226 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_1864 on replicon NC_007973
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003295  RSc1748  hypothetical protein  65.48 
 
 		 525 aa  650    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0735869  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1396  hypothetical protein  80.08 
 
 		 520 aa  820    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1026  hypothetical protein  64.11 
 
 		 505 aa  640    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.260579  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1864  hypothetical protein  100 
 
 		 544 aa  1120    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.236339 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2276  hypothetical protein  63.71 
 
 		 518 aa  634  1e-180  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.391464  normal  0.115261 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1456  hypothetical protein  62.05 
 
 		 529 aa  633  1e-180  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0629194  hitchhiker  0.0000911668 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1497  hypothetical protein  61.86 
 
 		 529 aa  633  1e-180  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0834231  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1924  hypothetical protein  63.31 
 
 		 518 aa  630  1e-179  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.064946  normal  0.732324 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6171  hypothetical protein  59.69 
 
 		 522 aa  594  1e-168  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1908  hypothetical protein  59.69 
 
 		 522 aa  594  1e-168  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0738688  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1931  hypothetical protein  59.88 
 
 		 522 aa  594  1e-168  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0356725  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1826  hypothetical protein  60.19 
 
 		 522 aa  585  1e-166  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.469331  normal  0.512842 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1896  hypothetical protein  60 
 
 		 522 aa  585  1e-166  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2297  hypothetical protein  62.3 
 
 		 525 aa  585  1e-166  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.398806  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1440  hypothetical protein  62.3 
 
 		 525 aa  584  1.0000000000000001e-165  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.558637  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2457  hypothetical protein  62.3 
 
 		 521 aa  583  1.0000000000000001e-165  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1204  hypothetical protein  62.3 
 
 		 525 aa  584  1.0000000000000001e-165  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1931  hypothetical protein  62.3 
 
 		 525 aa  584  1.0000000000000001e-165  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.904611  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3374  hypothetical protein  62.3 
 
 		 521 aa  583  1.0000000000000001e-165  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5209  hypothetical protein  59.5 
 
 		 540 aa  579  1e-164  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.356256 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2140  hypothetical protein  62.3 
 
 		 521 aa  580  1e-164  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0423999  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2336  hypothetical protein  62.1 
 
 		 521 aa  581  1e-164  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1366  hypothetical protein  59.07 
 
 		 522 aa  574  1.0000000000000001e-162  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.389221  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4038  hypothetical protein  58.84 
 
 		 499 aa  563  1.0000000000000001e-159  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2581  hypothetical protein  55.79 
 
 		 496 aa  560  1e-158  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0720636 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1768  hypothetical protein  59.15 
 
 		 507 aa  560  1e-158  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0126151 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2947  hypothetical protein  58.17 
 
 		 498 aa  546  1e-154  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.497677  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1842  hypothetical protein  57.73 
 
 		 503 aa  545  1e-153  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1836  hypothetical protein  55.93 
 
 		 497 aa  537  1e-151  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.421405 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1677  hypothetical protein  56.56 
 
 		 495 aa  528  1e-149  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2027  protein of unknown function UPF0061  57.64 
 
 		 495 aa  528  1e-148  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2935  protein of unknown function UPF0061  55.71 
 
 		 494 aa  521  1e-146  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.185797  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2395  hypothetical protein  54.39 
 
 		 496 aa  518  1.0000000000000001e-145  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.39187  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3302  hypothetical protein  54.13 
 
 		 510 aa  510  1e-143  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.232274 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1019  hypothetical protein  53.83 
 
 		 488 aa  508  9.999999999999999e-143  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00586805 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1800  hypothetical protein  54.95 
 
 		 476 aa  506  9.999999999999999e-143  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1192  protein of unknown function UPF0061  54.33 
 
 		 492 aa  504  1e-141  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0971  hypothetical protein  49.59 
 
 		 488 aa  504  1e-141  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.803854  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01411  hypothetical protein  48.51 
 
 		 489 aa  446  1.0000000000000001e-124  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5118  hypothetical protein  48.48 
 
 		 486 aa  447  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.380647  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0017  protein of unknown function UPF0061  49.6 
 
 		 500 aa  442  1e-123  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.394227  normal  0.227022 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5068  hypothetical protein  46.35 
 
 		 540 aa  439  9.999999999999999e-123  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1924  hypothetical protein  48.19 
 
 		 478 aa  439  9.999999999999999e-123  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0996685  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0398  hypothetical protein  48.08 
 
 		 486 aa  439  9.999999999999999e-123  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004051  UPF0061 domain-containing protein  48.07 
 
 		 489 aa  437  1e-121  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.243743  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4941  hypothetical protein  47.68 
 
 		 486 aa  438  1e-121  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01675  hypothetical protein  47.78 
 
 		 478 aa  435  1e-120  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0763449  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1936  protein of unknown function UPF0061  47.98 
 
 		 478 aa  434  1e-120  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1910  hypothetical protein  48.19 
 
 		 478 aa  435  1e-120  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1484  hypothetical protein  47.98 
 
 		 478 aa  435  1e-120  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2463  hypothetical protein  48.79 
 
 		 483 aa  434  1e-120  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.560083  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01664  hypothetical protein  47.78 
 
 		 478 aa  435  1e-120  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.049992  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1925  hypothetical protein  47.98 
 
 		 478 aa  434  1e-120  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.369744 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1786  hypothetical protein  47.98 
 
 		 478 aa  435  1e-120  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0585  hypothetical protein  47.47 
 
 		 504 aa  432  1e-119  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.473998  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1734  hypothetical protein  48.37 
 
 		 483 aa  430  1e-119  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1840  hypothetical protein  48.37 
 
 		 487 aa  429  1e-119  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2424  hypothetical protein  47.58 
 
 		 478 aa  431  1e-119  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2569  hypothetical protein  47.26 
 
 		 484 aa  430  1e-119  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.000577129  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2576  hypothetical protein  47.26 
 
 		 484 aa  430  1e-119  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00357647  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2583  hypothetical protein  47.26 
 
 		 484 aa  430  1e-119  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.109639  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2765  hypothetical protein  48.88 
 
 		 483 aa  427  1e-118  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.862973  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1736  hypothetical protein  47.38 
 
 		 480 aa  427  1e-118  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.106684 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1456  hypothetical protein  48.3 
 
 		 480 aa  424  1e-117  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2210  hypothetical protein  45.84 
 
 		 485 aa  422  1e-117  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0842577  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2000  hypothetical protein  48.3 
 
 		 480 aa  424  1e-117  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.407713 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2164  hypothetical protein  47.68 
 
 		 480 aa  422  1e-117  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.649385  normal  0.541556 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1828  hypothetical protein  48.1 
 
 		 480 aa  422  1e-117  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0558  hypothetical protein  46.67 
 
 		 487 aa  419  1e-116  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000359024 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1474  hypothetical protein  47.9 
 
 		 480 aa  420  1e-116  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1440  hypothetical protein  47.79 
 
 		 480 aa  421  1e-116  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0641647 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1659  hypothetical protein  45.66 
 
 		 483 aa  421  1e-116  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1520  hypothetical protein  47.8 
 
 		 508 aa  417  9.999999999999999e-116  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66410  hypothetical protein  46.76 
 
 		 486 aa  415  1e-114  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45110  hypothetical protein  47.49 
 
 		 487 aa  411  1e-113  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0479071  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0262  hypothetical protein  45.36 
 
 		 484 aa  412  1e-113  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0540554  normal  0.0168688 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5760  hypothetical protein  47.17 
 
 		 486 aa  410  1e-113  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0494  hypothetical protein  45.77 
 
 		 487 aa  404  1e-111  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0444  hypothetical protein  47.58 
 
 		 487 aa  405  1e-111  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.734273  normal  0.98827 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1631  hypothetical protein  45.62 
 
 		 483 aa  404  1e-111  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5028  hypothetical protein  45.36 
 
 		 487 aa  400  9.999999999999999e-111  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3645  hypothetical protein  45.4 
 
 		 484 aa  397  1e-109  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.348897  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3961  protein of unknown function UPF0061  45.36 
 
 		 484 aa  392  1e-108  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0330  hypothetical protein  45.11 
 
 		 484 aa  395  1e-108  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3659  hypothetical protein  45.56 
 
 		 484 aa  395  1e-108  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.269088  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0299  hypothetical protein  45.2 
 
 		 484 aa  394  1e-108  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.281657  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4038  hypothetical protein  45.36 
 
 		 484 aa  393  1e-108  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4063  hypothetical protein  45.16 
 
 		 484 aa  392  1e-108  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.145391  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2793  hypothetical protein  42.97 
 
 		 522 aa  390  1e-107  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.458547  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4156  hypothetical protein  44.96 
 
 		 484 aa  389  1e-107  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.246643  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3841  hypothetical protein  45 
 
 		 484 aa  392  1e-107  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.261021  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1589  hypothetical protein  43.26 
 
 		 521 aa  390  1e-107  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.510421  normal  0.752048 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4892  hypothetical protein  45.75 
 
 		 491 aa  391  1e-107  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.856599  hitchhiker  0.00960553 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0308  hypothetical protein  44.06 
 
 		 483 aa  386  1e-106  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0254223  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1045  hypothetical protein  43.72 
 
 		 494 aa  382  1e-105  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0432954 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5348  hypothetical protein  43.98 
 
 		 497 aa  376  1e-103  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4863  hypothetical protein  43.98 
 
 		 497 aa  376  1e-103  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0407  hypothetical protein  43 
 
 		 493 aa  377  1e-103  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2495  hypothetical protein  43.52 
 
 		 492 aa  374  1e-102  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.469671  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2948  hypothetical protein  43.93 
 
 		 492 aa  375  1e-102  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>