121 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_1780 on replicon NC_007973
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007973  Rmet_1780  methyltransferase type 11  100 
 
 		 198 aa  396  1e-109  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.0020102  normal  0.965795 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5472  hypothetical protein  48.73 
 
 		 212 aa  172  1.9999999999999998e-42  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.221639  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0872  methyltransferase type 12  50 
 
 		 214 aa  173  1.9999999999999998e-42  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.140268  normal  0.160573 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1722  methyltransferase type 12  44.85 
 
 		 575 aa  149  2e-35  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0792321 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1909  methyltransferase type 11  41.54 
 
 		 560 aa  144  1e-33  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2356  methyltransferase type 12  42.79 
 
 		 226 aa  142  4e-33  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0212873  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2105  Methyltransferase type 12  42.79 
 
 		 226 aa  142  4e-33  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0497297  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2119  methyltransferase type 12  42.79 
 
 		 226 aa  142  5e-33  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.908555  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2240  methyltransferase type 12  42.79 
 
 		 226 aa  141  5e-33  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.39948  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3129  methyltransferase type 11  35.9 
 
 		 201 aa  133  1.9999999999999998e-30  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0588283  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2925  methyltransferase type 11  38.35 
 
 		 585 aa  130  2.0000000000000002e-29  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00128  Methyltransferase type 11  38.71 
 
 		 202 aa  121  7e-27  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.000851543  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4103  methyltransferase type 12  36.19 
 
 		 586 aa  119  3.9999999999999996e-26  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2004  methyltransferase type 11  39.27 
 
 		 236 aa  119  3.9999999999999996e-26  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.388226  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01393  hypothetical protein  38.89 
 
 		 535 aa  118  4.9999999999999996e-26  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2265  methyltransferase type 12  37.44 
 
 		 228 aa  118  4.9999999999999996e-26  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0736  tellurite resistance protein TehB  31.98 
 
 		 208 aa  117  9.999999999999999e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.304393  normal  0.132387 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004080  hypothetical protein  38.31 
 
 		 522 aa  105  3e-22  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0933  methyltransferase type 12  27.86 
 
 		 208 aa  66.2  0.0000000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.275777  hitchhiker  0.00155248 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1792  methyltransferase type 11  37.5 
 
 		 202 aa  64.3  0.000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.980769  normal  0.955485 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3257  Methyltransferase type 11  28.75 
 
 		 551 aa  56.6  0.0000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.708921  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2192  methyltransferase type 11  33.65 
 
 		 279 aa  53.9  0.000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0393  methyltransferase protein  27.82 
 
 		 246 aa  53.5  0.000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1306  Methyltransferase type 11  46.55 
 
 		 223 aa  52.8  0.000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2477  Methyltransferase type 11  28.15 
 
 		 213 aa  51.2  0.00001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_03040  methyltransferase family protein  25.12 
 
 		 202 aa  50.4  0.00002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0938  SAM-dependent methyltransferases  35.85 
 
 		 201 aa  50.1  0.00002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4319  methyltransferase type 11  31.97 
 
 		 246 aa  50.1  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0915  Methyltransferase type 12  34.91 
 
 		 222 aa  49.7  0.00003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1186  methyltransferase type 11  43.08 
 
 		 262 aa  48.9  0.00005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.315285  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4053  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase UbiE  30.77 
 
 		 207 aa  48.9  0.00005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3491  methyltransferase type 11  31.65 
 
 		 364 aa  48.9  0.00005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3562  Methyltransferase type 11  29.75 
 
 		 200 aa  48.5  0.00006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.50395 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2524  methyltransferase type 12  23.19 
 
 		 195 aa  48.5  0.00006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.347392  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1093  methyltransferase  34.91 
 
 		 201 aa  48.5  0.00007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.280373  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2262  hypothetical protein  34.91 
 
 		 201 aa  48.1  0.00008  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.363838  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0559  hypothetical protein  34.91 
 
 		 201 aa  48.1  0.00008  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0942  hypothetical protein  34.91 
 
 		 201 aa  48.1  0.00008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2139  hypothetical protein  34.91 
 
 		 201 aa  48.1  0.00008  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1407  methyltransferase type 11  21.43 
 
 		 196 aa  47.8  0.00009  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1544  Methyltransferase type 11  22.39 
 
 		 200 aa  47.8  0.0001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.580406  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1267  methyltransferase type 12  63.16 
 
 		 350 aa  47.4  0.0001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.628172 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4108  hypothetical protein  29.46 
 
 		 212 aa  46.6  0.0002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.404315  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4119  hypothetical protein  29.46 
 
 		 212 aa  46.6  0.0002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0995588  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2548  thiopurine S-methyltransferase  28.06 
 
 		 213 aa  47  0.0002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.997429  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0178  methyltransferase type 11  29.52 
 
 		 265 aa  46.6  0.0002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1068  Methyltransferase type 12  28.57 
 
 		 222 aa  46.2  0.0003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0641  smtA protein  43.4 
 
 		 249 aa  46.2  0.0003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35300  hypothetical protein  30.7 
 
 		 218 aa  46.2  0.0003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1519  Methyltransferase type 11  27.87 
 
 		 274 aa  46.6  0.0003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.799591 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0233  hypothetical protein  28.18 
 
 		 209 aa  45.8  0.0004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.385291  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0750  hypothetical protein  29.82 
 
 		 201 aa  45.8  0.0004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0087  SAM-dependent methyltransferase  29.92 
 
 		 246 aa  45.8  0.0004  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4586  methyltransferase type 12  45.28 
 
 		 249 aa  45.8  0.0004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.545494  normal  0.0935438 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0578  methyltransferase, putative  35.16 
 
 		 249 aa  45.4  0.0005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.612846 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0486  hypothetical protein  28.18 
 
 		 208 aa  45.4  0.0005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0907  Methyltransferase type 11  30.23 
 
 		 220 aa  45.4  0.0005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0617  methyltransferase type 11  35.16 
 
 		 249 aa  45.4  0.0005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0514794  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1053  hypothetical protein  23.42 
 
 		 192 aa  45.4  0.0005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.19261  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0145  thiopurine S-methyltransferase  28.57 
 
 		 210 aa  45.4  0.0006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.285436  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1418  putative methyltransferase  27.5 
 
 		 259 aa  45.4  0.0006  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.282901  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0476  putative methyltransferase  30.68 
 
 		 253 aa  45.1  0.0007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.626019  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1507  tellurite resistance protein TehB  31.68 
 
 		 292 aa  45.1  0.0007  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0318008  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4271  hypothetical protein  28.68 
 
 		 212 aa  45.1  0.0008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.208511  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4603  hypothetical protein  28.68 
 
 		 212 aa  45.1  0.0008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.964338  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1752  putative methyltransferase  36.21 
 
 		 253 aa  45.1  0.0008  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.610135  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0587  Methyltransferase type 11  30.19 
 
 		 220 aa  44.7  0.0008  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4508  hypothetical protein  28.68 
 
 		 212 aa  45.1  0.0008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000692373  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4494  hypothetical protein  28.68 
 
 		 212 aa  45.1  0.0008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.605831  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4455  hypothetical protein  28.68 
 
 		 212 aa  45.1  0.0008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.821165 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4457  hypothetical protein  28.68 
 
 		 212 aa  44.7  0.0009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.643189  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4222  methyltransferase type 11  28.68 
 
 		 212 aa  44.7  0.0009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3267  hypothetical protein  27.84 
 
 		 303 aa  44.3  0.001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0740  smtA protein  39.62 
 
 		 221 aa  44.3  0.001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.867796  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0633  methyltransferase, putative  32.14 
 
 		 249 aa  44.3  0.001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0489  methyltransferase type 12  33.96 
 
 		 197 aa  44.7  0.001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.178372 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1187  tellurite resistance related protein  26.4 
 
 		 214 aa  44.7  0.001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.954275  normal  1 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0182  tellurite resistance related protein  26.4 
 
 		 214 aa  44.7  0.001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0041705 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0440  methyltransferase type 12  30.43 
 
 		 284 aa  44.3  0.001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.000034912  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5088  methyltransferase type 12  55.81 
 
 		 348 aa  44.7  0.001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.115261  normal  0.362219 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1394  methyltransferase type 11  34.92 
 
 		 248 aa  43.9  0.001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07260  SAM dependent methyltransferase  40.98 
 
 		 252 aa  43.9  0.001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1440  methyltransferase type 11  34.92 
 
 		 248 aa  43.9  0.001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1631  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  31.58 
 
 		 246 aa  44.3  0.001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3271  Methyltransferase type 12  40.95 
 
 		 238 aa  43.9  0.001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.128592 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3306  Methyltransferase type 12  30.77 
 
 		 196 aa  44.3  0.001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0246311 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0257  Methyltransferase type 11  25.78 
 
 		 208 aa  44.3  0.001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00403327 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_9984  predicted protein  28.47 
 
 		 249 aa  43.9  0.001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0507609  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0742  hypothetical protein  27.91 
 
 		 212 aa  44.3  0.001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2959  Methyltransferase type 12  29.81 
 
 		 196 aa  43.5  0.002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0135677 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3026  hypothetical protein  27.7 
 
 		 196 aa  43.9  0.002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.000455995  normal  0.015635 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1156  methyltransferase  33.86 
 
 		 355 aa  43.5  0.002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0402  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  27.45 
 
 		 239 aa  43.5  0.002  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.272999  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3203  methyltransferase type 12  31.01 
 
 		 198 aa  43.5  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15760  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  33.96 
 
 		 232 aa  43.1  0.002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0260  Methyltransferase type 11  24.84 
 
 		 267 aa  43.5  0.002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00488037  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0757  methyltransferase type 11  35.71 
 
 		 201 aa  43.5  0.002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.137769  normal  0.156895 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0623  methyltransferase type 12  43.4 
 
 		 249 aa  43.5  0.002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00766953 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1784  Methyltransferase type 11  29.25 
 
 		 214 aa  43.5  0.002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0925  Methyltransferase type 11  27.97 
 
 		 222 aa  43.9  0.002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>