159 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_2176 on replicon NC_007973
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007973  Rmet_2176  ornithine-acyl[acyl carrier protein] N-acyltransferase  100 
 
 
283 aa  582  1.0000000000000001e-165  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.525625 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2158  ornithine-acyl[acyl carrier protein] N-acyltransferase  86.12 
 
 
281 aa  498  1e-140  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1538  hypothetical protein  76.79 
 
 
278 aa  440  9.999999999999999e-123  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.642798  normal  0.166075 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1709  hypothetical protein  77.78 
 
 
277 aa  440  9.999999999999999e-123  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0276647  normal  0.676906 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2017  hypothetical protein  77.42 
 
 
277 aa  438  9.999999999999999e-123  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1588  putative hemolysin-like protein  66.39 
 
 
307 aa  361  8e-99  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1997  putative hemolysin-like protein  64.52 
 
 
268 aa  356  1.9999999999999998e-97  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.351889  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4454  ornithine-acyl[acyl carrier protein] N-acyltransferase  64.87 
 
 
268 aa  356  1.9999999999999998e-97  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0859563  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1311  putative hemolysin-like protein  64.52 
 
 
268 aa  355  5.999999999999999e-97  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.309532  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1196  putative hemolysin-like protein  64.87 
 
 
268 aa  354  6.999999999999999e-97  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0329892  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1221  putative hemolysin-like protein  64.87 
 
 
268 aa  354  6.999999999999999e-97  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1293  putative hemolysin-like protein  64.52 
 
 
268 aa  354  8.999999999999999e-97  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.418328  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0891  hypothetical protein  64.52 
 
 
271 aa  352  2.9999999999999997e-96  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0879726 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0797  hypothetical protein  65.83 
 
 
272 aa  351  8.999999999999999e-96  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.874102  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1503  hypothetical protein  65.83 
 
 
272 aa  351  8.999999999999999e-96  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.176854  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1533  hypothetical protein  65.83 
 
 
272 aa  351  8.999999999999999e-96  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1704  hypothetical protein  65.83 
 
 
301 aa  350  2e-95  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.372177  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2757  hypothetical protein  65.83 
 
 
338 aa  349  3e-95  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  decreased coverage  0.00398439  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1275  ornithine-acyl[acyl carrier protein] N-acyltransferase  63.08 
 
 
270 aa  345  6e-94  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.599594  normal  0.201087 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2849  hypothetical protein  62.37 
 
 
270 aa  343  2.9999999999999997e-93  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.890159  normal  0.909838 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1310  hypothetical protein  67.62 
 
 
250 aa  334  7.999999999999999e-91  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0560  hypothetical protein  67.62 
 
 
250 aa  334  7.999999999999999e-91  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0592  hypothetical protein  67.62 
 
 
250 aa  334  7.999999999999999e-91  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.12334  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1479  ornithine-acyl(acyl carrier protein) N-acyltransferase  56.49 
 
 
278 aa  317  2e-85  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2379  ornithine-acyl[acyl carrier protein] N-acyltransferase  56.14 
 
 
278 aa  315  5e-85  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.633832  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2028  hypothetical protein  55.63 
 
 
282 aa  307  2.0000000000000002e-82  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.131913  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2243  ornithine-acyl[acyl carrier protein] N-acyltransferase  53.17 
 
 
294 aa  303  3.0000000000000004e-81  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.782779 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2305  hypothetical protein  51.38 
 
 
286 aa  299  3e-80  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.050145  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2581  hypothetical protein  54.45 
 
 
279 aa  298  8e-80  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00571368 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0325  ornithine-acyl[acyl carrier protein] N-acyltransferase  54.55 
 
 
283 aa  297  1e-79  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0746411  normal  0.0207105 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2621  ornithine-acyl[acyl carrier protein] N-acyltransferase  57.54 
 
 
265 aa  291  8e-78  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0630357  normal  0.540771 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3452  hypothetical protein  55.92 
 
 
255 aa  290  1e-77  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.320745  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0369  hypothetical protein  57.32 
 
 
285 aa  289  4e-77  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.548265 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0469  ornithine-acyl[acyl carrier protein] N-acyltransferase  57.76 
 
 
249 aa  276  2e-73  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00940053  normal  0.968751 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1032  hypothetical protein  51.24 
 
 
286 aa  265  5.999999999999999e-70  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3934  ornithine-acyl[acyl carrier protein] N-acyltransferase  52.34 
 
 
250 aa  264  2e-69  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.638634  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6049  ornithine-acyl(acyl carrier protein) N- acyltransferase  48.95 
 
 
256 aa  238  5.999999999999999e-62  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0583  putative hemolysin-like protein  50.21 
 
 
320 aa  235  6e-61  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0059  hypothetical protein  43.32 
 
 
258 aa  212  4.9999999999999996e-54  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4066  hypothetical protein  45.2 
 
 
256 aa  203  2e-51  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.311734  normal  0.0821052 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2736  putative hemolysin  42.98 
 
 
271 aa  202  4e-51  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4353  hypothetical protein  45.66 
 
 
251 aa  200  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1121  hypothetical protein  44.73 
 
 
249 aa  199  6e-50  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.335572 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4048  hypothetical protein  45.66 
 
 
251 aa  197  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0726  hypothetical protein  45.41 
 
 
258 aa  196  3e-49  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0874  conserved hypothetical protein, predicted autoinducer synthesis protein family  45.41 
 
 
258 aa  196  3e-49  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.936705  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4921  hypothetical protein  43.27 
 
 
251 aa  195  6e-49  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.880265  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56560  hypothetical protein  45.21 
 
 
251 aa  194  1e-48  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.492473  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_37760  hypothetical protein  43.84 
 
 
252 aa  193  2e-48  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0990  hypothetical protein  45.79 
 
 
251 aa  190  2e-47  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00020068 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1287  ornithine-acyl[acyl carrier protein] N-acyltransferase  42.6 
 
 
251 aa  190  2e-47  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1126  ornithine-acyl[acyl carrier protein] N-acyltransferase  41.3 
 
 
243 aa  185  7e-46  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.968432 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4464  hypothetical protein  44.39 
 
 
251 aa  184  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.552016  normal  0.0135664 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0963  hypothetical protein  44.39 
 
 
251 aa  184  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.07893 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0924  hypothetical protein  44.39 
 
 
251 aa  184  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2322  putative hemolysin  42.74 
 
 
253 aa  179  4.999999999999999e-44  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1873  ornithine-acyl[acyl carrier protein] N-acyltransferase  40.65 
 
 
277 aa  179  5.999999999999999e-44  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.447204  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1919  ornithine-acyl[acyl carrier protein] N-acyltransferase  40.65 
 
 
277 aa  179  5.999999999999999e-44  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0456889  normal  0.658773 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1853  ornithine-acyl[acyl carrier protein] N-acyltransferase  40.65 
 
 
277 aa  179  5.999999999999999e-44  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.313144  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2103  hypothetical protein  38.82 
 
 
287 aa  176  5e-43  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4257  hypothetical protein  39.6 
 
 
283 aa  172  5e-42  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1049  putative hemolysin  34.88 
 
 
277 aa  167  2e-40  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2912  hypothetical protein  38.58 
 
 
267 aa  166  5e-40  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3258  hypothetical protein  38.81 
 
 
291 aa  160  2e-38  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3535  hypothetical protein  37.86 
 
 
258 aa  160  2e-38  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1900  hypothetical protein  41.83 
 
 
271 aa  160  3e-38  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1440  ornithine-acyl(acyl carrier protein) N- acyltransferase  40.76 
 
 
261 aa  159  4e-38  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.204428  normal  0.907823 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13043  hypothetical protein  40.69 
 
 
246 aa  157  2e-37  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000906572  hitchhiker  0.00196121 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0716  hypothetical protein  34.85 
 
 
266 aa  155  5.0000000000000005e-37  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000130069  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3681  ornithine-acyl[acyl carrier protein] N-acyltransferase  41.37 
 
 
292 aa  149  5e-35  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1208  ornithine-acyl[acyl carrier protein] N-acyltransferase  38.49 
 
 
253 aa  145  6e-34  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.32888  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1654  hypothetical protein  38.43 
 
 
304 aa  140  1.9999999999999998e-32  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.816423 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0944  Putative hemolysin-like protein  37.85 
 
 
288 aa  140  1.9999999999999998e-32  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000783609  normal  0.05177 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0333  putative hemolysin-like protein  38.04 
 
 
384 aa  138  1e-31  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.515717  normal  0.703122 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3632  hypothetical protein  37.89 
 
 
305 aa  135  8e-31  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.135191 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2886  putative hemolysin-like protein  38.46 
 
 
265 aa  132  6e-30  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.801461  normal  0.222823 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1116  hypothetical protein  36.36 
 
 
332 aa  132  9e-30  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.719302 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3768  ornithine-acyl[acyl carrier protein] N-acyltransferase  33.86 
 
 
266 aa  131  1.0000000000000001e-29  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0148  hypothetical protein  34.4 
 
 
281 aa  130  2.0000000000000002e-29  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0412  hypothetical protein  36.47 
 
 
337 aa  130  2.0000000000000002e-29  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.666795 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0160  hypothetical protein  35.6 
 
 
297 aa  130  2.0000000000000002e-29  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0143  hypothetical protein  35.29 
 
 
297 aa  130  3e-29  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4880  hypothetical protein  36.33 
 
 
332 aa  130  3e-29  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.055868  normal  0.748823 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2436  ornithine-acyl[acyl carrier protein] N-acyltransferase  36.07 
 
 
258 aa  129  4.0000000000000003e-29  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00586603 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0408  hypothetical protein  36.36 
 
 
337 aa  129  6e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0035  hypothetical protein  36.73 
 
 
291 aa  129  6e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.227098 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0318  putative hemolysin  37.5 
 
 
316 aa  129  7.000000000000001e-29  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.361608  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0050  hypothetical protein  37.14 
 
 
291 aa  128  9.000000000000001e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0314  hypothetical protein  37.25 
 
 
321 aa  128  1.0000000000000001e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4417  hypothetical protein  35.94 
 
 
332 aa  128  1.0000000000000001e-28  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.704988  normal  0.744356 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0418  hypothetical protein  35.92 
 
 
291 aa  127  2.0000000000000002e-28  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1138  hypothetical protein  28.24 
 
 
280 aa  127  2.0000000000000002e-28  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.194098  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4721  hypothetical protein  36.19 
 
 
332 aa  126  4.0000000000000003e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.325273  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1472  phospholipid/glycerol acyltransferase  35.92 
 
 
258 aa  126  4.0000000000000003e-28  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.031802  normal  0.0574374 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4208  hypothetical protein  36.72 
 
 
330 aa  125  7e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.159321 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2102  hypothetical protein  35.63 
 
 
281 aa  124  1e-27  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0028  hypothetical protein  35.25 
 
 
296 aa  124  1e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000147407 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4926  hypothetical protein  35.29 
 
 
332 aa  124  1e-27  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.263605 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3807  phospholipid/glycerol acyltransferase  37.65 
 
 
261 aa  124  2e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.395823  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3597  hypothetical protein  35.14 
 
 
341 aa  122  6e-27  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.485263  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>