More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_1980 on replicon NC_007973
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007973  Rmet_1980  asparaginase  100 
 
 		 333 aa  655    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0624321 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2007  L-asparaginase, type II  76.99 
 
 		 378 aa  448  1e-125  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.354174  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5182  L-asparaginase, type II  59.63 
 
 		 340 aa  340  2e-92  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.699287  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1624  L-asparaginase, type II  57.19 
 
 		 355 aa  339  2.9999999999999998e-92  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.53483 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1181  Asparaginase  58.33 
 
 		 330 aa  338  5.9999999999999996e-92  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.177192  normal  0.183755 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1242  Asparaginase  57.44 
 
 		 330 aa  337  9.999999999999999e-92  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0987888  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1306  L-asparaginase II precursor signal peptide protein  57.06 
 
 		 367 aa  337  1.9999999999999998e-91  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1791  L-asparaginase, type II  59.33 
 
 		 340 aa  335  5.999999999999999e-91  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1392  L-asparaginase, type II  57.62 
 
 		 340 aa  332  6e-90  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1819  L-asparaginases, type II  60.32 
 
 		 340 aa  332  6e-90  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.498334  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6197  L-asparaginases, type II  58.1 
 
 		 365 aa  327  1.0000000000000001e-88  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.329515  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1905  L-asparaginase, type II  58.1 
 
 		 340 aa  328  1.0000000000000001e-88  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000217284 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1882  L-asparaginases, type II  58.1 
 
 		 365 aa  327  1.0000000000000001e-88  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1778  L-asparaginase, type II  58.5 
 
 		 338 aa  324  1e-87  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.116458  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2166  asparaginase family protein  55.89 
 
 		 347 aa  321  9.999999999999999e-87  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.559992  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2464  L-asparaginase, type II  57.84 
 
 		 346 aa  321  9.999999999999999e-87  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.232555  normal  0.387168 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1413  asparaginase family protein  58.31 
 
 		 347 aa  315  7e-85  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0424299  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1175  asparaginase family protein  58.31 
 
 		 347 aa  315  7e-85  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.120195  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1902  asparaginase family protein  58.31 
 
 		 347 aa  315  7e-85  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3402  asparaginase family protein  58.31 
 
 		 347 aa  315  7e-85  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.432934  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2265  L-asparaginase, type II  58.31 
 
 		 347 aa  315  7e-85  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.609083  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2305  L-asparaginase, type II  58.31 
 
 		 347 aa  315  7e-85  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.820101  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2428  asparaginase family protein  58.31 
 
 		 396 aa  315  8e-85  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000646  L-asparaginase  42.34 
 
 		 354 aa  258  1e-67  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0013  putative phage integrase  43.07 
 
 		 344 aa  254  2.0000000000000002e-66  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06515  L-asparaginase II  42.04 
 
 		 338 aa  253  2.0000000000000002e-66  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0031  L-asparaginase  43.54 
 
 		 348 aa  250  2e-65  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0056  L-asparaginase  43.54 
 
 		 348 aa  247  2e-64  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0619  L-asparaginase, type II  41.14 
 
 		 352 aa  245  6.999999999999999e-64  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3745  L-asparaginase, type II  41.14 
 
 		 356 aa  245  8e-64  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.148156  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0080  L-asparaginase  41.74 
 
 		 348 aa  245  8e-64  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0646  L-asparaginase, type II  40.84 
 
 		 352 aa  244  9.999999999999999e-64  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0641  L-asparaginase, type II  40.84 
 
 		 352 aa  244  9.999999999999999e-64  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1657  L-asparaginase II  41.72 
 
 		 348 aa  244  9.999999999999999e-64  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1178  L-asparaginase, type II  43.07 
 
 		 347 aa  242  5e-63  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02750  hypothetical protein  44.14 
 
 		 348 aa  239  4e-62  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00507808  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02787  periplasmic L-asparaginase II  44.14 
 
 		 348 aa  239  4e-62  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00534571  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2953  asparaginase  47.8 
 
 		 316 aa  239  5e-62  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4260  L-asparaginase II  43.54 
 
 		 348 aa  237  2e-61  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1362  L-asparaginase II  41.95 
 
 		 348 aa  237  2e-61  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  unclonable  0.00000230453  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2449  asparaginase  45.29 
 
 		 327 aa  236  3e-61  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1118  L-asparaginase II  43.54 
 
 		 348 aa  236  3e-61  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.881329 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3389  L-asparaginase II  43.54 
 
 		 348 aa  236  4e-61  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3117  L-asparaginase II  43.54 
 
 		 348 aa  236  4e-61  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0757  L-asparaginase II  43.54 
 
 		 348 aa  236  4e-61  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00188173 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3099  L-asparaginase II  43.54 
 
 		 348 aa  236  4e-61  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00149168 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3301  L-asparaginase II  43.54 
 
 		 348 aa  236  5.0000000000000005e-61  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1606  L-asparaginase, type II  40.06 
 
 		 352 aa  236  5.0000000000000005e-61  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.57786  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0738  L-asparaginase, type II  43.24 
 
 		 348 aa  235  1.0000000000000001e-60  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1705  L-asparaginase II  42.17 
 
 		 348 aa  233  3e-60  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.108514  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1949  L-asparaginase II  44.24 
 
 		 345 aa  233  4.0000000000000004e-60  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0010291  normal  0.072144 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2006  L-asparaginase, type II  40.96 
 
 		 348 aa  233  4.0000000000000004e-60  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.602671  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2586  L-asparaginase II  44.24 
 
 		 345 aa  233  5e-60  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2674  L-asparaginase II  44.24 
 
 		 345 aa  233  5e-60  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3345  L-asparaginase II  43.24 
 
 		 348 aa  232  7.000000000000001e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.52837  normal  0.418181 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3449  L-asparaginase II  43.24 
 
 		 348 aa  232  8.000000000000001e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.65351  normal  0.38324 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3269  L-asparaginase II  43.24 
 
 		 348 aa  232  8.000000000000001e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3353  L-asparaginase II  43.24 
 
 		 348 aa  232  8.000000000000001e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.529278 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3280  L-asparaginase II  43.24 
 
 		 348 aa  231  1e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0792755 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0029  L-asparaginase  40.72 
 
 		 338 aa  229  5e-59  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.304062  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0029  L-asparaginase  41.57 
 
 		 331 aa  229  5e-59  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.51172  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1919  asparaginase  45.37 
 
 		 321 aa  229  6e-59  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1145  L-asparaginase, type II  45.95 
 
 		 339 aa  228  1e-58  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.209792  normal  0.423972 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3792  L-asparaginase  41.44 
 
 		 347 aa  226  6e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0751735  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4206  L-asparaginases, type II  41.96 
 
 		 356 aa  225  9e-58  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3870  L-asparaginase  41.14 
 
 		 347 aa  224  2e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3973  L-asparaginase  41.14 
 
 		 347 aa  224  2e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2637  Asparaginase  48.93 
 
 		 329 aa  224  2e-57  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.558879  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3912  L-asparaginase  41.14 
 
 		 347 aa  224  2e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.278506  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3804  L-asparaginase  41.14 
 
 		 347 aa  224  2e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3136  L-asparaginase, type II  43.37 
 
 		 373 aa  223  3e-57  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.239344  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1550  Asparaginase  48.12 
 
 		 323 aa  223  3e-57  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.429076  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1025  L-asparaginase II  42.32 
 
 		 347 aa  223  3e-57  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  unclonable  0.00000000000214281  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3863  L-asparaginases, type II  43.37 
 
 		 366 aa  223  3e-57  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.354581 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3314  L-asparaginase, type II  43.45 
 
 		 346 aa  222  9e-57  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2132  asparaginase  45.73 
 
 		 330 aa  221  9.999999999999999e-57  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2993  asparaginase  43.93 
 
 		 341 aa  221  9.999999999999999e-57  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.740991  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0442  L-asparaginases, type II  43.67 
 
 		 379 aa  221  9.999999999999999e-57  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.228079  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0996  L-asparaginase, type II  41.74 
 
 		 346 aa  220  3e-56  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.396669  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2924  L-asparaginase, type II  41.47 
 
 		 348 aa  220  3e-56  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4182  L-asparaginases, type II  42.86 
 
 		 365 aa  220  3e-56  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.428323  normal  0.315829 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2559  asparaginase/glutaminase  45.48 
 
 		 325 aa  219  5e-56  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0847476  normal  0.0141583 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4896  asparaginase  45.57 
 
 		 356 aa  219  5e-56  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.970044  normal  0.227329 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2309  asparaginase  47.19 
 
 		 323 aa  217  2e-55  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  decreased coverage  0.00324768  normal  0.172792 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3114  L-asparaginase, type II  41.49 
 
 		 348 aa  216  5e-55  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.526818  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4748  L-asparaginase, type II  42.77 
 
 		 356 aa  214  9.999999999999999e-55  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0564  L-asparaginase, type II  42.47 
 
 		 378 aa  211  1e-53  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5349  L-asparaginase, type II  43.81 
 
 		 372 aa  209  4e-53  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.438245  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0683  L-asparaginases, type II  41.79 
 
 		 316 aa  209  6e-53  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5042  L-asparaginase, type II  43.94 
 
 		 369 aa  208  1e-52  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.122979  hitchhiker  0.00128464 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3427  L-asparaginase, type II  42.51 
 
 		 373 aa  207  2e-52  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.104551 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1812  L-asparaginase, type II  40.06 
 
 		 374 aa  207  2e-52  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0266176  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4228  L-asparaginase, type II  39.88 
 
 		 330 aa  204  1e-51  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.965091  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2081  asparaginase  44.13 
 
 		 309 aa  204  2e-51  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.438459 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2689  L-asparaginase, type II  44.44 
 
 		 356 aa  203  4e-51  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.373089 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1583  asparaginase  40.78 
 
 		 375 aa  203  4e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000246256  normal  0.508617 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07280  L-asparaginase, type II  42.94 
 
 		 362 aa  196  3e-49  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.706918  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3916  L-asparaginase, type II  36.36 
 
 		 349 aa  194  1e-48  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.823534  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1917  L-asparaginase, type II  40.42 
 
 		 362 aa  191  1e-47  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.155631  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2339  Asparaginase  42.12 
 
 		 352 aa  190  2.9999999999999997e-47  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>