More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_1879 on replicon NC_007973
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_003295  RSc1719  glucose-6-phosphate isomerase  67.6 
 
 
539 aa  729    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.23992 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1861  glucose-6-phosphate isomerase  67.41 
 
 
539 aa  731    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000375128 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1386  glucose-6-phosphate isomerase  80.55 
 
 
545 aa  888    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.214201  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1649  glucose-6-phosphate isomerase  64.86 
 
 
542 aa  699    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.614391  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1528  glucose-6-phosphate isomerase  67.22 
 
 
539 aa  730    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.561375  normal  0.223338 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1879  glucose-6-phosphate isomerase  100 
 
 
541 aa  1110    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.10773  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0871  Glucose-6-phosphate isomerase  57.35 
 
 
548 aa  620  1e-176  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.881777  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1215  glucose-6-phosphate isomerase  57.3 
 
 
540 aa  612  9.999999999999999e-175  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1449  glucose-6-phosphate isomerase  57.3 
 
 
540 aa  612  9.999999999999999e-175  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.446361  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2347  glucose-6-phosphate isomerase  57.3 
 
 
540 aa  612  9.999999999999999e-175  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.11339  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1942  glucose-6-phosphate isomerase  57.3 
 
 
540 aa  612  9.999999999999999e-175  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3363  glucose-6-phosphate isomerase  57.3 
 
 
540 aa  612  9.999999999999999e-175  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.383524  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2466  glucose-6-phosphate isomerase  57.38 
 
 
540 aa  611  1e-173  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2308  glucose-6-phosphate isomerase  56.93 
 
 
540 aa  607  9.999999999999999e-173  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.764178  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2132  glucose-6-phosphate isomerase  56.93 
 
 
615 aa  605  9.999999999999999e-173  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.163418  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1940  glucose-6-phosphate isomerase  56.35 
 
 
540 aa  601  1e-170  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.478064  normal 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1267  glucose-6-phosphate isomerase  51.77 
 
 
547 aa  598  1e-170  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1835  glucose-6-phosphate isomerase  56.54 
 
 
540 aa  600  1e-170  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.312318 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6162  glucose-6-phosphate isomerase  56.35 
 
 
556 aa  601  1e-170  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1914  glucose-6-phosphate isomerase  56.69 
 
 
540 aa  599  1e-170  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.572285  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1905  glucose-6-phosphate isomerase  56.54 
 
 
556 aa  600  1e-170  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.139815  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1917  glucose-6-phosphate isomerase  56.35 
 
 
556 aa  601  1e-170  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0173524  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1019  glucose-6-phosphate isomerase  56.85 
 
 
540 aa  597  1e-169  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.500907  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5218  glucose-6-phosphate isomerase  55.8 
 
 
556 aa  596  1e-169  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.454549 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1231  Glucose-6-phosphate isomerase  54.58 
 
 
549 aa  597  1e-169  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.89106  hitchhiker  0.000628963 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1304  glucose-6-phosphate isomerase  56.78 
 
 
649 aa  593  1e-168  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1357  glucose-6-phosphate isomerase  56.98 
 
 
540 aa  588  1e-167  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0553854  normal  0.605631 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2287  glucose-6-phosphate isomerase  56.69 
 
 
540 aa  590  1e-167  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.384563  normal  0.236333 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2986  Glucose-6-phosphate isomerase  55.66 
 
 
541 aa  587  1e-166  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2063  glucose-6-phosphate isomerase  56.04 
 
 
560 aa  585  1e-166  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.210638  normal  0.260784 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1161  glucose-6-phosphate isomerase  53.9 
 
 
552 aa  586  1e-166  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.149944  normal  0.283638 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1140  glucose-6-phosphate isomerase  53.96 
 
 
547 aa  587  1e-166  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.279922  normal  0.256164 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0612  glucose-6-phosphate isomerase  56.09 
 
 
548 aa  585  1e-166  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.000038742  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1325  glucose-6-phosphate isomerase  55.75 
 
 
531 aa  586  1e-166  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0252663  normal  0.710455 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1515  glucose-6-phosphate isomerase  54.17 
 
 
562 aa  585  1e-166  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.447812  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1095  glucose-6-phosphate isomerase  55.02 
 
 
559 aa  587  1e-166  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.0000244755  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1247  glucose-6-phosphate isomerase  54.83 
 
 
546 aa  583  1.0000000000000001e-165  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.237953  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0481  Glucose-6-phosphate isomerase  52.42 
 
 
552 aa  583  1.0000000000000001e-165  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.734703 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0975  glucose-6-phosphate isomerase  54.44 
 
 
549 aa  584  1.0000000000000001e-165  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.307999  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5494  Glucose-6-phosphate isomerase  52.5 
 
 
550 aa  581  1e-164  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0138523 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0472  glucose-6-phosphate isomerase  51.49 
 
 
567 aa  579  1e-164  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2367  glucose phosphate isomerase  53.32 
 
 
548 aa  573  1.0000000000000001e-162  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000694926  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3768  glucose-6-phosphate isomerase  53.12 
 
 
549 aa  574  1.0000000000000001e-162  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.510592  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1339  glucose-6-phosphate isomerase  54.9 
 
 
548 aa  572  1.0000000000000001e-162  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0803183  unclonable  0.00000158602 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0938  glucose-6-phosphate isomerase  51.73 
 
 
549 aa  572  1.0000000000000001e-162  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0373  glucose-6-phosphate isomerase  53.37 
 
 
549 aa  568  1e-161  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.92303  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0373  glucose-6-phosphate isomerase  51.93 
 
 
548 aa  568  1e-161  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0302  glucose-6-phosphate isomerase  51.93 
 
 
548 aa  568  1e-161  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  unclonable  1.19722e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3946  glucose-6-phosphate isomerase  52.57 
 
 
549 aa  570  1e-161  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00605304  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3918  glucose-6-phosphate isomerase  51.93 
 
 
548 aa  568  1e-161  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.588557  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3591  glucose-6-phosphate isomerase  53.62 
 
 
550 aa  570  1e-161  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.183253 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4412  glucose-6-phosphate isomerase  52.19 
 
 
549 aa  565  1e-160  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.890974  normal  0.0629525 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2785  glucose-6-phosphate isomerase  51.67 
 
 
550 aa  566  1e-160  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0501561  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4477  glucose-6-phosphate isomerase  52.29 
 
 
548 aa  565  1e-160  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4563  glucose-6-phosphate isomerase  52.19 
 
 
549 aa  566  1e-160  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.963608  normal  0.872816 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4615  glucose-6-phosphate isomerase  52.19 
 
 
549 aa  566  1e-160  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.267215 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03897  glucose-6-phosphate isomerase  51.84 
 
 
549 aa  562  1.0000000000000001e-159  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3972  Glucose-6-phosphate isomerase  52.02 
 
 
549 aa  563  1.0000000000000001e-159  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4264  glucose-6-phosphate isomerase  51.84 
 
 
549 aa  563  1.0000000000000001e-159  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4530  glucose-6-phosphate isomerase  51.84 
 
 
549 aa  562  1.0000000000000001e-159  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4478  glucose-6-phosphate isomerase  52.21 
 
 
549 aa  565  1.0000000000000001e-159  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4005  glucose-6-phosphate isomerase  51.84 
 
 
549 aa  562  1.0000000000000001e-159  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.684976 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00012  glucose-6-phosphate isomerase  51.3 
 
 
550 aa  564  1.0000000000000001e-159  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0385  glucose-6-phosphate isomerase  51.48 
 
 
550 aa  563  1.0000000000000001e-159  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0412831  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5504  glucose-6-phosphate isomerase  51.84 
 
 
549 aa  562  1.0000000000000001e-159  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0463  glucose-6-phosphate isomerase  53.19 
 
 
550 aa  565  1.0000000000000001e-159  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4563  glucose-6-phosphate isomerase  52.19 
 
 
549 aa  565  1.0000000000000001e-159  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.606184  normal  0.0348478 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4573  glucose-6-phosphate isomerase  51.84 
 
 
549 aa  563  1.0000000000000001e-159  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3177  Glucose-6-phosphate isomerase  54.24 
 
 
548 aa  563  1.0000000000000001e-159  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00158404  hitchhiker  0.00000207698 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03857  hypothetical protein  51.84 
 
 
549 aa  562  1.0000000000000001e-159  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4486  glucose-6-phosphate isomerase  51.84 
 
 
549 aa  563  1.0000000000000001e-159  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0903  glucose-6-phosphate isomerase  52.96 
 
 
549 aa  559  1e-158  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.144639  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0710  glucose-6-phosphate isomerase  54.85 
 
 
543 aa  560  1e-158  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0210645  normal  0.310155 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002341  glucose-6-phosphate isomerase  51.67 
 
 
550 aa  560  1e-158  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2494  Glucose-6-phosphate isomerase  54.53 
 
 
551 aa  558  1e-158  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0280  Glucose-6-phosphate isomerase  50.74 
 
 
548 aa  556  1e-157  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0655697  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1935  glucose-6-phosphate isomerase  53.38 
 
 
547 aa  558  1e-157  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2589  Glucose-6-phosphate isomerase  53.12 
 
 
569 aa  552  1e-156  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0431757  normal  0.0153093 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0012  glucose-6-phosphate isomerase  48.8 
 
 
553 aa  553  1e-156  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.350529  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4356  glucose-6-phosphate isomerase  55.37 
 
 
543 aa  551  1e-155  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.099888 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4018  glucose-6-phosphate isomerase  48.18 
 
 
548 aa  549  1e-155  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.732321 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0819  glucose-6-phosphate isomerase  48.51 
 
 
539 aa  548  1e-155  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0974  glucose-6-phosphate isomerase  54.9 
 
 
550 aa  551  1e-155  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0649451  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0995  Glucose-6-phosphate isomerase  51.38 
 
 
547 aa  549  1e-155  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2030  Glucose-6-phosphate isomerase  55.84 
 
 
550 aa  550  1e-155  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0476253  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0324  glucose-6-phosphate isomerase  50.93 
 
 
550 aa  551  1e-155  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0735  glucose-6-phosphate isomerase  47.58 
 
 
547 aa  547  1e-154  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0230  glucose-6-phosphate isomerase  50.92 
 
 
549 aa  547  1e-154  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0355158  normal  0.332391 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05125  glucose-6-phosphate isomerase  48.44 
 
 
545 aa  543  1e-153  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2947  glucose-6-phosphate isomerase  55.77 
 
 
547 aa  545  1e-153  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1808  glucose-6-phosphate isomerase  50 
 
 
554 aa  539  9.999999999999999e-153  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.339602 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7561  glucose-6-phosphate isomerase  52.99 
 
 
545 aa  541  9.999999999999999e-153  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1857  glucose-6-phosphate isomerase  49.37 
 
 
549 aa  538  9.999999999999999e-153  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.145522  normal  0.452958 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7286  glucose-6-phosphate isomerase  55.49 
 
 
570 aa  541  9.999999999999999e-153  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.813116  normal  0.252141 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4701  glucose-6-phosphate isomerase  49.82 
 
 
554 aa  538  1e-151  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00101931 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0469  glucose-6-phosphate isomerase  52.07 
 
 
546 aa  535  1e-151  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3080  glucose-6-phosphate isomerase  53.2 
 
 
550 aa  536  1e-151  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.562717  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42740  glucose-6-phosphate isomerase  50.18 
 
 
554 aa  538  1e-151  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.967363  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4700  glucose-6-phosphate isomerase  50 
 
 
554 aa  536  1e-151  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0570543  hitchhiker  0.00570528 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4877  glucose-6-phosphate isomerase  50 
 
 
553 aa  538  1e-151  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.872303 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>