More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_1755 on replicon NC_007973
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007973  Rmet_1755  twin-arginine translocation pathway signal  100 
 
 		 332 aa  665    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0203925 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0061  hypothetical protein  64.85 
 
 		 333 aa  449  1e-125  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4308  hypothetical protein  57.67 
 
 		 343 aa  367  1e-100  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.41466 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1400  hypothetical protein  55.56 
 
 		 337 aa  366  1e-100  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3733  hypothetical protein  55.08 
 
 		 331 aa  354  1e-96  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3014  hypothetical protein  55.08 
 
 		 331 aa  354  1e-96  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3875  hypothetical protein  55.37 
 
 		 325 aa  323  3e-87  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.229403  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2584  hypothetical protein  47.08 
 
 		 337 aa  311  1e-83  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0899321  normal  0.923305 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0838  hypothetical protein  51.01 
 
 		 332 aa  310  2e-83  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  decreased coverage  0.0037307  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3886  hypothetical protein  41.96 
 
 		 351 aa  279  4e-74  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.576729  normal  0.153424 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3801  extra-cytoplasmic solute receptor  39.2 
 
 		 330 aa  244  1.9999999999999999e-63  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.828068  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4821  hypothetical protein  40.53 
 
 		 330 aa  234  1.0000000000000001e-60  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1041  hypothetical protein  40.27 
 
 		 327 aa  228  9e-59  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1121  hypothetical protein  40.27 
 
 		 325 aa  228  9e-59  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.237862  normal  0.618143 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3324  hypothetical protein  38.18 
 
 		 328 aa  227  2e-58  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  decreased coverage  0.0025587  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3974  hypothetical protein  38.18 
 
 		 328 aa  226  3e-58  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.406148 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0801  hypothetical protein  42.62 
 
 		 323 aa  222  4.9999999999999996e-57  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.618864  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4876  extra-cytoplasmic solute receptor  39.46 
 
 		 328 aa  222  6e-57  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.748926  normal  0.754985 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3949  hypothetical protein  37.04 
 
 		 339 aa  221  9.999999999999999e-57  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.187886  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5382  extra-cytoplasmic solute receptor  36.36 
 
 		 331 aa  220  3e-56  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.203559  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3178  hypothetical protein  36.56 
 
 		 328 aa  219  7e-56  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000137109 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0256  hypothetical protein  39.08 
 
 		 327 aa  218  1e-55  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4389  hypothetical protein  37.84 
 
 		 321 aa  218  2e-55  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.907682 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5112  hypothetical protein  37.34 
 
 		 325 aa  217  2e-55  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.386337  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0646  hypothetical protein  37.96 
 
 		 334 aa  216  5.9999999999999996e-55  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2776  hypothetical protein  38.04 
 
 		 332 aa  215  7e-55  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.918758  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2117  hypothetical protein  39.06 
 
 		 327 aa  215  9e-55  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.299705  normal  0.290671 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0596  hypothetical protein  38.84 
 
 		 336 aa  214  9.999999999999999e-55  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.642014  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3530  hypothetical protein  39.94 
 
 		 331 aa  214  1.9999999999999998e-54  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.175021  hitchhiker  0.00737093 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4214  hypothetical protein  39.8 
 
 		 324 aa  213  3.9999999999999995e-54  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0145  hypothetical protein  37.92 
 
 		 325 aa  213  4.9999999999999996e-54  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1691  hypothetical protein  38.13 
 
 		 331 aa  212  5.999999999999999e-54  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0127  hypothetical protein  37.92 
 
 		 325 aa  212  5.999999999999999e-54  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1026  hypothetical protein  37.74 
 
 		 333 aa  212  7e-54  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.346833  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0143  hypothetical protein  38.05 
 
 		 330 aa  211  1e-53  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.627963 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0161  hypothetical protein  38.05 
 
 		 330 aa  211  1e-53  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0797  hypothetical protein  39.22 
 
 		 386 aa  211  2e-53  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2648  hypothetical protein  37.46 
 
 		 336 aa  210  3e-53  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.43635  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3798  hypothetical protein  36.76 
 
 		 326 aa  209  4e-53  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.226331  normal  0.673423 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2997  hypothetical protein  37.95 
 
 		 343 aa  209  4e-53  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0266851  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0869  hypothetical protein  41.33 
 
 		 339 aa  209  5e-53  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4073  extra-cytoplasmic solute receptor  36.31 
 
 		 332 aa  208  8e-53  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000509768  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5932  hypothetical protein  38.05 
 
 		 328 aa  208  9e-53  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5589  hypothetical protein  40.18 
 
 		 335 aa  208  9e-53  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3884  hypothetical protein  33.54 
 
 		 328 aa  208  1e-52  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0060  hypothetical protein  37.58 
 
 		 322 aa  208  1e-52  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4004  hypothetical protein  35.91 
 
 		 339 aa  208  1e-52  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.506172  normal  0.0371737 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2783  hypothetical protein  36.95 
 
 		 324 aa  207  2e-52  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0971389 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6278  hypothetical protein  38.8 
 
 		 322 aa  207  2e-52  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.000130922  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5492  hypothetical protein  38.64 
 
 		 329 aa  207  2e-52  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3830  hypothetical protein  38.13 
 
 		 330 aa  206  4e-52  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.956859  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2869  hypothetical protein  34.23 
 
 		 329 aa  206  4e-52  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1323  hypothetical protein  39.87 
 
 		 333 aa  206  5e-52  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.520366  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0116  hypothetical protein  35.83 
 
 		 331 aa  206  6e-52  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1017  hypothetical protein  37.88 
 
 		 304 aa  206  7e-52  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.221773 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3624  hypothetical protein  36.92 
 
 		 330 aa  205  7e-52  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.210677  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4415  extra-cytoplasmic solute receptor  37.38 
 
 		 320 aa  205  7e-52  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.597884  normal  0.464948 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2796  hypothetical protein  36.84 
 
 		 336 aa  206  7e-52  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.309219  normal  0.544833 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0099  hypothetical protein  35.83 
 
 		 331 aa  205  7e-52  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.361253  normal  0.47407 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5278  extra-cytoplasmic solute receptor  34.85 
 
 		 331 aa  204  1e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.777708  normal  0.21823 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3745  hypothetical protein  39.8 
 
 		 330 aa  205  1e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0812255  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5438  hypothetical protein  38.12 
 
 		 326 aa  205  1e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2356  hypothetical protein  35.39 
 
 		 329 aa  204  1e-51  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.632454  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0462  hypothetical protein  39.93 
 
 		 345 aa  204  2e-51  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.170176 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0453  hypothetical protein  39.93 
 
 		 345 aa  204  2e-51  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.533416  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4511  hypothetical protein  36.09 
 
 		 337 aa  204  2e-51  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0112  hypothetical protein  36.12 
 
 		 338 aa  203  3e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.25815  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4624  hypothetical protein  37.54 
 
 		 327 aa  203  3e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3546  hypothetical protein  35.74 
 
 		 330 aa  204  3e-51  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0909589  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4853  extra-cytoplasmic solute receptor  37.62 
 
 		 314 aa  203  3e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0565268  normal  0.206495 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2869  hypothetical protein  35.74 
 
 		 330 aa  202  4e-51  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5741  hypothetical protein  39.88 
 
 		 339 aa  202  4e-51  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.286317  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3558  hypothetical protein  35.69 
 
 		 327 aa  202  5e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0638  twin-arginine translocation pathway signal  35.67 
 
 		 330 aa  202  5e-51  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5547  hypothetical protein  37.58 
 
 		 325 aa  202  6e-51  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0994  hypothetical protein  37.69 
 
 		 341 aa  202  7e-51  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0779  hypothetical protein  39.27 
 
 		 360 aa  202  7e-51  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0843  hypothetical protein  38.67 
 
 		 324 aa  202  9e-51  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.593129  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1078  hypothetical protein  38.41 
 
 		 344 aa  202  9e-51  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.058258  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3785  hypothetical protein  36.79 
 
 		 362 aa  201  9.999999999999999e-51  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0141562  normal  0.251227 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4385  hypothetical protein  38 
 
 		 323 aa  201  9.999999999999999e-51  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.944912  normal  0.325254 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4265  hypothetical protein  38.54 
 
 		 328 aa  201  9.999999999999999e-51  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.348047 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5060  hypothetical protein  34.74 
 
 		 331 aa  201  1.9999999999999998e-50  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4501  extra-cytoplasmic solute receptor  37.89 
 
 		 327 aa  201  1.9999999999999998e-50  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.034407  normal  0.0507087 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3664  hypothetical protein  37.1 
 
 		 324 aa  200  1.9999999999999998e-50  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3937  hypothetical protein  38.96 
 
 		 328 aa  200  1.9999999999999998e-50  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.178831  normal  0.0313351 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2562  hypothetical protein  37.39 
 
 		 330 aa  201  1.9999999999999998e-50  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5199  hypothetical protein  37.75 
 
 		 342 aa  201  1.9999999999999998e-50  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6131  hypothetical protein  37.29 
 
 		 314 aa  200  1.9999999999999998e-50  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.554613  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1383  hypothetical protein  35.59 
 
 		 325 aa  201  1.9999999999999998e-50  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.5589  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2123  hypothetical protein  34.04 
 
 		 326 aa  201  1.9999999999999998e-50  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0729826  normal  0.176092 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6257  hypothetical protein  37.21 
 
 		 330 aa  200  1.9999999999999998e-50  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5574  extra-cytoplasmic solute receptor  37.78 
 
 		 330 aa  200  3e-50  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1717  hypothetical protein  37.8 
 
 		 330 aa  200  3e-50  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.169515  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1912  hypothetical protein  36.15 
 
 		 335 aa  200  3.9999999999999996e-50  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5146  hypothetical protein  32.01 
 
 		 327 aa  199  3.9999999999999996e-50  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0987531  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2294  hypothetical protein  39.13 
 
 		 326 aa  199  3.9999999999999996e-50  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.0000131413  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3163  hypothetical protein  37.34 
 
 		 334 aa  200  3.9999999999999996e-50  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000218374 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1992  hypothetical protein  38.13 
 
 		 317 aa  199  3.9999999999999996e-50  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.108122  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5203  hypothetical protein  38.13 
 
 		 332 aa  199  3.9999999999999996e-50  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.65094  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>