56 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_1647 on replicon NC_007973
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007973  Rmet_1647  hypothetical protein  100 
 
 		 242 aa  473  1e-133  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.042207  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0696  transmembrane protein  65.16 
 
 		 240 aa  294  7e-79  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.220237  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2576  putative transmembrane protein  48.55 
 
 		 239 aa  204  8e-52  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.245443 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2172  hypothetical protein  48.55 
 
 		 239 aa  204  8e-52  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.196397 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2362  hypothetical protein  47.3 
 
 		 239 aa  190  2e-47  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.170965 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5289  putative transmembrane protein  38.69 
 
 		 275 aa  150  1e-35  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1085  putative transmembrane protein  37.26 
 
 		 260 aa  150  2e-35  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4573  hypothetical protein  36.58 
 
 		 260 aa  140  9.999999999999999e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0888  hypothetical protein  36.58 
 
 		 260 aa  136  3.0000000000000003e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1295  hypothetical protein  31.88 
 
 		 237 aa  86.7  3e-16  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.785718  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1695  hypothetical protein  31.03 
 
 		 238 aa  84.7  0.000000000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0088  hypothetical protein  31.62 
 
 		 239 aa  83.6  0.000000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2635  hypothetical protein  28.46 
 
 		 232 aa  84.3  0.000000000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.352315  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3548  hypothetical protein  33.61 
 
 		 230 aa  84  0.000000000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.390955  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0073  hypothetical protein  33.19 
 
 		 239 aa  79.7  0.00000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0271234 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6587  hypothetical protein  32.91 
 
 		 244 aa  74.3  0.000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0308609  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3700  hypothetical protein  26.95 
 
 		 250 aa  71.6  0.00000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.677468  normal  0.239626 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0461  hypothetical protein  29.44 
 
 		 240 aa  70.5  0.00000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4013  uncharacterized protein-like protein  32.61 
 
 		 234 aa  67.8  0.0000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0859661 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1332  hypothetical protein  33.47 
 
 		 234 aa  67.8  0.0000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0361  hypothetical protein  25.64 
 
 		 235 aa  67.4  0.0000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0400  uncharacterized protein-like protein  30.17 
 
 		 238 aa  66.6  0.0000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0636  putative transmembrane protein  29.89 
 
 		 171 aa  67  0.0000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4493  hypothetical protein  28.34 
 
 		 243 aa  65.9  0.0000000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00129044 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4360  hypothetical protein  28.34 
 
 		 243 aa  65.9  0.0000000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01781  hypothetical protein  29.23 
 
 		 277 aa  65.9  0.0000000006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.270891  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01570  hypothetical protein  27.71 
 
 		 244 aa  63.9  0.000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3590  hypothetical protein  31.12 
 
 		 233 aa  63.9  0.000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.080762  normal  0.394996 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1097  hypothetical protein  30 
 
 		 254 aa  60.1  0.00000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5507  uncharacterized protein-like protein  30.13 
 
 		 229 aa  58.9  0.00000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.250869 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3808  RNA polymerase sigma-70 family protein  28.09 
 
 		 248 aa  58.5  0.0000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.178048  normal  0.362907 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5200  hypothetical protein  35.75 
 
 		 258 aa  57.4  0.0000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.131551 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5177  hypothetical protein  26.16 
 
 		 235 aa  55.8  0.0000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1137  hypothetical protein  27.24 
 
 		 254 aa  55.5  0.0000008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3056  hypothetical protein  26.97 
 
 		 243 aa  55.5  0.0000009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3920  uncharacterized protein-like protein  29.79 
 
 		 241 aa  54.7  0.000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  decreased coverage  0.00106031  normal  0.125751 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0162  hypothetical protein  30.04 
 
 		 245 aa  54.3  0.000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.88805  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3747  hypothetical protein  25.32 
 
 		 231 aa  52.8  0.000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.831367  normal  0.357527 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1718  hypothetical protein  30.67 
 
 		 242 aa  52.4  0.000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.202927 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1269  hypothetical protein  29.27 
 
 		 249 aa  51.6  0.00001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000174467 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4227  hypothetical protein  24.01 
 
 		 294 aa  51.2  0.00002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3537  hypothetical protein  30.38 
 
 		 234 aa  50.1  0.00003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.440642  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1826  hypothetical protein  24.67 
 
 		 315 aa  49.7  0.00004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0616664  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0076  hypothetical protein  29.31 
 
 		 236 aa  49.7  0.00004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.499992  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3908  hypothetical protein  37.07 
 
 		 302 aa  48.9  0.00007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0132845  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2687  hypothetical protein  28.94 
 
 		 230 aa  48.9  0.00008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3668  hypothetical protein  36.21 
 
 		 299 aa  48.5  0.00009  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0972  hypothetical protein  27.54 
 
 		 250 aa  48.5  0.0001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.221303  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7563  hypothetical protein  27.27 
 
 		 234 aa  47  0.0002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.434123  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4257  uncharacterized protein-like protein  26.77 
 
 		 259 aa  47  0.0003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.683033 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2488  hypothetical protein  26.75 
 
 		 237 aa  45.8  0.0006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.101842 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1110  hypothetical protein  26.01 
 
 		 211 aa  45.1  0.001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6529  hypothetical protein  34.82 
 
 		 328 aa  45.1  0.001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.270942  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3005  hypothetical protein  28.98 
 
 		 233 aa  45.1  0.001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.660261  normal  0.0479294 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0288  Anti-sigma-K factor RskA  25.54 
 
 		 224 aa  43.9  0.002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3981  hypothetical protein  22.92 
 
 		 237 aa  42.7  0.006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.822328 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>