More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_1716 on replicon NC_007973
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007973  Rmet_1716  zinc-binding alcohol dehydrogenase  100 
 
 		 326 aa  660    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2148  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  92.94 
 
 		 326 aa  619  1e-176  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2820  alcohol dehydrogenase  82.82 
 
 		 326 aa  563  1.0000000000000001e-159  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.516166 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4840  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  83.13 
 
 		 326 aa  557  1e-157  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0102128  hitchhiker  0.00303362 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2677  alcohol dehydrogenase  81.9 
 
 		 326 aa  555  1e-157  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1585  alcohol dehydrogenase  82.21 
 
 		 326 aa  547  1e-155  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1596  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  80.06 
 
 		 326 aa  543  1e-153  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1604  alcohol dehydrogenase  81.29 
 
 		 326 aa  543  1e-153  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.300093 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5285  NADPH-dependent quinone oxidoreductase  77.61 
 
 		 326 aa  526  1e-148  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.131724 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3099  putative quinone oxidoreductase  74.85 
 
 		 327 aa  494  1e-139  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2042  quinone oxidoreductase  74.85 
 
 		 327 aa  494  1e-139  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.282793  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2332  quinone oxidoreductase  74.85 
 
 		 327 aa  494  1e-139  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1350  quinone oxidoreductase  74.85 
 
 		 327 aa  494  1e-139  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1439  quinone oxidoreductase  75.15 
 
 		 327 aa  496  1e-139  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.845456  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1065  quinone oxidoreductase  74.85 
 
 		 327 aa  494  1e-139  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7175  alcohol dehydrogenase  74.85 
 
 		 327 aa  491  1e-137  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2184  NADPH:quinone reductase, zeta-crystallin homolog oxidoreductase protein  58.15 
 
 		 324 aa  380  1e-104  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.200214  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1981  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  57.1 
 
 		 326 aa  377  1e-103  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.642936 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2060  alcohol dehydrogenase  55.08 
 
 		 324 aa  376  1e-103  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.285411  normal  0.174232 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2381  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  55.56 
 
 		 326 aa  365  1e-100  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.722017  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0548  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  56.62 
 
 		 324 aa  365  1e-100  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.967786 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2503  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  54.46 
 
 		 327 aa  365  1e-100  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.731792  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1305  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  53.54 
 
 		 324 aa  361  1e-98  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.263394  normal  0.0862174 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2472  alcohol dehydrogenase  55.05 
 
 		 325 aa  357  9.999999999999999e-98  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.439289  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3633  alcohol dehydrogenase  52.76 
 
 		 325 aa  356  3.9999999999999996e-97  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1019  quinone oxidoreductase  53.23 
 
 		 324 aa  353  2e-96  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.527544  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2985  alcohol dehydrogenase  54.15 
 
 		 323 aa  353  2e-96  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5834  quinone oxidoreductase (NADPH  57.06 
 
 		 324 aa  351  8e-96  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.487323  normal  0.847734 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3255  putative NADPH-quinone reductase  51.69 
 
 		 324 aa  351  8e-96  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.953866 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1391  quinone oxidoreductase  52.31 
 
 		 324 aa  351  1e-95  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1238  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  52 
 
 		 324 aa  350  2e-95  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1245  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  52 
 
 		 324 aa  349  3e-95  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1879  quinone oxidoreductase  52 
 
 		 324 aa  349  3e-95  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0458768  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0363  quinone oxidoreductase  52 
 
 		 324 aa  349  3e-95  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0787  quinone oxidoreductase  52 
 
 		 324 aa  349  3e-95  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.399125  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4628  NADPH-dependent quinone oxidoreductase  54.46 
 
 		 412 aa  349  3e-95  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1080  quinone oxidoreductase  52 
 
 		 324 aa  349  3e-95  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.169344  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5617  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  52.31 
 
 		 324 aa  347  1e-94  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0414164  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0571  quinone oxidoreductase  52.45 
 
 		 324 aa  346  3e-94  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0988  alcohol dehydrogenase  52 
 
 		 324 aa  346  3e-94  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1582  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  53.85 
 
 		 324 aa  346  4e-94  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.45945  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3620  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  53.37 
 
 		 324 aa  345  4e-94  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1476  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  51.69 
 
 		 323 aa  345  7e-94  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2173  alcohol dehydrogenase  53.61 
 
 		 330 aa  343  2.9999999999999997e-93  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.133443 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3840  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  53.23 
 
 		 323 aa  340  2e-92  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.38359  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1191  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  52.31 
 
 		 323 aa  340  2e-92  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.87291  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2313  alcohol dehydrogenase  52.31 
 
 		 324 aa  338  9.999999999999999e-92  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.730105 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1678  zinc-binding alcohol dehydrogenase  52.31 
 
 		 324 aa  337  9.999999999999999e-92  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.05574  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2290  alcohol dehydrogenase  52.31 
 
 		 324 aa  337  9.999999999999999e-92  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0024  quinone oxidoreductase  53.68 
 
 		 325 aa  337  1.9999999999999998e-91  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.523604  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2969  alcohol dehydrogenase  50.77 
 
 		 324 aa  337  1.9999999999999998e-91  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2328  alcohol dehydrogenase  52 
 
 		 324 aa  334  1e-90  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2206  alcohol dehydrogenase  52 
 
 		 324 aa  334  1e-90  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.889298  normal  0.771237 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1170  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  53.37 
 
 		 331 aa  334  1e-90  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.636549 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2235  alcohol dehydrogenase  49.85 
 
 		 330 aa  333  3e-90  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3010  zinc-binding alcohol dehydrogenase  51.24 
 
 		 322 aa  331  1e-89  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1258  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  51.37 
 
 		 328 aa  330  3e-89  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.292182  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0021  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  51.23 
 
 		 325 aa  328  5.0000000000000004e-89  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00189953  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00250  quinone oxidoreductase  51.23 
 
 		 325 aa  328  7e-89  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.798779 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2009  alcohol dehydrogenase  53.23 
 
 		 323 aa  326  3e-88  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.792874  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0482  zinc-binding alcohol dehydrogenase  49.39 
 
 		 322 aa  325  6e-88  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1429  zinc-binding alcohol dehydrogenase  49.09 
 
 		 331 aa  325  8.000000000000001e-88  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3232  alcohol dehydrogenase  49.39 
 
 		 331 aa  323  2e-87  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3468  alcohol dehydrogenase  49.85 
 
 		 328 aa  323  3e-87  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.92927  normal  0.411159 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0088  alcohol dehydrogenase  50.31 
 
 		 325 aa  322  4e-87  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000155478 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1228  alcohol dehydrogenase  49.85 
 
 		 327 aa  322  7e-87  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2740  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  49.24 
 
 		 328 aa  321  9.999999999999999e-87  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.42219  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3853  zinc-binding alcohol dehydrogenase  49.54 
 
 		 344 aa  321  9.999999999999999e-87  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1264  alcohol dehydrogenase  49.69 
 
 		 327 aa  318  9e-86  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0072  quinone oxidoreductase  49.69 
 
 		 325 aa  317  2e-85  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.899686  hitchhiker  0.0000690857 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3903  alcohol dehydrogenase  51.39 
 
 		 323 aa  317  2e-85  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.221632  normal  0.178635 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_5020  alcohol dehydrogenase  50.47 
 
 		 321 aa  317  2e-85  Caulobacter sp. K31  Bacteria  decreased coverage  0.00109136  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1644  alcohol dehydrogenase  50.31 
 
 		 325 aa  317  2e-85  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.44369 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3872  alcohol dehydrogenase  51.23 
 
 		 324 aa  316  4e-85  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.772345 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4272  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  51.08 
 
 		 323 aa  316  4e-85  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0472622  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4375  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  50.46 
 
 		 323 aa  315  5e-85  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.313231 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5121  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  49.08 
 
 		 324 aa  315  7e-85  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0173  quinone oxidoreductase  50.15 
 
 		 325 aa  314  9.999999999999999e-85  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0088  alcohol dehydrogenase  49.39 
 
 		 325 aa  314  9.999999999999999e-85  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.654811 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2619  zinc-binding alcohol dehydrogenase  50.15 
 
 		 324 aa  314  1.9999999999999998e-84  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.869285  normal  0.466568 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1694  zinc-binding alcohol dehydrogenase  49.54 
 
 		 325 aa  313  1.9999999999999998e-84  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0377622  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5388  alcohol dehydrogenase  49.7 
 
 		 326 aa  313  2.9999999999999996e-84  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.497485 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0023  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  50.15 
 
 		 325 aa  312  3.9999999999999997e-84  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00210  NADH-quinone oxidoreductase  51.53 
 
 		 325 aa  311  6.999999999999999e-84  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.336084  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0091  alcohol dehydrogenase  49.08 
 
 		 325 aa  310  2.9999999999999997e-83  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.547437  hitchhiker  0.0000221127 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1715  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  49.69 
 
 		 326 aa  310  2.9999999999999997e-83  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0197  zinc-binding alcohol dehydrogenase  49.07 
 
 		 327 aa  309  4e-83  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2841  alcohol dehydrogenase  48.92 
 
 		 324 aa  309  5e-83  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.397829  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2949  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  49.54 
 
 		 324 aa  309  5e-83  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3228  alcohol dehydrogenase  49.08 
 
 		 324 aa  308  5.9999999999999995e-83  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.603844 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1508  zinc-binding alcohol dehydrogenase  49.24 
 
 		 325 aa  308  6.999999999999999e-83  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3049  quinone oxidoreductase, putative  48.16 
 
 		 331 aa  308  1.0000000000000001e-82  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.658374  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3766  quinone oxidoreductase, NADPH-dependent  49.09 
 
 		 327 aa  306  3e-82  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000252302  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2044  zinc-binding alcohol dehydrogenase  48.92 
 
 		 324 aa  306  4.0000000000000004e-82  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3856  quinone oxidoreductase, NADPH-dependent  48.78 
 
 		 327 aa  305  6e-82  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.323591  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1504  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  48.31 
 
 		 324 aa  305  8.000000000000001e-82  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0905187 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3109  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  50.93 
 
 		 322 aa  305  9.000000000000001e-82  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.750258  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3497  quinone oxidoreductase, NADPH-dependent  49.7 
 
 		 327 aa  303  2.0000000000000002e-81  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2632  zinc-binding alcohol dehydrogenase  48.31 
 
 		 324 aa  303  2.0000000000000002e-81  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.40031  decreased coverage  0.0000390702 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4450  quinone oxidoreductase, NADPH-dependent  49.09 
 
 		 329 aa  303  3.0000000000000004e-81  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.553295 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>