More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_1957 on replicon NC_007973
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007509  Bcep18194_C6623  gamma-glutamyltransferase 1  71.38 
 
 		 691 aa  861    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.189852 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5737  gamma-glutamyltransferase  71.94 
 
 		 662 aa  877    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0740848  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6695  gamma-glutamyltransferase  71.71 
 
 		 661 aa  852    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.401633 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1435  gamma-glutamyltransferase  62.42 
 
 		 662 aa  748    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.999861  normal  0.647396 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6219  gamma-glutamyltransferase  71.87 
 
 		 661 aa  854    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0108346 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1782  Gamma-glutamyltransferase  62.58 
 
 		 696 aa  749    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1957  gamma-glutamyltranspeptidase  100 
 
 		 616 aa  1231    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000150594  normal  0.152366 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3307  gamma-glutamyltransferase 1  66.13 
 
 		 669 aa  808    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.444427  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5852  gamma-glutamyltransferase  71.87 
 
 		 661 aa  854    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.385279  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5335  gamma-glutamyltransferase  71.96 
 
 		 660 aa  868    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.848716  normal  0.0291024 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5982  gamma-glutamyltransferase  71.94 
 
 		 662 aa  865    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2546  gamma-glutamyltransferase  55.37 
 
 		 658 aa  618  1e-176  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2441  gamma-glutamyltransferase 1  55.89 
 
 		 634 aa  608  1e-173  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.147788 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2435  gamma-glutamyltransferase 1  55.89 
 
 		 634 aa  608  1e-173  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.67728  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2394  gamma-glutamyltransferase 1  55.89 
 
 		 634 aa  608  1e-173  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.50502  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12422  gamma-glutamyltranspeptidase precursor ggtB  55.67 
 
 		 643 aa  609  1e-173  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3716  gamma-glutamyltransferase  58.05 
 
 		 648 aa  607  9.999999999999999e-173  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.156989 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1314  Gamma-glutamyltransferase  54.97 
 
 		 652 aa  605  9.999999999999999e-173  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3535  gamma-glutamyltransferase  45.57 
 
 		 596 aa  451  1e-125  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1005  gamma-glutamyltranspeptidase  44.35 
 
 		 625 aa  449  1e-125  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2238  gamma-glutamyltransferase  45.35 
 
 		 598 aa  451  1e-125  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0970  gamma-glutamyltransferase 1  44.79 
 
 		 653 aa  448  1.0000000000000001e-124  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.160788  normal  0.0246651 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2389  gamma-glutamyltransferase  45.41 
 
 		 596 aa  443  1e-123  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.599503 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3054  gamma-glutamyltransferase  45.74 
 
 		 596 aa  445  1e-123  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2892  gamma-glutamyltransferase  45.8 
 
 		 624 aa  439  9.999999999999999e-123  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.50146 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4764  gamma-glutamyltransferase 1  43.49 
 
 		 610 aa  441  9.999999999999999e-123  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0674092 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6223  gamma-glutamyltransferase 1  45.83 
 
 		 625 aa  439  9.999999999999999e-123  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.703917  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2267  gamma-glutamyltransferase  45.8 
 
 		 624 aa  441  9.999999999999999e-123  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0422  gamma-glutamyltransferase  45.81 
 
 		 648 aa  439  9.999999999999999e-123  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2882  gamma-glutamyltransferase  45.8 
 
 		 624 aa  441  9.999999999999999e-123  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1042  gamma-glutamyltransferase 1  44.07 
 
 		 623 aa  432  1e-120  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.103549 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0960  gamma-glutamyltransferase  44.07 
 
 		 623 aa  433  1e-120  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2936  gamma-glutamyltransferase  46.01 
 
 		 626 aa  433  1e-120  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.444733  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2798  gamma-glutamyltransferase  45.85 
 
 		 626 aa  430  1e-119  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.162588  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0623  gamma-glutamyltransferase  43.49 
 
 		 624 aa  431  1e-119  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1410  gamma-glutamyltransferase 1  44.32 
 
 		 628 aa  422  1e-117  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.510021  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1607  gamma-glutamyltransferase  43.23 
 
 		 618 aa  419  1e-116  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.607897  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3094  gamma-glutamyltransferase 1  43.41 
 
 		 621 aa  410  1e-113  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.421947 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1044  gamma-glutamyltransferase 1  42.62 
 
 		 586 aa  410  1e-113  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0698667  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2921  gamma-glutamyltranspeptidase precursor  44.1 
 
 		 623 aa  408  1.0000000000000001e-112  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.609482 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3237  gamma-glutamyltransferase  43.76 
 
 		 627 aa  405  1.0000000000000001e-112  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.782882  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2560  gamma-glutamyltransferase  42.41 
 
 		 599 aa  408  1.0000000000000001e-112  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00330179 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0214  gamma-glutamyltransferase  43.76 
 
 		 627 aa  405  1.0000000000000001e-112  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2150  gamma-glutamyltranspeptidase  40.4 
 
 		 586 aa  403  1e-111  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.224451  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2806  gamma-glutamyltransferase  43.59 
 
 		 627 aa  403  1e-111  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1379  gamma-glutamyltransferase  43.59 
 
 		 627 aa  403  1e-111  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0310  gamma-glutamyltransferase  42.27 
 
 		 577 aa  405  1e-111  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0630  hypothetical protein  43.93 
 
 		 692 aa  405  1e-111  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0447  gamma-glutamyltransferase  43.93 
 
 		 626 aa  404  1e-111  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0467  gamma-glutamyltransferase  43.93 
 
 		 627 aa  404  1e-111  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.911304  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0389  gamma-glutamyltransferase  44.37 
 
 		 629 aa  400  9.999999999999999e-111  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3272  gamma-glutamyltransferase 1  42.95 
 
 		 595 aa  396  1e-109  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00348  gamma-glutamyltransferase  38.91 
 
 		 588 aa  396  1e-109  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_4005  gamma-glutamyltransferase  42.95 
 
 		 593 aa  397  1e-109  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0916  gamma-glutamyltransferase  40.23 
 
 		 586 aa  395  1e-108  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02192  gamma-glutamyltranspeptidase  40.1 
 
 		 580 aa  390  1e-107  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.473359  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002088  gamma-glutamyltranspeptidase  38.08 
 
 		 588 aa  387  1e-106  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2574  gamma-glutamyltranspeptidase  38.84 
 
 		 588 aa  379  1e-103  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2514  gamma-glutamyltransferase 1  42.58 
 
 		 588 aa  377  1e-103  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.25139  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2396  gamma-glutamyltransferase  37.4 
 
 		 581 aa  373  1e-102  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.403058  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0675  gamma-glutamyltransferase  40.37 
 
 		 596 aa  375  1e-102  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0462  gamma-glutamyltransferase  43.08 
 
 		 571 aa  365  1e-99  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0192  gamma-glutamyltransferase 1  40.17 
 
 		 583 aa  350  3e-95  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2637  gamma-glutamyltransferase  39.77 
 
 		 595 aa  345  1e-93  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0160449 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3459  gamma-glutamyltransferase  36.95 
 
 		 582 aa  340  5.9999999999999996e-92  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.00000240901  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0391  gamma-glutamyltransferase  39.51 
 
 		 572 aa  330  4e-89  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2655  gamma-glutamyltransferase  39.3 
 
 		 619 aa  317  3e-85  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0482  gamma-glutamyltransferase 1  41.09 
 
 		 437 aa  305  1.0000000000000001e-81  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.174178  normal  0.259779 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0681  gamma-glutamyltransferase  38.15 
 
 		 575 aa  305  1.0000000000000001e-81  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.141037 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001611  gamma-glutamyltranspeptidase  33.39 
 
 		 576 aa  276  1.0000000000000001e-72  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00725831  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5232  gamma-glutamyltransferase  38.5 
 
 		 605 aa  262  2e-68  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2158  gamma-glutamyltransferase  33.11 
 
 		 576 aa  252  1e-65  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.148613  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1540  gamma-glutamyltransferase  34.59 
 
 		 610 aa  247  4e-64  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00533292 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1176  gamma-glutamyltransferase 1  31.61 
 
 		 645 aa  246  9.999999999999999e-64  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1655  gamma-glutamyltransferase  32.02 
 
 		 583 aa  245  9.999999999999999e-64  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.000000129294  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3136  gamma-glutamyltransferase  36.55 
 
 		 614 aa  244  1.9999999999999999e-63  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0564894  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3753  gamma-glutamyltranspeptidase  32.5 
 
 		 580 aa  244  3.9999999999999997e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1929  gamma-glutamyltransferase  31.74 
 
 		 581 aa  243  6e-63  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.127563  normal  0.166463 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1221  gamma-glutamyltransferase  31.21 
 
 		 645 aa  243  6e-63  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.134114  normal  0.315285 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3726  gamma-glutamyltranspeptidase  32.62 
 
 		 581 aa  243  7.999999999999999e-63  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0660  gamma-glutamyltransferase  32.03 
 
 		 580 aa  243  7.999999999999999e-63  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4485  gamma-glutamyltransferase  34.92 
 
 		 583 aa  243  9e-63  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4553  gamma-glutamyltransferase  34.75 
 
 		 586 aa  242  1e-62  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.420864  decreased coverage  0.00202761 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3850  gamma-glutamyltranspeptidase  32.26 
 
 		 581 aa  242  1e-62  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.968854 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0798  gamma-glutamyltransferase  34.7 
 
 		 578 aa  241  2e-62  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.979487  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1566  gamma-glutamyltransferase  31.9 
 
 		 590 aa  241  2.9999999999999997e-62  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.830668  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3644  gamma-glutamyltranspeptidase  32.43 
 
 		 580 aa  241  2.9999999999999997e-62  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4761  gamma-glutamyltranspeptidase  32.45 
 
 		 581 aa  241  2.9999999999999997e-62  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0368944 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0269  gamma-glutamyltranspeptidase  32.43 
 
 		 580 aa  241  2.9999999999999997e-62  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.00159627  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0268  gamma-glutamyltransferase  32.43 
 
 		 580 aa  240  5e-62  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3924  gamma-glutamyltranspeptidase  32.39 
 
 		 577 aa  239  8e-62  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3820  gamma-glutamyltranspeptidase  32.34 
 
 		 580 aa  239  9e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03296  gamma-glutamyltranspeptidase periplasmic precursor  32.26 
 
 		 580 aa  239  1e-61  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0836777  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1114  gamma-glutamyltransferase 1  32.83 
 
 		 589 aa  239  1e-61  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.827494  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03249  hypothetical protein  32.26 
 
 		 580 aa  239  1e-61  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.092805  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2689  gamma-glutamyltransferase  30.71 
 
 		 582 aa  238  2e-61  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.516535  normal  0.975732 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3863  gamma-glutamyltranspeptidase  32.17 
 
 		 580 aa  238  2e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1864  gamma-glutamyltransferase  32.43 
 
 		 599 aa  238  3e-61  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.370117  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1754  gamma-glutamyltransferase  33.11 
 
 		 633 aa  237  4e-61  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1373  gamma-glutamyltransferase  31.21 
 
 		 617 aa  237  4e-61  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0146115 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>