85 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_1891 on replicon NC_007973
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007973  Rmet_1891  hypothetical protein  100 
 
 		 300 aa  582  1.0000000000000001e-165  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS01739  hypothetical protein  50.19 
 
 		 303 aa  242  5e-63  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0781  protein of unknown function DUF6 transmembrane  49.29 
 
 		 295 aa  230  2e-59  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1656  hypothetical protein  46.04 
 
 		 297 aa  192  6e-48  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0479067  normal  0.122332 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3109  hypothetical protein  42.97 
 
 		 289 aa  191  9e-48  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0895719 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2935  hypothetical protein  45.28 
 
 		 286 aa  188  1e-46  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4102  hypothetical protein  40.15 
 
 		 302 aa  185  7e-46  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.576037  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2000  hypothetical protein  41.86 
 
 		 283 aa  184  2.0000000000000003e-45  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00389336  decreased coverage  0.00000000377823 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1975  hypothetical protein  41.47 
 
 		 283 aa  183  3e-45  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0979714  hitchhiker  0.00214562 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2087  LysR family transcriptional regulator  41.09 
 
 		 283 aa  182  8.000000000000001e-45  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.632032  hitchhiker  0.0000000953173 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4266  hypothetical protein  39.77 
 
 		 295 aa  180  2.9999999999999997e-44  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1774  hypothetical protein  38.6 
 
 		 297 aa  179  4e-44  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5364  hypothetical protein  41.95 
 
 		 285 aa  179  4.999999999999999e-44  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.278081  normal  0.929346 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4790  membrane protein  36.96 
 
 		 285 aa  178  1e-43  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.278325  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1446  hypothetical protein  37.06 
 
 		 314 aa  172  3.9999999999999995e-42  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0746  DMT family permease  41.91 
 
 		 297 aa  171  1e-41  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1850  sensor protein GLPS  40.15 
 
 		 302 aa  167  2.9999999999999998e-40  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.829384 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3816  hypothetical protein  43.02 
 
 		 307 aa  162  7e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1346  hypothetical protein  36.52 
 
 		 314 aa  161  1e-38  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3521  hypothetical protein  41.95 
 
 		 290 aa  158  1e-37  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.349623  normal  0.801415 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0646  hypothetical protein  34.7 
 
 		 288 aa  158  1e-37  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00955347  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1416  hypothetical protein  34.62 
 
 		 304 aa  157  2e-37  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.732037  normal  0.239593 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001148  permease  36.36 
 
 		 289 aa  156  3e-37  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.270511  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1068  hypothetical protein  33.33 
 
 		 311 aa  152  5.9999999999999996e-36  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0600  hypothetical protein  39.77 
 
 		 297 aa  145  9e-34  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.172684 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2406  hypothetical protein  42.48 
 
 		 290 aa  144  2e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.268881  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2254  hypothetical protein  42.7 
 
 		 290 aa  141  9.999999999999999e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.290541  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38950  hypothetical protein  44.15 
 
 		 287 aa  137  2e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06636  hypothetical protein  34.85 
 
 		 289 aa  136  4e-31  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1051  DMT superfamily efflux pump  36.99 
 
 		 254 aa  133  3.9999999999999996e-30  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.226473  normal  0.464817 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2916  hypothetical protein  41.13 
 
 		 282 aa  132  7.999999999999999e-30  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.264108  normal  0.862431 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6146  hypothetical protein  38.81 
 
 		 302 aa  129  5.0000000000000004e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6439  hypothetical protein  38.87 
 
 		 275 aa  125  1e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.719443 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46360  hypothetical protein  43.7 
 
 		 285 aa  124  2e-27  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.206778  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02132  permease of the drug/metabolite transporter superfamily protein  40.54 
 
 		 194 aa  122  5e-27  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.259073  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3318  hypothetical protein  43.23 
 
 		 286 aa  122  9e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1433  protein of unknown function DUF6 transmembrane  35.82 
 
 		 296 aa  121  9.999999999999999e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3356  hypothetical protein  35.94 
 
 		 287 aa  120  3e-26  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0856  hypothetical protein  41.47 
 
 		 288 aa  116  5e-25  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0559005  normal  0.228089 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1087  hypothetical protein  43.92 
 
 		 281 aa  109  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.647653 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1613  protein of unknown function DUF6 transmembrane  40.15 
 
 		 307 aa  104  2e-21  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.76207  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2262  hypothetical protein  39.56 
 
 		 319 aa  102  1e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.099345  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1689  protein of unknown function DUF6 transmembrane  40.15 
 
 		 301 aa  101  2e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.112167  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1374  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.67 
 
 		 289 aa  53.1  0.000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0209968 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0791  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.63 
 
 		 296 aa  52  0.00001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2910  hypothetical protein  29.77 
 
 		 294 aa  51.2  0.00002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.743017  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0199  hypothetical protein  21.97 
 
 		 298 aa  50.1  0.00005  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2872  hypothetical protein  29.86 
 
 		 326 aa  49.3  0.00007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2825  hypothetical protein  24.12 
 
 		 301 aa  49.3  0.00007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.693217  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2817  hypothetical protein  29.86 
 
 		 294 aa  48.9  0.0001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.813656  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2647  hypothetical protein  24.54 
 
 		 298 aa  48.5  0.0001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.176077 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0732  hypothetical protein  24.62 
 
 		 343 aa  47.8  0.0002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3820  hypothetical protein  30.3 
 
 		 308 aa  48.1  0.0002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0151109  normal  0.339393 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3877  hypothetical protein  26.05 
 
 		 300 aa  47.8  0.0002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.421169  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1215  hypothetical protein  22.92 
 
 		 299 aa  48.1  0.0002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2875  threonine and homoserine efflux system  26.24 
 
 		 293 aa  48.1  0.0002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00290146  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2528  hypothetical protein  30.9 
 
 		 289 aa  47.4  0.0003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00740472  normal  0.181025 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1258  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.93 
 
 		 305 aa  47.4  0.0003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.559477  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0292  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.56 
 
 		 292 aa  47  0.0004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0721  hypothetical protein  26.29 
 
 		 294 aa  47  0.0004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0361886  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4018  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.89 
 
 		 282 aa  46.2  0.0007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.0042e-23 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00797  hypothetical protein  29.59 
 
 		 295 aa  45.4  0.001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0962  threonine and homoserine efflux system  29.59 
 
 		 299 aa  45.1  0.001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0232509  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1272  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.01 
 
 		 314 aa  45.4  0.001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.162759  normal  0.535938 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0337  hypothetical protein  25.2 
 
 		 279 aa  45.1  0.001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.595745  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00780  threonine and homoserine efflux system  29.59 
 
 		 295 aa  45.4  0.001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2829  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.59 
 
 		 295 aa  45.4  0.001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0520778  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3217  protein of unknown function DUF6 transmembrane  24.3 
 
 		 293 aa  45.4  0.001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.182093  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0870  threonine and homoserine efflux system  29.59 
 
 		 295 aa  45.4  0.001  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000096225  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0883  threonine and homoserine efflux system  29.59 
 
 		 295 aa  45.4  0.001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000921417  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2830  threonine and homoserine efflux system  29.59 
 
 		 295 aa  45.4  0.001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0837  threonine and homoserine efflux system  29.59 
 
 		 295 aa  45.4  0.001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0124814  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2535  threonine and homoserine efflux system  29.59 
 
 		 295 aa  45.4  0.001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000316984  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3433  hypothetical protein  29.52 
 
 		 295 aa  44.7  0.002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.0000000302271  normal  0.447533 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0672  hypothetical protein  33.15 
 
 		 325 aa  43.9  0.003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.176077  normal  0.524236 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1505  hypothetical protein  24.5 
 
 		 305 aa  43.5  0.004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03890  probable transmembrane protein  25.11 
 
 		 294 aa  43.5  0.004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5882  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.04 
 
 		 299 aa  43.5  0.005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0925  hypothetical protein  22.14 
 
 		 304 aa  43.1  0.005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.986628  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2469  protein of unknown function DUF6 transmembrane  21.74 
 
 		 293 aa  43.1  0.005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0908  putative transporter  25.64 
 
 		 294 aa  42.7  0.007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0905  putative transporter  25.64 
 
 		 294 aa  42.7  0.007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0354  hypothetical protein  27.63 
 
 		 307 aa  42.7  0.008  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4318  protein of unknown function DUF6 transmembrane  32.45 
 
 		 305 aa  42.4  0.009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.342879 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4208  protein of unknown function DUF6 transmembrane  32.45 
 
 		 305 aa  42.4  0.009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0577458  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>