59 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_2015 on replicon NC_007973
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007973  Rmet_2015  putative phage-related protein  100 
 
 		 446 aa  901    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0608266 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4115  peptidase U35, phage prohead HK97  45.97 
 
 		 649 aa  377  1e-103  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5067  peptidase U35 phage prohead HK97  43.7 
 
 		 659 aa  346  6e-94  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4080  peptidase U35 phage prohead HK97  42.61 
 
 		 659 aa  337  1.9999999999999998e-91  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2892  putative prohead protease  39.61 
 
 		 645 aa  290  3e-77  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000204536 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2246  putative prohead protease  39.61 
 
 		 645 aa  290  3e-77  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000101798 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2238  peptidase U35, phage prohead HK97  40.94 
 
 		 646 aa  290  3e-77  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1539  putative prohead protease  39.61 
 
 		 645 aa  290  3e-77  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4282  peptidase U35 phage prohead HK97  39.23 
 
 		 661 aa  259  5.0000000000000005e-68  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2613  peptidase U35 phage prohead HK97  39.23 
 
 		 661 aa  259  5.0000000000000005e-68  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.846097  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0240  putative major head protein/prohead protease  38.66 
 
 		 469 aa  238  2e-61  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1640  hypothetical protein  34.98 
 
 		 431 aa  229  5e-59  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.891376  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0958  putative major phage head protein/prohead proteinase  33.14 
 
 		 357 aa  147  5e-34  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0701578 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2974  putative major phage head protein/prohead proteinase  32.45 
 
 		 360 aa  129  1.0000000000000001e-28  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.594334  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1753  phage major capsid protein, HK97  26.32 
 
 		 435 aa  106  1e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.357661 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3877  hypothetical protein  26.28 
 
 		 490 aa  104  3e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0282142 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2184  peptidase U35, phage prohead HK97  39.11 
 
 		 177 aa  99  2e-19  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000692792 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2686  phage major capsid protein, HK97 family  25.55 
 
 		 466 aa  98.2  3e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1622  hypothetical protein  26.74 
 
 		 439 aa  95.1  2e-18  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.264122  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0562  hypothetical protein  28.02 
 
 		 472 aa  87.4  4e-16  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.123092  hitchhiker  0.000000108718 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1645  putative phage-related protein  28.57 
 
 		 444 aa  85.9  0.000000000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1619  HK97 family phage major capsid protein  24.44 
 
 		 437 aa  81.3  0.00000000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.314426 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5150  putative phage-related protein  25.61 
 
 		 409 aa  73.2  0.000000000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.788402  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3652  phage phi-C31 gp36 major capsid-like protein  27.47 
 
 		 393 aa  69.7  0.0000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1150  hypothetical protein  25.87 
 
 		 624 aa  62.8  0.00000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0411  hypothetical protein  25.87 
 
 		 624 aa  62.8  0.00000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1170  peptidase U35 phage prohead HK97  25.87 
 
 		 624 aa  62.4  0.00000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1284  major capsid protein HK97  24.15 
 
 		 416 aa  60.1  0.00000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0461297  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0369  peptidase U35 phage prohead HK97  25.6 
 
 		 624 aa  59.7  0.0000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3898  major capsid protein HK97  29.78 
 
 		 279 aa  59.3  0.0000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1717  prohead protease  23.56 
 
 		 525 aa  56.6  0.0000008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.155167  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1458  HK97 family major capsid protein  22.5 
 
 		 388 aa  55.1  0.000003  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.90039  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1359  HK97 family phage major capsid protein  28.69 
 
 		 385 aa  53.1  0.00001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.504084  normal  0.308637 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1482  Phage major capsid protein, HK97  28.15 
 
 		 385 aa  52  0.00002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.353157 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1625  Phage major capsid protein, HK97  28.15 
 
 		 385 aa  52  0.00002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.490763  normal  0.450118 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2025  phage major capsid protein, HK97  26.77 
 
 		 382 aa  50.8  0.00004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.848367  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0337  phage major capsid protein, HK97  26.77 
 
 		 382 aa  50.8  0.00004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.139658  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1998  phage major capsid protein, HK97 family  27.04 
 
 		 438 aa  50.4  0.00006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0852  major capsid protein, HK97 family  22.61 
 
 		 386 aa  50.4  0.00007  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.0590991  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2910  phage major capsid protein, HK97  28.75 
 
 		 281 aa  50.1  0.00009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1970  phage major capsid protein, HK97  26.13 
 
 		 431 aa  50.1  0.00009  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.141118  normal  0.540615 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2954  phage major capsid protein, HK97  28.75 
 
 		 281 aa  50.1  0.00009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.624972  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3173  peptidase S49  22.43 
 
 		 781 aa  50.1  0.00009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.792634 
 
 
-
 
NC_002936  DET1085  HK97 family major capsid protein  20.83 
 
 		 405 aa  49.3  0.0001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0400  HK97 family phage major capsid protein  24.64 
 
 		 397 aa  48.9  0.0002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3078  phage major capsid protein, HK97  29.94 
 
 		 282 aa  48.9  0.0002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.237973  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0861  phage phi-C31 gp36 major capsid-like protein  22.95 
 
 		 403 aa  48.5  0.0003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.456659  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2358  phage phi-C31 gp36-like protein /HK97 family major capsid protein  25.89 
 
 		 420 aa  47.8  0.0004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.172606  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3805  phage major capsid protein, HK97  26.9 
 
 		 285 aa  47.8  0.0005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.183482  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3878  phage major capsid protein, HK97  26.9 
 
 		 285 aa  47.8  0.0005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.112437  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4311  phage major capsid protein, HK97  26.9 
 
 		 285 aa  47.8  0.0005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.101318  normal  0.740598 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1719  phage major capsid protein, HK97  27.69 
 
 		 384 aa  47.4  0.0006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3122  phage major capsid protein, HK97  25.59 
 
 		 380 aa  47  0.0006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1086  HK97 family phage major capsid protein  26.52 
 
 		 400 aa  47.4  0.0006  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1254  HK97 family phage major capsid protein  26.36 
 
 		 399 aa  45.8  0.001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2834  phage major capsid protein, HK97 family  23.7 
 
 		 397 aa  46.2  0.001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.174812  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1805  phage major capsid protein, HK97  24.35 
 
 		 416 aa  45.1  0.003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.539863  normal  0.129536 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1415  phage major capsid protein, HK97  23.91 
 
 		 417 aa  44.3  0.005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1655  phage major capsid protein, HK97 family  26.42 
 
 		 406 aa  43.9  0.006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>