51 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_2056 on replicon NC_007973
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007973  Rmet_2056  HAD family hydrolase  100 
 
 		 268 aa  541  1e-153  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.413042  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2053  HAD family hydrolase  75.95 
 
 		 287 aa  397  1e-109  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1184  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIB  62.55 
 
 		 297 aa  328  7e-89  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.24726  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1091  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIB  62.41 
 
 		 297 aa  327  2.0000000000000001e-88  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.024164  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1263  hypothetical protein  61.98 
 
 		 295 aa  320  9.999999999999999e-87  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.151023  normal  0.478475 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3500  HAD family hydrolase  49.21 
 
 		 267 aa  244  8e-64  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.126173 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2700  HAD family hydrolase  45.95 
 
 		 270 aa  231  8.000000000000001e-60  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5932  HAD family hydrolase  47.37 
 
 		 265 aa  219  3e-56  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4690  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIB  44.13 
 
 		 275 aa  200  1.9999999999999998e-50  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0616  HAD family hydrolase  44.73 
 
 		 278 aa  200  3e-50  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0595  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIB  44.16 
 
 		 278 aa  197  2.0000000000000003e-49  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0644  HAD family hydrolase  41.79 
 
 		 283 aa  194  1e-48  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.123589  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4133  HAD family hydrolase  41.44 
 
 		 271 aa  192  3e-48  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0769  HAD family hydrolase  40.77 
 
 		 257 aa  186  3e-46  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0183682  normal  0.618821 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0610  HAD family hydrolase  39.46 
 
 		 282 aa  183  3e-45  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000152168 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2097  HAD family hydrolase  36.06 
 
 		 268 aa  181  1e-44  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.978592  normal  0.811139 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2219  HAD family hydrolase  39.76 
 
 		 259 aa  177  2e-43  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4067  HAD family hydrolase  42.54 
 
 		 301 aa  174  9e-43  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5210  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIB  38.8 
 
 		 281 aa  163  2.0000000000000002e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.43756 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06400  hypothetical protein  32.46 
 
 		 274 aa  159  4e-38  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5196  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIB  39.11 
 
 		 278 aa  154  1e-36  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6760  HAD family hydrolase  37.55 
 
 		 263 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6271  HAD family hydrolase  38.26 
 
 		 263 aa  146  3e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.274563  normal  0.690052 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1558  HAD family hydrolase  38.26 
 
 		 263 aa  146  3e-34  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3590  HAD family hydrolase  33.33 
 
 		 270 aa  111  1.0000000000000001e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.684772  normal  0.0477257 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3874  HAD family hydrolase  26.94 
 
 		 260 aa  107  1e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0597322 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5151  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIB  32.13 
 
 		 321 aa  104  1e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0566  HAD family hydrolase  30.08 
 
 		 251 aa  94.4  2e-18  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.0688357 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0088  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIB  27.94 
 
 		 265 aa  92.8  6e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0509044 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2939  SPP-like hydrolase  26.23 
 
 		 232 aa  53.1  0.000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.0000389482  normal  0.976262 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0041  SPP-like hydrolase  28.69 
 
 		 233 aa  50.4  0.00003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0746  Cof-like hydrolase  23.62 
 
 		 273 aa  50.4  0.00003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl481  HAD-superfamily cof-like hydrolase  23.14 
 
 		 282 aa  45.8  0.0006  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1446  Cof-like hydrolase  21.74 
 
 		 265 aa  45.8  0.0007  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1274  Cof-like hydrolase  25.74 
 
 		 272 aa  45.4  0.0009  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.442966  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00960  Cof subfamily of IIB subfamily of haloacid dehalogenase superfamily/HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIB  43.84 
 
 		 282 aa  45.4  0.0009  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0140  Cof-like hydrolase  21.48 
 
 		 262 aa  44.7  0.001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.00000381708  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1919  SPP-like hydrolase  26.39 
 
 		 234 aa  45.1  0.001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1845  HAD superfamily hydrolase  22.01 
 
 		 269 aa  45.1  0.001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2337  phosphoglycolate phosphatase  23.85 
 
 		 226 aa  45.1  0.001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.488898  normal  0.0135027 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8838  hypothetical protein  39.19 
 
 		 572 aa  44.3  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.139707 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1070  SPP-like hydrolase  22.89 
 
 		 228 aa  44.3  0.002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0195406  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0324  Cof-like hydrolase  21.03 
 
 		 275 aa  43.9  0.002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000119179  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0590  HAD family hydrolase  22.3 
 
 		 279 aa  44.7  0.002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.24971  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0704  HAD family hydrolase  23.62 
 
 		 290 aa  43.9  0.003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1541  HAD family hydrolase  22.02 
 
 		 276 aa  42.7  0.005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.145336  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0638  hypothetical protein  24.07 
 
 		 226 aa  43.1  0.005  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2176  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIB  22.99 
 
 		 258 aa  42.7  0.006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.685473  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0700  putative HAD superfamily hydrolase  34.04 
 
 		 273 aa  42.7  0.007  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1451  Cof-like hydrolase  32.5 
 
 		 276 aa  42.7  0.007  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1119  SPP-like hydrolase  31.92 
 
 		 227 aa  42.4  0.008  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.660919  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>