypothetical protein  67.07 
 
 		 249 aa  325  6e-88  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2381  hypothetical protein  69.48 
 
 		 249 aa  322  5e-87  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  decreased coverage  0.00881734  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2207  hypothetical protein  69.48 
 
 		 249 aa  321  7e-87  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.981738  normal  0.777815 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0962  hypothetical protein  68.67 
 
 		 249 aa  318  6e-86  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.718481  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0526  hypothetical protein  64.66 
 
 		 249 aa  317  7.999999999999999e-86  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0674  hypothetical protein  66.67 
 
 		 249 aa  305  6e-82  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4502  hypothetical protein  49.8 
 
 		 248 aa  262  3e-69  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_59700  hypothetical protein  49.4 
 
 		 248 aa  261  1e-68  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000231653  hitchhiker  1.4536800000000001e-18 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1453  hypothetical protein  49.4 
 
 		 249 aa  254  1.0000000000000001e-66  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.186215 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3013  hypothetical protein  49 
 
 		 243 aa  253  1.0000000000000001e-66  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.531569 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0880  hypothetical protein  49.4 
 
 		 249 aa  253  3e-66  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_59820  hypothetical protein  52.07 
 
 		 216 aa  240  1e-62  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000000530233  hitchhiker  2.99054e-18 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2935  hypothetical protein  51.48 
 
 		 242 aa  218  5e-56  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3306  hypothetical protein  50 
 
 		 222 aa  208  5e-53  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.878573  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4095  hypothetical protein  40.5 
 
 		 252 aa  175  5e-43  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0327  hypothetical protein  39.26 
 
 		 252 aa  172  3.9999999999999995e-42  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0775646 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4178  hypothetical protein  39.26 
 
 		 252 aa  170  2e-41  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0633  hypothetical protein  38.21 
 
 		 243 aa  158  9e-38  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_3936  hypothetical protein  33.33 
 
 		 242 aa  154  1e-36  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.294631  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1753  hypothetical protein  37.44 
 
 		 229 aa  154  1e-36  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0646  putative inner membrane protein  37.6 
 
 		 250 aa  151  8e-36  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.956503  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3717  hypothetical protein  38.59 
 
 		 250 aa  145  5e-34  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.162813  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1678  hypothetical protein  45.83 
 
 		 96 aa  101  1e-20  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0359565  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2763  hypothetical protein  28.4 
 
 		 254 aa  84  0.000000000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.405219  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1031  hypothetical protein  33.93 
 
 		 210 aa  74.3  0.000000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1069  hypothetical protein  33.93 
 
 		 210 aa  73.9  0.000000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2383  hypothetical protein  38.83 
 
 		 232 aa  71.6  0.00000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>