More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_1842 on replicon NC_007973
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007973  Rmet_1842  twin-arginine translocation pathway signal  100 
 
 
327 aa  672    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00400007  normal  0.117909 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1420  twin-arginine translocation pathway signal  88.69 
 
 
327 aa  582  1.0000000000000001e-165  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  decreased coverage  0.00102429  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0005  hypothetical protein  75.08 
 
 
323 aa  503  1e-141  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.736537 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0023  hypothetical protein  75.08 
 
 
323 aa  502  1e-141  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.908143  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4137  hypothetical protein  61.54 
 
 
326 aa  410  1e-113  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.864349 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4691  hypothetical protein  60.92 
 
 
324 aa  409  1e-113  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.23954  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4068  hypothetical protein  63.14 
 
 
315 aa  404  1e-111  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1404  hypothetical protein  48.45 
 
 
328 aa  321  9.999999999999999e-87  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3575  hypothetical protein  43.3 
 
 
336 aa  293  2e-78  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.106202 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1801  hypothetical protein  47.51 
 
 
331 aa  292  5e-78  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000114766 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3035  hypothetical protein  45.64 
 
 
338 aa  289  6e-77  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.208714  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5204  hypothetical protein  47.42 
 
 
335 aa  288  1e-76  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  decreased coverage  0.00787806  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2083  hypothetical protein  42.55 
 
 
332 aa  281  9e-75  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.280461  normal  0.301608 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0720  hypothetical protein  42.77 
 
 
377 aa  279  4e-74  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.49556  normal  0.409913 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2348  hypothetical protein  40.5 
 
 
331 aa  277  1e-73  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3813  extra-cytoplasmic solute receptor  44.37 
 
 
325 aa  271  1e-71  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1719  hypothetical protein  44.1 
 
 
327 aa  269  5.9999999999999995e-71  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0287751  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3513  hypothetical protein  43.21 
 
 
333 aa  260  2e-68  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1436  hypothetical protein  41.49 
 
 
318 aa  257  2e-67  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.779932  normal  0.517463 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1953  hypothetical protein  39.32 
 
 
331 aa  251  1e-65  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4279  hypothetical protein  40.27 
 
 
339 aa  248  1e-64  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.557506  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4263  hypothetical protein  37.79 
 
 
324 aa  243  3.9999999999999997e-63  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5765  hypothetical protein  42.18 
 
 
326 aa  238  9e-62  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2212  hypothetical protein  35.98 
 
 
383 aa  236  4e-61  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0366732  normal  0.76249 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2123  hypothetical protein  38.01 
 
 
326 aa  205  7e-52  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0729826  normal  0.176092 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5382  extra-cytoplasmic solute receptor  36.89 
 
 
331 aa  204  1e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.203559  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3359  hypothetical protein  41.57 
 
 
331 aa  197  2.0000000000000003e-49  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5894  extra-cytoplasmic solute receptor  38.34 
 
 
358 aa  197  2.0000000000000003e-49  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3983  extra-cytoplasmic solute receptor  40.74 
 
 
328 aa  196  3e-49  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0104878 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1164  hypothetical protein  35.37 
 
 
332 aa  196  6e-49  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0784  hypothetical protein  39.19 
 
 
328 aa  194  1e-48  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6283  hypothetical protein  37.14 
 
 
321 aa  193  3e-48  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.120039  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2596  hypothetical protein  37.92 
 
 
327 aa  193  4e-48  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.523201  normal  0.428813 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0855  hypothetical protein  38.46 
 
 
353 aa  192  9e-48  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.898803 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0744  hypothetical protein  37.42 
 
 
325 aa  191  1e-47  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.61051  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4779  hypothetical protein  35.17 
 
 
324 aa  191  2e-47  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3546  hypothetical protein  37.67 
 
 
330 aa  190  2e-47  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0909589  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5327  hypothetical protein  38.13 
 
 
322 aa  189  5e-47  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4853  extra-cytoplasmic solute receptor  35.6 
 
 
314 aa  189  5.999999999999999e-47  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0565268  normal  0.206495 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4624  hypothetical protein  38.63 
 
 
327 aa  188  1e-46  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5438  hypothetical protein  37.93 
 
 
326 aa  187  2e-46  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2869  hypothetical protein  37.54 
 
 
330 aa  187  3e-46  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0869  hypothetical protein  35.69 
 
 
339 aa  187  3e-46  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2507  hypothetical protein  37.89 
 
 
336 aa  186  4e-46  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1128  hypothetical protein  33.94 
 
 
324 aa  186  7e-46  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.794936  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1818  hypothetical protein  37.41 
 
 
326 aa  185  9e-46  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00429449 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3664  hypothetical protein  36.24 
 
 
324 aa  185  1.0000000000000001e-45  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3508  hypothetical protein  38.38 
 
 
320 aa  185  1.0000000000000001e-45  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.231435 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2903  hypothetical protein  35.26 
 
 
327 aa  184  2.0000000000000003e-45  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.900443  normal  0.012055 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4609  extra-cytoplasmic solute receptor  38.01 
 
 
328 aa  184  2.0000000000000003e-45  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.636278 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2597  hypothetical protein  37.12 
 
 
331 aa  184  2.0000000000000003e-45  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0909173  normal  0.221055 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2776  hypothetical protein  35.15 
 
 
332 aa  184  2.0000000000000003e-45  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.918758  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1635  hypothetical protein  35.76 
 
 
333 aa  184  2.0000000000000003e-45  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.345549  normal  0.902401 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1815  hypothetical protein  38.44 
 
 
325 aa  184  2.0000000000000003e-45  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00540737  normal  0.0160042 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0179  hypothetical protein  35.78 
 
 
328 aa  184  3e-45  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.303741 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0060  hypothetical protein  37.41 
 
 
322 aa  183  3e-45  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5733  hypothetical protein  36.3 
 
 
341 aa  182  6e-45  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.558781 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1717  hypothetical protein  35.24 
 
 
330 aa  182  6e-45  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.169515  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4821  hypothetical protein  35.14 
 
 
330 aa  182  8.000000000000001e-45  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0842  hypothetical protein  36.13 
 
 
325 aa  182  8.000000000000001e-45  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4513  hypothetical protein  37.5 
 
 
338 aa  182  9.000000000000001e-45  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0122346  normal  0.691436 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4419  hypothetical protein  34.35 
 
 
321 aa  182  1e-44  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4415  extra-cytoplasmic solute receptor  38.69 
 
 
320 aa  181  1e-44  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.597884  normal  0.464948 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4109  extra-cytoplasmic solute receptor  37.06 
 
 
334 aa  181  2e-44  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.305056  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1033  hypothetical protein  37.29 
 
 
325 aa  181  2e-44  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.829997  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5370  extra-cytoplasmic solute receptor  37.3 
 
 
322 aa  180  2e-44  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.114035  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5801  hypothetical protein  34.9 
 
 
330 aa  180  2.9999999999999997e-44  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.744071  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2127  hypothetical protein  36.02 
 
 
332 aa  179  4e-44  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00713348 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4354  hypothetical protein  34.57 
 
 
327 aa  180  4e-44  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.110423  normal  0.165755 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0779  hypothetical protein  38.41 
 
 
335 aa  179  4e-44  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0710  hypothetical protein  36.5 
 
 
328 aa  180  4e-44  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3792  extra-cytoplasmic solute receptor  36.83 
 
 
326 aa  178  9e-44  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0579  hypothetical protein  36.08 
 
 
322 aa  178  1e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.444417  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5472  hypothetical protein  41.18 
 
 
330 aa  178  1e-43  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5146  hypothetical protein  35.76 
 
 
327 aa  178  1e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0987531  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4271  hypothetical protein  35.81 
 
 
339 aa  178  1e-43  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4314  hypothetical protein  36.42 
 
 
322 aa  178  1e-43  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.210006  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0823  hypothetical protein  34.73 
 
 
325 aa  178  1e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0213458 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1019  hypothetical protein  37.06 
 
 
334 aa  178  1e-43  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.100584  normal  0.433272 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5551  extra-cytoplasmatic solute receptor  35.89 
 
 
322 aa  177  2e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4422  hypothetical protein  36.62 
 
 
352 aa  177  2e-43  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.386029  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1370  hypothetical protein  36.95 
 
 
338 aa  177  2e-43  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4073  extra-cytoplasmic solute receptor  34.78 
 
 
332 aa  177  2e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000509768  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3798  hypothetical protein  35.91 
 
 
326 aa  177  3e-43  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.226331  normal  0.673423 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1548  hypothetical protein  36.04 
 
 
332 aa  177  3e-43  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4625  hypothetical protein  37.54 
 
 
327 aa  176  4e-43  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5221  Bug family extra-cytoplasmic solute receptor  36.21 
 
 
347 aa  176  4e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.334182 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4213  extra-cytoplasmic solute receptor  34.81 
 
 
326 aa  176  4e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4458  hypothetical protein  34.44 
 
 
332 aa  176  5e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.60746  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0982  hypothetical protein  35.95 
 
 
326 aa  176  6e-43  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0309  twin-arginine translocation pathway signal  36.02 
 
 
328 aa  176  6e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0125  hypothetical protein  36.7 
 
 
332 aa  176  6e-43  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.232724  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3745  hypothetical protein  35.28 
 
 
330 aa  176  6e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0812255  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4047  extra-cytoplasmic solute receptor  35.31 
 
 
329 aa  175  7e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0364236  normal  0.64466 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4645  extra-cytoplasmic solute receptor  33.65 
 
 
348 aa  175  7e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.176289  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3966  hypothetical protein  36.14 
 
 
356 aa  176  7e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0682449  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4644  hypothetical protein  36.94 
 
 
321 aa  175  8e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.206487  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2117  hypothetical protein  37.29 
 
 
327 aa  175  8e-43  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.299705  normal  0.290671 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4673  hypothetical protein  38.77 
 
 
344 aa  175  9e-43  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1913  hypothetical protein  34.44 
 
 
333 aa  174  9.999999999999999e-43  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0165718  hitchhiker  0.00808178 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>