More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_1692 on replicon NC_007973
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



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Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007973  Rmet_1692  Crp/FNR family transcriptional regulator  100 
 
 		 244 aa  489  1e-137  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.816346  normal  1 
 
 
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NC_007347  Reut_A2034  cyclic nucleotide-binding: regulatory protein, Crp  56.77 
 
 		 232 aa  283  2.0000000000000002e-75  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_007973  Rmet_2037  Crp/FNR family transcriptional regulator  55.75 
 
 		 232 aa  276  3e-73  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.441781 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1204  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  52.61 
 
 		 242 aa  254  1.0000000000000001e-66  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1111  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  52.84 
 
 		 242 aa  253  2.0000000000000002e-66  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.700786  normal  0.531022 
 
 
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NC_003295  RSc1283  putative fumarate and nitrate reduction regulatory transcription regulator protein  52.17 
 
 		 242 aa  252  4.0000000000000004e-66  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0516193  normal  0.32826 
 
 
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NC_009379  Pnuc_0460  CRP/FNR family transcriptional regulator  51.58 
 
 		 256 aa  248  5e-65  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_010531  Pnec_1356  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  49.77 
 
 		 256 aa  241  9e-63  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.0588975 
 
 
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NC_007348  Reut_B4212  cyclic nucleotide-binding: regulatory protein, Crp  50.22 
 
 		 303 aa  233  1.0000000000000001e-60  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_011662  Tmz1t_1288  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  46.96 
 
 		 246 aa  219  3e-56  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1170  Crp/FNR family transcriptional regulator  47.11 
 
 		 274 aa  213  1.9999999999999998e-54  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_007948  Bpro_4294  Crp/FNR family transcriptional regulator  48 
 
 		 272 aa  213  1.9999999999999998e-54  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1091  CRP/FNR family transcriptional regulator  45.29 
 
 		 247 aa  213  1.9999999999999998e-54  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.140321  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1007  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  45.29 
 
 		 242 aa  213  1.9999999999999998e-54  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1530  Crp/FNR family transcriptional regulator  44.84 
 
 		 239 aa  210  2e-53  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_010002  Daci_2782  Crp/FNR family transcriptional regulator  45.29 
 
 		 262 aa  209  3e-53  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0680307  normal  0.414614 
 
 
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NC_007298  Daro_1047  cyclic nucleotide-binding: regulatory protein, Crp  45.7 
 
 		 247 aa  209  4e-53  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_007492  Pfl01_3345  Crp/FNR family transcriptional regulator  45.58 
 
 		 247 aa  209  4e-53  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.797997  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2772  Crp/FNR family transcriptional regulator  44.93 
 
 		 245 aa  206  2e-52  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00275745 
 
 
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NC_008781  Pnap_3775  CRP/FNR family transcriptional regulator  43.95 
 
 		 265 aa  205  5e-52  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_004578  PSPTO_1666  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  44.74 
 
 		 250 aa  204  8e-52  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0506299  n/a   
 
 
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NC_011312  VSAL_I1571  fumarate/nitrate reduction transcriptional regulator  43.64 
 
 		 250 aa  204  8e-52  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.75505  n/a   
 
 
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NC_008786  Veis_1163  CRP/FNR family transcriptional regulator  44.39 
 
 		 251 aa  204  1e-51  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_008781  Pnap_0792  CRP/FNR family transcriptional regulator  46.15 
 
 		 262 aa  202  3e-51  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.328451  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2219  fumarate/nitrate reduction transcriptional regulator  42.73 
 
 		 249 aa  201  9e-51  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_008309  HS_0878  fumarate/nitrate reduction transcriptional regulator  42.73 
 
 		 257 aa  201  9.999999999999999e-51  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0364978  n/a   
 
 
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NC_012912  Dd1591_2081  fumarate/nitrate reduction transcriptional regulator  43.06 
 
 		 250 aa  200  1.9999999999999998e-50  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0488524  n/a   
 
 
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NC_012917  PC1_2105  fumarate/nitrate reduction transcriptional regulator  42.73 
 
 		 248 aa  200  1.9999999999999998e-50  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0944449  n/a   
 
 
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NC_013421  Pecwa_2398  fumarate/nitrate reduction transcriptional regulator  42.27 
 
 		 248 aa  199  3e-50  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2222  fumarate/nitrate reduction transcriptional regulator  42.27 
 
 		 250 aa  199  3.9999999999999996e-50  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0665535  n/a   
 
 
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NC_004347  SO_2356  fumarate/nitrate reduction transcriptional regulator  42.15 
 
 		 254 aa  197  1.0000000000000001e-49  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
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NC_010622  Bphy_1138  Crp/FNR family transcriptional regulator  42.08 
 
 		 260 aa  197  1.0000000000000001e-49  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_009457  VC0395_A1045  fumarate/nitrate reduction transcriptional regulator  43.46 
 
 		 250 aa  197  1.0000000000000001e-49  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.18077  n/a   
 
 
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NC_008322  Shewmr7_1961  fumarate/nitrate reduction transcriptional regulator  41.7 
 
 		 250 aa  197  1.0000000000000001e-49  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00754009 
 
 
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CP001637  EcDH1_2311  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  41.82 
 
 		 250 aa  196  2.0000000000000003e-49  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.144598  n/a   
 
 
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NC_010468  EcolC_2291  fumarate/nitrate reduction transcriptional regulator  41.82 
 
 		 250 aa  196  2.0000000000000003e-49  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_009801  EcE24377A_1546  fumarate/nitrate reduction transcriptional regulator  41.82 
 
 		 250 aa  196  2.0000000000000003e-49  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009783  VIBHAR_02295  fumarate/nitrate reduction transcriptional regulator  42.73 
 
 		 248 aa  196  2.0000000000000003e-49  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
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NC_011083  SeHA_C1845  fumarate/nitrate reduction transcriptional regulator  41.82 
 
 		 250 aa  197  2.0000000000000003e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.918423  normal  1 
 
 
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NC_010498  EcSMS35_1788  fumarate/nitrate reduction transcriptional regulator  41.82 
 
 		 250 aa  196  2.0000000000000003e-49  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.765276  normal  1 
 
 
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NC_010159  YpAngola_A2293  fumarate/nitrate reduction transcriptional regulator  41.82 
 
 		 250 aa  196  2.0000000000000003e-49  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_011149  SeAg_B1491  fumarate/nitrate reduction transcriptional regulator  41.82 
 
 		 250 aa  197  2.0000000000000003e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0202312  n/a   
 
 
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NC_011094  SeSA_A1785  fumarate/nitrate reduction transcriptional regulator  41.82 
 
 		 250 aa  197  2.0000000000000003e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.377507  normal  0.141635 
 
 
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NC_011080  SNSL254_A1783  fumarate/nitrate reduction transcriptional regulator  41.82 
 
 		 250 aa  197  2.0000000000000003e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.251439 
 
 
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NC_009800  EcHS_A1450  fumarate/nitrate reduction transcriptional regulator  41.82 
 
 		 250 aa  196  2.0000000000000003e-49  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_011205  SeD_A1673  fumarate/nitrate reduction transcriptional regulator  41.82 
 
 		 250 aa  197  2.0000000000000003e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.349784  normal  0.0983377 
 
 
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NC_010658  SbBS512_E1575  fumarate/nitrate reduction transcriptional regulator  41.82 
 
 		 250 aa  196  2.0000000000000003e-49  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009708  YpsIP31758_1833  fumarate/nitrate reduction transcriptional regulator  41.82 
 
 		 250 aa  196  2.0000000000000003e-49  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_012880  Dd703_1864  fumarate/nitrate reduction transcriptional regulator  42.27 
 
 		 250 aa  197  2.0000000000000003e-49  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.856056  n/a   
 
 
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NC_010465  YPK_1944  fumarate/nitrate reduction transcriptional regulator  41.82 
 
 		 250 aa  196  2.0000000000000003e-49  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.755264  n/a   
 
 
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NC_003910  CPS_1987  fumarate/nitrate reduction transcriptional regulator  41.63 
 
 		 239 aa  196  3e-49  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_013456  VEA_003475  fumarate and nitrate reduction regulatory protein  42.73 
 
 		 248 aa  196  3e-49  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.292896  n/a   
 
 
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NC_007908  Rfer_1937  Crp/FNR family transcriptional regulator  44.55 
 
 		 223 aa  196  3e-49  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.155753  n/a   
 
 
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NC_011353  ECH74115_1981  fumarate/nitrate reduction transcriptional regulator  41.82 
 
 		 250 aa  196  3e-49  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.320226 
 
 
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NC_008577  Shewana3_2115  fumarate/nitrate reduction transcriptional regulator  41.7 
 
 		 250 aa  196  3e-49  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.508722  normal  0.0650668 
 
 
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NC_008825  Mpe_A2471  transcription factor Fnr  45.61 
 
 		 269 aa  196  3e-49  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.366844  normal  0.0435693 
 
 
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NC_008321  Shewmr4_2014  fumarate/nitrate reduction transcriptional regulator  41.7 
 
 		 250 aa  196  3e-49  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000000422436 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2417  fumarate/nitrate reduction transcriptional regulator  41.36 
 
 		 249 aa  195  4.0000000000000005e-49  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0646393  decreased coverage  0.000000159166 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1993  fumarate/nitrate reduction transcriptional regulator  41.82 
 
 		 249 aa  196  4.0000000000000005e-49  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.238952  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1853  fumarate/nitrate reduction transcriptional regulator  40.81 
 
 		 250 aa  195  5.000000000000001e-49  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.755428 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1951  fumarate/nitrate reduction transcriptional regulator  41.7 
 
 		 250 aa  195  6e-49  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.80493  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2582  fumarate/nitrate reduction transcriptional regulator  40.81 
 
 		 254 aa  194  1e-48  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1799  fumarate/nitrate reduction transcriptional regulator  41.82 
 
 		 250 aa  194  2e-48  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.417815  normal  0.180258 
 
 
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NC_008345  Sfri_2018  fumarate/nitrate reduction transcriptional regulator  42.27 
 
 		 252 aa  193  2e-48  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.831368  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44490  transcriptional regulator Anr  44.91 
 
 		 244 aa  193  3e-48  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.793348 
 
 
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NC_009656  PSPA7_3788  transcriptional regulator Anr  44.91 
 
 		 244 aa  193  3e-48  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.620164  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0212  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  42.27 
 
 		 254 aa  192  4e-48  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2162  fumarate/nitrate reduction transcriptional regulator  41.26 
 
 		 250 aa  192  4e-48  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.914647  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2212  fumarate/nitrate reduction transcriptional regulator  41.26 
 
 		 250 aa  192  4e-48  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00299596  normal  0.266977 
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4495  fumarate/nitrate reduction transcriptional regulator  41.26 
 
 		 250 aa  192  4e-48  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2209  fumarate/nitrate reduction transcriptional regulator  41.26 
 
 		 250 aa  192  4e-48  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00613295  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2222  fumarate/nitrate reduction transcriptional regulator  41.26 
 
 		 250 aa  192  4e-48  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00000942023  normal  0.178468 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4280  Crp/FNR family transcriptional regulator  40.62 
 
 		 257 aa  191  6e-48  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0900166 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3812  Crp/FNR family transcriptional regulator  40.62 
 
 		 257 aa  192  6e-48  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.279241  normal  0.577974 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6195  Crp/FNR family transcriptional regulator  40.18 
 
 		 257 aa  190  2e-47  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.107166  normal  0.295507 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5811  Crp/FNR family transcriptional regulator  40.27 
 
 		 266 aa  189  2.9999999999999997e-47  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.118405 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4486  Crp/FNR family transcriptional regulator  42.15 
 
 		 248 aa  188  5.999999999999999e-47  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5008  Crp/FNR family transcriptional regulator  42.79 
 
 		 249 aa  188  8e-47  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3149  Crp/FNR family transcriptional regulator  42.79 
 
 		 249 aa  188  8e-47  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4265  transcriptional regulator Anr  43.52 
 
 		 244 aa  187  1e-46  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.880812  normal  1 
 
 
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NC_012560  Avin_19910  Fnr-like negative transcriptional regulator of CydAB  43.5 
 
 		 244 aa  187  1e-46  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009512  Pput_1603  CRP/FNR family transcriptional regulator  43.52 
 
 		 244 aa  187  1e-46  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.138297 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0931  fumarate/nitrate reduction transcriptional regulator  40.36 
 
 		 249 aa  187  1e-46  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.896198 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2615  CRP/FNR family transcriptional regulator  43.52 
 
 		 244 aa  187  1e-46  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00240538  normal  0.855877 
 
 
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NC_010087  Bmul_5904  Crp/FNR family transcriptional regulator  39.73 
 
 		 257 aa  187  1e-46  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.379633  normal  0.222249 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3583  Crp/FNR family transcriptional regulator  43.52 
 
 		 244 aa  187  2e-46  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3830  Crp/FNR family transcriptional regulator  43.52 
 
 		 244 aa  187  2e-46  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.525453 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1991  transcriptional activator Anr  42.52 
 
 		 244 aa  186  2e-46  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.695719  n/a   
 
 
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NC_007492  Pfl01_1811  Crp/FNR family transcriptional regulator  43.06 
 
 		 244 aa  187  2e-46  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_007650  BTH_II0460  Crp/FNR family transcriptional regulator  39.82 
 
 		 260 aa  186  2e-46  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_006349  BMAA0164  Crp/FNR family transcriptional regulator  40.27 
 
 		 260 aa  186  3e-46  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_007435  BURPS1710b_A1016  Crp/FNR family transcriptional regulator  40.27 
 
 		 260 aa  186  3e-46  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009079  BMA10247_A0190  Crp/FNR family transcriptional regulator  40.27 
 
 		 242 aa  186  3e-46  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_008784  BMASAVP1_1334  Crp/FNR family transcriptional regulator  40.27 
 
 		 242 aa  186  3e-46  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_007954  Sden_1843  fumarate/nitrate reduction transcriptional regulator  40.91 
 
 		 250 aa  186  3e-46  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0177159  n/a   
 
 
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NC_010086  Bmul_4265  Crp/FNR family transcriptional regulator  40.72 
 
 		 259 aa  186  3e-46  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.367581  normal  0.892156 
 
 
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NC_009075  BURPS668_A2747  Crp/Fnr family transcriptional regulator  40.27 
 
 		 260 aa  186  3e-46  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.225266  n/a   
 
 
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NC_009078  BURPS1106A_A2604  Crp/Fnr family transcriptional regulator  40.27 
 
 		 260 aa  186  3e-46  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_007650  BTH_II1244  Crp/FNR family transcriptional regulator  38.57 
 
 		 261 aa  186  4e-46  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_010676  Bphyt_6315  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  40.28 
 
 		 403 aa  186  4e-46  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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