More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_1644 on replicon NC_007973
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007348  Reut_B4249  NUDIX hydrolase:Beta-lactamase-like  65.58 
 
 		 566 aa  723    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1644  beta-lactamase-like protein  100 
 
 		 566 aa  1155    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.162683  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3801  beta-lactamase domain-containing protein  43.64 
 
 		 545 aa  418  9.999999999999999e-116  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1959  NUDIX hydrolase  42.95 
 
 		 426 aa  325  9e-88  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0680964  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1055  beta-lactamase-like  37.52 
 
 		 550 aa  318  2e-85  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.128997 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1452  beta-lactamase domain-containing protein  38.43 
 
 		 556 aa  315  9.999999999999999e-85  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.463729  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3001  beta-lactamase domain protein  37.75 
 
 		 568 aa  312  1e-83  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0874  beta-lactamase domain protein  37.83 
 
 		 557 aa  311  2e-83  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3441  beta-lactamase domain-containing protein  37.38 
 
 		 544 aa  310  4e-83  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3446  beta-lactamase-like  35.92 
 
 		 562 aa  307  3e-82  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3691  beta-lactamase domain-containing protein  37.39 
 
 		 568 aa  307  4.0000000000000004e-82  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.781768  normal  0.827014 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1888  beta-lactamase domain-containing protein  36.8 
 
 		 559 aa  299  1e-79  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.378711 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0793  beta-lactamase domain-containing protein  37.61 
 
 		 556 aa  294  3e-78  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.541294  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1441  beta-lactamase domain-containing protein  43.75 
 
 		 313 aa  181  4e-44  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.610229  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4714  beta-lactamase domain-containing protein  44.2 
 
 		 312 aa  181  4.999999999999999e-44  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.644544  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0953  beta-lactamase domain-containing protein  40.58 
 
 		 308 aa  180  5.999999999999999e-44  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.421827  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1084  beta-lactamase domain protein  42.75 
 
 		 302 aa  178  2e-43  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0086  beta-lactamase-like  40.69 
 
 		 311 aa  177  4e-43  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0801  beta-lactamase domain-containing protein  39.78 
 
 		 301 aa  175  1.9999999999999998e-42  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.451978  normal  0.510072 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0361  beta-lactamase-like protein  43.21 
 
 		 306 aa  175  1.9999999999999998e-42  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.426501 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2717  beta-lactamase domain-containing protein  40.82 
 
 		 278 aa  175  1.9999999999999998e-42  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3305  beta-lactamase domain protein  44.4 
 
 		 282 aa  172  1e-41  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0149024  normal  0.0144108 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1316  beta-lactamase domain-containing protein  42.55 
 
 		 297 aa  172  2e-41  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.078247  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0725  beta-lactamase domain protein  40.79 
 
 		 303 aa  170  5e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.264304  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4394  beta-lactamase domain protein  41.96 
 
 		 304 aa  168  2.9999999999999998e-40  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5004  beta-lactamase domain-containing protein  41.45 
 
 		 317 aa  166  8e-40  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.331086  normal  0.0887437 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0552  beta-lactamase domain-containing protein  39.72 
 
 		 302 aa  166  1.0000000000000001e-39  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.893963 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0671  beta-lactamase domain protein  39.71 
 
 		 302 aa  165  2.0000000000000002e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.461585  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1480  beta-lactamase-like  35.66 
 
 		 307 aa  163  7e-39  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.245912  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2901  beta-lactamase domain-containing protein  40.79 
 
 		 310 aa  163  7e-39  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.605946  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0692  beta-lactamase domain-containing protein  37.82 
 
 		 316 aa  163  8.000000000000001e-39  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3127  beta-lactamase domain protein  40.79 
 
 		 310 aa  162  1e-38  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.257865  normal  0.300589 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2731  beta-lactamase domain-containing protein  39.16 
 
 		 307 aa  156  8e-37  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.146298 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1837  beta-lactamase domain-containing protein  38.85 
 
 		 303 aa  155  1e-36  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3024  beta-lactamase domain protein  39.86 
 
 		 310 aa  155  2e-36  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0101087  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0775  beta-lactamase-like  37.28 
 
 		 302 aa  155  2e-36  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0505  metallo-beta-lactamase family protein  36.82 
 
 		 301 aa  154  2.9999999999999998e-36  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0508  metallo-beta-lactamase family protein  36.82 
 
 		 306 aa  154  2.9999999999999998e-36  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0204  metallo-beta-lactamase family protein  39.57 
 
 		 303 aa  154  5e-36  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1127  metallo-beta-lactamase superfamily protein  41.76 
 
 		 285 aa  152  1e-35  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4296  beta-lactamase-like  37.37 
 
 		 308 aa  151  3e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0804764  normal  0.0768999 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0859  beta-lactamase domain-containing protein  39.56 
 
 		 304 aa  151  3e-35  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1285  beta-lactamase domain protein  36.52 
 
 		 310 aa  147  4.0000000000000006e-34  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1163  Beta-lactamase-like  36.65 
 
 		 310 aa  147  6e-34  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0506017  normal  0.1623 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1772  beta-lactamase domain-containing protein  38.06 
 
 		 288 aa  147  6e-34  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.32284 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1265  beta-lactamase-like  36.08 
 
 		 310 aa  147  7.0000000000000006e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.581191  normal  0.66012 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2452  putative Beta-lactamase  38.43 
 
 		 304 aa  146  9e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2470  beta-lactamase domain-containing protein  37.45 
 
 		 305 aa  146  1e-33  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00708378 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1832  beta-lactamase-like  38.83 
 
 		 294 aa  145  2e-33  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.930975  normal  0.178967 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0613  beta-lactamase-like  37.72 
 
 		 305 aa  145  3e-33  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0754  beta-lactamase-like  37.74 
 
 		 315 aa  144  3e-33  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1920  hypothetical protein  38.91 
 
 		 301 aa  137  6.0000000000000005e-31  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.0000181581  hitchhiker  0.000000000000329346 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2700  NUDIX hydrolase  34.47 
 
 		 273 aa  123  9e-27  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.805281  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4749  beta-lactamase domain protein  39.46 
 
 		 288 aa  123  9.999999999999999e-27  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0248  beta-lactamase domain protein  38.71 
 
 		 266 aa  123  9.999999999999999e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0512  beta-lactamase domain protein  34.87 
 
 		 315 aa  121  3e-26  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0174052  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8910  beta-lactamase domain protein  34.75 
 
 		 264 aa  121  3.9999999999999996e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3602  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 		 263 aa  118  3e-25  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2699  NUDIX hydrolase  32.41 
 
 		 294 aa  112  2.0000000000000002e-23  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3111  NUDIX hydrolase  32.95 
 
 		 264 aa  110  8.000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.43203 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1889  beta-lactamase domain protein  34.47 
 
 		 286 aa  109  1e-22  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1854  beta-lactamase domain protein  34.24 
 
 		 272 aa  108  3e-22  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.189866  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0235  NUDIX hydrolase  35.88 
 
 		 260 aa  107  5e-22  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.998235  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5001  hypothetical protein  34.75 
 
 		 267 aa  107  8e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.257497 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0516  NUDIX hydrolase  33.72 
 
 		 264 aa  106  1e-21  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2528  beta-lactamase domain-containing protein  32.28 
 
 		 260 aa  105  2e-21  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00565773  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25410  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  34.21 
 
 		 259 aa  103  6e-21  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3570  NUDIX hydrolase  34.45 
 
 		 254 aa  103  1e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.511087  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4236  Beta-lactamase-like  36.9 
 
 		 500 aa  103  1e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0203  beta-lactamase domain-containing protein  34.3 
 
 		 263 aa  103  1e-20  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0208476  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0716  beta-lactamase domain protein  35.29 
 
 		 270 aa  101  3e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0467  metallo-beta-lactamase family protein  36.29 
 
 		 262 aa  101  5e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.56187 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2833  beta-lactamase domain protein  32.72 
 
 		 277 aa  99.4  1e-19  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.705023  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4392  beta-lactamase domain protein  36.36 
 
 		 497 aa  99.4  2e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0466  NUDIX hydrolase  33.47 
 
 		 275 aa  98.6  3e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.743041 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0247  NUDIX hydrolase  39.18 
 
 		 279 aa  97.4  6e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4283  NUDIX hydrolase  30.43 
 
 		 315 aa  97.1  8e-19  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.918616  normal  1 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05524  metallo-beta-lactamase domain protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G12940)  30.6 
 
 		 291 aa  95.9  2e-18  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4369  beta-lactamase domain protein  35.57 
 
 		 497 aa  95.9  2e-18  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2913  NUDIX hydrolase  33.72 
 
 		 272 aa  95.9  2e-18  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5314  beta-lactamase domain protein  32.06 
 
 		 268 aa  95.1  3e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.498114 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_10245  predicted protein  31.95 
 
 		 285 aa  94.4  5e-18  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.00334407  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1997  beta-lactamase domain-containing protein  30.92 
 
 		 268 aa  94.4  5e-18  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0715  NUDIX hydrolase  35.4 
 
 		 247 aa  94  6e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0202  NUDIX hydrolase  33.76 
 
 		 295 aa  94  6e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0949289  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4852  NUDIX hydrolase  32.06 
 
 		 285 aa  94  7e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0115  hypothetical protein  30.98 
 
 		 310 aa  93.2  1e-17  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13708  hydrolase  31.58 
 
 		 264 aa  92  2e-17  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.0451158 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2354  NUDIX hydrolase  32.02 
 
 		 264 aa  92.4  2e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.081221  normal  0.303498 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0504  beta-lactamase domain protein  30.04 
 
 		 267 aa  91.7  4e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0630883  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0641  beta-lactamase domain protein  30.73 
 
 		 290 aa  91.3  5e-17  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.117018  normal  0.604387 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4271  NUDIX hydrolase  31.82 
 
 		 283 aa  90.9  5e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.707988  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1303  beta-lactamase domain protein  34.85 
 
 		 262 aa  90.5  7e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3933  beta-lactamase domain protein  30.57 
 
 		 276 aa  90.5  8e-17  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.997989  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0330  beta-lactamase domain-containing protein  34.38 
 
 		 259 aa  90.1  8e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.478372  normal  0.100644 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3275  NUDIX hydrolase  31.35 
 
 		 274 aa  90.1  9e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.424821  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06001  metallo-beta-lactamase domain protein (AFU_orthologue; AFUA_7G00120)  31.19 
 
 		 309 aa  90.1  1e-16  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.355889  normal  0.401572 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_19280  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  34.23 
 
 		 271 aa  89.7  1e-16  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0116  putative hydrolase  31.58 
 
 		 284 aa  89.4  2e-16  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26240  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  33.46 
 
 		 273 aa  88.6  3e-16  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.810697  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>