More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_2239 on replicon NC_007973
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007347  Reut_A2214  FAD dependent oxidoreductase  83.86 
 
 		 534 aa  889    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2239  FAD dependent oxidoreductase  100 
 
 		 546 aa  1102    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0659803 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1677  FAD dependent oxidoreductase  56.46 
 
 		 516 aa  545  1e-154  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000164822  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2521  FAD dependent oxidoreductase  56.75 
 
 		 519 aa  540  9.999999999999999e-153  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0484  FAD dependent oxidoreductase  55.25 
 
 		 533 aa  510  1e-143  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00000858537  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1486  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  47.95 
 
 		 525 aa  498  1e-140  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0679435  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1031  FAD dependent oxidoreductase  53.1 
 
 		 529 aa  498  1e-139  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.334153  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3670  FAD dependent oxidoreductase  52.49 
 
 		 566 aa  497  1e-139  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.234288  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2687  FAD dependent oxidoreductase  53.04 
 
 		 518 aa  497  1e-139  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.95747  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4885  FAD dependent oxidoreductase  49.91 
 
 		 525 aa  496  1e-139  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.158619  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0382  FAD dependent oxidoreductase  56.31 
 
 		 532 aa  482  1e-135  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  decreased coverage  0.000000868135  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0329  FAD dependent oxidoreductase  55.02 
 
 		 528 aa  483  1e-135  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.0000174141  hitchhiker  0.00162584 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0390  FAD dependent oxidoreductase  56.12 
 
 		 532 aa  479  1e-134  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0808861  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2135  FAD dependent oxidoreductase  49.91 
 
 		 519 aa  477  1e-133  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.148047  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1921  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein, N-terminal:FAD dependent oxidoreductase  50.85 
 
 		 524 aa  472  1e-132  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0728  Glycerol-3-phosphate dehydrogenase  50.78 
 
 		 530 aa  470  1.0000000000000001e-131  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000166291 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2761  FAD-dependent glycerol-3-phosphate dehydrogenase subunit  54.1 
 
 		 517 aa  467  9.999999999999999e-131  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00308859  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2429  FAD dependent oxidoreductase  47.6 
 
 		 519 aa  461  9.999999999999999e-129  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.765246  hitchhiker  0.000212597 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0569  FAD dependent oxidoreductase  48.78 
 
 		 536 aa  461  9.999999999999999e-129  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0610  FAD dependent oxidoreductase  53.79 
 
 		 540 aa  452  1.0000000000000001e-126  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0615442  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0526  FAD dependent oxidoreductase  51.24 
 
 		 543 aa  446  1.0000000000000001e-124  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0248  glycerol-3-phosphate dehydrogenase, anaerobic  39.85 
 
 		 520 aa  428  1e-118  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2819  FAD dependent oxidoreductase  43.35 
 
 		 531 aa  375  1e-102  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.158053  normal  0.100824 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0254  FAD dependent oxidoreductase  41.17 
 
 		 546 aa  375  1e-102  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.626232  normal  1 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_30486  predicted protein  42.45 
 
 		 602 aa  365  1e-100  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.349562  normal  0.801939 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0378  FAD dependent oxidoreductase  41.32 
 
 		 539 aa  362  7.0000000000000005e-99  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0408  glycerol-3-phosphate dehydrogenase, FAD-dependent  41.04 
 
 		 545 aa  355  8.999999999999999e-97  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2890  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  42.26 
 
 		 532 aa  353  2.9999999999999997e-96  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.152299 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0871  FAD dependent oxidoreductase  41.47 
 
 		 537 aa  353  2.9999999999999997e-96  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.633579 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3375  FAD dependent oxidoreductase  40.61 
 
 		 537 aa  353  5.9999999999999994e-96  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0811  FAD dependent oxidoreductase  41.19 
 
 		 542 aa  351  2e-95  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.238426 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1243  FAD dependent oxidoreductase  47.05 
 
 		 520 aa  343  4e-93  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  decreased coverage  0.00622056  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01396  glycerol-3-phosphate dehydrogenase, mitochondrial (AFU_orthologue; AFUA_1G08810)  36.72 
 
 		 700 aa  331  2e-89  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  hitchhiker  0.00220943 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1508  FAD dependent oxidoreductase  41.02 
 
 		 548 aa  324  3e-87  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6051  FAD dependent oxidoreductase  36.47 
 
 		 552 aa  317  5e-85  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2005  FAD dependent oxidoreductase  38.09 
 
 		 543 aa  311  2e-83  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.758416  normal  0.433601 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_68764  mitochondrial glycerol-3-phosphate dehydrogenase  34.86 
 
 		 640 aa  310  2.9999999999999997e-83  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006685  CNC04320  conserved hypothetical protein  38.24 
 
 		 668 aa  301  2e-80  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.931414  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC04310  glycerol-3-phosphate dehydrogenase, putative  37.52 
 
 		 798 aa  300  5e-80  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0315  FAD dependent oxidoreductase  40.61 
 
 		 603 aa  293  5e-78  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000259452 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_23030  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  35.28 
 
 		 591 aa  291  2e-77  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0272  FAD dependent oxidoreductase  40.25 
 
 		 639 aa  285  2.0000000000000002e-75  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.688812  normal  0.0156592 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2437  FAD dependent oxidoreductase  39.12 
 
 		 573 aa  281  2e-74  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00112879 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2873  FAD dependent oxidoreductase  37.33 
 
 		 583 aa  280  7e-74  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.186763  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1173  FAD dependent oxidoreductase  38.19 
 
 		 578 aa  278  2e-73  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.994563  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0493  FAD dependent oxidoreductase  38.48 
 
 		 574 aa  277  3e-73  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2580  FAD dependent oxidoreductase  36.73 
 
 		 579 aa  277  3e-73  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000016538 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5038  FAD dependent oxidoreductase  38.02 
 
 		 575 aa  274  2.0000000000000002e-72  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.991443  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5123  FAD dependent oxidoreductase  38.14 
 
 		 600 aa  272  9e-72  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1363  FAD dependent oxidoreductase  36.31 
 
 		 579 aa  271  1e-71  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.890822 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0265  FAD dependent oxidoreductase  37.11 
 
 		 569 aa  272  1e-71  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.339178  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1006  FAD dependent oxidoreductase  37.65 
 
 		 576 aa  271  2.9999999999999997e-71  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.194481  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6411  FAD dependent oxidoreductase  36.48 
 
 		 579 aa  270  4e-71  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4019  FAD dependent oxidoreductase  39.22 
 
 		 573 aa  270  4e-71  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.147958  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0560  FAD dependent oxidoreductase  35.39 
 
 		 603 aa  270  5.9999999999999995e-71  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000358551 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3289  FAD dependent oxidoreductase  35.69 
 
 		 582 aa  270  5.9999999999999995e-71  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.398024  normal  0.023153 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06820  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  35.14 
 
 		 585 aa  268  2e-70  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1009  FAD dependent oxidoreductase  36.72 
 
 		 568 aa  266  5e-70  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00611314 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2593  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  37.32 
 
 		 605 aa  266  5.999999999999999e-70  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1799  FAD dependent oxidoreductase  36.75 
 
 		 582 aa  266  7e-70  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0487  FAD dependent oxidoreductase  36.94 
 
 		 582 aa  265  1e-69  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0836475  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0027  FAD dependent oxidoreductase  37.8 
 
 		 582 aa  264  3e-69  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0391  FAD dependent oxidoreductase  37.08 
 
 		 582 aa  263  4e-69  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.452734  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5444  putative glycerol-3-phosphate oxidase (FAD-dependent)  37.02 
 
 		 559 aa  263  4e-69  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21330  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  36.96 
 
 		 554 aa  263  6e-69  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.609696  normal  0.519106 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05790  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  36.28 
 
 		 587 aa  263  8e-69  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.837912  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4361  FAD dependent oxidoreductase  38.32 
 
 		 557 aa  261  2e-68  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5301  FAD dependent oxidoreductase  35.77 
 
 		 572 aa  261  2e-68  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5746  FAD dependent oxidoreductase  41.14 
 
 		 583 aa  258  1e-67  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0411962  normal  0.0261037 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0626  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  36.78 
 
 		 567 aa  259  1e-67  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2461  FAD dependent oxidoreductase  37.18 
 
 		 559 aa  258  2e-67  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0527  FAD dependent oxidoreductase  35.52 
 
 		 557 aa  258  3e-67  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2088  FAD dependent oxidoreductase  35.04 
 
 		 554 aa  258  3e-67  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0044542  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0938  FAD dependent oxidoreductase  38 
 
 		 595 aa  256  6e-67  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.00411841  normal  0.908691 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2081  FAD dependent oxidoreductase  35.99 
 
 		 559 aa  256  7e-67  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.571499 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13331  glycerol-3-phosphate dehydrogenase glpD2  36.38 
 
 		 585 aa  256  7e-67  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.819547  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4251  FAD dependent oxidoreductase  35.97 
 
 		 577 aa  256  8e-67  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4065  FAD dependent oxidoreductase  37.74 
 
 		 567 aa  255  2.0000000000000002e-66  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.783415 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1277  FAD dependent oxidoreductase  36.13 
 
 		 579 aa  254  3e-66  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.214408 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1250  FAD dependent oxidoreductase  35.73 
 
 		 579 aa  254  3e-66  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1267  FAD dependent oxidoreductase  35.73 
 
 		 579 aa  254  3e-66  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29940  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  36.23 
 
 		 583 aa  252  1e-65  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4611  FAD dependent oxidoreductase  38.29 
 
 		 574 aa  251  2e-65  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.497063 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4821  FAD dependent oxidoreductase  36.96 
 
 		 581 aa  251  3e-65  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.929207  normal  0.0366818 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4577  FAD dependent oxidoreductase  36.55 
 
 		 559 aa  251  3e-65  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0056  FAD dependent oxidoreductase  32.1 
 
 		 564 aa  249  7e-65  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1836  putative glycerol-3-phosphate dehydrogenase  36.96 
 
 		 529 aa  249  9e-65  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.399827  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3637  FAD dependent oxidoreductase  35.79 
 
 		 584 aa  249  9e-65  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.256736  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5604  FAD dependent oxidoreductase  37.72 
 
 		 593 aa  248  1e-64  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.969598  hitchhiker  0.0026989 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0808  FAD dependent oxidoreductase  31.91 
 
 		 560 aa  248  2e-64  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000105669  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1196  glycerol-3-phosphate dehydrogenase, aerobic  31.43 
 
 		 560 aa  247  4e-64  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000405869  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0868  aerobic glycerol-3-phosphate dehydrogenase  32.39 
 
 		 557 aa  247  4.9999999999999997e-64  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0953137  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0948  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  31.24 
 
 		 560 aa  246  9e-64  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  7.99901e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0961  glycerol-3-phosphate dehydrogenase, aerobic  31.67 
 
 		 560 aa  246  9.999999999999999e-64  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00186325  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1027  glycerol-3-phosphate dehydrogenase, aerobic  31.67 
 
 		 560 aa  246  9.999999999999999e-64  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000000888189  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1107  glycerol-3-phosphate dehydrogenase, aerobic  31.67 
 
 		 560 aa  246  9.999999999999999e-64  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.58319e-29 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1620  FAD dependent oxidoreductase  40.37 
 
 		 585 aa  245  9.999999999999999e-64  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0117086 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2018  FAD dependent oxidoreductase  35.89 
 
 		 581 aa  245  9.999999999999999e-64  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.523268 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1126  glycerol-3-phosphate dehydrogenase, aerobic  31.48 
 
 		 560 aa  244  3.9999999999999997e-63  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.000000204459  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0939  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  31.48 
 
 		 560 aa  243  6e-63  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000453053  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>