259 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_1772 on replicon NC_007973
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007973  Rmet_1772  GCN5-related N-acetyltransferase  100 
 
 
188 aa  383  1e-106  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0639273  normal  0.595385 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3997  GCN5-related N-acetyltransferase  55.11 
 
 
193 aa  194  7e-49  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0143681  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2041  CoA-binding domain protein  37.42 
 
 
895 aa  112  2.0000000000000002e-24  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.171993  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4246  GCN5-related N-acetyltransferase  37.21 
 
 
904 aa  105  5e-22  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1862  CoA-binding domain protein  37.82 
 
 
900 aa  104  6e-22  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.167225  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3063  acetyltransferase  39.22 
 
 
897 aa  104  9e-22  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0639  GCN5-related N-acetyltransferase  38.92 
 
 
810 aa  103  1e-21  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00627705 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2718  GCN5-related N-acetyltransferase:CoA-binding  36.05 
 
 
905 aa  100  9e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.0140591 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2710  GCN5-related N-acetyltransferase  40.13 
 
 
175 aa  100  1e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.297237  hitchhiker  0.000129512 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1676  GCN5-related N-acetyltransferase  39.75 
 
 
889 aa  99.4  3e-20  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1501  CoA-binding domain protein  36.71 
 
 
886 aa  98.6  4e-20  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.137638  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2024  long-chain fatty-acid-CoA ligase  35.76 
 
 
892 aa  97.8  7e-20  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3232  acetyltransferase  33.51 
 
 
189 aa  97.1  1e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2463  GCN5-related N-acetyltransferase  32.45 
 
 
189 aa  97.1  2e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0279306  normal  0.590012 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2819  GCN5-related N-acetyltransferase  32.75 
 
 
897 aa  95.9  3e-19  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.869939 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2023  GCN5-related N-acetyltransferase  34.73 
 
 
908 aa  94  1e-18  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0872701  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1832  GCN5-related N-acetyltransferase  34.73 
 
 
901 aa  94  1e-18  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.52555  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3026  GCN5-related N-acetyltransferase  32.45 
 
 
189 aa  92.4  4e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.150578  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2420  acetyltransferase  32.72 
 
 
892 aa  91.7  6e-18  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.773408  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3962  GCN5-related N-acetyltransferase  35.88 
 
 
192 aa  89  4e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  hitchhiker  0.00434349  normal  0.0285152 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3848  GCN5-related N-acetyltransferase  35.88 
 
 
192 aa  89  4e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.0000121275  normal  0.760581 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2352  GCN5-related N-acetyltransferase  32.75 
 
 
892 aa  88.6  5e-17  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2530  GCN5-related N-acetyltransferase  32.9 
 
 
896 aa  88.2  6e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0056  GCN5-related N-acetyltransferase  32.14 
 
 
896 aa  87.8  7e-17  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.145927 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3341  GCN5-related N-acetyltransferase  37.8 
 
 
187 aa  87  1e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1742  GCN5-related N-acetyltransferase  34.13 
 
 
903 aa  87.4  1e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1011  acyl-CoA synthetase (ADP forming)  31.55 
 
 
918 aa  86.7  2e-16  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.415353  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1436  GCN5-related N-acetyltransferase  29.75 
 
 
179 aa  85.1  5e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.068223 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3343  GCN5-related N-acetyltransferase  31.36 
 
 
880 aa  84.3  9e-16  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0598594  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6906  GCN5-related N-acetyltransferase  32.7 
 
 
175 aa  84.3  9e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3206  putative acyl-CoA synthetase  31.36 
 
 
880 aa  84.3  0.000000000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3164  GCN5-related N-acetyltransferase  33.54 
 
 
812 aa  84  0.000000000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3465  putative acyl-CoA synthetase  31.36 
 
 
880 aa  84.3  0.000000000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.063853  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04744  N-acetyltransferase family protein  32.53 
 
 
180 aa  84  0.000000000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02478  fused predicted acyl-CoA synthetase: NAD(P)-binding subunit/ATP-binding subunit  31.13 
 
 
886 aa  83.2  0.000000000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1084  GCN5-related N-acetyltransferase  31.13 
 
 
886 aa  83.2  0.000000000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3821  acetyltransferase, GNAT family protein  31.13 
 
 
886 aa  83.2  0.000000000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.126569  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2871  CoA-binding domain/acetyltransferase domain-containing protein  31.13 
 
 
886 aa  82.8  0.000000000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.288181  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3748  GCN5-related N-acetyltransferase  31.79 
 
 
882 aa  82.8  0.000000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0223555  normal  0.236384 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2737  CoA-binding domain/acetyltransferase domain-containing protein  31.13 
 
 
886 aa  83.2  0.000000000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.028573  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2952  acetyltransferase, GNAT family protein  31.13 
 
 
886 aa  83.2  0.000000000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.487518  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02442  hypothetical protein  31.13 
 
 
886 aa  83.2  0.000000000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2741  CoA-binding domain/acetyltransferase domain-containing protein  31.13 
 
 
886 aa  83.2  0.000000000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.225885  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1093  GCN5-related N-acetyltransferase  31.13 
 
 
886 aa  83.2  0.000000000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.312736  normal  0.038329 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3337  GCN5-related N-acetyltransferase  32 
 
 
882 aa  82.8  0.000000000000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1570  GCN5-related N-acetyltransferase  35.44 
 
 
177 aa  82.4  0.000000000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.763005 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2039  GCN5-related N-acetyltransferase  28.57 
 
 
900 aa  82.8  0.000000000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.583899  normal  0.0195221 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1513  putative acetyl-CoA synthetase  32.75 
 
 
892 aa  82  0.000000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.417267  normal  0.191357 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0556  GCN5-related N-acetyltransferase  30.52 
 
 
177 aa  82.4  0.000000000000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000991626 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02893  acetyltransferase, gnat family  30.65 
 
 
902 aa  82  0.000000000000005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0540  GCN5-related N-acetyltransferase  32.14 
 
 
895 aa  81.6  0.000000000000006  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72260  hypothetical protein  35.48 
 
 
186 aa  81.6  0.000000000000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6272  hypothetical protein  35.48 
 
 
186 aa  81.6  0.000000000000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2867  CoA binding domain/acetyltransferase domain-containing protein  30.67 
 
 
886 aa  80.5  0.00000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0837  GCN5-related N-acetyltransferase  28.28 
 
 
176 aa  80.9  0.00000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00901347  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2979  CoA-binding domain/acetyltransferase domain-containing protein  30.67 
 
 
886 aa  80.5  0.00000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2761  CoA binding domain/acetyltransferase domain protein  30.67 
 
 
886 aa  80.9  0.00000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.282153  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2863  CoA binding domain/acetyltransferase domain protein  30.67 
 
 
886 aa  80.9  0.00000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2271  GCN5-related N-acetyltransferase  34.03 
 
 
178 aa  80.9  0.00000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2845  CoA binding domain/acetyltransferase domain protein  30.67 
 
 
886 aa  80.5  0.00000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3289  acetyltransferase  34.55 
 
 
182 aa  79.7  0.00000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.252345  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3069  GCN5-related N-acetyltransferase  29.65 
 
 
887 aa  80.1  0.00000000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.835722  hitchhiker  0.00746938 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1904  CoA-binding  33.15 
 
 
915 aa  79.7  0.00000000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3493  GCN5-related N-acetyltransferase  33.11 
 
 
882 aa  79  0.00000000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0975  GCN5-related N-acetyltransferase  31.06 
 
 
517 aa  79.3  0.00000000000003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.021927  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4857  GCN5-related N-acetyltransferase  32.74 
 
 
201 aa  79  0.00000000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1477  GCN5-related N-acetyltransferase  30.46 
 
 
896 aa  79  0.00000000000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.630899  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000156  protein acetyltransferase  32.19 
 
 
877 aa  79  0.00000000000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.775567  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2589  CoA-binding domain-containing protein  32.92 
 
 
918 aa  78.2  0.00000000000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.121473 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1092  GCN5-related N-acetyltransferase  31.03 
 
 
893 aa  78.2  0.00000000000006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.20314  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3911  GCN5-related N-acetyltransferase  32.42 
 
 
891 aa  78.2  0.00000000000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.680583  normal  0.356909 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4638  CoA-binding domain protein  32.52 
 
 
907 aa  77.8  0.00000000000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.349562  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05787  hypothetical protein  32.88 
 
 
877 aa  77.4  0.0000000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0885  GCN5-related N-acetyltransferase  30.54 
 
 
887 aa  77.4  0.0000000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3902  GCN5-related N-acetyltransferase  28.07 
 
 
906 aa  77.4  0.0000000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.835064  normal  0.701113 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4289  GCN5-related N-acetyltransferase  32.89 
 
 
807 aa  77  0.0000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2469  GCN5-related N-acetyltransferase  33.33 
 
 
182 aa  75.5  0.0000000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.298594  normal  0.469762 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4815  GCN5-related N-acetyltransferase  28.73 
 
 
201 aa  75.1  0.0000000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.342854  normal  0.884231 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4719  GCN5-related N-acetyltransferase  30.51 
 
 
907 aa  75.1  0.0000000000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.345229  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2087  GCN5-related N-acetyltransferase  31.79 
 
 
187 aa  75.5  0.0000000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.738524  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0400  GCN5-related N-acetyltransferase  31.01 
 
 
898 aa  75.5  0.0000000000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.249053  normal  0.200769 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7135  hypothetical protein  31.97 
 
 
183 aa  75.1  0.0000000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.12543  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0852  GCN5-related N-acetyltransferase  29.65 
 
 
888 aa  74.7  0.0000000000007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.121285  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1928  CoA-binding domain-containing protein  32.24 
 
 
900 aa  74.7  0.0000000000007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.517585  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5238  GCN5-related N-acetyltransferase  31.79 
 
 
900 aa  73.2  0.000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.365104 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3208  acetyltransferase  32.08 
 
 
911 aa  73.2  0.000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1205  CoA-binding  30.86 
 
 
903 aa  73.6  0.000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.370285  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5313  GCN5-related N-acetyltransferase  32.45 
 
 
900 aa  73.2  0.000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.653204  normal  0.891732 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4771  GCN5-related N-acetyltransferase  31.79 
 
 
900 aa  72.8  0.000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2324  GCN5-related N-acetyltransferase  30.99 
 
 
898 aa  73.2  0.000000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0517  hypothetical protein  28.03 
 
 
893 aa  73.2  0.000000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2078  GCN5-related N-acetyltransferase  31.61 
 
 
896 aa  73.2  0.000000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0450979  normal  0.503964 
 
 
-
 
NC_003296  RS05540  hypothetical protein  35.15 
 
 
199 aa  72.4  0.000000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.00436113  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1202  GCN5-related N-acetyltransferase  31.58 
 
 
181 aa  72.8  0.000000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.142014 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1548  CoA-binding domain protein  36.09 
 
 
899 aa  72.8  0.000000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.25767  normal  0.134976 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1718  CoA-binding domain protein  29.3 
 
 
901 aa  71.6  0.000000000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2102  GCN5-related N-acetyltransferase  28.88 
 
 
194 aa  71.6  0.000000000006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0909168  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1351  GCN5-related N-acetyltransferase  31.41 
 
 
907 aa  71.2  0.000000000008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7067  Acyl-CoA synthetase (NDP forming)-like protein  32.07 
 
 
881 aa  71.2  0.000000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1694  GCN5-related N-acetyltransferase  34.15 
 
 
926 aa  71.2  0.000000000009  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.133796  normal  0.55865 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>